Protein–RNA interactions for Protein: Q5T0U0

CCDC122, Coiled-coil domain-containing protein 122, humanhuman

Predictions only

Length 273 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CCDC122Q5T0U0 DNAAF3-201ENST00000391720 2169 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC22.48■■□□□ 1.19
CCDC122Q5T0U0 EGLN2-202ENST00000406058 2150 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.48■■□□□ 1.19
CCDC122Q5T0U0 EPS8L1-201ENST00000201647 2536 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.48■■□□□ 1.19
CCDC122Q5T0U0 RALB-203ENST00000420510 1252 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.48■■□□□ 1.19
CCDC122Q5T0U0 ANKRD63-201ENST00000434396 1143 ntAPPRIS P1 BASIC22.48■■□□□ 1.19
CCDC122Q5T0U0 CDKN2A-206ENST00000494262 989 ntTSL 3 BASIC22.48■■□□□ 1.19
CCDC122Q5T0U0 MCRIP1-205ENST00000572645 1038 ntTSL 1 (best) BASIC22.48■■□□□ 1.19
CCDC122Q5T0U0 PPP1R14A-204ENST00000591291 433 ntTSL 5 BASIC22.48■■□□□ 1.19
CCDC122Q5T0U0 AC008764.7-201ENST00000593779 1081 ntBASIC22.48■■□□□ 1.19
CCDC122Q5T0U0 KRTAP5-AS1-201ENST00000424148 2265 ntTSL 2 BASIC22.48■■□□□ 1.19
CCDC122Q5T0U0 PROSER2-205ENST00000622831 1646 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.48■■□□□ 1.19
CCDC122Q5T0U0 ZBTB7A-201ENST00000322357 5422 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.48■■□□□ 1.19
CCDC122Q5T0U0 SMPD5-201ENST00000528912 1390 ntTSL 5 BASIC22.48■■□□□ 1.19
CCDC122Q5T0U0 DDIT4-201ENST00000307365 1748 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.48■■□□□ 1.19
CCDC122Q5T0U0 SOBP-201ENST00000317357 5245 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.48■■□□□ 1.19
CCDC122Q5T0U0 EIPR1-206ENST00000443925 1771 ntTSL 3 BASIC22.48■■□□□ 1.19
CCDC122Q5T0U0 APBB3-203ENST00000357560 2218 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC22.47■■□□□ 1.19
CCDC122Q5T0U0 DLG3-201ENST00000194900 6112 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.47■■□□□ 1.19
CCDC122Q5T0U0 RGMA-210ENST00000557301 1929 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.47■■□□□ 1.19
CCDC122Q5T0U0 TMED4-203ENST00000457408 2322 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.47■■□□□ 1.19
CCDC122Q5T0U0 WEE1-202ENST00000450114 2799 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.47■■□□□ 1.19
CCDC122Q5T0U0 MAPT-203ENST00000340799 5724 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.47■■□□□ 1.19
CCDC122Q5T0U0 IL20RA-202ENST00000367746 1244 ntTSL 2 BASIC22.47■■□□□ 1.19
CCDC122Q5T0U0 HRH3-203ENST00000611492 900 ntTSL 1 (best) BASIC22.47■■□□□ 1.19
CCDC122Q5T0U0 AC092902.2-206ENST00000625484 846 ntTSL 5 BASIC22.47■■□□□ 1.19
CCDC122Q5T0U0 EXOG-203ENST00000422077 1317 ntTSL 2 BASIC22.47■■□□□ 1.19
CCDC122Q5T0U0 UGP2-201ENST00000337130 2338 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.47■■□□□ 1.19
CCDC122Q5T0U0 TTYH1-202ENST00000376530 1885 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.47■■□□□ 1.19
CCDC122Q5T0U0 CERS1-202ENST00000542296 1947 ntTSL 1 (best) BASIC22.47■■□□□ 1.19
CCDC122Q5T0U0 FAM43B-201ENST00000332947 2572 ntAPPRIS P1 BASIC22.46■■□□□ 1.19
CCDC122Q5T0U0 CBWD3-202ENST00000377342 1665 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.46■■□□□ 1.19
CCDC122Q5T0U0 LAYN-204ENST00000525126 1763 ntTSL 5 BASIC22.46■■□□□ 1.19
CCDC122Q5T0U0 MUS81-201ENST00000308110 2392 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.46■■□□□ 1.19
CCDC122Q5T0U0 FSTL3-201ENST00000166139 2542 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.46■■□□□ 1.19
CCDC122Q5T0U0 AL357078.1-201ENST00000448344 310 ntTSL 4 BASIC22.46■■□□□ 1.19
CCDC122Q5T0U0 SLC30A5-201ENST00000380860 1317 ntTSL 1 (best) BASIC22.46■■□□□ 1.19
CCDC122Q5T0U0 SP3-208ENST00000640958 2142 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.46■■□□□ 1.19
CCDC122Q5T0U0 CBWD3-201ENST00000360171 2165 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.46■■□□□ 1.19
CCDC122Q5T0U0 MYL5-206ENST00000506838 2956 ntTSL 2 BASIC22.46■■□□□ 1.19
CCDC122Q5T0U0 HDGFL2-208ENST00000616600 2281 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.46■■□□□ 1.19
CCDC122Q5T0U0 TBL1Y-201ENST00000346432 2312 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.46■■□□□ 1.19
CCDC122Q5T0U0 RUSC1-AS1-203ENST00000450199 1636 ntTSL 1 (best) BASIC22.46■■□□□ 1.19
CCDC122Q5T0U0 DUSP15-201ENST00000278979 1732 ntTSL 2 BASIC22.45■■□□□ 1.19
CCDC122Q5T0U0 PGAM5-204ENST00000543955 1773 ntTSL 2 BASIC22.45■■□□□ 1.19
CCDC122Q5T0U0 SUSD1-203ENST00000374264 2754 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.45■■□□□ 1.19
CCDC122Q5T0U0 AC007128.1-201ENST00000424460 1853 ntTSL 5 BASIC22.45■■□□□ 1.19
CCDC122Q5T0U0 C14orf79-207ENST00000550614 1912 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.45■■□□□ 1.18
CCDC122Q5T0U0 MYO1D-213ENST00000583621 1916 ntTSL 1 (best) BASIC22.45■■□□□ 1.18
CCDC122Q5T0U0 PABPC1L-202ENST00000217074 1263 ntTSL 5 BASIC22.45■■□□□ 1.18
CCDC122Q5T0U0 HM13-AS1-201ENST00000412178 489 ntTSL 3 BASIC22.45■■□□□ 1.18
CCDC122Q5T0U0 AL355987.3-201ENST00000456614 735 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC22.45■■□□□ 1.18
CCDC122Q5T0U0 SERTAD4-AS1-202ENST00000475406 591 ntTSL 2 BASIC22.45■■□□□ 1.18
CCDC122Q5T0U0 GSG1L-202ENST00000395724 1399 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.45■■□□□ 1.18
CCDC122Q5T0U0 NEURL4-203ENST00000570460 4890 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.45■■□□□ 1.18
CCDC122Q5T0U0 LRRC3B-201ENST00000396641 1696 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.45■■□□□ 1.18
CCDC122Q5T0U0 SPOCK3-204ENST00000502330 2180 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.45■■□□□ 1.18
CCDC122Q5T0U0 ABLIM2-204ENST00000407564 2291 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.45■■□□□ 1.18
CCDC122Q5T0U0 IQCJ-SCHIP1-204ENST00000485419 2445 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.45■■□□□ 1.18
CCDC122Q5T0U0 EZH2-201ENST00000320356 2639 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC22.44■■□□□ 1.18
CCDC122Q5T0U0 VGF-201ENST00000249330 2575 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.44■■□□□ 1.18
CCDC122Q5T0U0 ZNF622-201ENST00000308683 1699 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.44■■□□□ 1.18
CCDC122Q5T0U0 PIF1-202ENST00000333425 2278 ntTSL 1 (best) BASIC22.44■■□□□ 1.18
CCDC122Q5T0U0 NRXN1-202ENST00000342183 3315 ntTSL 1 (best) BASIC22.44■■□□□ 1.18
CCDC122Q5T0U0 CHRNA3-202ENST00000348639 2030 ntTSL 1 (best) BASIC22.44■■□□□ 1.18
CCDC122Q5T0U0 TDRD10-202ENST00000368482 2331 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.44■■□□□ 1.18
CCDC122Q5T0U0 FGF7P6-201ENST00000377614 1890 ntTSL 1 (best) BASIC22.44■■□□□ 1.18
CCDC122Q5T0U0 CDKN2B-202ENST00000380142 859 ntTSL 1 (best) BASIC22.44■■□□□ 1.18
CCDC122Q5T0U0 AC009237.3-201ENST00000393279 1427 ntBASIC22.44■■□□□ 1.18
CCDC122Q5T0U0 STX5-203ENST00000394690 1568 ntTSL 5 BASIC22.44■■□□□ 1.18
CCDC122Q5T0U0 PLEKHB1-204ENST00000398494 2061 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.44■■□□□ 1.18
CCDC122Q5T0U0 IFNGR2-203ENST00000405436 1684 ntTSL 5 BASIC22.44■■□□□ 1.18
CCDC122Q5T0U0 ERF-202ENST00000440177 2032 ntTSL 2 BASIC22.44■■□□□ 1.18
CCDC122Q5T0U0 ZGPAT-206ENST00000448100 1881 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.44■■□□□ 1.18
CCDC122Q5T0U0 AICDA-202ENST00000537228 667 ntTSL 5 BASIC22.44■■□□□ 1.18
CCDC122Q5T0U0 CYP1B1-207ENST00000614273 2174 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.44■■□□□ 1.18
CCDC122Q5T0U0 MADCAM1-208ENST00000621286 1203 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.44■■□□□ 1.18
CCDC122Q5T0U0 PBX1-222ENST00000627490 1769 ntTSL 2 BASIC22.44■■□□□ 1.18
CCDC122Q5T0U0 SCN1B-206ENST00000638536 1600 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.44■■□□□ 1.18
CCDC122Q5T0U0 BX664615.2-202ENST00000639056 1888 ntTSL 1 (best) BASIC22.44■■□□□ 1.18
CCDC122Q5T0U0 PLCD1-201ENST00000334661 2769 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.44■■□□□ 1.18
CCDC122Q5T0U0 AL391422.3-201ENST00000603791 2761 ntBASIC22.44■■□□□ 1.18
CCDC122Q5T0U0 ESR2-212ENST00000556275 2695 ntTSL 2 BASIC22.44■■□□□ 1.18
CCDC122Q5T0U0 PRELID3B-201ENST00000355937 2626 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.44■■□□□ 1.18
CCDC122Q5T0U0 GATA5-201ENST00000252997 2595 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.44■■□□□ 1.18
CCDC122Q5T0U0 IRF7-205ENST00000397574 1968 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.43■■□□□ 1.18
CCDC122Q5T0U0 AC099791.1-201ENST00000416440 715 ntBASIC22.43■■□□□ 1.18
CCDC122Q5T0U0 CAMTA1-208ENST00000473578 567 ntTSL 1 (best) BASIC22.43■■□□□ 1.18
CCDC122Q5T0U0 ACAP1-206ENST00000571471 320 ntTSL 2 BASIC22.43■■□□□ 1.18
CCDC122Q5T0U0 BAG1-212ENST00000641048 1038 ntAPPRIS P3 BASIC22.43■■□□□ 1.18
CCDC122Q5T0U0 ADAP1-218ENST00000617043 1946 ntTSL 2 BASIC22.43■■□□□ 1.18
CCDC122Q5T0U0 RCN3-201ENST00000270645 1859 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.43■■□□□ 1.18
CCDC122Q5T0U0 LHX6-201ENST00000340587 3457 ntTSL 1 (best) BASIC22.43■■□□□ 1.18
CCDC122Q5T0U0 PAQR9-201ENST00000340634 2452 ntAPPRIS P1 BASIC22.42■■□□□ 1.18
CCDC122Q5T0U0 CCDC91-207ENST00000539107 2440 ntTSL 5 BASIC22.42■■□□□ 1.18
CCDC122Q5T0U0 UAP1-201ENST00000271469 2377 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC22.42■■□□□ 1.18
CCDC122Q5T0U0 ZNF511-202ENST00000361518 1520 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.42■■□□□ 1.18
CCDC122Q5T0U0 BRD9-202ENST00000467963 2156 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.42■■□□□ 1.18
CCDC122Q5T0U0 CCDC107-203ENST00000378407 899 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.42■■□□□ 1.18
CCDC122Q5T0U0 ZEB1-AS1-201ENST00000423714 456 ntTSL 3 BASIC22.42■■□□□ 1.18
CCDC122Q5T0U0 ZNF696-205ENST00000521537 705 ntTSL 2 BASIC22.42■■□□□ 1.18
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 55.7 ms