Protein–RNA interactions for Protein: Q53GL0

PLEKHO1, Pleckstrin homology domain-containing family O member 1, humanhuman

Predicted RBP Predictions only

Length 409 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
PLEKHO1Q53GL0 GBX2-201ENST00000306318 2123 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.37■■□□□ 1.97
PLEKHO1Q53GL0 SLC2A7-201ENST00000400906 1539 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.36■■□□□ 1.97
PLEKHO1Q53GL0 NR0B1-202ENST00000378970 2021 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.36■■□□□ 1.97
PLEKHO1Q53GL0 DDIT4-201ENST00000307365 1748 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.36■■□□□ 1.97
PLEKHO1Q53GL0 SPDYE2-201ENST00000341656 1219 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.36■■□□□ 1.97
PLEKHO1Q53GL0 CYYR1-202ENST00000400043 735 ntTSL 1 (best) BASIC27.36■■□□□ 1.97
PLEKHO1Q53GL0 PTPA-214ENST00000423100 988 ntTSL 2 BASIC27.36■■□□□ 1.97
PLEKHO1Q53GL0 LINC01659-202ENST00000449711 917 ntTSL 3 BASIC27.36■■□□□ 1.97
PLEKHO1Q53GL0 SPDYE2B-202ENST00000455020 1219 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.36■■□□□ 1.97
PLEKHO1Q53GL0 ANAPC11-208ENST00000572851 686 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.36■■□□□ 1.97
PLEKHO1Q53GL0 AL589743.5-201ENST00000616611 1050 ntBASIC27.36■■□□□ 1.97
PLEKHO1Q53GL0 SAMD4B-208ENST00000598913 2877 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC27.36■■□□□ 1.97
PLEKHO1Q53GL0 ATP8A1-207ENST00000510289 2238 ntTSL 1 (best) BASIC27.36■■□□□ 1.97
PLEKHO1Q53GL0 NAPSA-201ENST00000253719 1548 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.36■■□□□ 1.97
PLEKHO1Q53GL0 ENTPD2-201ENST00000312665 1500 ntTSL 1 (best) BASIC27.36■■□□□ 1.97
PLEKHO1Q53GL0 NPAS1-202ENST00000449844 2043 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.35■■□□□ 1.97
PLEKHO1Q53GL0 LINGO3-201ENST00000585527 2241 ntAPPRIS P1 BASIC27.35■■□□□ 1.97
PLEKHO1Q53GL0 CSF1-205ENST00000420111 1083 ntTSL 5 BASIC27.35■■□□□ 1.97
PLEKHO1Q53GL0 MAGI2-AS3-211ENST00000451809 707 ntTSL 3 BASIC27.35■■□□□ 1.97
PLEKHO1Q53GL0 NCBP2-207ENST00000452404 1133 ntTSL 2 BASIC27.35■■□□□ 1.97
PLEKHO1Q53GL0 OVCH1-AS1-203ENST00000551108 963 ntTSL 2 BASIC27.35■■□□□ 1.97
PLEKHO1Q53GL0 IRX5-204ENST00000560154 879 ntTSL 5 BASIC27.35■■□□□ 1.97
PLEKHO1Q53GL0 AC006058.3-201ENST00000606217 1069 ntBASIC27.35■■□□□ 1.97
PLEKHO1Q53GL0 IRX5-205ENST00000620085 881 ntTSL 1 (best) BASIC27.35■■□□□ 1.97
PLEKHO1Q53GL0 FGF13-208ENST00000626909 1039 ntTSL 2 BASIC27.35■■□□□ 1.97
PLEKHO1Q53GL0 HLA-C-201ENST00000376228 1536 ntAPPRIS P2 BASIC27.35■■□□□ 1.97
PLEKHO1Q53GL0 SCARB2-219ENST00000639738 1517 ntTSL 5 BASIC27.35■■□□□ 1.97
PLEKHO1Q53GL0 GCH1-206ENST00000543643 1897 ntTSL 1 (best) BASIC27.34■■□□□ 1.97
PLEKHO1Q53GL0 KCNK4-201ENST00000394525 1673 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.34■■□□□ 1.97
PLEKHO1Q53GL0 GAL3ST3-201ENST00000312006 2133 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.34■■□□□ 1.97
PLEKHO1Q53GL0 PPT2-248ENST00000395523 2111 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC27.34■■□□□ 1.97
PLEKHO1Q53GL0 HAND1-201ENST00000231121 1738 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.34■■□□□ 1.97
PLEKHO1Q53GL0 HCFC1R1-202ENST00000354679 765 ntTSL 2 BASIC27.34■■□□□ 1.97
PLEKHO1Q53GL0 TMEM240-202ENST00000425828 717 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC27.34■■□□□ 1.97
PLEKHO1Q53GL0 AC098590.1-201ENST00000468126 897 ntBASIC27.34■■□□□ 1.97
PLEKHO1Q53GL0 AC093827.2-201ENST00000512654 315 ntBASIC27.34■■□□□ 1.97
PLEKHO1Q53GL0 LINC00605-201ENST00000514902 1558 ntTSL 1 (best) BASIC27.34■■□□□ 1.97
PLEKHO1Q53GL0 AC242852.2-201ENST00000615738 1807 ntBASIC27.34■■□□□ 1.97
PLEKHO1Q53GL0 GALC-202ENST00000393568 2054 ntTSL 2 BASIC27.34■■□□□ 1.97
PLEKHO1Q53GL0 TLX2-201ENST00000233638 2136 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.34■■□□□ 1.97
PLEKHO1Q53GL0 DPF1-201ENST00000355526 1632 ntTSL 1 (best) BASIC27.34■■□□□ 1.97
PLEKHO1Q53GL0 ACTR1B-201ENST00000289228 2243 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.33■■□□□ 1.97
PLEKHO1Q53GL0 HNRNPM-202ENST00000348943 2568 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.33■■□□□ 1.97
PLEKHO1Q53GL0 RPLP0-201ENST00000228306 1257 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.33■■□□□ 1.97
PLEKHO1Q53GL0 TPSAB1-201ENST00000338844 1175 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC27.33■■□□□ 1.97
PLEKHO1Q53GL0 KRT18P68-201ENST00000392293 1000 ntBASIC27.33■■□□□ 1.97
PLEKHO1Q53GL0 ALG5-202ENST00000443765 1119 ntTSL 2 BASIC27.33■■□□□ 1.97
PLEKHO1Q53GL0 AC026366.1-201ENST00000488803 879 ntBASIC27.33■■□□□ 1.97
PLEKHO1Q53GL0 MAGIX-206ENST00000615626 1057 ntTSL 1 (best) BASIC27.33■■□□□ 1.97
PLEKHO1Q53GL0 NR2F2-204ENST00000453270 1712 ntTSL 1 (best) BASIC27.33■■□□□ 1.96
PLEKHO1Q53GL0 GJB6-203ENST00000400065 1805 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.32■■□□□ 1.96
PLEKHO1Q53GL0 NUF2-208ENST00000524800 1845 ntTSL 5 BASIC27.32■■□□□ 1.96
PLEKHO1Q53GL0 AC005906.2-202ENST00000638821 2168 ntTSL 5 BASIC27.32■■□□□ 1.96
PLEKHO1Q53GL0 PANK2-201ENST00000316562 2280 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC27.32■■□□□ 1.96
PLEKHO1Q53GL0 BCAT2-207ENST00000597011 1579 ntTSL 5 BASIC27.32■■□□□ 1.96
PLEKHO1Q53GL0 C3orf80-201ENST00000326474 2718 ntAPPRIS P1 BASIC27.32■■□□□ 1.96
PLEKHO1Q53GL0 AC128676.1-201ENST00000454392 318 ntBASIC27.32■■□□□ 1.96
PLEKHO1Q53GL0 RPS2P52-201ENST00000469610 820 ntBASIC27.32■■□□□ 1.96
PLEKHO1Q53GL0 LCN6-203ENST00000476567 1015 ntTSL 1 (best) BASIC27.32■■□□□ 1.96
PLEKHO1Q53GL0 AL356020.1-201ENST00000554235 1076 ntTSL 5 BASIC27.32■■□□□ 1.96
PLEKHO1Q53GL0 RPS15-206ENST00000589656 473 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC27.32■■□□□ 1.96
PLEKHO1Q53GL0 SUGCT-202ENST00000401647 1369 ntTSL 1 (best) BASIC27.32■■□□□ 1.96
PLEKHO1Q53GL0 GCK-205ENST00000437084 1385 ntTSL 5 BASIC27.32■■□□□ 1.96
PLEKHO1Q53GL0 SH3GL1-206ENST00000598564 2194 ntTSL 2 BASIC27.32■■□□□ 1.96
PLEKHO1Q53GL0 RRNAD1-202ENST00000368218 1802 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC27.32■■□□□ 1.96
PLEKHO1Q53GL0 PPCS-203ENST00000372561 1431 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.32■■□□□ 1.96
PLEKHO1Q53GL0 ACBD4-202ENST00000376955 1453 ntTSL 2 BASIC27.32■■□□□ 1.96
PLEKHO1Q53GL0 DONSON-210ENST00000453626 2332 ntTSL 5 BASIC27.32■■□□□ 1.96
PLEKHO1Q53GL0 DPH1-203ENST00000570477 1747 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC27.31■■□□□ 1.96
PLEKHO1Q53GL0 FDXR-219ENST00000583917 1762 ntTSL 5 BASIC27.31■■□□□ 1.96
PLEKHO1Q53GL0 ETHE1-201ENST00000292147 963 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.31■■□□□ 1.96
PLEKHO1Q53GL0 RAC1-202ENST00000356142 907 ntTSL 1 (best) BASIC27.31■■□□□ 1.96
PLEKHO1Q53GL0 EEF1DP3-201ENST00000428783 1309 ntTSL 1 (best) BASIC27.31■■□□□ 1.96
PLEKHO1Q53GL0 PRODH-203ENST00000357068 2462 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC27.31■■□□□ 1.96
PLEKHO1Q53GL0 ADD1-202ENST00000355842 4743 ntTSL 1 (best) BASIC27.3■■□□□ 1.96
PLEKHO1Q53GL0 SPN-202ENST00000395389 1935 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC27.3■■□□□ 1.96
PLEKHO1Q53GL0 IFI27L2-201ENST00000238609 511 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.3■■□□□ 1.96
PLEKHO1Q53GL0 TPST1-201ENST00000304842 2116 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.3■■□□□ 1.96
PLEKHO1Q53GL0 C10orf91-201ENST00000321248 1257 ntTSL 1 (best) BASIC27.3■■□□□ 1.96
PLEKHO1Q53GL0 GCSHP5-201ENST00000443090 522 ntBASIC27.3■■□□□ 1.96
PLEKHO1Q53GL0 ABCC3-217ENST00000515707 656 ntTSL 3 BASIC27.3■■□□□ 1.96
PLEKHO1Q53GL0 C17orf50-201ENST00000603305 569 ntTSL 3 BASIC27.3■■□□□ 1.96
PLEKHO1Q53GL0 C17orf50-203ENST00000605587 1018 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.3■■□□□ 1.96
PLEKHO1Q53GL0 FAH-202ENST00000407106 2152 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC27.3■■□□□ 1.96
PLEKHO1Q53GL0 VRK2-201ENST00000340157 1888 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC27.3■■□□□ 1.96
PLEKHO1Q53GL0 TERT-206ENST00000508104 2486 ntTSL 5 BASIC27.29■■□□□ 1.96
PLEKHO1Q53GL0 MRAP-201ENST00000303645 935 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC27.29■■□□□ 1.96
PLEKHO1Q53GL0 PRSS3-202ENST00000361005 966 ntTSL 1 (best) BASIC27.29■■□□□ 1.96
PLEKHO1Q53GL0 RRAS2-203ENST00000526063 970 ntTSL 1 (best) BASIC27.29■■□□□ 1.96
PLEKHO1Q53GL0 AP003097.1-201ENST00000530657 1135 ntBASIC27.29■■□□□ 1.96
PLEKHO1Q53GL0 RRAS2-208ENST00000532814 982 ntTSL 1 (best) BASIC27.29■■□□□ 1.96
PLEKHO1Q53GL0 HLA-B-256ENST00000639848 1089 ntBASIC27.29■■□□□ 1.96
PLEKHO1Q53GL0 CTDSPL-206ENST00000443503 4640 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC27.29■■□□□ 1.96
PLEKHO1Q53GL0 NELFE-202ENST00000375429 1584 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC27.29■■□□□ 1.96
PLEKHO1Q53GL0 AC133555.3-201ENST00000549950 1693 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC27.29■■□□□ 1.96
PLEKHO1Q53GL0 AC106782.1-201ENST00000550538 1693 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC27.29■■□□□ 1.96
PLEKHO1Q53GL0 PYCR1-216ENST00000619204 1904 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.29■■□□□ 1.96
PLEKHO1Q53GL0 SLC2A8-203ENST00000373371 2172 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.29■■□□□ 1.96
PLEKHO1Q53GL0 ZNF354A-201ENST00000335815 2484 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.29■■□□□ 1.96
PLEKHO1Q53GL0 ERGIC1-202ENST00000393784 2881 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.29■■□□□ 1.96
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 17.6 ms