Protein–RNA interactions for Protein: Q2YD98

UVSSA, UV-stimulated scaffold protein A, humanhuman

Predictions only

Length 709 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
UVSSAQ2YD98 SCOC-207ENST00000506597 1838 ntTSL 1 (best) BASIC23.76■■□□□ 1.39
UVSSAQ2YD98 CEP104-201ENST00000378223 1121 ntTSL 1 (best) BASIC23.76■■□□□ 1.39
UVSSAQ2YD98 AL499627.2-201ENST00000606283 725 ntBASIC23.76■■□□□ 1.39
UVSSAQ2YD98 FAM53A-202ENST00000461064 2159 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.76■■□□□ 1.39
UVSSAQ2YD98 SLC16A5-201ENST00000329783 1934 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.76■■□□□ 1.39
UVSSAQ2YD98 PNMA2-204ENST00000522362 4965 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.76■■□□□ 1.39
UVSSAQ2YD98 MOGS-201ENST00000233616 2895 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.76■■□□□ 1.39
UVSSAQ2YD98 CAMKK2-208ENST00000412367 2006 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.76■■□□□ 1.39
UVSSAQ2YD98 PEX5-204ENST00000412720 2105 ntTSL 2 BASIC23.75■■□□□ 1.39
UVSSAQ2YD98 GTPBP3-222ENST00000600625 2493 ntTSL 1 (best) BASIC23.75■■□□□ 1.39
UVSSAQ2YD98 LENG1-201ENST00000222224 1542 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.75■■□□□ 1.39
UVSSAQ2YD98 ZNF276-208ENST00000568064 2203 ntTSL 5 BASIC23.75■■□□□ 1.39
UVSSAQ2YD98 STK19-202ENST00000375333 1557 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.75■■□□□ 1.39
UVSSAQ2YD98 TLE3-216ENST00000559191 1575 ntTSL 5 BASIC23.75■■□□□ 1.39
UVSSAQ2YD98 UBE2C-202ENST00000335046 737 ntTSL 2 BASIC23.75■■□□□ 1.39
UVSSAQ2YD98 UBE2J2-203ENST00000360466 1047 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.75■■□□□ 1.39
UVSSAQ2YD98 C20orf144-201ENST00000375222 571 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.75■■□□□ 1.39
UVSSAQ2YD98 LRRK1-208ENST00000532029 1241 ntTSL 1 (best) BASIC23.75■■□□□ 1.39
UVSSAQ2YD98 TRAF4-217ENST00000618771 543 ntTSL 5 BASIC23.75■■□□□ 1.39
UVSSAQ2YD98 AC133555.3-201ENST00000549950 1693 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC23.75■■□□□ 1.39
UVSSAQ2YD98 AC106782.1-201ENST00000550538 1693 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC23.75■■□□□ 1.39
UVSSAQ2YD98 HOXC13-201ENST00000243056 2423 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.75■■□□□ 1.39
UVSSAQ2YD98 IRX3-201ENST00000329734 2601 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.75■■□□□ 1.39
UVSSAQ2YD98 TRABD2A-201ENST00000335459 1844 ntTSL 1 (best) BASIC23.75■■□□□ 1.39
UVSSAQ2YD98 AC016065.1-201ENST00000500118 2413 ntTSL 2 BASIC23.74■■□□□ 1.39
UVSSAQ2YD98 FBXL19-207ENST00000565690 2570 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.74■■□□□ 1.39
UVSSAQ2YD98 HSD11B1L-218ENST00000581773 1687 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.74■■□□□ 1.39
UVSSAQ2YD98 SPHK1-203ENST00000545180 2238 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC23.74■■□□□ 1.39
UVSSAQ2YD98 DISC1-215ENST00000602281 2761 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.74■■□□□ 1.39
UVSSAQ2YD98 PAXIP1-AS1-201ENST00000608317 2256 ntBASIC23.74■■□□□ 1.39
UVSSAQ2YD98 AK1-201ENST00000223836 736 ntTSL 3 BASIC23.74■■□□□ 1.39
UVSSAQ2YD98 HES3-201ENST00000377898 697 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.74■■□□□ 1.39
UVSSAQ2YD98 IGHV3-20-201ENST00000390606 415 ntAPPRIS P1 BASIC23.74■■□□□ 1.39
UVSSAQ2YD98 LYPD1-202ENST00000397463 1891 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.74■■□□□ 1.39
UVSSAQ2YD98 PARP2-202ENST00000429687 1881 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.74■■□□□ 1.39
UVSSAQ2YD98 MAP1LC3A-201ENST00000360668 1574 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.74■■□□□ 1.39
UVSSAQ2YD98 NKIRAS2-204ENST00000393880 1644 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.73■■□□□ 1.39
UVSSAQ2YD98 GOLGA6L9-202ENST00000618348 1710 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.73■■□□□ 1.39
UVSSAQ2YD98 LAYN-204ENST00000525126 1763 ntTSL 5 BASIC23.73■■□□□ 1.39
UVSSAQ2YD98 REV1-201ENST00000258428 4751 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.73■■□□□ 1.39
UVSSAQ2YD98 MBD1-216ENST00000587605 1945 ntTSL 2 BASIC23.73■■□□□ 1.39
UVSSAQ2YD98 OLIG3-201ENST00000367734 2049 ntAPPRIS P1 BASIC23.73■■□□□ 1.39
UVSSAQ2YD98 AC126544.1-201ENST00000580842 1059 ntBASIC23.73■■□□□ 1.39
UVSSAQ2YD98 TDRD10-202ENST00000368482 2331 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.73■■□□□ 1.39
UVSSAQ2YD98 FAM185A-201ENST00000409231 1446 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC23.73■■□□□ 1.39
UVSSAQ2YD98 NR2F1-AS1-210ENST00000606739 1431 ntTSL 2 BASIC23.73■■□□□ 1.39
UVSSAQ2YD98 FAM47E-201ENST00000424749 1484 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC23.73■■□□□ 1.39
UVSSAQ2YD98 TERF1-202ENST00000276603 1677 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC23.73■■□□□ 1.39
UVSSAQ2YD98 ST7L-221ENST00000490067 1780 ntTSL 1 (best) BASIC23.73■■□□□ 1.39
UVSSAQ2YD98 SUMF2-201ENST00000275607 1894 ntTSL 1 (best) BASIC23.73■■□□□ 1.39
UVSSAQ2YD98 DMWD-202ENST00000377735 3292 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.72■■□□□ 1.39
UVSSAQ2YD98 AC008105.1-201ENST00000587534 2003 ntTSL 2 BASIC23.72■■□□□ 1.39
UVSSAQ2YD98 SLC35E4-202ENST00000406566 2081 ntTSL 1 (best) BASIC23.72■■□□□ 1.39
UVSSAQ2YD98 AFG3L1P-217ENST00000557444 2447 ntBASIC23.72■■□□□ 1.39
UVSSAQ2YD98 ME2-218ENST00000640965 2476 ntTSL 5 BASIC23.72■■□□□ 1.39
UVSSAQ2YD98 NARS2-201ENST00000281038 2519 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.72■■□□□ 1.39
UVSSAQ2YD98 TMEM61-201ENST00000371268 1097 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.72■■□□□ 1.39
UVSSAQ2YD98 AL162430.1-201ENST00000480705 870 ntBASIC23.72■■□□□ 1.39
UVSSAQ2YD98 LINC01574-201ENST00000512115 560 ntTSL 2 BASIC23.72■■□□□ 1.39
UVSSAQ2YD98 HERC2P4-206ENST00000568097 1062 ntTSL 5 BASIC23.72■■□□□ 1.39
UVSSAQ2YD98 AC008105.3-201ENST00000586376 844 ntTSL 3 BASIC23.72■■□□□ 1.39
UVSSAQ2YD98 HOXB7-201ENST00000239165 1371 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.72■■□□□ 1.39
UVSSAQ2YD98 CEBPE-201ENST00000206513 1554 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.72■■□□□ 1.39
UVSSAQ2YD98 PHF10-202ENST00000366780 1589 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.72■■□□□ 1.39
UVSSAQ2YD98 DTX2-212ENST00000446820 1770 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.72■■□□□ 1.39
UVSSAQ2YD98 RBM45-207ENST00000616198 1788 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC23.72■■□□□ 1.39
UVSSAQ2YD98 HMOX2-208ENST00000570646 2147 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.72■■□□□ 1.39
UVSSAQ2YD98 OGG1-202ENST00000302008 2191 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.72■■□□□ 1.39
UVSSAQ2YD98 TRPV6-209ENST00000638686 2298 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.72■■□□□ 1.39
UVSSAQ2YD98 UGP2-201ENST00000337130 2338 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.72■■□□□ 1.39
UVSSAQ2YD98 C16orf70-201ENST00000219139 2865 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.72■■□□□ 1.39
UVSSAQ2YD98 TPBGL-201ENST00000562197 2793 ntAPPRIS P1 BASIC23.71■■□□□ 1.39
UVSSAQ2YD98 PDCD2-204ENST00000453163 2657 ntTSL 1 (best) BASIC23.71■■□□□ 1.39
UVSSAQ2YD98 CRHR1-203ENST00000339069 2490 ntTSL 2 BASIC23.71■■□□□ 1.39
UVSSAQ2YD98 CPT2-203ENST00000635862 2319 ntTSL 5 BASIC23.71■■□□□ 1.39
UVSSAQ2YD98 KDM3B-201ENST00000314358 6813 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.71■■□□□ 1.39
UVSSAQ2YD98 VSX1-202ENST00000376709 2192 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.71■■□□□ 1.39
UVSSAQ2YD98 DNAAF3-201ENST00000391720 2169 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC23.71■■□□□ 1.39
UVSSAQ2YD98 GAL3ST3-201ENST00000312006 2133 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.71■■□□□ 1.39
UVSSAQ2YD98 HDAC11-211ENST00000433119 2043 ntTSL 1 (best) BASIC23.71■■□□□ 1.39
UVSSAQ2YD98 SLC12A5-217ENST00000626937 1224 ntTSL 1 (best) BASIC23.71■■□□□ 1.39
UVSSAQ2YD98 PITX2-201ENST00000306732 2320 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC23.71■■□□□ 1.39
UVSSAQ2YD98 PYCR3-207ENST00000495276 2332 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.71■■□□□ 1.39
UVSSAQ2YD98 NKX2-1-202ENST00000498187 2338 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.71■■□□□ 1.39
UVSSAQ2YD98 AP003356.1-202ENST00000517910 2770 ntTSL 2 BASIC23.7■■□□□ 1.39
UVSSAQ2YD98 HPS6-201ENST00000299238 2649 ntAPPRIS P1 BASIC23.7■■□□□ 1.38
UVSSAQ2YD98 HAUS7-202ENST00000370211 1363 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.7■■□□□ 1.38
UVSSAQ2YD98 SLC39A4-201ENST00000276833 2297 ntTSL 2 BASIC23.7■■□□□ 1.38
UVSSAQ2YD98 AICDA-202ENST00000537228 667 ntTSL 5 BASIC23.7■■□□□ 1.38
UVSSAQ2YD98 FGF14-IT1-202ENST00000607251 2123 ntTSL 2 BASIC23.7■■□□□ 1.38
UVSSAQ2YD98 TMEM163-201ENST00000281924 1892 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.7■■□□□ 1.38
UVSSAQ2YD98 ALDH6A1-201ENST00000350259 1869 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC23.7■■□□□ 1.38
UVSSAQ2YD98 NAGK-229ENST00000613852 1801 ntTSL 1 (best) BASIC23.7■■□□□ 1.38
UVSSAQ2YD98 JMJD4-202ENST00000438896 2502 ntTSL 2 BASIC23.7■■□□□ 1.38
UVSSAQ2YD98 INPP5J-203ENST00000401755 1751 ntTSL 2 BASIC23.7■■□□□ 1.38
UVSSAQ2YD98 FAM69B-202ENST00000371692 1668 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.7■■□□□ 1.38
UVSSAQ2YD98 AC009041.2-204ENST00000568394 3343 ntTSL 1 (best) BASIC23.69■■□□□ 1.38
UVSSAQ2YD98 NABP2-202ENST00000341463 1411 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC23.69■■□□□ 1.38
UVSSAQ2YD98 AF117829.1-201ENST00000519655 1398 ntTSL 5 BASIC23.69■■□□□ 1.38
UVSSAQ2YD98 SQLE-206ENST00000523430 1879 ntTSL 2 BASIC23.69■■□□□ 1.38
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 14 ms