Protein–RNA interactions for Protein: Q5JTN6

WDR38, WD repeat-containing protein 38, humanhuman

Predictions only

Length 314 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
WDR38Q5JTN6 C20orf144-201ENST00000375222 571 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.29■□□□□ 0.52
WDR38Q5JTN6 AC091305.1-201ENST00000479476 895 ntBASIC18.29■□□□□ 0.52
WDR38Q5JTN6 AL390816.2-201ENST00000554252 737 ntTSL 3 BASIC18.29■□□□□ 0.52
WDR38Q5JTN6 ACAP1-206ENST00000571471 320 ntTSL 2 BASIC18.29■□□□□ 0.52
WDR38Q5JTN6 MCRIP1-205ENST00000572645 1038 ntTSL 1 (best) BASIC18.29■□□□□ 0.52
WDR38Q5JTN6 AL136967.2-201ENST00000623968 743 ntBASIC18.29■□□□□ 0.52
WDR38Q5JTN6 MGAT3-201ENST00000341184 5062 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.29■□□□□ 0.52
WDR38Q5JTN6 GRINA-201ENST00000313269 1968 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.29■□□□□ 0.52
WDR38Q5JTN6 SP3-208ENST00000640958 2142 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.29■□□□□ 0.52
WDR38Q5JTN6 CYP27A1-201ENST00000258415 2286 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.29■□□□□ 0.52
WDR38Q5JTN6 B4GALT5-201ENST00000371711 4722 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.29■□□□□ 0.52
WDR38Q5JTN6 AC121338.2-201ENST00000622535 1744 ntBASIC18.29■□□□□ 0.52
WDR38Q5JTN6 ADRM1-204ENST00000491935 1530 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.28■□□□□ 0.52
WDR38Q5JTN6 CADPS-202ENST00000357948 5190 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.28■□□□□ 0.52
WDR38Q5JTN6 SP9-201ENST00000394967 2554 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.28■□□□□ 0.52
WDR38Q5JTN6 LRIG1-201ENST00000273261 5273 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.28■□□□□ 0.52
WDR38Q5JTN6 LIN7B-202ENST00000391864 582 ntTSL 3 BASIC18.28■□□□□ 0.52
WDR38Q5JTN6 DNAAF3-207ENST00000527223 2228 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC18.28■□□□□ 0.52
WDR38Q5JTN6 DUSP15-201ENST00000278979 1732 ntTSL 2 BASIC18.28■□□□□ 0.52
WDR38Q5JTN6 EGFL7-201ENST00000308874 1747 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.28■□□□□ 0.52
WDR38Q5JTN6 FDXR-201ENST00000293195 1875 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC18.28■□□□□ 0.52
WDR38Q5JTN6 MLST8-202ENST00000382450 1861 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC18.28■□□□□ 0.52
WDR38Q5JTN6 MOK-226ENST00000522874 1890 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.28■□□□□ 0.52
WDR38Q5JTN6 MLST8-215ENST00000564088 1861 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC18.28■□□□□ 0.52
WDR38Q5JTN6 NCKAP1-201ENST00000360982 4989 ntTSL 1 (best) BASIC18.28■□□□□ 0.52
WDR38Q5JTN6 PLEKHG4-201ENST00000360461 6782 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC18.28■□□□□ 0.52
WDR38Q5JTN6 RASA4CP-201ENST00000424092 1398 ntBASIC18.28■□□□□ 0.52
WDR38Q5JTN6 HOXA11-AS-204ENST00000522674 1549 ntTSL 1 (best) BASIC18.28■□□□□ 0.52
WDR38Q5JTN6 PLSCR3-201ENST00000324822 1689 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.28■□□□□ 0.52
WDR38Q5JTN6 ANKRD53-204ENST00000457410 1671 ntTSL 5 BASIC18.28■□□□□ 0.52
WDR38Q5JTN6 FAM19A4-201ENST00000295569 2292 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.28■□□□□ 0.52
WDR38Q5JTN6 PANK1-201ENST00000307534 6976 ntTSL 1 (best) BASIC18.27■□□□□ 0.52
WDR38Q5JTN6 CCDC107-205ENST00000421582 1324 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC18.27■□□□□ 0.52
WDR38Q5JTN6 DTX3-201ENST00000337737 2029 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC18.27■□□□□ 0.52
WDR38Q5JTN6 LAMTOR1-201ENST00000278671 1179 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.27■□□□□ 0.52
WDR38Q5JTN6 WDR4-202ENST00000398208 2122 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.27■□□□□ 0.52
WDR38Q5JTN6 MYO1D-213ENST00000583621 1916 ntTSL 1 (best) BASIC18.27■□□□□ 0.51
WDR38Q5JTN6 SPOCK3-217ENST00000511269 1768 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC18.27■□□□□ 0.51
WDR38Q5JTN6 CNTNAP3B-212ENST00000617422 2170 ntTSL 2 BASIC18.27■□□□□ 0.51
WDR38Q5JTN6 SCN1B-206ENST00000638536 1600 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.27■□□□□ 0.51
WDR38Q5JTN6 CCNE1-201ENST00000262643 2043 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.27■□□□□ 0.51
WDR38Q5JTN6 HSD11B1L-201ENST00000301382 1457 ntTSL 1 (best) BASIC18.26■□□□□ 0.51
WDR38Q5JTN6 ASCL2-201ENST00000331289 1852 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.26■□□□□ 0.51
WDR38Q5JTN6 DEDD2-201ENST00000336034 1882 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC18.26■□□□□ 0.51
WDR38Q5JTN6 DGKZ-214ENST00000527911 3337 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.26■□□□□ 0.51
WDR38Q5JTN6 YAP1-202ENST00000345877 5284 ntTSL 5 BASIC18.26■□□□□ 0.51
WDR38Q5JTN6 CYP21A1P-201ENST00000342991 1971 ntTSL 3 BASIC18.26■□□□□ 0.51
WDR38Q5JTN6 MAMSTR-202ENST00000356751 1825 ntTSL 2 BASIC18.26■□□□□ 0.51
WDR38Q5JTN6 PLEKHB1-204ENST00000398494 2061 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC18.26■□□□□ 0.51
WDR38Q5JTN6 AFDN-202ENST00000351017 5823 ntTSL 5 BASIC18.26■□□□□ 0.51
WDR38Q5JTN6 GRAMD4P2-201ENST00000423297 1097 ntBASIC18.26■□□□□ 0.51
WDR38Q5JTN6 AICDA-202ENST00000537228 667 ntTSL 5 BASIC18.26■□□□□ 0.51
WDR38Q5JTN6 MPST-208ENST00000628507 698 ntTSL 5 BASIC18.26■□□□□ 0.51
WDR38Q5JTN6 PACRGL-227ENST00000513459 1773 ntTSL 5 BASIC18.26■□□□□ 0.51
WDR38Q5JTN6 FSTL3-201ENST00000166139 2542 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.26■□□□□ 0.51
WDR38Q5JTN6 KCNJ12-202ENST00000583088 5425 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.26■□□□□ 0.51
WDR38Q5JTN6 ZNF316-201ENST00000382252 5392 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.26■□□□□ 0.51
WDR38Q5JTN6 TMEM121B-201ENST00000331437 4954 ntAPPRIS P3 BASIC18.26■□□□□ 0.51
WDR38Q5JTN6 PITPNB-205ENST00000455418 2963 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC18.26■□□□□ 0.51
WDR38Q5JTN6 ARPP19-201ENST00000249822 5301 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.26■□□□□ 0.51
WDR38Q5JTN6 ZBED3-201ENST00000255198 6172 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.26■□□□□ 0.51
WDR38Q5JTN6 BCAM-201ENST00000270233 2402 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.25■□□□□ 0.51
WDR38Q5JTN6 CYP1B1-207ENST00000614273 2174 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.25■□□□□ 0.51
WDR38Q5JTN6 RAB24-201ENST00000303251 1311 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.25■□□□□ 0.51
WDR38Q5JTN6 AC005224.4-201ENST00000583262 1652 ntBASIC18.25■□□□□ 0.51
WDR38Q5JTN6 CHRNA3-202ENST00000348639 2030 ntTSL 1 (best) BASIC18.25■□□□□ 0.51
WDR38Q5JTN6 MARCH9-201ENST00000266643 2982 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.25■□□□□ 0.51
WDR38Q5JTN6 CLN3-207ENST00000395653 1430 ntTSL 5 BASIC18.25■□□□□ 0.51
WDR38Q5JTN6 CHST1-201ENST00000308064 2718 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.25■□□□□ 0.51
WDR38Q5JTN6 TERF2IP-201ENST00000300086 2118 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.25■□□□□ 0.51
WDR38Q5JTN6 FGF2-202ENST00000608478 3880 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.25■□□□□ 0.51
WDR38Q5JTN6 BLCAP-208ENST00000414542 2205 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC18.25■□□□□ 0.51
WDR38Q5JTN6 ELOA3B-201ENST00000611323 1641 ntAPPRIS P1 BASIC18.25■□□□□ 0.51
WDR38Q5JTN6 ELOA3D-201ENST00000620881 1641 ntAPPRIS P1 BASIC18.25■□□□□ 0.51
WDR38Q5JTN6 AP003419.1-201ENST00000535922 470 ntTSL 3 BASIC18.25■□□□□ 0.51
WDR38Q5JTN6 OTUB1-212ENST00000543988 1259 ntTSL 1 (best) BASIC18.25■□□□□ 0.51
WDR38Q5JTN6 AL355102.2-201ENST00000553811 600 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.25■□□□□ 0.51
WDR38Q5JTN6 AC012313.1-203ENST00000597980 570 ntTSL 4 BASIC18.25■□□□□ 0.51
WDR38Q5JTN6 NDUFAF1-201ENST00000260361 1461 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.25■□□□□ 0.51
WDR38Q5JTN6 RARG-204ENST00000543726 1779 ntTSL 2 BASIC18.25■□□□□ 0.51
WDR38Q5JTN6 ECHDC2-221ENST00000536120 1446 ntTSL 3 BASIC18.24■□□□□ 0.51
WDR38Q5JTN6 NTN4-207ENST00000553059 1818 ntTSL 1 (best) BASIC18.24■□□□□ 0.51
WDR38Q5JTN6 NRG2-204ENST00000358522 2559 ntAPPRIS P5 TSL 1 (best) BASIC18.24■□□□□ 0.51
WDR38Q5JTN6 CTU2-210ENST00000567949 1905 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.24■□□□□ 0.51
WDR38Q5JTN6 ORMDL1-202ENST00000392349 1137 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.24■□□□□ 0.51
WDR38Q5JTN6 LHPP-203ENST00000392757 840 ntTSL 3 BASIC18.24■□□□□ 0.51
WDR38Q5JTN6 FEZ1-205ENST00000524435 750 ntTSL 2 BASIC18.24■□□□□ 0.51
WDR38Q5JTN6 AC105233.4-201ENST00000642045 216 ntBASIC18.24■□□□□ 0.51
WDR38Q5JTN6 APBB3-203ENST00000357560 2218 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC18.24■□□□□ 0.51
WDR38Q5JTN6 DUSP28-201ENST00000343217 1555 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.24■□□□□ 0.51
WDR38Q5JTN6 TMEM163-201ENST00000281924 1892 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.24■□□□□ 0.51
WDR38Q5JTN6 IRF7-201ENST00000330243 1992 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC18.24■□□□□ 0.51
WDR38Q5JTN6 AP000679.1-202ENST00000319763 2081 ntTSL 1 (best) BASIC18.24■□□□□ 0.51
WDR38Q5JTN6 HDAC2-201ENST00000368632 2084 ntTSL 2 BASIC18.24■□□□□ 0.51
WDR38Q5JTN6 SUSD1-203ENST00000374264 2754 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.24■□□□□ 0.51
WDR38Q5JTN6 GSR-204ENST00000537535 1323 ntTSL 1 (best) BASIC18.23■□□□□ 0.51
WDR38Q5JTN6 MBNL3-202ENST00000370844 1643 ntTSL 1 (best) BASIC18.23■□□□□ 0.51
WDR38Q5JTN6 SLC46A3-202ENST00000380814 2121 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC18.23■□□□□ 0.51
WDR38Q5JTN6 TDRD10-202ENST00000368482 2331 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.23■□□□□ 0.51
WDR38Q5JTN6 UBC-201ENST00000339647 2688 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.23■□□□□ 0.51
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 11.6 ms