Protein–RNA interactions for Protein: Q2M2W7

C17orf58, UPF0450 protein C17orf58, humanhuman

Predictions only

Length 97 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
C17orf58Q2M2W7 NTF6G-201ENST00000591094 616 ntBASIC17.15■□□□□ 0.34
C17orf58Q2M2W7 RARRES2P11-201ENST00000635158 484 ntBASIC17.15■□□□□ 0.34
C17orf58Q2M2W7 LGR4-201ENST00000379214 5206 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.15■□□□□ 0.34
C17orf58Q2M2W7 FGF7P6-201ENST00000377614 1890 ntTSL 1 (best) BASIC17.15■□□□□ 0.34
C17orf58Q2M2W7 BX664615.2-202ENST00000639056 1888 ntTSL 1 (best) BASIC17.15■□□□□ 0.34
C17orf58Q2M2W7 SMTNL2-202ENST00000389313 2280 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.15■□□□□ 0.34
C17orf58Q2M2W7 AC243965.2-201ENST00000612576 2671 ntTSL 5 BASIC17.15■□□□□ 0.34
C17orf58Q2M2W7 FAM20C-201ENST00000313766 2751 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.15■□□□□ 0.34
C17orf58Q2M2W7 PLK5-205ENST00000642079 1969 ntBASIC17.15■□□□□ 0.34
C17orf58Q2M2W7 GATA6-AS1-202ENST00000583490 1788 ntTSL 2 BASIC17.15■□□□□ 0.34
C17orf58Q2M2W7 CACNA1H-210ENST00000638323 8048 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.14■□□□□ 0.34
C17orf58Q2M2W7 SLC16A10-202ENST00000368851 2508 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.14■□□□□ 0.33
C17orf58Q2M2W7 SLC25A27-202ENST00000411689 2526 ntTSL 1 (best) BASIC17.14■□□□□ 0.33
C17orf58Q2M2W7 GSPT1-203ENST00000439887 2509 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.14■□□□□ 0.33
C17orf58Q2M2W7 ITGB1BP1-203ENST00000359712 2126 ntTSL 2 BASIC17.14■□□□□ 0.33
C17orf58Q2M2W7 AC121338.2-201ENST00000622535 1744 ntBASIC17.14■□□□□ 0.33
C17orf58Q2M2W7 CBR1-201ENST00000290349 1293 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.14■□□□□ 0.33
C17orf58Q2M2W7 KRT19P1-201ENST00000405746 1186 ntBASIC17.14■□□□□ 0.33
C17orf58Q2M2W7 GMPPA-201ENST00000313597 1544 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.14■□□□□ 0.33
C17orf58Q2M2W7 TRIB3-201ENST00000217233 2499 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.14■□□□□ 0.33
C17orf58Q2M2W7 CTCF-202ENST00000401394 2978 ntTSL 1 (best) BASIC17.14■□□□□ 0.33
C17orf58Q2M2W7 NDUFAF3-202ENST00000326925 2012 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.14■□□□□ 0.33
C17orf58Q2M2W7 ARL6IP4-204ENST00000392435 1339 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.14■□□□□ 0.33
C17orf58Q2M2W7 BAZ1A-201ENST00000358716 5920 ntTSL 1 (best) BASIC17.14■□□□□ 0.33
C17orf58Q2M2W7 ICAM5-201ENST00000221980 3000 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.14■□□□□ 0.33
C17orf58Q2M2W7 GPAA1-202ENST00000361036 1840 ntTSL 1 (best) BASIC17.14■□□□□ 0.33
C17orf58Q2M2W7 RAP2C-202ENST00000370874 2333 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.14■□□□□ 0.33
C17orf58Q2M2W7 WHAMM-201ENST00000286760 5101 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.14■□□□□ 0.33
C17orf58Q2M2W7 STX18-205ENST00000505286 1380 ntTSL 1 (best) BASIC17.14■□□□□ 0.33
C17orf58Q2M2W7 FDFT1-210ENST00000525954 1890 ntTSL 2 BASIC17.14■□□□□ 0.33
C17orf58Q2M2W7 SPATA22-214ENST00000575375 1374 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.14■□□□□ 0.33
C17orf58Q2M2W7 ITGBL1-206ENST00000618057 2368 ntTSL 1 (best) BASIC17.14■□□□□ 0.33
C17orf58Q2M2W7 EPN1-201ENST00000085079 2355 ntTSL 1 (best) BASIC17.14■□□□□ 0.33
C17orf58Q2M2W7 ZMYND11-210ENST00000403354 1664 ntTSL 5 BASIC17.13■□□□□ 0.33
C17orf58Q2M2W7 EXOC3-AS1-202ENST00000623673 1663 ntBASIC17.13■□□□□ 0.33
C17orf58Q2M2W7 AC090360.1-201ENST00000569722 2218 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC17.13■□□□□ 0.33
C17orf58Q2M2W7 ABLIM2-204ENST00000407564 2291 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.13■□□□□ 0.33
C17orf58Q2M2W7 KRT7-201ENST00000331817 1754 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.13■□□□□ 0.33
C17orf58Q2M2W7 CFAP97-205ENST00000514798 2895 ntTSL 1 (best) BASIC17.13■□□□□ 0.33
C17orf58Q2M2W7 MANBAL-202ENST00000373606 1208 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.13■□□□□ 0.33
C17orf58Q2M2W7 AL731577.2-201ENST00000508096 555 ntTSL 2 BASIC17.13■□□□□ 0.33
C17orf58Q2M2W7 RARRES2P6-201ENST00000567333 442 ntBASIC17.13■□□□□ 0.33
C17orf58Q2M2W7 H2AFB3-201ENST00000615853 591 ntAPPRIS P1 BASIC17.13■□□□□ 0.33
C17orf58Q2M2W7 AL133516.1-201ENST00000633012 540 ntTSL 5 BASIC17.13■□□□□ 0.33
C17orf58Q2M2W7 PITX1-201ENST00000265340 2406 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.13■□□□□ 0.33
C17orf58Q2M2W7 SLC43A3-225ENST00000533524 1879 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC17.13■□□□□ 0.33
C17orf58Q2M2W7 S1PR5-202ENST00000439028 2191 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.13■□□□□ 0.33
C17orf58Q2M2W7 TRMT2A-204ENST00000439169 2473 ntTSL 5 BASIC17.13■□□□□ 0.33
C17orf58Q2M2W7 DPF1-201ENST00000355526 1632 ntTSL 1 (best) BASIC17.13■□□□□ 0.33
C17orf58Q2M2W7 NNT-AS1-206ENST00000606697 1945 ntTSL 2 BASIC17.13■□□□□ 0.33
C17orf58Q2M2W7 STRADB-201ENST00000194530 2293 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.13■□□□□ 0.33
C17orf58Q2M2W7 CELF2-211ENST00000632065 1952 ntTSL 1 (best) BASIC17.13■□□□□ 0.33
C17orf58Q2M2W7 LINC00094-201ENST00000432807 2300 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC17.13■□□□□ 0.33
C17orf58Q2M2W7 HTRA3-202ENST00000382512 2023 ntTSL 1 (best) BASIC17.13■□□□□ 0.33
C17orf58Q2M2W7 TMC7-205ENST00000569532 2738 ntTSL 2 BASIC17.12■□□□□ 0.33
C17orf58Q2M2W7 MMP17-201ENST00000360564 2411 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.12■□□□□ 0.33
C17orf58Q2M2W7 DCPS-201ENST00000263579 1479 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.12■□□□□ 0.33
C17orf58Q2M2W7 PACSIN3-201ENST00000298838 1843 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.12■□□□□ 0.33
C17orf58Q2M2W7 PTPRM-211ENST00000580170 5941 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.12■□□□□ 0.33
C17orf58Q2M2W7 HOXC9-203ENST00000508190 1505 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC17.12■□□□□ 0.33
C17orf58Q2M2W7 KLF1-201ENST00000264834 1592 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.12■□□□□ 0.33
C17orf58Q2M2W7 D2HGDH-201ENST00000321264 2617 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.12■□□□□ 0.33
C17orf58Q2M2W7 PKD1P6-201ENST00000343738 4769 ntBASIC17.12■□□□□ 0.33
C17orf58Q2M2W7 KLC2-207ENST00000421552 2721 ntTSL 5 BASIC17.12■□□□□ 0.33
C17orf58Q2M2W7 FAM207A-201ENST00000291634 927 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.12■□□□□ 0.33
C17orf58Q2M2W7 HIST2H2AC-201ENST00000331380 390 ntAPPRIS P1 BASIC17.12■□□□□ 0.33
C17orf58Q2M2W7 PTRH1-201ENST00000335223 759 ntTSL 1 (best) BASIC17.12■□□□□ 0.33
C17orf58Q2M2W7 GUK1-207ENST00000366726 873 ntAPPRIS P3 TSL 3 BASIC17.12■□□□□ 0.33
C17orf58Q2M2W7 SPOCK2-203ENST00000412663 1284 ntTSL 5 BASIC17.12■□□□□ 0.33
C17orf58Q2M2W7 UMAD1-202ENST00000463725 559 ntTSL 4 BASIC17.12■□□□□ 0.33
C17orf58Q2M2W7 ATP6V0B-204ENST00000471859 865 ntTSL 5 BASIC17.12■□□□□ 0.33
C17orf58Q2M2W7 AC106820.5-201ENST00000566085 789 ntTSL 3 BASIC17.12■□□□□ 0.33
C17orf58Q2M2W7 C19orf84-201ENST00000570516 788 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.12■□□□□ 0.33
C17orf58Q2M2W7 DISC1-224ENST00000639374 1071 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.12■□□□□ 0.33
C17orf58Q2M2W7 DTX3-201ENST00000337737 2029 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC17.12■□□□□ 0.33
C17orf58Q2M2W7 C7orf49-213ENST00000617987 1727 ntTSL 5 BASIC17.12■□□□□ 0.33
C17orf58Q2M2W7 CNIH2-201ENST00000311445 1356 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.12■□□□□ 0.33
C17orf58Q2M2W7 ASAP2-201ENST00000281419 5712 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.12■□□□□ 0.33
C17orf58Q2M2W7 SAMD10-201ENST00000369886 2181 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.12■□□□□ 0.33
C17orf58Q2M2W7 INAFM2-202ENST00000638170 3052 ntAPPRIS P1 BASIC17.12■□□□□ 0.33
C17orf58Q2M2W7 SPR-201ENST00000234454 1480 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.12■□□□□ 0.33
C17orf58Q2M2W7 ABHD12B-202ENST00000353130 1477 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.12■□□□□ 0.33
C17orf58Q2M2W7 GNB2-206ENST00000424361 1478 ntTSL 5 BASIC17.12■□□□□ 0.33
C17orf58Q2M2W7 NUTF2-201ENST00000219169 2321 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.12■□□□□ 0.33
C17orf58Q2M2W7 SLC9A3R1-201ENST00000262613 1969 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.11■□□□□ 0.33
C17orf58Q2M2W7 ERF-202ENST00000440177 2032 ntTSL 2 BASIC17.11■□□□□ 0.33
C17orf58Q2M2W7 CAMK2B-216ENST00000440254 2097 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC17.11■□□□□ 0.33
C17orf58Q2M2W7 AC006128.1-201ENST00000624704 1661 ntBASIC17.11■□□□□ 0.33
C17orf58Q2M2W7 ZNF331-202ENST00000411977 2248 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.11■□□□□ 0.33
C17orf58Q2M2W7 LAYN-204ENST00000525126 1763 ntTSL 5 BASIC17.11■□□□□ 0.33
C17orf58Q2M2W7 EFNA2-201ENST00000215368 949 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.11■□□□□ 0.33
C17orf58Q2M2W7 GP9-201ENST00000307395 889 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.11■□□□□ 0.33
C17orf58Q2M2W7 AC068385.1-201ENST00000533218 409 ntTSL 3 BASIC17.11■□□□□ 0.33
C17orf58Q2M2W7 AP001005.4-202ENST00000575325 560 ntTSL 4 BASIC17.11■□□□□ 0.33
C17orf58Q2M2W7 RPS15-210ENST00000592623 873 ntTSL 1 (best) BASIC17.11■□□□□ 0.33
C17orf58Q2M2W7 CREB3-201ENST00000353704 1832 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.11■□□□□ 0.33
C17orf58Q2M2W7 PKIB-206ENST00000392490 1811 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.11■□□□□ 0.33
C17orf58Q2M2W7 SCOC-207ENST00000506597 1838 ntTSL 1 (best) BASIC17.11■□□□□ 0.33
C17orf58Q2M2W7 NAGK-229ENST00000613852 1801 ntTSL 1 (best) BASIC17.11■□□□□ 0.33
C17orf58Q2M2W7 PITX1-205ENST00000506438 1305 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.11■□□□□ 0.33
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 20.4 ms