Protein–RNA interactions for Protein: Q3B726

TWISTNB, DNA-directed RNA polymerase I subunit RPA43, humanhuman

Predicted RBP Predictions only

Length 338 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
TWISTNBQ3B726 AL121761.1-202ENST00000412571 415 ntTSL 2 BASIC26.86■■□□□ 1.89
TWISTNBQ3B726 NDUFS3-207ENST00000529276 558 ntTSL 2 BASIC26.86■■□□□ 1.89
TWISTNBQ3B726 PARN-205ENST00000539279 1557 ntTSL 2 BASIC26.86■■□□□ 1.89
TWISTNBQ3B726 ZBTB42-202ENST00000555360 1411 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.86■■□□□ 1.89
TWISTNBQ3B726 CPNE9-203ENST00000383832 2068 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC26.86■■□□□ 1.89
TWISTNBQ3B726 TBXA2R-202ENST00000411851 1494 ntTSL 2 BASIC26.86■■□□□ 1.89
TWISTNBQ3B726 SLC1A6-203ENST00000544886 2420 ntTSL 1 (best) BASIC26.86■■□□□ 1.89
TWISTNBQ3B726 TBL1X-201ENST00000217964 5871 ntTSL 1 (best) BASIC26.86■■□□□ 1.89
TWISTNBQ3B726 AL021707.1-201ENST00000416406 500 ntTSL 3 BASIC26.85■■□□□ 1.89
TWISTNBQ3B726 CROCCP5-201ENST00000436658 830 ntBASIC26.85■■□□□ 1.89
TWISTNBQ3B726 AC105001.1-201ENST00000506149 821 ntTSL 1 (best) BASIC26.85■■□□□ 1.89
TWISTNBQ3B726 SLC25A29-212ENST00000555927 960 ntTSL 2 BASIC26.85■■□□□ 1.89
TWISTNBQ3B726 PLLP-204ENST00000569059 665 ntTSL 3 BASIC26.85■■□□□ 1.89
TWISTNBQ3B726 GPX1-204ENST00000620890 897 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC26.85■■□□□ 1.89
TWISTNBQ3B726 PARP1-210ENST00000629232 477 ntTSL 5 BASIC26.85■■□□□ 1.89
TWISTNBQ3B726 PNLIPRP2-204ENST00000591655 1456 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC26.85■■□□□ 1.89
TWISTNBQ3B726 POMGNT2-201ENST00000344697 2544 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.85■■□□□ 1.89
TWISTNBQ3B726 HENMT1-203ENST00000402983 1696 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC26.85■■□□□ 1.89
TWISTNBQ3B726 FNDC10-201ENST00000422725 2085 ntAPPRIS P1 BASIC26.85■■□□□ 1.89
TWISTNBQ3B726 ZIM2-201ENST00000593711 2083 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.85■■□□□ 1.89
TWISTNBQ3B726 LPCAT4-201ENST00000314891 2262 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.85■■□□□ 1.89
TWISTNBQ3B726 ZBTB22-208ENST00000431845 2651 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.84■■□□□ 1.89
TWISTNBQ3B726 FEM1AP4-201ENST00000443167 1987 ntBASIC26.84■■□□□ 1.89
TWISTNBQ3B726 MOB2-201ENST00000329957 1207 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC26.84■■□□□ 1.89
TWISTNBQ3B726 AC007322.1-201ENST00000426983 750 ntBASIC26.84■■□□□ 1.89
TWISTNBQ3B726 AC007322.4-201ENST00000509611 723 ntBASIC26.84■■□□□ 1.89
TWISTNBQ3B726 AC012313.6-201ENST00000599889 790 ntTSL 3 BASIC26.84■■□□□ 1.89
TWISTNBQ3B726 SEC61A2-205ENST00000379033 2462 ntTSL 2 BASIC26.84■■□□□ 1.89
TWISTNBQ3B726 VGF-202ENST00000445482 2477 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC26.83■■□□□ 1.89
TWISTNBQ3B726 DPF1-201ENST00000355526 1632 ntTSL 1 (best) BASIC26.83■■□□□ 1.89
TWISTNBQ3B726 S1PR5-204ENST00000617721 1698 ntTSL 5 BASIC26.83■■□□□ 1.89
TWISTNBQ3B726 RAMP2-201ENST00000253796 780 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC26.83■■□□□ 1.89
TWISTNBQ3B726 ZNF451-202ENST00000370702 458 ntTSL 2 BASIC26.83■■□□□ 1.89
TWISTNBQ3B726 AC091799.1-201ENST00000422823 811 ntBASIC26.83■■□□□ 1.89
TWISTNBQ3B726 RBKS-201ENST00000302188 1973 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.83■■□□□ 1.89
TWISTNBQ3B726 CERS4-209ENST00000559450 1637 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC26.83■■□□□ 1.88
TWISTNBQ3B726 CPEB1-218ENST00000620182 2422 ntTSL 2 BASIC26.82■■□□□ 1.88
TWISTNBQ3B726 ILDR2-204ENST00000525740 2242 ntTSL 5 BASIC26.82■■□□□ 1.88
TWISTNBQ3B726 TOP2B-204ENST00000435706 5389 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC26.82■■□□□ 1.88
TWISTNBQ3B726 TPTEP1-205ENST00000558085 1738 ntTSL 2 BASIC26.82■■□□□ 1.88
TWISTNBQ3B726 TPD52L1-201ENST00000304877 1468 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC26.82■■□□□ 1.88
TWISTNBQ3B726 TAF9-201ENST00000217893 1283 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC26.82■■□□□ 1.88
TWISTNBQ3B726 TMEM218-207ENST00000528724 1117 ntTSL 5 BASIC26.82■■□□□ 1.88
TWISTNBQ3B726 TMEM218-214ENST00000532156 954 ntTSL 1 (best) BASIC26.82■■□□□ 1.88
TWISTNBQ3B726 FNDC5-207ENST00000640867 639 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC26.82■■□□□ 1.88
TWISTNBQ3B726 ALX3-201ENST00000369792 1859 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.82■■□□□ 1.88
TWISTNBQ3B726 ARNTL2-209ENST00000546179 1861 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC26.82■■□□□ 1.88
TWISTNBQ3B726 TRIM67-203ENST00000449018 2166 ntTSL 1 (best) BASIC26.82■■□□□ 1.88
TWISTNBQ3B726 TEAD2-208ENST00000598810 2191 ntTSL 1 (best) BASIC26.82■■□□□ 1.88
TWISTNBQ3B726 CHST8-202ENST00000434302 2225 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC26.82■■□□□ 1.88
TWISTNBQ3B726 TMEM178A-201ENST00000281961 1662 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.82■■□□□ 1.88
TWISTNBQ3B726 YWHAZ-205ENST00000395956 2974 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.82■■□□□ 1.88
TWISTNBQ3B726 AC068338.2-201ENST00000563278 1430 ntBASIC26.82■■□□□ 1.88
TWISTNBQ3B726 RASGEF1C-201ENST00000361132 2243 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.81■■□□□ 1.88
TWISTNBQ3B726 PGPEP1L-201ENST00000378919 995 ntTSL 1 (best) BASIC26.81■■□□□ 1.88
TWISTNBQ3B726 CD44-222ENST00000526025 1052 ntTSL 2 BASIC26.81■■□□□ 1.88
TWISTNBQ3B726 Z97986.1-201ENST00000565879 476 ntTSL 5 BASIC26.81■■□□□ 1.88
TWISTNBQ3B726 PARD6A-203ENST00000602551 1171 ntTSL 5 BASIC26.81■■□□□ 1.88
TWISTNBQ3B726 AL050303.2-201ENST00000619798 666 ntBASIC26.81■■□□□ 1.88
TWISTNBQ3B726 POU5F1-209ENST00000638788 369 ntTSL 5 BASIC26.81■■□□□ 1.88
TWISTNBQ3B726 GRK4-201ENST00000345167 2013 ntTSL 1 (best) BASIC26.81■■□□□ 1.88
TWISTNBQ3B726 ARHGAP27-201ENST00000290470 1376 ntTSL 1 (best) BASIC26.81■■□□□ 1.88
TWISTNBQ3B726 P2RX4-202ENST00000337233 2032 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.8■■□□□ 1.88
TWISTNBQ3B726 IRAK3-203ENST00000545837 1579 ntTSL 1 (best) BASIC26.8■■□□□ 1.88
TWISTNBQ3B726 AF106564.1-201ENST00000607058 2553 ntBASIC26.8■■□□□ 1.88
TWISTNBQ3B726 PANO1-201ENST00000620120 1680 ntAPPRIS P1 BASIC26.8■■□□□ 1.88
TWISTNBQ3B726 AIDA-202ENST00000355727 1072 ntTSL 5 BASIC26.8■■□□□ 1.88
TWISTNBQ3B726 APTR-203ENST00000430801 583 ntTSL 5 BASIC26.8■■□□□ 1.88
TWISTNBQ3B726 POLE4-205ENST00000483063 1248 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.8■■□□□ 1.88
TWISTNBQ3B726 C11orf24-209ENST00000533310 980 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC26.8■■□□□ 1.88
TWISTNBQ3B726 RAP1B-220ENST00000539091 977 ntTSL 2 BASIC26.8■■□□□ 1.88
TWISTNBQ3B726 MFSD14C-203ENST00000602917 786 ntAPPRIS P5 TSL 1 (best) BASIC26.8■■□□□ 1.88
TWISTNBQ3B726 GGTLC3-201ENST00000619998 968 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC26.8■■□□□ 1.88
TWISTNBQ3B726 NTN4-207ENST00000553059 1818 ntTSL 1 (best) BASIC26.8■■□□□ 1.88
TWISTNBQ3B726 TRIM28-201ENST00000253024 2960 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.8■■□□□ 1.88
TWISTNBQ3B726 SERPINB5-201ENST00000382771 2783 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.8■■□□□ 1.88
TWISTNBQ3B726 LINC00605-201ENST00000514902 1558 ntTSL 1 (best) BASIC26.8■■□□□ 1.88
TWISTNBQ3B726 KAT2B-201ENST00000263754 4833 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.79■■□□□ 1.88
TWISTNBQ3B726 OSR1-201ENST00000272223 1936 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.79■■□□□ 1.88
TWISTNBQ3B726 TM4SF5-201ENST00000270560 708 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.79■■□□□ 1.88
TWISTNBQ3B726 SLC22A15-201ENST00000369502 1230 ntTSL 2 BASIC26.79■■□□□ 1.88
TWISTNBQ3B726 MIR663A-201ENST00000385250 93 ntBASIC26.79■■□□□ 1.88
TWISTNBQ3B726 AL645608.9-201ENST00000442292 829 ntTSL 1 (best) BASIC26.79■■□□□ 1.88
TWISTNBQ3B726 LOXL1-AS1-208ENST00000565756 885 ntTSL 2 BASIC26.79■■□□□ 1.88
TWISTNBQ3B726 AC005181.1-201ENST00000604782 1256 ntBASIC26.79■■□□□ 1.88
TWISTNBQ3B726 GDF6-203ENST00000621429 1179 ntTSL 5 BASIC26.79■■□□□ 1.88
TWISTNBQ3B726 UBXN2B-206ENST00000638450 591 ntTSL 5 BASIC26.79■■□□□ 1.88
TWISTNBQ3B726 RAB11FIP3-201ENST00000262305 4831 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC26.79■■□□□ 1.88
TWISTNBQ3B726 TRIM15-210ENST00000619857 2217 ntTSL 5 BASIC26.79■■□□□ 1.88
TWISTNBQ3B726 IKBKG-206ENST00000594239 2299 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC26.79■■□□□ 1.88
TWISTNBQ3B726 MAMSTR-202ENST00000356751 1825 ntTSL 2 BASIC26.79■■□□□ 1.88
TWISTNBQ3B726 LINC01117-201ENST00000443670 699 ntTSL 5 BASIC26.78■■□□□ 1.88
TWISTNBQ3B726 PET100-202ENST00000594797 719 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.78■■□□□ 1.88
TWISTNBQ3B726 AL161421.1-201ENST00000619666 1101 ntTSL 1 (best) BASIC26.78■■□□□ 1.88
TWISTNBQ3B726 AC244517.4-202ENST00000624089 484 ntTSL 3 BASIC26.78■■□□□ 1.88
TWISTNBQ3B726 IGFBP1-203ENST00000468955 1369 ntTSL 5 BASIC26.78■■□□□ 1.88
TWISTNBQ3B726 SIRT3-202ENST00000524564 1395 ntTSL 2 BASIC26.78■■□□□ 1.88
TWISTNBQ3B726 CASP16P-201ENST00000428155 1433 ntTSL 1 (best) BASIC26.78■■□□□ 1.88
TWISTNBQ3B726 C7orf49-213ENST00000617987 1727 ntTSL 5 BASIC26.78■■□□□ 1.88
TWISTNBQ3B726 NAPEPLD-208ENST00000427257 1822 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC26.78■■□□□ 1.88
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 20.3 ms