Protein–RNA interactions for Protein: Q5MNV8

FBXO47, F-box only protein 47, humanhuman

Predictions only

Length 452 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
FBXO47Q5MNV8 PRR20A-201ENST00000377931 1847 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.87■■□□□ 1.25
FBXO47Q5MNV8 PRR20E-201ENST00000434815 1847 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.87■■□□□ 1.25
FBXO47Q5MNV8 PRR20D-201ENST00000452123 1847 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.87■■□□□ 1.25
FBXO47Q5MNV8 PRR20C-201ENST00000544357 1847 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.87■■□□□ 1.25
FBXO47Q5MNV8 PRR20C-202ENST00000614894 1847 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.87■■□□□ 1.25
FBXO47Q5MNV8 HERC2P8-204ENST00000567073 1988 ntTSL 5 BASIC22.87■■□□□ 1.25
FBXO47Q5MNV8 CCNG2-204ENST00000502280 1459 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.86■■□□□ 1.25
FBXO47Q5MNV8 PRAF2-202ENST00000553851 1334 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.86■■□□□ 1.25
FBXO47Q5MNV8 ARL2BP-201ENST00000219204 2130 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.86■■□□□ 1.25
FBXO47Q5MNV8 PRDX1-201ENST00000262746 1234 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.86■■□□□ 1.25
FBXO47Q5MNV8 INS-203ENST00000397262 639 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.86■■□□□ 1.25
FBXO47Q5MNV8 AC098590.1-201ENST00000468126 897 ntBASIC22.86■■□□□ 1.25
FBXO47Q5MNV8 CDV3P1-201ENST00000471403 739 ntBASIC22.86■■□□□ 1.25
FBXO47Q5MNV8 FBXL8-203ENST00000518148 1054 ntTSL 2 BASIC22.86■■□□□ 1.25
FBXO47Q5MNV8 MMAB-206ENST00000540016 945 ntTSL 3 BASIC22.86■■□□□ 1.25
FBXO47Q5MNV8 PLEKHB1-216ENST00000543085 632 ntTSL 3 BASIC22.86■■□□□ 1.25
FBXO47Q5MNV8 AC092143.2-201ENST00000554623 985 ntTSL 3 BASIC22.86■■□□□ 1.25
FBXO47Q5MNV8 AC100791.3-201ENST00000617619 330 ntBASIC22.86■■□□□ 1.25
FBXO47Q5MNV8 FGF13-208ENST00000626909 1039 ntTSL 2 BASIC22.86■■□□□ 1.25
FBXO47Q5MNV8 NEK6-214ENST00000545174 2573 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.86■■□□□ 1.25
FBXO47Q5MNV8 CENPS-CORT-201ENST00000400900 1469 ntTSL 2 BASIC22.85■■□□□ 1.25
FBXO47Q5MNV8 ACSF2-207ENST00000504392 1881 ntTSL 2 BASIC22.85■■□□□ 1.25
FBXO47Q5MNV8 GRK4-204ENST00000503518 2136 ntTSL 1 (best) BASIC22.85■■□□□ 1.25
FBXO47Q5MNV8 FAM99A-202ENST00000538190 1989 ntBASIC22.85■■□□□ 1.25
FBXO47Q5MNV8 RNASET2-203ENST00000366855 1417 ntTSL 5 BASIC22.85■■□□□ 1.25
FBXO47Q5MNV8 ZNF584-203ENST00000593920 2187 ntTSL 2 BASIC22.85■■□□□ 1.25
FBXO47Q5MNV8 GAR1-201ENST00000226796 1224 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.85■■□□□ 1.25
FBXO47Q5MNV8 MAGI2-AS3-211ENST00000451809 707 ntTSL 3 BASIC22.85■■□□□ 1.25
FBXO47Q5MNV8 RPS2P52-201ENST00000469610 820 ntBASIC22.85■■□□□ 1.25
FBXO47Q5MNV8 CYP2T3P-201ENST00000601990 817 ntBASIC22.85■■□□□ 1.25
FBXO47Q5MNV8 SLC25A39-212ENST00000590194 1542 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC22.85■■□□□ 1.25
FBXO47Q5MNV8 ACAT1-201ENST00000265838 1761 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.85■■□□□ 1.25
FBXO47Q5MNV8 PXYLP1-203ENST00000502783 2066 ntTSL 2 BASIC22.85■■□□□ 1.25
FBXO47Q5MNV8 QTRT1-201ENST00000250237 1317 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.84■■□□□ 1.25
FBXO47Q5MNV8 DUSP23-201ENST00000368107 756 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.84■■□□□ 1.25
FBXO47Q5MNV8 ANKRD39-201ENST00000393537 976 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.84■■□□□ 1.25
FBXO47Q5MNV8 AC008667.2-201ENST00000504413 469 ntTSL 3 BASIC22.84■■□□□ 1.25
FBXO47Q5MNV8 WDR88-201ENST00000355868 1718 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC22.84■■□□□ 1.25
FBXO47Q5MNV8 TMEM235-205ENST00000586400 2272 ntTSL 1 (best) BASIC22.84■■□□□ 1.25
FBXO47Q5MNV8 C1QL3-201ENST00000298943 2493 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.84■■□□□ 1.25
FBXO47Q5MNV8 AUH-202ENST00000375731 1577 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.84■■□□□ 1.25
FBXO47Q5MNV8 TERF1-202ENST00000276603 1677 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC22.84■■□□□ 1.25
FBXO47Q5MNV8 NARF-205ENST00000412079 1760 ntTSL 5 BASIC22.84■■□□□ 1.25
FBXO47Q5MNV8 SMPD2-201ENST00000258052 1645 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.83■■□□□ 1.25
FBXO47Q5MNV8 UBE2I-205ENST00000402301 1708 ntTSL 1 (best) BASIC22.83■■□□□ 1.25
FBXO47Q5MNV8 SPAST-204ENST00000621856 1715 ntTSL 1 (best) BASIC22.83■■□□□ 1.25
FBXO47Q5MNV8 TLX2-201ENST00000233638 2136 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.83■■□□□ 1.25
FBXO47Q5MNV8 SYNE2-201ENST00000341472 1132 ntTSL 1 (best) BASIC22.83■■□□□ 1.25
FBXO47Q5MNV8 NENF-201ENST00000366988 949 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.83■■□□□ 1.25
FBXO47Q5MNV8 UNC93B5-201ENST00000530315 699 ntBASIC22.83■■□□□ 1.25
FBXO47Q5MNV8 ACYP2-207ENST00000606082 713 ntTSL 5 BASIC22.83■■□□□ 1.25
FBXO47Q5MNV8 ARMC10-202ENST00000323716 2635 ntTSL 1 (best) BASIC22.83■■□□□ 1.25
FBXO47Q5MNV8 TMEM204-201ENST00000253934 1686 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.83■■□□□ 1.24
FBXO47Q5MNV8 HSF2BP-201ENST00000291560 1899 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.83■■□□□ 1.24
FBXO47Q5MNV8 LMF1-202ENST00000543238 2103 ntTSL 2 BASIC22.82■■□□□ 1.24
FBXO47Q5MNV8 PLEKHA8-208ENST00000622102 2140 ntTSL 5 BASIC22.82■■□□□ 1.24
FBXO47Q5MNV8 MAGI2-217ENST00000629359 6704 ntTSL 5 BASIC22.82■■□□□ 1.24
FBXO47Q5MNV8 PDE9A-212ENST00000398234 1783 ntTSL 1 (best) BASIC22.82■■□□□ 1.24
FBXO47Q5MNV8 GNB4-204ENST00000468623 1360 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.82■■□□□ 1.24
FBXO47Q5MNV8 RAC1-202ENST00000356142 907 ntTSL 1 (best) BASIC22.82■■□□□ 1.24
FBXO47Q5MNV8 TMEM240-202ENST00000425828 717 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.82■■□□□ 1.24
FBXO47Q5MNV8 IRX5-204ENST00000560154 879 ntTSL 5 BASIC22.82■■□□□ 1.24
FBXO47Q5MNV8 AC006058.3-201ENST00000606217 1069 ntBASIC22.82■■□□□ 1.24
FBXO47Q5MNV8 IRX5-205ENST00000620085 881 ntTSL 1 (best) BASIC22.82■■□□□ 1.24
FBXO47Q5MNV8 TPRN-202ENST00000409012 2718 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.82■■□□□ 1.24
FBXO47Q5MNV8 AC092384.1-201ENST00000378347 1812 ntTSL 2 BASIC22.82■■□□□ 1.24
FBXO47Q5MNV8 ADAM22-209ENST00000439864 2576 ntTSL 1 (best) BASIC22.82■■□□□ 1.24
FBXO47Q5MNV8 RTCA-201ENST00000260563 1534 ntTSL 1 (best) BASIC22.82■■□□□ 1.24
FBXO47Q5MNV8 PDCD2-203ENST00000443345 1897 ntTSL 1 (best) BASIC22.81■■□□□ 1.24
FBXO47Q5MNV8 CPE-201ENST00000402744 2421 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.81■■□□□ 1.24
FBXO47Q5MNV8 NIPSNAP1-201ENST00000216121 2237 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.81■■□□□ 1.24
FBXO47Q5MNV8 CCDC154-201ENST00000389176 2212 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC22.81■■□□□ 1.24
FBXO47Q5MNV8 ANKHD1-205ENST00000394723 2135 ntTSL 1 (best) BASIC22.81■■□□□ 1.24
FBXO47Q5MNV8 AC012676.1-201ENST00000574705 1949 ntBASIC22.81■■□□□ 1.24
FBXO47Q5MNV8 ANKRD19P-205ENST00000473204 2370 ntTSL 1 (best) BASIC22.81■■□□□ 1.24
FBXO47Q5MNV8 CDC42EP5-201ENST00000301200 864 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.81■■□□□ 1.24
FBXO47Q5MNV8 UNC50-201ENST00000357765 1143 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.81■■□□□ 1.24
FBXO47Q5MNV8 C20orf196-202ENST00000378979 585 ntTSL 2 BASIC22.81■■□□□ 1.24
FBXO47Q5MNV8 GCSHP5-201ENST00000443090 522 ntBASIC22.81■■□□□ 1.24
FBXO47Q5MNV8 GATS-209ENST00000454084 1030 ntTSL 3 BASIC22.81■■□□□ 1.24
FBXO47Q5MNV8 CFL1-211ENST00000531407 1062 ntTSL 2 BASIC22.81■■□□□ 1.24
FBXO47Q5MNV8 BMP2K-204ENST00000502871 3195 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.81■■□□□ 1.24
FBXO47Q5MNV8 B4GALNT1-203ENST00000449184 1633 ntTSL 2 BASIC22.81■■□□□ 1.24
FBXO47Q5MNV8 AC133561.1-201ENST00000568600 2415 ntBASIC22.81■■□□□ 1.24
FBXO47Q5MNV8 RELL2-207ENST00000521367 1780 ntTSL 5 BASIC22.81■■□□□ 1.24
FBXO47Q5MNV8 C12orf76-203ENST00000546651 1755 ntTSL 2 BASIC22.81■■□□□ 1.24
FBXO47Q5MNV8 IL17RE-201ENST00000383814 2704 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.81■■□□□ 1.24
FBXO47Q5MNV8 TPD52L1-201ENST00000304877 1468 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.8■■□□□ 1.24
FBXO47Q5MNV8 MRPL40-201ENST00000333130 1387 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.8■■□□□ 1.24
FBXO47Q5MNV8 ARL13B-205ENST00000471138 2206 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.8■■□□□ 1.24
FBXO47Q5MNV8 VMO1-204ENST00000441199 741 ntTSL 2 BASIC22.8■■□□□ 1.24
FBXO47Q5MNV8 NCBP2-207ENST00000452404 1133 ntTSL 2 BASIC22.8■■□□□ 1.24
FBXO47Q5MNV8 AC128676.1-201ENST00000454392 318 ntBASIC22.8■■□□□ 1.24
FBXO47Q5MNV8 LCN6-203ENST00000476567 1015 ntTSL 1 (best) BASIC22.8■■□□□ 1.24
FBXO47Q5MNV8 HLA-C-201ENST00000376228 1536 ntAPPRIS P2 BASIC22.8■■□□□ 1.24
FBXO47Q5MNV8 LINC01089-202ENST00000429892 1521 ntTSL 1 (best) BASIC22.8■■□□□ 1.24
FBXO47Q5MNV8 RBBP7-202ENST00000380084 2036 ntTSL 2 BASIC22.8■■□□□ 1.24
FBXO47Q5MNV8 MXRA8-203ENST00000445648 2001 ntTSL 2 BASIC22.8■■□□□ 1.24
FBXO47Q5MNV8 KAT5-201ENST00000341318 2296 ntTSL 1 (best) BASIC22.8■■□□□ 1.24
FBXO47Q5MNV8 KCNK4-201ENST00000394525 1673 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.8■■□□□ 1.24
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 19.2 ms