Protein–RNA interactions for Protein: Q2QD12

RPEL1, Ribulose-phosphate 3-epimerase-like protein 1, humanhuman

Predictions only

Length 228 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
RPEL1Q2QD12 AC007952.6-201ENST00000573168 2673 ntBASIC16.58■□□□□ 0.24
RPEL1Q2QD12 AC003957.1-201ENST00000625108 2673 ntBASIC16.58■□□□□ 0.24
RPEL1Q2QD12 SLC17A7-201ENST00000221485 2973 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.58■□□□□ 0.24
RPEL1Q2QD12 ARHGAP23-222ENST00000622683 5964 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC16.57■□□□□ 0.24
RPEL1Q2QD12 QKI-205ENST00000392127 7911 ntTSL 1 (best) BASIC16.57■□□□□ 0.24
RPEL1Q2QD12 VGF-201ENST00000249330 2575 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.57■□□□□ 0.24
RPEL1Q2QD12 ANKRD19P-205ENST00000473204 2370 ntTSL 1 (best) BASIC16.57■□□□□ 0.24
RPEL1Q2QD12 KCNQ1-202ENST00000335475 2159 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.57■□□□□ 0.24
RPEL1Q2QD12 ALG1-201ENST00000262374 2132 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.57■□□□□ 0.24
RPEL1Q2QD12 SH2B2-202ENST00000536178 2113 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.57■□□□□ 0.24
RPEL1Q2QD12 ASCL5-201ENST00000449188 2026 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC16.57■□□□□ 0.24
RPEL1Q2QD12 TBC1D22A-206ENST00000407381 1949 ntTSL 5 BASIC16.57■□□□□ 0.24
RPEL1Q2QD12 AP004607.7-201ENST00000527152 1677 ntBASIC16.57■□□□□ 0.24
RPEL1Q2QD12 BX005040.4-201ENST00000637145 1518 ntBASIC16.57■□□□□ 0.24
RPEL1Q2QD12 JTB-203ENST00000368589 1216 ntTSL 2 BASIC16.57■□□□□ 0.24
RPEL1Q2QD12 CCDC28B-201ENST00000373602 1089 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.57■□□□□ 0.24
RPEL1Q2QD12 ITGA9-AS1-210ENST00000457661 738 ntTSL 4 BASIC16.57■□□□□ 0.24
RPEL1Q2QD12 BCAP29-209ENST00000465919 942 ntTSL 2 BASIC16.57■□□□□ 0.24
RPEL1Q2QD12 ZNF696-205ENST00000521537 705 ntTSL 2 BASIC16.57■□□□□ 0.24
RPEL1Q2QD12 FAM222B-213ENST00000583522 556 ntTSL 2 BASIC16.57■□□□□ 0.24
RPEL1Q2QD12 GOLGA3-203ENST00000456883 5496 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.57■□□□□ 0.24
RPEL1Q2QD12 JADE2-204ENST00000402835 2797 ntTSL 5 BASIC16.57■□□□□ 0.24
RPEL1Q2QD12 KLC2-207ENST00000421552 2721 ntTSL 5 BASIC16.57■□□□□ 0.24
RPEL1Q2QD12 PATZ1-201ENST00000215919 2516 ntTSL 1 (best) BASIC16.57■□□□□ 0.24
RPEL1Q2QD12 LSM11-201ENST00000286307 6584 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.57■□□□□ 0.24
RPEL1Q2QD12 BRSK2-208ENST00000528841 3586 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.57■□□□□ 0.24
RPEL1Q2QD12 INTS11-208ENST00000435064 2148 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.57■□□□□ 0.24
RPEL1Q2QD12 AC084757.3-201ENST00000558061 1943 ntTSL 3 BASIC16.57■□□□□ 0.24
RPEL1Q2QD12 DOK3-202ENST00000357198 1729 ntTSL 2 BASIC16.56■□□□□ 0.24
RPEL1Q2QD12 AMIGO1-202ENST00000369864 5088 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.56■□□□□ 0.24
RPEL1Q2QD12 CACTIN-202ENST00000248420 2671 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.56■□□□□ 0.24
RPEL1Q2QD12 HMBS-201ENST00000278715 1501 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.56■□□□□ 0.24
RPEL1Q2QD12 IQSEC2-218ENST00000640694 5958 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.56■□□□□ 0.24
RPEL1Q2QD12 CDIPT-210ENST00000570016 1346 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.56■□□□□ 0.24
RPEL1Q2QD12 METTL23-201ENST00000341249 1155 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.56■□□□□ 0.24
RPEL1Q2QD12 HBM-201ENST00000356815 506 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.56■□□□□ 0.24
RPEL1Q2QD12 CCDC160-201ENST00000370809 1299 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.56■□□□□ 0.24
RPEL1Q2QD12 CDKN2AIPNL-201ENST00000395009 800 ntTSL 1 (best) BASIC16.56■□□□□ 0.24
RPEL1Q2QD12 AC027612.3-201ENST00000413684 1047 ntBASIC16.56■□□□□ 0.24
RPEL1Q2QD12 HERC2P4-206ENST00000568097 1062 ntTSL 5 BASIC16.56■□□□□ 0.24
RPEL1Q2QD12 AP2S1-203ENST00000593442 636 ntTSL 2 BASIC16.56■□□□□ 0.24
RPEL1Q2QD12 SLMAP-201ENST00000295951 5433 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.56■□□□□ 0.24
RPEL1Q2QD12 KLF14-201ENST00000583337 2827 ntAPPRIS P1 BASIC16.56■□□□□ 0.24
RPEL1Q2QD12 PMPCA-203ENST00000399219 1987 ntTSL 2 BASIC16.56■□□□□ 0.24
RPEL1Q2QD12 DLGAP4-201ENST00000339266 5016 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.56■□□□□ 0.24
RPEL1Q2QD12 UCHL5-205ENST00000367454 1815 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.56■□□□□ 0.24
RPEL1Q2QD12 LARGE2-208ENST00000531526 2528 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC16.56■□□□□ 0.24
RPEL1Q2QD12 FOSL1-201ENST00000312562 1669 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.56■□□□□ 0.24
RPEL1Q2QD12 DPYS-201ENST00000351513 2127 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.55■□□□□ 0.24
RPEL1Q2QD12 FUBP3-201ENST00000319725 3124 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.55■□□□□ 0.24
RPEL1Q2QD12 MCTP1-218ENST00000515393 5396 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.55■□□□□ 0.24
RPEL1Q2QD12 TLE3-201ENST00000317509 5207 ntTSL 1 (best) BASIC16.55■□□□□ 0.24
RPEL1Q2QD12 NFATC1-201ENST00000253506 4642 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.55■□□□□ 0.24
RPEL1Q2QD12 C10orf55-202ENST00000412307 2360 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.55■□□□□ 0.24
RPEL1Q2QD12 DUSP26-201ENST00000256261 1835 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.55■□□□□ 0.24
RPEL1Q2QD12 WNT10B-202ENST00000403957 1817 ntTSL 5 BASIC16.55■□□□□ 0.24
RPEL1Q2QD12 CBWD6-213ENST00000613716 1820 ntTSL 1 (best) BASIC16.55■□□□□ 0.24
RPEL1Q2QD12 KRTAP17-1-201ENST00000334202 779 ntAPPRIS P1 BASIC16.55■□□□□ 0.24
RPEL1Q2QD12 TMEM61-201ENST00000371268 1097 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.55■□□□□ 0.24
RPEL1Q2QD12 SP2-202ENST00000613139 908 ntTSL 5 BASIC16.55■□□□□ 0.24
RPEL1Q2QD12 ACBD4-216ENST00000619916 1276 ntTSL 5 BASIC16.55■□□□□ 0.24
RPEL1Q2QD12 ASL-203ENST00000380839 1765 ntTSL 5 BASIC16.55■□□□□ 0.24
RPEL1Q2QD12 RASGRP2-207ENST00000377497 2221 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.55■□□□□ 0.24
RPEL1Q2QD12 PRR16-202ENST00000407149 1747 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.55■□□□□ 0.24
RPEL1Q2QD12 ARFRP1-214ENST00000622789 2559 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.55■□□□□ 0.24
RPEL1Q2QD12 NF2-201ENST00000334961 2020 ntTSL 1 (best) BASIC16.55■□□□□ 0.24
RPEL1Q2QD12 WDR86-207ENST00000621812 1542 ntTSL 5 BASIC16.55■□□□□ 0.24
RPEL1Q2QD12 PRR7-201ENST00000323249 1480 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.54■□□□□ 0.24
RPEL1Q2QD12 TRADD-202ENST00000486556 1833 ntTSL 2 BASIC16.54■□□□□ 0.24
RPEL1Q2QD12 PRELID3B-201ENST00000355937 2626 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.54■□□□□ 0.24
RPEL1Q2QD12 TMEM129-206ENST00000536901 2172 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.54■□□□□ 0.24
RPEL1Q2QD12 RARG-204ENST00000543726 1779 ntTSL 2 BASIC16.54■□□□□ 0.24
RPEL1Q2QD12 P2RY2-203ENST00000393597 2107 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.54■□□□□ 0.24
RPEL1Q2QD12 AGO4-201ENST00000373210 7116 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.54■□□□□ 0.24
RPEL1Q2QD12 SLC12A4-202ENST00000422611 4670 ntTSL 2 BASIC16.54■□□□□ 0.24
RPEL1Q2QD12 NXT1-201ENST00000254998 1123 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.54■□□□□ 0.24
RPEL1Q2QD12 FAIM-202ENST00000360570 1157 ntAPPRIS ALT1 TSL 3 BASIC16.54■□□□□ 0.24
RPEL1Q2QD12 AL355102.2-201ENST00000553811 600 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.54■□□□□ 0.24
RPEL1Q2QD12 ELANE-202ENST00000590230 1028 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.54■□□□□ 0.24
RPEL1Q2QD12 GSX2-205ENST00000611459 1262 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.54■□□□□ 0.24
RPEL1Q2QD12 KREMEN2-201ENST00000303746 2326 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC16.54■□□□□ 0.24
RPEL1Q2QD12 TMEM5-201ENST00000261234 1918 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.54■□□□□ 0.24
RPEL1Q2QD12 MAP3K15-201ENST00000338883 4012 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.54■□□□□ 0.24
RPEL1Q2QD12 VDAC1-203ENST00000395047 1873 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.54■□□□□ 0.24
RPEL1Q2QD12 RAB3A-201ENST00000222256 1528 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.54■□□□□ 0.24
RPEL1Q2QD12 RNF166-202ENST00000537718 1525 ntTSL 2 BASIC16.54■□□□□ 0.24
RPEL1Q2QD12 AC009237.3-201ENST00000393279 1427 ntBASIC16.53■□□□□ 0.24
RPEL1Q2QD12 ZSWIM5-201ENST00000359600 5819 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.53■□□□□ 0.24
RPEL1Q2QD12 FBXL17-205ENST00000542267 5188 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.53■□□□□ 0.24
RPEL1Q2QD12 SOX17-201ENST00000297316 2342 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.53■□□□□ 0.24
RPEL1Q2QD12 AQP6-201ENST00000315520 1398 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.53■□□□□ 0.24
RPEL1Q2QD12 GATA5-201ENST00000252997 2595 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.53■□□□□ 0.24
RPEL1Q2QD12 GDF7-201ENST00000272224 9749 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.53■□□□□ 0.24
RPEL1Q2QD12 IKBKG-212ENST00000617207 1949 ntAPPRIS ALT1 TSL 3 BASIC16.53■□□□□ 0.24
RPEL1Q2QD12 AVPR2-203ENST00000370049 1307 ntTSL 1 (best) BASIC16.53■□□□□ 0.24
RPEL1Q2QD12 SPTBN4-202ENST00000352632 8676 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC16.53■□□□□ 0.24
RPEL1Q2QD12 PLCB2-204ENST00000557821 4517 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.53■□□□□ 0.24
RPEL1Q2QD12 UBTD2-201ENST00000393792 3301 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.53■□□□□ 0.24
RPEL1Q2QD12 MRPL14-201ENST00000372014 959 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.53■□□□□ 0.24
RPEL1Q2QD12 ANKRD63-201ENST00000434396 1143 ntAPPRIS P1 BASIC16.53■□□□□ 0.24
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 23.9 ms