Protein–RNA interactions for Protein: Q52LW3

ARHGAP29, Rho GTPase-activating protein 29, humanhuman

Predictions only

Length 1,261 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
ARHGAP29Q52LW3 PKMYT1-201ENST00000262300 2171 ntTSL 1 (best) BASIC23.03■■□□□ 1.28
ARHGAP29Q52LW3 PPP1R3F-203ENST00000466508 1885 ntTSL 2 BASIC23.02■■□□□ 1.28
ARHGAP29Q52LW3 STARD3NL-202ENST00000396013 1365 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.02■■□□□ 1.28
ARHGAP29Q52LW3 EPHA10-202ENST00000373048 5425 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC23.02■■□□□ 1.28
ARHGAP29Q52LW3 BCL2L12-201ENST00000246784 990 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.02■■□□□ 1.28
ARHGAP29Q52LW3 CDKN2AIPNL-201ENST00000395009 800 ntTSL 1 (best) BASIC23.02■■□□□ 1.28
ARHGAP29Q52LW3 AC093817.1-201ENST00000507296 812 ntTSL 3 BASIC23.02■■□□□ 1.28
ARHGAP29Q52LW3 AC010525.1-201ENST00000585559 441 ntBASIC23.02■■□□□ 1.28
ARHGAP29Q52LW3 IKBKGP1-201ENST00000612193 1073 ntBASIC23.02■■□□□ 1.28
ARHGAP29Q52LW3 RARRES2P11-201ENST00000635158 484 ntBASIC23.02■■□□□ 1.28
ARHGAP29Q52LW3 LMAN2-201ENST00000303127 1800 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.02■■□□□ 1.28
ARHGAP29Q52LW3 GFRA3-202ENST00000378362 1837 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.02■■□□□ 1.28
ARHGAP29Q52LW3 MEDAG-201ENST00000380482 2374 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.02■■□□□ 1.28
ARHGAP29Q52LW3 RDX-202ENST00000405097 2761 ntTSL 1 (best) BASIC23.02■■□□□ 1.28
ARHGAP29Q52LW3 MATN4-204ENST00000372756 2077 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.02■■□□□ 1.28
ARHGAP29Q52LW3 CPNE9-203ENST00000383832 2068 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.02■■□□□ 1.28
ARHGAP29Q52LW3 RITA1-201ENST00000548278 2053 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.02■■□□□ 1.28
ARHGAP29Q52LW3 MTMR12-203ENST00000382142 5187 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.01■■□□□ 1.27
ARHGAP29Q52LW3 ALDOA-221ENST00000566897 2448 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC23.01■■□□□ 1.27
ARHGAP29Q52LW3 SPI1-202ENST00000378538 1403 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.01■■□□□ 1.27
ARHGAP29Q52LW3 TMEM132A-202ENST00000453848 3346 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.01■■□□□ 1.27
ARHGAP29Q52LW3 HFE2-202ENST00000357836 2123 ntTSL 1 (best) BASIC23.01■■□□□ 1.27
ARHGAP29Q52LW3 AC019068.1-201ENST00000415226 552 ntTSL 4 BASIC23.01■■□□□ 1.27
ARHGAP29Q52LW3 MELTF-AS1-202ENST00000415244 951 ntTSL 1 (best) BASIC23.01■■□□□ 1.27
ARHGAP29Q52LW3 MYD88-205ENST00000424893 1279 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.01■■□□□ 1.27
ARHGAP29Q52LW3 AC012313.1-204ENST00000444227 462 ntTSL 1 (best) BASIC23.01■■□□□ 1.27
ARHGAP29Q52LW3 EDA-209ENST00000525810 843 ntTSL 1 (best) BASIC23.01■■□□□ 1.27
ARHGAP29Q52LW3 UBE2Q2P2-204ENST00000618775 648 ntTSL 1 (best) BASIC23.01■■□□□ 1.27
ARHGAP29Q52LW3 AP1S1-201ENST00000337619 1306 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.01■■□□□ 1.27
ARHGAP29Q52LW3 EXOG-203ENST00000422077 1317 ntTSL 2 BASIC23.01■■□□□ 1.27
ARHGAP29Q52LW3 RHBDL3-204ENST00000538145 1338 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.01■■□□□ 1.27
ARHGAP29Q52LW3 SDC3-202ENST00000339394 1580 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.01■■□□□ 1.27
ARHGAP29Q52LW3 ANKLE1-204ENST00000594072 2294 ntTSL 5 BASIC23.01■■□□□ 1.27
ARHGAP29Q52LW3 CEL-201ENST00000372080 2384 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23■■□□□ 1.27
ARHGAP29Q52LW3 CDCP1-202ENST00000425231 1416 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23■■□□□ 1.27
ARHGAP29Q52LW3 MAIP1-201ENST00000295079 1495 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC23■■□□□ 1.27
ARHGAP29Q52LW3 TCF7-201ENST00000342854 3045 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23■■□□□ 1.27
ARHGAP29Q52LW3 CTNNAL1-202ENST00000374593 761 ntTSL 3 BASIC23■■□□□ 1.27
ARHGAP29Q52LW3 KRTAP5-2-201ENST00000412090 1118 ntAPPRIS P1 BASIC23■■□□□ 1.27
ARHGAP29Q52LW3 CENPVL3-201ENST00000417339 864 ntAPPRIS P1 BASIC23■■□□□ 1.27
ARHGAP29Q52LW3 ZNF302-209ENST00000507959 854 ntTSL 2 BASIC23■■□□□ 1.27
ARHGAP29Q52LW3 ATOX1-207ENST00000524142 749 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23■■□□□ 1.27
ARHGAP29Q52LW3 ZFPL1-203ENST00000525509 478 ntTSL 2 BASIC23■■□□□ 1.27
ARHGAP29Q52LW3 AP005435.1-201ENST00000529293 1178 ntBASIC23■■□□□ 1.27
ARHGAP29Q52LW3 SUZ12P1-202ENST00000578070 929 ntTSL 5 BASIC23■■□□□ 1.27
ARHGAP29Q52LW3 MIF4GD-211ENST00000580571 952 ntTSL 2 BASIC23■■□□□ 1.27
ARHGAP29Q52LW3 UQCR11-202ENST00000589880 504 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC23■■□□□ 1.27
ARHGAP29Q52LW3 ZNF467-201ENST00000302017 2553 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23■■□□□ 1.27
ARHGAP29Q52LW3 HDAC2-201ENST00000368632 2084 ntTSL 2 BASIC23■■□□□ 1.27
ARHGAP29Q52LW3 AC110285.2-201ENST00000571724 1565 ntTSL 2 BASIC23■■□□□ 1.27
ARHGAP29Q52LW3 TERF2IP-201ENST00000300086 2118 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23■■□□□ 1.27
ARHGAP29Q52LW3 CXXC5-201ENST00000302517 2658 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23■■□□□ 1.27
ARHGAP29Q52LW3 GLIPR2-203ENST00000396613 1917 ntTSL 4 BASIC23■■□□□ 1.27
ARHGAP29Q52LW3 CDCA4-201ENST00000336219 2513 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23■■□□□ 1.27
ARHGAP29Q52LW3 SNX27-204ENST00000458013 6403 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC22.99■■□□□ 1.27
ARHGAP29Q52LW3 FAM3A-208ENST00000419205 1763 ntTSL 2 BASIC22.99■■□□□ 1.27
ARHGAP29Q52LW3 CITED2-203ENST00000537332 1780 ntTSL 3 BASIC22.99■■□□□ 1.27
ARHGAP29Q52LW3 MGAT4B-201ENST00000292591 2446 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.99■■□□□ 1.27
ARHGAP29Q52LW3 GPSM1-201ENST00000291775 2114 ntTSL 1 (best) BASIC22.99■■□□□ 1.27
ARHGAP29Q52LW3 C2CD4B-201ENST00000380392 1579 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.99■■□□□ 1.27
ARHGAP29Q52LW3 TNIP1-205ENST00000518977 2200 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.99■■□□□ 1.27
ARHGAP29Q52LW3 GP9-201ENST00000307395 889 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.99■■□□□ 1.27
ARHGAP29Q52LW3 AC090192.1-201ENST00000517740 490 ntBASIC22.99■■□□□ 1.27
ARHGAP29Q52LW3 H2AFB3-201ENST00000615853 591 ntAPPRIS P1 BASIC22.99■■□□□ 1.27
ARHGAP29Q52LW3 INPP1-201ENST00000322522 1919 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.99■■□□□ 1.27
ARHGAP29Q52LW3 NKIRAS2-204ENST00000393880 1644 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.99■■□□□ 1.27
ARHGAP29Q52LW3 NEU4-205ENST00000407683 2273 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.99■■□□□ 1.27
ARHGAP29Q52LW3 P2RX4-202ENST00000337233 2032 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.99■■□□□ 1.27
ARHGAP29Q52LW3 SPATA22-214ENST00000575375 1374 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.99■■□□□ 1.27
ARHGAP29Q52LW3 MFF-203ENST00000349901 1716 ntTSL 2 BASIC22.99■■□□□ 1.27
ARHGAP29Q52LW3 MESP2-201ENST00000341735 1552 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.98■■□□□ 1.27
ARHGAP29Q52LW3 GADD45A-201ENST00000370985 803 ntTSL 1 (best) BASIC22.98■■□□□ 1.27
ARHGAP29Q52LW3 LHPP-203ENST00000392757 840 ntTSL 3 BASIC22.98■■□□□ 1.27
ARHGAP29Q52LW3 AC080013.1-202ENST00000465477 674 ntTSL 5 BASIC22.98■■□□□ 1.27
ARHGAP29Q52LW3 OTUB1-212ENST00000543988 1259 ntTSL 1 (best) BASIC22.98■■□□□ 1.27
ARHGAP29Q52LW3 GALNS-211ENST00000568311 703 ntTSL 1 (best) BASIC22.98■■□□□ 1.27
ARHGAP29Q52LW3 CCDC92B-201ENST00000575506 885 ntBASIC22.98■■□□□ 1.27
ARHGAP29Q52LW3 SAMD10-201ENST00000369886 2181 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.98■■□□□ 1.27
ARHGAP29Q52LW3 TANGO2-212ENST00000434570 2180 ntTSL 2 BASIC22.98■■□□□ 1.27
ARHGAP29Q52LW3 ZFAND2B-202ENST00000409097 1765 ntTSL 2 BASIC22.98■■□□□ 1.27
ARHGAP29Q52LW3 CHST8-202ENST00000434302 2225 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.98■■□□□ 1.27
ARHGAP29Q52LW3 AC092835.1-201ENST00000425953 1850 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.98■■□□□ 1.27
ARHGAP29Q52LW3 MGAT5B-201ENST00000301618 4486 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC22.98■■□□□ 1.27
ARHGAP29Q52LW3 NDUFAF3-202ENST00000326925 2012 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.98■■□□□ 1.27
ARHGAP29Q52LW3 CAMK2B-216ENST00000440254 2097 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC22.97■■□□□ 1.27
ARHGAP29Q52LW3 MAML1-201ENST00000292599 5723 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.97■■□□□ 1.27
ARHGAP29Q52LW3 CCDC88B-202ENST00000356786 4915 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.97■■□□□ 1.27
ARHGAP29Q52LW3 PGF-201ENST00000238607 1693 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC22.97■■□□□ 1.27
ARHGAP29Q52LW3 SCRN2-212ENST00000584123 1745 ntTSL 1 (best) BASIC22.97■■□□□ 1.27
ARHGAP29Q52LW3 IRX4-208ENST00000622814 2398 ntTSL 1 (best) BASIC22.97■■□□□ 1.27
ARHGAP29Q52LW3 CYB561D2-205ENST00000425346 1319 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.97■■□□□ 1.27
ARHGAP29Q52LW3 AP003356.1-202ENST00000517910 2770 ntTSL 2 BASIC22.97■■□□□ 1.27
ARHGAP29Q52LW3 DISC1-215ENST00000602281 2761 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.97■■□□□ 1.27
ARHGAP29Q52LW3 CBWD3-201ENST00000360171 2165 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.97■■□□□ 1.27
ARHGAP29Q52LW3 SHCBP1L-201ENST00000367547 2317 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.97■■□□□ 1.27
ARHGAP29Q52LW3 STK19-202ENST00000375333 1557 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.97■■□□□ 1.27
ARHGAP29Q52LW3 TMPO-204ENST00000393053 2374 ntTSL 1 (best) BASIC22.97■■□□□ 1.27
ARHGAP29Q52LW3 ILF3-217ENST00000589998 2622 ntTSL 2 BASIC22.96■■□□□ 1.27
ARHGAP29Q52LW3 NAA35-202ENST00000376040 1797 ntTSL 2 BASIC22.96■■□□□ 1.27
ARHGAP29Q52LW3 OTOP1-201ENST00000296358 1864 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.96■■□□□ 1.27
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 45.3 ms