Protein–RNA interactions for Protein: Q5GLZ8

HERC4, Probable E3 ubiquitin-protein ligase HERC4, humanhuman

Predicted RBP Predictions only

Length 1,057 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
HERC4Q5GLZ8 BID-214ENST00000617586 542 ntTSL 5 BASIC23.27■■□□□ 1.32
HERC4Q5GLZ8 MOK-226ENST00000522874 1890 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.27■■□□□ 1.32
HERC4Q5GLZ8 MYO1C-203ENST00000438665 4898 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC23.27■■□□□ 1.32
HERC4Q5GLZ8 MRPL37-206ENST00000605337 1582 ntTSL 5 BASIC23.27■■□□□ 1.32
HERC4Q5GLZ8 TNFAIP8L3-202ENST00000637513 2002 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.26■■□□□ 1.31
HERC4Q5GLZ8 TSPAN4-206ENST00000397408 1430 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.26■■□□□ 1.31
HERC4Q5GLZ8 ZNF446-208ENST00000622313 1884 ntTSL 1 (best) BASIC23.26■■□□□ 1.31
HERC4Q5GLZ8 ZPBP-201ENST00000046087 1213 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.26■■□□□ 1.31
HERC4Q5GLZ8 ZSWIM7-205ENST00000472495 703 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.26■■□□□ 1.31
HERC4Q5GLZ8 TESC-206ENST00000541210 936 ntTSL 3 BASIC23.26■■□□□ 1.31
HERC4Q5GLZ8 DBI-210ENST00000542275 757 ntTSL 5 BASIC23.26■■□□□ 1.31
HERC4Q5GLZ8 AC012313.6-201ENST00000599889 790 ntTSL 3 BASIC23.26■■□□□ 1.31
HERC4Q5GLZ8 AC104187.1-201ENST00000607510 612 ntBASIC23.26■■□□□ 1.31
HERC4Q5GLZ8 TMEM17-201ENST00000335390 1797 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.26■■□□□ 1.31
HERC4Q5GLZ8 PARN-205ENST00000539279 1557 ntTSL 2 BASIC23.26■■□□□ 1.31
HERC4Q5GLZ8 AC061975.6-201ENST00000579045 1553 ntBASIC23.26■■□□□ 1.31
HERC4Q5GLZ8 NAPEPLD-208ENST00000427257 1822 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.26■■□□□ 1.31
HERC4Q5GLZ8 TMEM9B-205ENST00000534025 2083 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.26■■□□□ 1.31
HERC4Q5GLZ8 RITA1-201ENST00000548278 2053 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.26■■□□□ 1.31
HERC4Q5GLZ8 ALX3-201ENST00000369792 1859 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.26■■□□□ 1.31
HERC4Q5GLZ8 AC004854.2-201ENST00000608450 1441 ntBASIC23.25■■□□□ 1.31
HERC4Q5GLZ8 ALDH16A1-202ENST00000455361 2470 ntTSL 2 BASIC23.25■■□□□ 1.31
HERC4Q5GLZ8 CACNA1H-202ENST00000358590 8069 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.25■■□□□ 1.31
HERC4Q5GLZ8 PARD3-214ENST00000545693 5962 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.25■■□□□ 1.31
HERC4Q5GLZ8 EML2-201ENST00000245925 2264 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.25■■□□□ 1.31
HERC4Q5GLZ8 AP004607.4-201ENST00000530158 1459 ntBASIC23.25■■□□□ 1.31
HERC4Q5GLZ8 CCDC130-201ENST00000221554 1792 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.25■■□□□ 1.31
HERC4Q5GLZ8 POLR2J3-220ENST00000613744 2096 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.25■■□□□ 1.31
HERC4Q5GLZ8 TTC7A-201ENST00000319190 5157 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.25■■□□□ 1.31
HERC4Q5GLZ8 LRRC75A-201ENST00000409083 2656 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC23.25■■□□□ 1.31
HERC4Q5GLZ8 UBE2C-203ENST00000352551 665 ntTSL 2 BASIC23.25■■□□□ 1.31
HERC4Q5GLZ8 C19orf12-205ENST00000392278 895 ntTSL 2 BASIC23.25■■□□□ 1.31
HERC4Q5GLZ8 IL15RA-208ENST00000397251 1046 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.25■■□□□ 1.31
HERC4Q5GLZ8 HAGH-201ENST00000397353 1257 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC23.25■■□□□ 1.31
HERC4Q5GLZ8 CCDC74B-203ENST00000409128 789 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC23.25■■□□□ 1.31
HERC4Q5GLZ8 AC093627.4-202ENST00000479592 591 ntTSL 4 BASIC23.25■■□□□ 1.31
HERC4Q5GLZ8 ATPIF1-204ENST00000497986 599 ntTSL 2 BASIC23.25■■□□□ 1.31
HERC4Q5GLZ8 AC012414.4-201ENST00000560839 1074 ntTSL 5 BASIC23.25■■□□□ 1.31
HERC4Q5GLZ8 TRAPPC2L-213ENST00000567895 854 ntTSL 3 BASIC23.25■■□□□ 1.31
HERC4Q5GLZ8 AC138907.5-202ENST00000569484 235 ntBASIC23.25■■□□□ 1.31
HERC4Q5GLZ8 IL15RA-221ENST00000620865 1037 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.25■■□□□ 1.31
HERC4Q5GLZ8 IL15RA-222ENST00000622442 1160 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.25■■□□□ 1.31
HERC4Q5GLZ8 AC060814.5-201ENST00000630916 1074 ntTSL 2 BASIC23.25■■□□□ 1.31
HERC4Q5GLZ8 TEAD2-201ENST00000311227 2164 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.25■■□□□ 1.31
HERC4Q5GLZ8 H2AFX-202ENST00000530167 1614 ntAPPRIS P1 BASIC23.25■■□□□ 1.31
HERC4Q5GLZ8 P2RX4-202ENST00000337233 2032 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.25■■□□□ 1.31
HERC4Q5GLZ8 BIN1-202ENST00000316724 2693 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC23.25■■□□□ 1.31
HERC4Q5GLZ8 SH3BP2-204ENST00000452765 2265 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.24■■□□□ 1.31
HERC4Q5GLZ8 DCXR-201ENST00000306869 887 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.24■■□□□ 1.31
HERC4Q5GLZ8 LARP6-202ENST00000344870 527 ntTSL 1 (best) BASIC23.24■■□□□ 1.31
HERC4Q5GLZ8 EFCAB6-202ENST00000356087 1129 ntTSL 5 BASIC23.24■■□□□ 1.31
HERC4Q5GLZ8 AL645608.9-201ENST00000442292 829 ntTSL 1 (best) BASIC23.24■■□□□ 1.31
HERC4Q5GLZ8 ZNF622-201ENST00000308683 1699 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.24■■□□□ 1.31
HERC4Q5GLZ8 HAND1-201ENST00000231121 1738 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.24■■□□□ 1.31
HERC4Q5GLZ8 KCNMA1-209ENST00000372443 5059 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.24■■□□□ 1.31
HERC4Q5GLZ8 PARD3-207ENST00000374788 5996 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC23.24■■□□□ 1.31
HERC4Q5GLZ8 PALM-208ENST00000592155 2272 ntTSL 4 BASIC23.24■■□□□ 1.31
HERC4Q5GLZ8 HLA-G-204ENST00000376828 1490 ntAPPRIS ALT2 BASIC23.24■■□□□ 1.31
HERC4Q5GLZ8 KDM3B-201ENST00000314358 6813 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.23■■□□□ 1.31
HERC4Q5GLZ8 ZNF668-209ENST00000539836 2469 ntTSL 5 BASIC23.23■■□□□ 1.31
HERC4Q5GLZ8 ARL6IP4-220ENST00000543566 1591 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.23■■□□□ 1.31
HERC4Q5GLZ8 CPNE2-201ENST00000290776 2645 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.23■■□□□ 1.31
HERC4Q5GLZ8 PLSCR3-201ENST00000324822 1689 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.23■■□□□ 1.31
HERC4Q5GLZ8 UTF1-201ENST00000304477 1157 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.23■■□□□ 1.31
HERC4Q5GLZ8 TMEM54-202ENST00000373463 999 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.23■■□□□ 1.31
HERC4Q5GLZ8 RAMP1-203ENST00000404910 857 ntTSL 2 BASIC23.23■■□□□ 1.31
HERC4Q5GLZ8 IDH2-203ENST00000559482 1278 ntTSL 5 BASIC23.23■■□□□ 1.31
HERC4Q5GLZ8 AC008175.2-201ENST00000612840 297 ntBASIC23.23■■□□□ 1.31
HERC4Q5GLZ8 PAXIP1-AS1-201ENST00000608317 2256 ntBASIC23.22■■□□□ 1.31
HERC4Q5GLZ8 YBX3-202ENST00000279550 1708 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.22■■□□□ 1.31
HERC4Q5GLZ8 ZGPAT-204ENST00000369967 1890 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.22■■□□□ 1.31
HERC4Q5GLZ8 AC007128.1-201ENST00000424460 1853 ntTSL 5 BASIC23.22■■□□□ 1.31
HERC4Q5GLZ8 METTL26-203ENST00000397664 604 ntTSL 2 BASIC23.22■■□□□ 1.31
HERC4Q5GLZ8 BEX2-204ENST00000536889 1077 ntTSL 2 BASIC23.22■■□□□ 1.31
HERC4Q5GLZ8 DDN-AS1-201ENST00000547395 858 ntTSL 2 BASIC23.22■■□□□ 1.31
HERC4Q5GLZ8 AC092368.3-201ENST00000562549 1107 ntTSL 5 BASIC23.22■■□□□ 1.31
HERC4Q5GLZ8 UBE2Q1-201ENST00000292211 3210 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.22■■□□□ 1.31
HERC4Q5GLZ8 UNC93B1-201ENST00000227471 2316 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.22■■□□□ 1.31
HERC4Q5GLZ8 IGDCC4-201ENST00000352385 6508 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.22■■□□□ 1.31
HERC4Q5GLZ8 NAA20-203ENST00000398602 1604 ntTSL 5 BASIC23.22■■□□□ 1.31
HERC4Q5GLZ8 ARSA-202ENST00000356098 1895 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.22■■□□□ 1.31
HERC4Q5GLZ8 PMPCA-203ENST00000399219 1987 ntTSL 2 BASIC23.21■■□□□ 1.31
HERC4Q5GLZ8 SRSF11-203ENST00000370951 2385 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.21■■□□□ 1.31
HERC4Q5GLZ8 CSNK1G2-201ENST00000255641 2918 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.21■■□□□ 1.31
HERC4Q5GLZ8 UCHL1-201ENST00000284440 1172 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.21■■□□□ 1.31
HERC4Q5GLZ8 DTYMK-201ENST00000305784 1232 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.21■■□□□ 1.31
HERC4Q5GLZ8 AC010141.2-201ENST00000452426 721 ntBASIC23.21■■□□□ 1.31
HERC4Q5GLZ8 UCHL1-210ENST00000512788 785 ntTSL 3 BASIC23.21■■□□□ 1.31
HERC4Q5GLZ8 TRAPPC5-203ENST00000595985 411 ntTSL 3 BASIC23.21■■□□□ 1.31
HERC4Q5GLZ8 AP001160.3-201ENST00000601484 763 ntBASIC23.21■■□□□ 1.31
HERC4Q5GLZ8 C10orf95-201ENST00000625129 1469 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.21■■□□□ 1.31
HERC4Q5GLZ8 PTPRJ-208ENST00000615445 4773 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.21■■□□□ 1.31
HERC4Q5GLZ8 FIP1L1-201ENST00000306932 1878 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.21■■□□□ 1.31
HERC4Q5GLZ8 FNDC10-201ENST00000422725 2085 ntAPPRIS P1 BASIC23.21■■□□□ 1.31
HERC4Q5GLZ8 APLP1-203ENST00000586861 2052 ntTSL 2 BASIC23.21■■□□□ 1.31
HERC4Q5GLZ8 POLR2F-205ENST00000442738 2106 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.21■■□□□ 1.31
HERC4Q5GLZ8 POMGNT2-201ENST00000344697 2544 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.21■■□□□ 1.31
HERC4Q5GLZ8 NISCH-201ENST00000345716 5238 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.2■■□□□ 1.31
HERC4Q5GLZ8 LSM14A-202ENST00000540746 2152 ntTSL 2 BASIC23.2■■□□□ 1.3
HERC4Q5GLZ8 TEAD2-208ENST00000598810 2191 ntTSL 1 (best) BASIC23.2■■□□□ 1.3
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 21.4 ms