Protein–RNA interactions for Protein: Q4ZG55

GREB1, Protein GREB1, humanhuman

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Length 1,949 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
GREB1Q4ZG55 EIF4E3-203ENST00000421769 777 ntTSL 1 (best) BASIC21.79■■□□□ 1.08
GREB1Q4ZG55 AC068987.5-201ENST00000642069 987 ntAPPRIS P1 BASIC21.79■■□□□ 1.08
GREB1Q4ZG55 MAN2C1-244ENST00000618257 1346 ntTSL 5 BASIC21.79■■□□□ 1.08
GREB1Q4ZG55 MDFI-203ENST00000373051 1622 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.79■■□□□ 1.08
GREB1Q4ZG55 TSC22D3-205ENST00000372390 1812 ntTSL 1 (best) BASIC21.79■■□□□ 1.08
GREB1Q4ZG55 GRINA-202ENST00000395068 1814 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.79■■□□□ 1.08
GREB1Q4ZG55 TMEM125-201ENST00000432792 1850 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.79■■□□□ 1.08
GREB1Q4ZG55 LMLN-210ENST00000482695 2010 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.79■■□□□ 1.08
GREB1Q4ZG55 RNF149-201ENST00000295317 2458 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.79■■□□□ 1.08
GREB1Q4ZG55 FAM19A5-202ENST00000358295 2638 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.79■■□□□ 1.08
GREB1Q4ZG55 ARL2-SNX15-201ENST00000301886 2392 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.79■■□□□ 1.08
GREB1Q4ZG55 KLHL17-205ENST00000622660 1950 ntTSL 5 BASIC21.79■■□□□ 1.08
GREB1Q4ZG55 ZGPAT-204ENST00000369967 1890 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.79■■□□□ 1.08
GREB1Q4ZG55 NELFE-202ENST00000375429 1584 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.78■■□□□ 1.08
GREB1Q4ZG55 LINC00605-201ENST00000514902 1558 ntTSL 1 (best) BASIC21.78■■□□□ 1.08
GREB1Q4ZG55 NOXO1-202ENST00000356120 1539 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.78■■□□□ 1.08
GREB1Q4ZG55 RNASET2-203ENST00000366855 1417 ntTSL 5 BASIC21.78■■□□□ 1.08
GREB1Q4ZG55 FMR1-202ENST00000334557 1295 ntTSL 1 (best) BASIC21.78■■□□□ 1.08
GREB1Q4ZG55 CBY3-201ENST00000376974 785 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.78■■□□□ 1.08
GREB1Q4ZG55 NOXO1-203ENST00000397280 1147 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.78■■□□□ 1.08
GREB1Q4ZG55 DGCR6L-202ENST00000405465 962 ntTSL 3 BASIC21.78■■□□□ 1.08
GREB1Q4ZG55 PBX1-209ENST00000485769 834 ntTSL 2 BASIC21.78■■□□□ 1.08
GREB1Q4ZG55 TP53I11-215ENST00000531928 1078 ntTSL 3 BASIC21.78■■□□□ 1.08
GREB1Q4ZG55 BEAN1-AS1-201ENST00000564618 533 ntTSL 4 BASIC21.78■■□□□ 1.08
GREB1Q4ZG55 SIN3B-209ENST00000596802 2556 ntTSL 1 (best) BASIC21.78■■□□□ 1.08
GREB1Q4ZG55 CNTFR-202ENST00000378980 2052 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.78■■□□□ 1.08
GREB1Q4ZG55 HIRA-202ENST00000340170 3395 ntTSL 1 (best) BASIC21.78■■□□□ 1.08
GREB1Q4ZG55 SPOP-206ENST00000504102 1865 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.78■■□□□ 1.08
GREB1Q4ZG55 PRSS33-202ENST00000570702 1676 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.78■■□□□ 1.08
GREB1Q4ZG55 LINC00471-201ENST00000313064 1282 ntTSL 1 (best) BASIC21.78■■□□□ 1.08
GREB1Q4ZG55 ASIP-201ENST00000374954 586 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.78■■□□□ 1.08
GREB1Q4ZG55 TFG-201ENST00000240851 1978 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.78■■□□□ 1.08
GREB1Q4ZG55 SMUG1-202ENST00000337581 1571 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.77■■□□□ 1.08
GREB1Q4ZG55 ARL6IP4-220ENST00000543566 1591 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.77■■□□□ 1.08
GREB1Q4ZG55 FOXN3-209ENST00000555353 1595 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.77■■□□□ 1.08
GREB1Q4ZG55 CCS-208ENST00000533244 1430 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.77■■□□□ 1.08
GREB1Q4ZG55 CENPN-201ENST00000299572 1398 ntTSL 1 (best) BASIC21.77■■□□□ 1.08
GREB1Q4ZG55 ANKRD65-202ENST00000442470 876 ntTSL 2 BASIC21.77■■□□□ 1.08
GREB1Q4ZG55 AC091874.3-201ENST00000512672 1195 ntBASIC21.77■■□□□ 1.08
GREB1Q4ZG55 PTMS-207ENST00000619580 1150 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.77■■□□□ 1.08
GREB1Q4ZG55 OGFR-204ENST00000621591 1194 ntTSL 5 BASIC21.77■■□□□ 1.08
GREB1Q4ZG55 KRT17P1-201ENST00000399211 1546 ntBASIC21.77■■□□□ 1.08
GREB1Q4ZG55 NAT16-204ENST00000455377 1492 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.77■■□□□ 1.08
GREB1Q4ZG55 TCP11-203ENST00000373974 1689 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC21.76■■□□□ 1.07
GREB1Q4ZG55 EXOC3-AS1-202ENST00000623673 1663 ntBASIC21.76■■□□□ 1.07
GREB1Q4ZG55 CAPN12-212ENST00000601953 2381 ntTSL 5 BASIC21.76■■□□□ 1.07
GREB1Q4ZG55 VMO1-204ENST00000441199 741 ntTSL 2 BASIC21.76■■□□□ 1.07
GREB1Q4ZG55 AC016588.1-201ENST00000591533 542 ntTSL 4 BASIC21.76■■□□□ 1.07
GREB1Q4ZG55 NOTUM-201ENST00000409678 2329 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.76■■□□□ 1.07
GREB1Q4ZG55 RFLNA-201ENST00000324038 2148 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC21.76■■□□□ 1.07
GREB1Q4ZG55 FARP2-223ENST00000627550 2122 ntTSL 2 BASIC21.76■■□□□ 1.07
GREB1Q4ZG55 MTAP-204ENST00000460874 1434 ntTSL 2 BASIC21.76■■□□□ 1.07
GREB1Q4ZG55 MRPL40-201ENST00000333130 1387 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.76■■□□□ 1.07
GREB1Q4ZG55 SAPCD2P1-201ENST00000395413 1184 ntBASIC21.76■■□□□ 1.07
GREB1Q4ZG55 PTGIR-205ENST00000597185 775 ntTSL 3 BASIC21.76■■□□□ 1.07
GREB1Q4ZG55 FAM21FP-204ENST00000608637 956 ntBASIC21.76■■□□□ 1.07
GREB1Q4ZG55 LAYN-201ENST00000375614 2066 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.76■■□□□ 1.07
GREB1Q4ZG55 SPATA2L-201ENST00000289805 2335 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.76■■□□□ 1.07
GREB1Q4ZG55 FUZ-212ENST00000528094 1479 ntTSL 2 BASIC21.76■■□□□ 1.07
GREB1Q4ZG55 TSSK1B-201ENST00000390666 2478 ntAPPRIS P1 BASIC21.76■■□□□ 1.07
GREB1Q4ZG55 AC087633.2-202ENST00000565166 1439 ntBASIC21.76■■□□□ 1.07
GREB1Q4ZG55 DAZAP1-211ENST00000592522 2157 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC21.75■■□□□ 1.07
GREB1Q4ZG55 ZNF843-201ENST00000315678 2137 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC21.75■■□□□ 1.07
GREB1Q4ZG55 GCH1-205ENST00000536224 1805 ntTSL 1 (best) BASIC21.75■■□□□ 1.07
GREB1Q4ZG55 MIPEPP3-201ENST00000412105 444 ntBASIC21.75■■□□□ 1.07
GREB1Q4ZG55 AL391244.2-201ENST00000428932 543 ntTSL 2 BASIC21.75■■□□□ 1.07
GREB1Q4ZG55 AC008694.1-202ENST00000636953 945 ntBASIC21.75■■□□□ 1.07
GREB1Q4ZG55 SLC10A3-201ENST00000263512 2161 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC21.75■■□□□ 1.07
GREB1Q4ZG55 FOXJ1-201ENST00000322957 2641 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.75■■□□□ 1.07
GREB1Q4ZG55 LYPD1-202ENST00000397463 1891 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.75■■□□□ 1.07
GREB1Q4ZG55 IVD-206ENST00000487418 1809 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.75■■□□□ 1.07
GREB1Q4ZG55 COL8A2-203ENST00000481785 2036 ntTSL 1 (best) BASIC21.75■■□□□ 1.07
GREB1Q4ZG55 VKORC1L1-202ENST00000434382 1541 ntTSL 2 BASIC21.75■■□□□ 1.07
GREB1Q4ZG55 KHDRBS1-204ENST00000492989 1215 ntTSL 1 (best) BASIC21.74■■□□□ 1.07
GREB1Q4ZG55 RPL29-209ENST00000495383 713 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.74■■□□□ 1.07
GREB1Q4ZG55 UNC93B6-201ENST00000525262 1143 ntTSL 5 BASIC21.74■■□□□ 1.07
GREB1Q4ZG55 AC138028.5-201ENST00000566114 558 ntTSL 5 BASIC21.74■■□□□ 1.07
GREB1Q4ZG55 AC006435.1-201ENST00000571775 1065 ntTSL 5 BASIC21.74■■□□□ 1.07
GREB1Q4ZG55 MAGIX-202ENST00000595224 1238 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC21.74■■□□□ 1.07
GREB1Q4ZG55 PFKL-212ENST00000628044 129 ntTSL 3 BASIC21.74■■□□□ 1.07
GREB1Q4ZG55 AC093762.2-201ENST00000641700 291 ntAPPRIS P1 BASIC21.74■■□□□ 1.07
GREB1Q4ZG55 CENPB-201ENST00000379751 2840 ntAPPRIS P1 BASIC21.74■■□□□ 1.07
GREB1Q4ZG55 SHMT1-201ENST00000316694 2464 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.74■■□□□ 1.07
GREB1Q4ZG55 GAS1-201ENST00000298743 2827 ntAPPRIS P1 BASIC21.74■■□□□ 1.07
GREB1Q4ZG55 HOXA11-AS-204ENST00000522674 1549 ntTSL 1 (best) BASIC21.74■■□□□ 1.07
GREB1Q4ZG55 FUZ-216ENST00000533418 1524 ntTSL 5 BASIC21.74■■□□□ 1.07
GREB1Q4ZG55 PRR7-202ENST00000502922 1345 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.74■■□□□ 1.07
GREB1Q4ZG55 KATNAL2-208ENST00000592005 1348 ntTSL 1 (best) BASIC21.74■■□□□ 1.07
GREB1Q4ZG55 SH3GL1-206ENST00000598564 2194 ntTSL 2 BASIC21.74■■□□□ 1.07
GREB1Q4ZG55 PTPA-214ENST00000423100 988 ntTSL 2 BASIC21.74■■□□□ 1.07
GREB1Q4ZG55 CYP2T3P-201ENST00000601990 817 ntBASIC21.74■■□□□ 1.07
GREB1Q4ZG55 AC092118.2-201ENST00000613495 667 ntBASIC21.74■■□□□ 1.07
GREB1Q4ZG55 AC133041.1-202ENST00000642053 222 ntBASIC21.74■■□□□ 1.07
GREB1Q4ZG55 CDKN2C-203ENST00000396148 2086 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.74■■□□□ 1.07
GREB1Q4ZG55 SNX21-201ENST00000342644 1506 ntTSL 1 (best) BASIC21.74■■□□□ 1.07
GREB1Q4ZG55 TMEM9B-201ENST00000309134 1659 ntTSL 1 (best) BASIC21.73■■□□□ 1.07
GREB1Q4ZG55 LIMS2-201ENST00000324938 2111 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.73■■□□□ 1.07
GREB1Q4ZG55 AC116050.2-201ENST00000612102 1779 ntBASIC21.73■■□□□ 1.07
GREB1Q4ZG55 GTPBP6-201ENST00000326153 1907 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.73■■□□□ 1.07
GREB1Q4ZG55 MESP1-201ENST00000300057 2369 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.73■■□□□ 1.07
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