Protein–RNA interactions for Protein: Q502W7

CCDC38, Coiled-coil domain-containing protein 38, humanhuman

Predictions only

Length 563 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CCDC38Q502W7 GCH1-202ENST00000395514 1977 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.52■■□□□ 1.04
CCDC38Q502W7 CRLF3-201ENST00000324238 2957 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.52■■□□□ 1.04
CCDC38Q502W7 TERF2IP-201ENST00000300086 2118 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.52■■□□□ 1.04
CCDC38Q502W7 BASP1-201ENST00000322611 1878 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.52■■□□□ 1.04
CCDC38Q502W7 VDAC1-203ENST00000395047 1873 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.52■■□□□ 1.04
CCDC38Q502W7 USP39-203ENST00000409470 2034 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.52■■□□□ 1.04
CCDC38Q502W7 LINC01089-202ENST00000429892 1521 ntTSL 1 (best) BASIC21.52■■□□□ 1.04
CCDC38Q502W7 FAM20B-201ENST00000263733 5984 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.52■■□□□ 1.04
CCDC38Q502W7 HSPE1-203ENST00000409729 478 ntTSL 2 BASIC21.52■■□□□ 1.04
CCDC38Q502W7 AICDA-202ENST00000537228 667 ntTSL 5 BASIC21.52■■□□□ 1.04
CCDC38Q502W7 OTUB1-212ENST00000543988 1259 ntTSL 1 (best) BASIC21.52■■□□□ 1.04
CCDC38Q502W7 AL136967.2-201ENST00000623968 743 ntBASIC21.52■■□□□ 1.04
CCDC38Q502W7 PARN-205ENST00000539279 1557 ntTSL 2 BASIC21.52■■□□□ 1.04
CCDC38Q502W7 RAB24-201ENST00000303251 1311 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.52■■□□□ 1.03
CCDC38Q502W7 DET1-201ENST00000268148 2267 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.52■■□□□ 1.03
CCDC38Q502W7 ALDOA-221ENST00000566897 2448 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC21.51■■□□□ 1.03
CCDC38Q502W7 ADAMTS2-202ENST00000274609 2044 ntTSL 1 (best) BASIC21.51■■□□□ 1.03
CCDC38Q502W7 ME3-212ENST00000543262 2311 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.51■■□□□ 1.03
CCDC38Q502W7 ULK2-202ENST00000395544 6010 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.51■■□□□ 1.03
CCDC38Q502W7 FAM66B-202ENST00000606573 2630 ntTSL 1 (best) BASIC21.51■■□□□ 1.03
CCDC38Q502W7 MFSD3-201ENST00000301327 1548 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.51■■□□□ 1.03
CCDC38Q502W7 AC133555.3-201ENST00000549950 1693 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC21.51■■□□□ 1.03
CCDC38Q502W7 AC106782.1-201ENST00000550538 1693 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC21.51■■□□□ 1.03
CCDC38Q502W7 LAMTOR1-201ENST00000278671 1179 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.51■■□□□ 1.03
CCDC38Q502W7 TESC-201ENST00000335209 1041 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.51■■□□□ 1.03
CCDC38Q502W7 FDX2-202ENST00000393708 1012 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.51■■□□□ 1.03
CCDC38Q502W7 AC009097.2-201ENST00000562763 465 ntTSL 2 BASIC21.51■■□□□ 1.03
CCDC38Q502W7 DIRAS1-202ENST00000585334 774 ntAPPRIS P1 BASIC21.51■■□□□ 1.03
CCDC38Q502W7 CTAG1A-201ENST00000593606 993 ntTSL 5 BASIC21.51■■□□□ 1.03
CCDC38Q502W7 CYP27A1-201ENST00000258415 2286 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.51■■□□□ 1.03
CCDC38Q502W7 GATA5-201ENST00000252997 2595 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.51■■□□□ 1.03
CCDC38Q502W7 JDP2-201ENST00000267569 1700 ntTSL 1 (best) BASIC21.51■■□□□ 1.03
CCDC38Q502W7 CXCR3-201ENST00000373691 1861 ntTSL 1 (best) BASIC21.51■■□□□ 1.03
CCDC38Q502W7 SMIM11B-205ENST00000624304 1863 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.51■■□□□ 1.03
CCDC38Q502W7 ZNF773-204ENST00000598770 2019 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC21.51■■□□□ 1.03
CCDC38Q502W7 SHCBP1L-201ENST00000367547 2317 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.51■■□□□ 1.03
CCDC38Q502W7 TRAF4-205ENST00000444415 1456 ntTSL 5 BASIC21.51■■□□□ 1.03
CCDC38Q502W7 PXK-203ENST00000383715 1756 ntTSL 5 BASIC21.51■■□□□ 1.03
CCDC38Q502W7 AL049796.1-201ENST00000565336 1766 ntBASIC21.51■■□□□ 1.03
CCDC38Q502W7 DMRTB1-201ENST00000371445 1910 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.51■■□□□ 1.03
CCDC38Q502W7 NSMF-201ENST00000265663 2981 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.51■■□□□ 1.03
CCDC38Q502W7 NSMF-206ENST00000371475 2987 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC21.51■■□□□ 1.03
CCDC38Q502W7 TMEM132A-202ENST00000453848 3346 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.5■■□□□ 1.03
CCDC38Q502W7 KRTAP5-AS1-201ENST00000424148 2265 ntTSL 2 BASIC21.5■■□□□ 1.03
CCDC38Q502W7 MGAT4D-208ENST00000515354 1806 ntTSL 3 BASIC21.5■■□□□ 1.03
CCDC38Q502W7 KCNH2-201ENST00000262186 4286 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.5■■□□□ 1.03
CCDC38Q502W7 RASA4CP-201ENST00000424092 1398 ntBASIC21.5■■□□□ 1.03
CCDC38Q502W7 FADS6-203ENST00000612771 2154 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.5■■□□□ 1.03
CCDC38Q502W7 ZNF821-202ENST00000425432 2000 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.5■■□□□ 1.03
CCDC38Q502W7 ABHD12B-201ENST00000337334 1708 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.5■■□□□ 1.03
CCDC38Q502W7 SIMC1-203ENST00000429602 2694 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.5■■□□□ 1.03
CCDC38Q502W7 RALB-208ENST00000631312 311 ntTSL 5 BASIC21.5■■□□□ 1.03
CCDC38Q502W7 NAE1-203ENST00000379463 1909 ntTSL 2 BASIC21.5■■□□□ 1.03
CCDC38Q502W7 FYN-204ENST00000368678 2573 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC21.5■■□□□ 1.03
CCDC38Q502W7 ACOT2-201ENST00000238651 1774 ntTSL 1 (best) BASIC21.5■■□□□ 1.03
CCDC38Q502W7 ZC3HAV1L-201ENST00000275766 1753 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.5■■□□□ 1.03
CCDC38Q502W7 ZIM2-208ENST00000629319 2253 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.5■■□□□ 1.03
CCDC38Q502W7 CYP2A7-201ENST00000291764 2128 ntTSL 5 BASIC21.5■■□□□ 1.03
CCDC38Q502W7 GNB2-209ENST00000436220 1479 ntTSL 5 BASIC21.5■■□□□ 1.03
CCDC38Q502W7 CCDC107-205ENST00000421582 1324 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC21.5■■□□□ 1.03
CCDC38Q502W7 EGLN2-202ENST00000406058 2150 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.5■■□□□ 1.03
CCDC38Q502W7 LARGE2-208ENST00000531526 2528 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC21.5■■□□□ 1.03
CCDC38Q502W7 VGF-201ENST00000249330 2575 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.49■■□□□ 1.03
CCDC38Q502W7 TXNRD3-204ENST00000640433 1932 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC21.49■■□□□ 1.03
CCDC38Q502W7 AP003419.1-201ENST00000535922 470 ntTSL 3 BASIC21.49■■□□□ 1.03
CCDC38Q502W7 AC104564.5-201ENST00000584986 278 ntTSL 3 BASIC21.49■■□□□ 1.03
CCDC38Q502W7 AL391422.3-201ENST00000603791 2761 ntBASIC21.49■■□□□ 1.03
CCDC38Q502W7 CCDC91-207ENST00000539107 2440 ntTSL 5 BASIC21.49■■□□□ 1.03
CCDC38Q502W7 SUMF2-208ENST00000434526 2052 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.49■■□□□ 1.03
CCDC38Q502W7 SLC26A5-209ENST00000393735 1947 ntTSL 1 (best) BASIC21.49■■□□□ 1.03
CCDC38Q502W7 NNT-AS1-206ENST00000606697 1945 ntTSL 2 BASIC21.49■■□□□ 1.03
CCDC38Q502W7 TBL1Y-201ENST00000346432 2312 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.49■■□□□ 1.03
CCDC38Q502W7 EP300-201ENST00000263253 9587 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.49■■□□□ 1.03
CCDC38Q502W7 SDSL-201ENST00000345635 1397 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.48■■□□□ 1.03
CCDC38Q502W7 TMEM17-201ENST00000335390 1797 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.48■■□□□ 1.03
CCDC38Q502W7 PCDHAC2-203ENST00000615316 3011 ntBASIC21.48■■□□□ 1.03
CCDC38Q502W7 OLIG3-201ENST00000367734 2049 ntAPPRIS P1 BASIC21.48■■□□□ 1.03
CCDC38Q502W7 FAM129C-203ENST00000449408 2004 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC21.48■■□□□ 1.03
CCDC38Q502W7 CREB3-201ENST00000353704 1832 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.48■■□□□ 1.03
CCDC38Q502W7 MOGS-201ENST00000233616 2895 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.48■■□□□ 1.03
CCDC38Q502W7 CRHR1-203ENST00000339069 2490 ntTSL 2 BASIC21.48■■□□□ 1.03
CCDC38Q502W7 TMEM125-201ENST00000432792 1850 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.48■■□□□ 1.03
CCDC38Q502W7 AC091305.1-201ENST00000479476 895 ntBASIC21.48■■□□□ 1.03
CCDC38Q502W7 SUDS3P1-201ENST00000505831 966 ntBASIC21.48■■□□□ 1.03
CCDC38Q502W7 LHX6-201ENST00000340587 3457 ntTSL 1 (best) BASIC21.48■■□□□ 1.03
CCDC38Q502W7 INSM1-201ENST00000310227 2829 ntAPPRIS P1 BASIC21.48■■□□□ 1.03
CCDC38Q502W7 C11orf96-201ENST00000339446 1308 ntTSL 5 BASIC21.48■■□□□ 1.03
CCDC38Q502W7 GJC2-201ENST00000366714 2243 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.48■■□□□ 1.03
CCDC38Q502W7 PDXDC1-205ENST00000535621 2048 ntTSL 1 (best) BASIC21.48■■□□□ 1.03
CCDC38Q502W7 PATZ1-201ENST00000215919 2516 ntTSL 1 (best) BASIC21.48■■□□□ 1.03
CCDC38Q502W7 C7orf43-201ENST00000316937 2520 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.48■■□□□ 1.03
CCDC38Q502W7 CDCA4-201ENST00000336219 2513 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.48■■□□□ 1.03
CCDC38Q502W7 CACNA1I-204ENST00000407673 5952 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.48■■□□□ 1.03
CCDC38Q502W7 MGAT3-201ENST00000341184 5062 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.48■■□□□ 1.03
CCDC38Q502W7 IL17RE-206ENST00000454190 2757 ntTSL 2 BASIC21.48■■□□□ 1.03
CCDC38Q502W7 GRINA-201ENST00000313269 1968 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.47■■□□□ 1.03
CCDC38Q502W7 PAQR9-201ENST00000340634 2452 ntAPPRIS P1 BASIC21.47■■□□□ 1.03
CCDC38Q502W7 DPP10-203ENST00000393147 2758 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.47■■□□□ 1.03
CCDC38Q502W7 E4F1-206ENST00000565090 2028 ntTSL 1 (best) BASIC21.47■■□□□ 1.03
CCDC38Q502W7 HES3-201ENST00000377898 697 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.47■■□□□ 1.03
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 22.3 ms