Protein–RNA interactions for Protein: Q59GN2

RPL39P5, Putative 60S ribosomal protein L39-like 5, humanhuman

Predictions only

Length 51 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
RPL39P5Q59GN2 AC138649.1-201ENST00000619611 1449 ntTSL 1 (best) BASIC17.05■□□□□ 0.32
RPL39P5Q59GN2 EPHA8-202ENST00000374644 1802 ntTSL 1 (best) BASIC17.05■□□□□ 0.32
RPL39P5Q59GN2 EPO-201ENST00000252723 1330 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.05■□□□□ 0.32
RPL39P5Q59GN2 ZDHHC14-203ENST00000359775 7380 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.05■□□□□ 0.32
RPL39P5Q59GN2 OLA1-204ENST00000409546 2071 ntTSL 5 BASIC17.05■□□□□ 0.32
RPL39P5Q59GN2 JADE2-204ENST00000402835 2797 ntTSL 5 BASIC17.05■□□□□ 0.32
RPL39P5Q59GN2 ZNF821-202ENST00000425432 2000 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.05■□□□□ 0.32
RPL39P5Q59GN2 RPL8-201ENST00000262584 1041 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.05■□□□□ 0.32
RPL39P5Q59GN2 ADAMTS13-204ENST00000371911 1155 ntTSL 1 (best) BASIC17.05■□□□□ 0.32
RPL39P5Q59GN2 AC053503.5-201ENST00000601508 636 ntBASIC17.05■□□□□ 0.32
RPL39P5Q59GN2 COL13A1-202ENST00000357811 2991 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.05■□□□□ 0.32
RPL39P5Q59GN2 TXNRD3-204ENST00000640433 1932 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC17.05■□□□□ 0.32
RPL39P5Q59GN2 ZXDC-201ENST00000336332 2579 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.05■□□□□ 0.32
RPL39P5Q59GN2 KCNH2-201ENST00000262186 4286 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.05■□□□□ 0.32
RPL39P5Q59GN2 FDFT1-210ENST00000525954 1890 ntTSL 2 BASIC17.05■□□□□ 0.32
RPL39P5Q59GN2 RNF38-204ENST00000357058 5254 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.05■□□□□ 0.32
RPL39P5Q59GN2 HSF4-215ENST00000521374 1515 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.05■□□□□ 0.32
RPL39P5Q59GN2 ZNF688-201ENST00000223459 2506 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.05■□□□□ 0.32
RPL39P5Q59GN2 TCP11-202ENST00000311875 2166 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.05■□□□□ 0.32
RPL39P5Q59GN2 ZDHHC17-201ENST00000426126 5259 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.05■□□□□ 0.32
RPL39P5Q59GN2 PPCS-203ENST00000372561 1431 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.04■□□□□ 0.32
RPL39P5Q59GN2 RAB1B-201ENST00000311481 2007 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.04■□□□□ 0.32
RPL39P5Q59GN2 KCNMB4-201ENST00000258111 4731 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.04■□□□□ 0.32
RPL39P5Q59GN2 PLK5-205ENST00000642079 1969 ntBASIC17.04■□□□□ 0.32
RPL39P5Q59GN2 AC135048.1-201ENST00000566056 1318 ntTSL 2 BASIC17.04■□□□□ 0.32
RPL39P5Q59GN2 CDIPT-210ENST00000570016 1346 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.04■□□□□ 0.32
RPL39P5Q59GN2 MMP17-201ENST00000360564 2411 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.04■□□□□ 0.32
RPL39P5Q59GN2 CLPSL2-201ENST00000360454 488 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.04■□□□□ 0.32
RPL39P5Q59GN2 AC079140.4-201ENST00000507448 529 ntBASIC17.04■□□□□ 0.32
RPL39P5Q59GN2 DYNC1I1-211ENST00000537881 2146 ntTSL 5 BASIC17.04■□□□□ 0.32
RPL39P5Q59GN2 AC145207.2-202ENST00000576554 565 ntTSL 5 BASIC17.04■□□□□ 0.32
RPL39P5Q59GN2 CPT2-209ENST00000636935 803 ntTSL 5 BASIC17.04■□□□□ 0.32
RPL39P5Q59GN2 CREB3-201ENST00000353704 1832 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.04■□□□□ 0.32
RPL39P5Q59GN2 SMPDL3A-203ENST00000539041 1755 ntTSL 2 BASIC17.04■□□□□ 0.32
RPL39P5Q59GN2 AOC1-202ENST00000416793 2453 ntTSL 1 (best) BASIC17.04■□□□□ 0.32
RPL39P5Q59GN2 SCOC-207ENST00000506597 1838 ntTSL 1 (best) BASIC17.03■□□□□ 0.32
RPL39P5Q59GN2 AC061975.6-201ENST00000579045 1553 ntBASIC17.03■□□□□ 0.32
RPL39P5Q59GN2 EMILIN2-201ENST00000254528 5910 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.03■□□□□ 0.32
RPL39P5Q59GN2 DET1-201ENST00000268148 2267 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.03■□□□□ 0.32
RPL39P5Q59GN2 ABLIM2-204ENST00000407564 2291 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.03■□□□□ 0.32
RPL39P5Q59GN2 PHACTR2-203ENST00000367584 2490 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.03■□□□□ 0.32
RPL39P5Q59GN2 EED-201ENST00000263360 2223 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.03■□□□□ 0.32
RPL39P5Q59GN2 KIRREL2-201ENST00000262625 1969 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.03■□□□□ 0.32
RPL39P5Q59GN2 EIF6-201ENST00000374436 1252 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.03■□□□□ 0.32
RPL39P5Q59GN2 TSPY4-201ENST00000383008 1143 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.03■□□□□ 0.32
RPL39P5Q59GN2 NMRAL1-202ENST00000404295 1233 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.03■□□□□ 0.32
RPL39P5Q59GN2 AP003071.3-201ENST00000562506 366 ntTSL 3 BASIC17.03■□□□□ 0.32
RPL39P5Q59GN2 FP565260.3-201ENST00000612610 1162 ntAPPRIS P5 TSL 1 (best) BASIC17.03■□□□□ 0.32
RPL39P5Q59GN2 SH3GL1-206ENST00000598564 2194 ntTSL 2 BASIC17.03■□□□□ 0.32
RPL39P5Q59GN2 MTMR9LP-204ENST00000441044 2624 ntTSL 1 (best) BASIC17.03■□□□□ 0.32
RPL39P5Q59GN2 TAF4-201ENST00000252996 4628 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.03■□□□□ 0.32
RPL39P5Q59GN2 DISC1-213ENST00000537876 2349 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC17.03■□□□□ 0.32
RPL39P5Q59GN2 DEDD2-201ENST00000336034 1882 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC17.03■□□□□ 0.32
RPL39P5Q59GN2 DR1-201ENST00000370267 1647 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.03■□□□□ 0.32
RPL39P5Q59GN2 VEGFA-204ENST00000372064 2909 ntTSL 1 (best) BASIC17.03■□□□□ 0.32
RPL39P5Q59GN2 NTN4-207ENST00000553059 1818 ntTSL 1 (best) BASIC17.03■□□□□ 0.32
RPL39P5Q59GN2 NR1H2-204ENST00000593926 1828 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC17.03■□□□□ 0.32
RPL39P5Q59GN2 BICRA-204ENST00000614245 5697 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.03■□□□□ 0.32
RPL39P5Q59GN2 CMTM4-201ENST00000330687 3414 ntTSL 1 (best) BASIC17.02■□□□□ 0.32
RPL39P5Q59GN2 TMEM62-201ENST00000260403 2771 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.02■□□□□ 0.32
RPL39P5Q59GN2 DMRTB1-201ENST00000371445 1910 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.02■□□□□ 0.32
RPL39P5Q59GN2 RTP5-201ENST00000343216 2296 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.02■□□□□ 0.32
RPL39P5Q59GN2 CLPB-202ENST00000340729 2071 ntTSL 2 BASIC17.02■□□□□ 0.32
RPL39P5Q59GN2 FGF7P6-201ENST00000377614 1890 ntTSL 1 (best) BASIC17.02■□□□□ 0.32
RPL39P5Q59GN2 BX664615.2-202ENST00000639056 1888 ntTSL 1 (best) BASIC17.02■□□□□ 0.32
RPL39P5Q59GN2 HLA-G-204ENST00000376828 1490 ntAPPRIS ALT2 BASIC17.02■□□□□ 0.32
RPL39P5Q59GN2 CROT-202ENST00000412227 1213 ntTSL 1 (best) BASIC17.02■□□□□ 0.32
RPL39P5Q59GN2 SDHAP3-201ENST00000436493 736 ntTSL 1 (best) BASIC17.02■□□□□ 0.32
RPL39P5Q59GN2 PRSS22-203ENST00000571228 1037 ntTSL 2 BASIC17.02■□□□□ 0.32
RPL39P5Q59GN2 ELANE-202ENST00000590230 1028 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.02■□□□□ 0.32
RPL39P5Q59GN2 MAMSTR-202ENST00000356751 1825 ntTSL 2 BASIC17.02■□□□□ 0.31
RPL39P5Q59GN2 FMR1-AS1-202ENST00000596112 1845 ntTSL 1 (best) BASIC17.02■□□□□ 0.31
RPL39P5Q59GN2 SLC41A3-201ENST00000315891 1797 ntTSL 1 (best) BASIC17.02■□□□□ 0.31
RPL39P5Q59GN2 ATP11C-203ENST00000370557 6924 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.02■□□□□ 0.31
RPL39P5Q59GN2 RPS6-203ENST00000380384 1355 ntTSL 1 (best) BASIC17.02■□□□□ 0.31
RPL39P5Q59GN2 TMEM161A-202ENST00000450333 1930 ntTSL 2 BASIC17.02■□□□□ 0.31
RPL39P5Q59GN2 GAS2-202ENST00000454584 2286 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.01■□□□□ 0.31
RPL39P5Q59GN2 UBA5-211ENST00000493720 2058 ntTSL 5 BASIC17.01■□□□□ 0.31
RPL39P5Q59GN2 ANTXR2-202ENST00000346652 1343 ntTSL 1 (best) BASIC17.01■□□□□ 0.31
RPL39P5Q59GN2 AC006128.1-201ENST00000624704 1661 ntBASIC17.01■□□□□ 0.31
RPL39P5Q59GN2 ADAMTS2-202ENST00000274609 2044 ntTSL 1 (best) BASIC17.01■□□□□ 0.31
RPL39P5Q59GN2 NAGK-229ENST00000613852 1801 ntTSL 1 (best) BASIC17.01■□□□□ 0.31
RPL39P5Q59GN2 KRT87P-202ENST00000534226 1464 ntBASIC17.01■□□□□ 0.31
RPL39P5Q59GN2 ME3-212ENST00000543262 2311 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.01■□□□□ 0.31
RPL39P5Q59GN2 GPRIN2-202ENST00000374317 1966 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC17.01■□□□□ 0.31
RPL39P5Q59GN2 NAA20-203ENST00000398602 1604 ntTSL 5 BASIC17.01■□□□□ 0.31
RPL39P5Q59GN2 AC027612.3-201ENST00000413684 1047 ntBASIC17.01■□□□□ 0.31
RPL39P5Q59GN2 CDKN2A-210ENST00000530628 748 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.01■□□□□ 0.31
RPL39P5Q59GN2 BCAT2-207ENST00000597011 1579 ntTSL 5 BASIC17.01■□□□□ 0.31
RPL39P5Q59GN2 LRR1-201ENST00000298288 1745 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.01■□□□□ 0.31
RPL39P5Q59GN2 EXOC3L2-202ENST00000413988 2964 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.01■□□□□ 0.31
RPL39P5Q59GN2 SPPL2B-212ENST00000618220 2459 ntTSL 1 (best) BASIC17.01■□□□□ 0.31
RPL39P5Q59GN2 LAMC3-202ENST00000361069 6133 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17■□□□□ 0.31
RPL39P5Q59GN2 SLC9A3R1-201ENST00000262613 1969 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17■□□□□ 0.31
RPL39P5Q59GN2 PAQR6-215ENST00000623241 1961 ntTSL 1 (best) BASIC17■□□□□ 0.31
RPL39P5Q59GN2 NPNT-204ENST00000453617 2419 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC17■□□□□ 0.31
RPL39P5Q59GN2 SPATA5L1-201ENST00000305560 2570 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17■□□□□ 0.31
RPL39P5Q59GN2 MPST-205ENST00000404802 1453 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC17■□□□□ 0.31
RPL39P5Q59GN2 H2AFX-202ENST00000530167 1614 ntAPPRIS P1 BASIC17■□□□□ 0.31
RPL39P5Q59GN2 KLF14-201ENST00000583337 2827 ntAPPRIS P1 BASIC17■□□□□ 0.31
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 21.6 ms