Protein–RNA interactions for Protein: Q5JSH3

WDR44, WD repeat-containing protein 44, humanhuman

Predictions only

Length 913 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
WDR44Q5JSH3 KRT19P1-201ENST00000405746 1186 ntBASIC22.58■■□□□ 1.21
WDR44Q5JSH3 AC010141.2-201ENST00000452426 721 ntBASIC22.58■■□□□ 1.21
WDR44Q5JSH3 ABHD14A-202ENST00000458031 1113 ntTSL 5 BASIC22.58■■□□□ 1.21
WDR44Q5JSH3 YIF1A-205ENST00000471387 854 ntTSL 5 BASIC22.58■■□□□ 1.21
WDR44Q5JSH3 TK2-208ENST00000545043 1120 ntTSL 2 BASIC22.58■■□□□ 1.21
WDR44Q5JSH3 AC120498.10-201ENST00000621827 505 ntBASIC22.58■■□□□ 1.21
WDR44Q5JSH3 ADCK2-201ENST00000072869 2377 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.58■■□□□ 1.21
WDR44Q5JSH3 ARL6IP4-220ENST00000543566 1591 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.58■■□□□ 1.2
WDR44Q5JSH3 RASGEF1C-201ENST00000361132 2243 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.58■■□□□ 1.2
WDR44Q5JSH3 CPNE9-203ENST00000383832 2068 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.58■■□□□ 1.2
WDR44Q5JSH3 HAND1-201ENST00000231121 1738 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.57■■□□□ 1.2
WDR44Q5JSH3 DTYMK-201ENST00000305784 1232 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.57■■□□□ 1.2
WDR44Q5JSH3 UBE2D3-201ENST00000321805 1087 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC22.57■■□□□ 1.2
WDR44Q5JSH3 TMEM54-202ENST00000373463 999 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.57■■□□□ 1.2
WDR44Q5JSH3 MPV17L-202ENST00000396385 1037 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.57■■□□□ 1.2
WDR44Q5JSH3 IDH2-203ENST00000559482 1278 ntTSL 5 BASIC22.57■■□□□ 1.2
WDR44Q5JSH3 AC110285.4-201ENST00000572590 424 ntTSL 3 BASIC22.57■■□□□ 1.2
WDR44Q5JSH3 AC093762.3-201ENST00000641918 318 ntAPPRIS P1 BASIC22.57■■□□□ 1.2
WDR44Q5JSH3 ZNF622-201ENST00000308683 1699 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.57■■□□□ 1.2
WDR44Q5JSH3 CCDC185-201ENST00000366875 2054 ntAPPRIS P1 BASIC22.57■■□□□ 1.2
WDR44Q5JSH3 MAP3K3-201ENST00000361357 4818 ntTSL 1 (best) BASIC22.57■■□□□ 1.2
WDR44Q5JSH3 CHST8-202ENST00000434302 2225 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.57■■□□□ 1.2
WDR44Q5JSH3 NAPEPLD-208ENST00000427257 1822 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.57■■□□□ 1.2
WDR44Q5JSH3 HNF4A-205ENST00000443598 1603 ntTSL 1 (best) BASIC22.57■■□□□ 1.2
WDR44Q5JSH3 ARHGEF7-202ENST00000317133 4361 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.57■■□□□ 1.2
WDR44Q5JSH3 MOGS-202ENST00000409065 2668 ntTSL 5 BASIC22.56■■□□□ 1.2
WDR44Q5JSH3 BCL11B-203ENST00000443726 2599 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.56■■□□□ 1.2
WDR44Q5JSH3 C7orf25-201ENST00000350427 2451 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.56■■□□□ 1.2
WDR44Q5JSH3 SH3GL1-206ENST00000598564 2194 ntTSL 2 BASIC22.56■■□□□ 1.2
WDR44Q5JSH3 ZNF446-208ENST00000622313 1884 ntTSL 1 (best) BASIC22.56■■□□□ 1.2
WDR44Q5JSH3 NEDD8-201ENST00000250495 708 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.56■■□□□ 1.2
WDR44Q5JSH3 FAM66A-201ENST00000525829 921 ntTSL 2 BASIC22.56■■□□□ 1.2
WDR44Q5JSH3 APOC3-205ENST00000630701 541 ntTSL 1 (best) BASIC22.56■■□□□ 1.2
WDR44Q5JSH3 AC073111.5-205ENST00000641717 521 ntBASIC22.56■■□□□ 1.2
WDR44Q5JSH3 CCNE1-201ENST00000262643 2043 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.56■■□□□ 1.2
WDR44Q5JSH3 GPC1-202ENST00000420138 1835 ntTSL 5 BASIC22.56■■□□□ 1.2
WDR44Q5JSH3 C10orf55-202ENST00000412307 2360 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.56■■□□□ 1.2
WDR44Q5JSH3 ZGPAT-204ENST00000369967 1890 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.56■■□□□ 1.2
WDR44Q5JSH3 AC007128.1-201ENST00000424460 1853 ntTSL 5 BASIC22.56■■□□□ 1.2
WDR44Q5JSH3 PITX1-205ENST00000506438 1305 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.56■■□□□ 1.2
WDR44Q5JSH3 CTGF-201ENST00000367976 2339 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.56■■□□□ 1.2
WDR44Q5JSH3 CCDC130-201ENST00000221554 1792 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.55■■□□□ 1.2
WDR44Q5JSH3 DRAM2-201ENST00000286692 2246 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.55■■□□□ 1.2
WDR44Q5JSH3 HRASLS5-201ENST00000301790 1166 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.55■■□□□ 1.2
WDR44Q5JSH3 OLFM1-206ENST00000371799 961 ntTSL 1 (best) BASIC22.55■■□□□ 1.2
WDR44Q5JSH3 IZUMO4-203ENST00000395307 944 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.55■■□□□ 1.2
WDR44Q5JSH3 SMIM12-202ENST00000423898 897 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.55■■□□□ 1.2
WDR44Q5JSH3 AC092171.1-201ENST00000455866 753 ntTSL 2 BASIC22.55■■□□□ 1.2
WDR44Q5JSH3 AC091138.1-202ENST00000578967 457 ntTSL 2 BASIC22.55■■□□□ 1.2
WDR44Q5JSH3 RPS15-210ENST00000592623 873 ntTSL 1 (best) BASIC22.55■■□□□ 1.2
WDR44Q5JSH3 RANBP10-202ENST00000448631 2232 ntTSL 2 BASIC22.55■■□□□ 1.2
WDR44Q5JSH3 FBXL19-205ENST00000562319 2462 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.55■■□□□ 1.2
WDR44Q5JSH3 AL137060.1-201ENST00000618151 2648 ntBASIC22.55■■□□□ 1.2
WDR44Q5JSH3 RASSF1-203ENST00000359365 1923 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.55■■□□□ 1.2
WDR44Q5JSH3 GSTM3-202ENST00000361066 1565 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.55■■□□□ 1.2
WDR44Q5JSH3 TUSC3-203ENST00000503731 1498 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC22.54■■□□□ 1.2
WDR44Q5JSH3 FIP1L1-201ENST00000306932 1878 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.54■■□□□ 1.2
WDR44Q5JSH3 PALM-207ENST00000590161 2137 ntTSL 4 BASIC22.54■■□□□ 1.2
WDR44Q5JSH3 SETD6-202ENST00000310682 2042 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC22.54■■□□□ 1.2
WDR44Q5JSH3 STX7-201ENST00000367937 1090 ntTSL 5 BASIC22.54■■□□□ 1.2
WDR44Q5JSH3 LINC01816-201ENST00000414141 662 ntTSL 1 (best) BASIC22.54■■□□□ 1.2
WDR44Q5JSH3 EXD3-208ENST00000479452 962 ntTSL 1 (best) BASIC22.54■■□□□ 1.2
WDR44Q5JSH3 AC140479.5-201ENST00000568189 735 ntTSL 3 BASIC22.54■■□□□ 1.2
WDR44Q5JSH3 GXYLT1P5-201ENST00000614548 1189 ntBASIC22.54■■□□□ 1.2
WDR44Q5JSH3 AF106564.1-201ENST00000607058 2553 ntBASIC22.54■■□□□ 1.2
WDR44Q5JSH3 AP000547.3-201ENST00000592918 1576 ntTSL 1 (best) BASIC22.54■■□□□ 1.2
WDR44Q5JSH3 IKBKG-206ENST00000594239 2299 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.54■■□□□ 1.2
WDR44Q5JSH3 AC005229.4-201ENST00000610085 2198 ntBASIC22.53■■□□□ 1.2
WDR44Q5JSH3 GAS2L1-207ENST00000611648 2482 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.53■■□□□ 1.2
WDR44Q5JSH3 NAA20-201ENST00000310450 920 ntTSL 2 BASIC22.53■■□□□ 1.2
WDR44Q5JSH3 PLAC9-202ENST00000372267 472 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC22.53■■□□□ 1.2
WDR44Q5JSH3 MAD2L2-204ENST00000376667 872 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.53■■□□□ 1.2
WDR44Q5JSH3 ZNF292-204ENST00000392985 1096 ntTSL 1 (best) BASIC22.53■■□□□ 1.2
WDR44Q5JSH3 YBEY-204ENST00000397692 433 ntTSL 1 (best) BASIC22.53■■□□□ 1.2
WDR44Q5JSH3 POLE4-205ENST00000483063 1248 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.53■■□□□ 1.2
WDR44Q5JSH3 BCAT2-207ENST00000597011 1579 ntTSL 5 BASIC22.53■■□□□ 1.2
WDR44Q5JSH3 PDE5A-201ENST00000264805 3020 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.53■■□□□ 1.2
WDR44Q5JSH3 TNFAIP8L3-202ENST00000637513 2002 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.53■■□□□ 1.2
WDR44Q5JSH3 TPD52L1-203ENST00000368402 1308 ntTSL 1 (best) BASIC22.53■■□□□ 1.2
WDR44Q5JSH3 RITA1-201ENST00000548278 2053 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.53■■□□□ 1.2
WDR44Q5JSH3 RGS20-202ENST00000297313 2104 ntTSL 1 (best) BASIC22.52■■□□□ 1.2
WDR44Q5JSH3 NFS1-204ENST00000397425 1956 ntTSL 5 BASIC22.52■■□□□ 1.2
WDR44Q5JSH3 NXNL2-201ENST00000375854 805 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.52■■□□□ 1.2
WDR44Q5JSH3 VSX1-201ENST00000376707 943 ntTSL 1 (best) BASIC22.52■■□□□ 1.2
WDR44Q5JSH3 MT1M-201ENST00000379818 829 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.52■■□□□ 1.2
WDR44Q5JSH3 AGAP1-IT1-201ENST00000440498 664 ntTSL 3 BASIC22.52■■□□□ 1.2
WDR44Q5JSH3 VSX1-206ENST00000444511 1197 ntTSL 1 (best) BASIC22.52■■□□□ 1.2
WDR44Q5JSH3 AC092368.3-201ENST00000562549 1107 ntTSL 5 BASIC22.52■■□□□ 1.2
WDR44Q5JSH3 CHN1-203ENST00000409156 1761 ntTSL 2 BASIC22.52■■□□□ 1.2
WDR44Q5JSH3 AL049796.1-201ENST00000565336 1766 ntBASIC22.52■■□□□ 1.2
WDR44Q5JSH3 TUBG1-201ENST00000251413 1611 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.52■■□□□ 1.2
WDR44Q5JSH3 RARRES2-202ENST00000466675 1618 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.52■■□□□ 1.2
WDR44Q5JSH3 CASTOR1-201ENST00000404953 1460 ntTSL 5 BASIC22.52■■□□□ 1.2
WDR44Q5JSH3 ESYT2-201ENST00000251527 5960 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.52■■□□□ 1.2
WDR44Q5JSH3 SNX18-203ENST00000381410 5218 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.52■■□□□ 1.19
WDR44Q5JSH3 GMPPA-201ENST00000313597 1544 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.52■■□□□ 1.19
WDR44Q5JSH3 ARSA-202ENST00000356098 1895 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.51■■□□□ 1.19
WDR44Q5JSH3 ALX3-201ENST00000369792 1859 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.51■■□□□ 1.19
WDR44Q5JSH3 STK11-205ENST00000586243 2777 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.51■■□□□ 1.19
WDR44Q5JSH3 KRT16P2-201ENST00000414673 1423 ntBASIC22.51■■□□□ 1.19
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 16.1 ms