Protein–RNA interactions for Protein: Q1L6U9

MSMP, Prostate-associated microseminoprotein, humanhuman

Predictions only

Length 139 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
MSMPQ1L6U9 BCKDK-201ENST00000219794 2128 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.86■□□□□ 0.45
MSMPQ1L6U9 C10orf55-202ENST00000412307 2360 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.86■□□□□ 0.45
MSMPQ1L6U9 ANO1-202ENST00000355303 4790 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.85■□□□□ 0.45
MSMPQ1L6U9 TMPO-201ENST00000261210 820 ntTSL 1 (best) BASIC17.85■□□□□ 0.45
MSMPQ1L6U9 DEDD2-201ENST00000336034 1882 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC17.85■□□□□ 0.45
MSMPQ1L6U9 DPYS-201ENST00000351513 2127 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.85■□□□□ 0.45
MSMPQ1L6U9 CDCA4-202ENST00000392590 1536 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.85■□□□□ 0.45
MSMPQ1L6U9 KIF2A-202ENST00000401507 2539 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.85■□□□□ 0.45
MSMPQ1L6U9 TMEM200B-201ENST00000420504 2553 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.85■□□□□ 0.45
MSMPQ1L6U9 AC083906.2-201ENST00000511578 360 ntBASIC17.85■□□□□ 0.45
MSMPQ1L6U9 DHRS4L2-204ENST00000537912 918 ntTSL 2 BASIC17.85■□□□□ 0.45
MSMPQ1L6U9 ZBTB42-202ENST00000555360 1411 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.85■□□□□ 0.45
MSMPQ1L6U9 CERS4-209ENST00000559450 1637 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.85■□□□□ 0.45
MSMPQ1L6U9 POU2F2-215ENST00000560398 1788 ntTSL 5 BASIC17.85■□□□□ 0.45
MSMPQ1L6U9 LITAF-205ENST00000570904 1118 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.85■□□□□ 0.45
MSMPQ1L6U9 GAMT-205ENST00000640762 751 ntTSL 5 BASIC17.85■□□□□ 0.45
MSMPQ1L6U9 RYK-208ENST00000620660 2942 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.85■□□□□ 0.45
MSMPQ1L6U9 AFDN-201ENST00000344191 5249 ntTSL 5 BASIC17.85■□□□□ 0.45
MSMPQ1L6U9 ELL3-201ENST00000319359 2352 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.84■□□□□ 0.45
MSMPQ1L6U9 CLDN23-201ENST00000519106 2169 ntAPPRIS P1 BASIC17.84■□□□□ 0.45
MSMPQ1L6U9 TMEM125-201ENST00000432792 1850 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.84■□□□□ 0.45
MSMPQ1L6U9 AC245052.3-201ENST00000450182 901 ntBASIC17.84■□□□□ 0.45
MSMPQ1L6U9 HAGH-203ENST00000455446 1276 ntTSL 2 BASIC17.84■□□□□ 0.45
MSMPQ1L6U9 MYO19-221ENST00000620640 1186 ntTSL 2 BASIC17.84■□□□□ 0.45
MSMPQ1L6U9 AC244517.4-202ENST00000624089 484 ntTSL 3 BASIC17.84■□□□□ 0.45
MSMPQ1L6U9 ARMC6-201ENST00000269932 2412 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.84■□□□□ 0.45
MSMPQ1L6U9 CTDSPL-206ENST00000443503 4640 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC17.84■□□□□ 0.45
MSMPQ1L6U9 PDXDC1-205ENST00000535621 2048 ntTSL 1 (best) BASIC17.84■□□□□ 0.45
MSMPQ1L6U9 AC007128.1-201ENST00000424460 1853 ntTSL 5 BASIC17.84■□□□□ 0.45
MSMPQ1L6U9 POMGNT2-201ENST00000344697 2544 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.83■□□□□ 0.45
MSMPQ1L6U9 ILDR2-206ENST00000528703 2446 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.83■□□□□ 0.45
MSMPQ1L6U9 IRAK3-203ENST00000545837 1579 ntTSL 1 (best) BASIC17.83■□□□□ 0.45
MSMPQ1L6U9 BCAT2-207ENST00000597011 1579 ntTSL 5 BASIC17.83■□□□□ 0.45
MSMPQ1L6U9 CAPZB-205ENST00000433834 1462 ntTSL 2 BASIC17.83■□□□□ 0.45
MSMPQ1L6U9 LSR-202ENST00000354900 2105 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.83■□□□□ 0.45
MSMPQ1L6U9 MREG-201ENST00000263268 1314 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.83■□□□□ 0.44
MSMPQ1L6U9 CCDC189-206ENST00000543610 1967 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.83■□□□□ 0.44
MSMPQ1L6U9 ZNF644-203ENST00000361321 1253 ntTSL 2 BASIC17.83■□□□□ 0.44
MSMPQ1L6U9 MGST3-205ENST00000367889 1015 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.83■□□□□ 0.44
MSMPQ1L6U9 GPX1P1-201ENST00000388829 606 ntBASIC17.83■□□□□ 0.44
MSMPQ1L6U9 ARF3-202ENST00000447318 1089 ntTSL 2 BASIC17.83■□□□□ 0.44
MSMPQ1L6U9 AC093787.1-201ENST00000450396 207 ntBASIC17.83■□□□□ 0.44
MSMPQ1L6U9 OAS3-207ENST00000551007 998 ntTSL 2 BASIC17.83■□□□□ 0.44
MSMPQ1L6U9 CAMTA1-216ENST00000557126 486 ntTSL 2 BASIC17.83■□□□□ 0.44
MSMPQ1L6U9 PTGER2-202ENST00000557436 643 ntTSL 3 BASIC17.83■□□□□ 0.44
MSMPQ1L6U9 ETHE1-205ENST00000600651 1052 ntTSL 1 (best) BASIC17.83■□□□□ 0.44
MSMPQ1L6U9 CD24-202ENST00000610952 802 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC17.83■□□□□ 0.44
MSMPQ1L6U9 AL121832.2-201ENST00000610979 668 ntBASIC17.83■□□□□ 0.44
MSMPQ1L6U9 AL109923.1-201ENST00000618799 583 ntBASIC17.83■□□□□ 0.44
MSMPQ1L6U9 DTWD2-203ENST00000510708 2307 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.83■□□□□ 0.44
MSMPQ1L6U9 TCP11-203ENST00000373974 1689 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC17.83■□□□□ 0.44
MSMPQ1L6U9 DPF1-201ENST00000355526 1632 ntTSL 1 (best) BASIC17.83■□□□□ 0.44
MSMPQ1L6U9 TPM1-208ENST00000404484 1568 ntTSL 1 (best) BASIC17.83■□□□□ 0.44
MSMPQ1L6U9 ARL6IP4-220ENST00000543566 1591 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.83■□□□□ 0.44
MSMPQ1L6U9 SARDH-203ENST00000371868 2266 ntTSL 2 BASIC17.82■□□□□ 0.44
MSMPQ1L6U9 AC073188.6-202ENST00000616616 2281 ntTSL 1 (best) BASIC17.82■□□□□ 0.44
MSMPQ1L6U9 ERLEC1-203ENST00000405123 1756 ntTSL 5 BASIC17.82■□□□□ 0.44
MSMPQ1L6U9 RNPS1-201ENST00000301730 1276 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.82■□□□□ 0.44
MSMPQ1L6U9 C4orf48-201ENST00000409248 433 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.82■□□□□ 0.44
MSMPQ1L6U9 CD44-222ENST00000526025 1052 ntTSL 2 BASIC17.82■□□□□ 0.44
MSMPQ1L6U9 CDK18-203ENST00000429964 1648 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.82■□□□□ 0.44
MSMPQ1L6U9 FADS6-204ENST00000614223 2044 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.82■□□□□ 0.44
MSMPQ1L6U9 CEBPE-201ENST00000206513 1554 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.82■□□□□ 0.44
MSMPQ1L6U9 LINC00605-201ENST00000514902 1558 ntTSL 1 (best) BASIC17.82■□□□□ 0.44
MSMPQ1L6U9 BAG4-202ENST00000432471 1943 ntTSL 1 (best) BASIC17.82■□□□□ 0.44
MSMPQ1L6U9 WDR88-201ENST00000355868 1718 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC17.81■□□□□ 0.44
MSMPQ1L6U9 MSANTD1-204ENST00000510580 2039 ntTSL 5 BASIC17.81■□□□□ 0.44
MSMPQ1L6U9 MAN2C1-244ENST00000618257 1346 ntTSL 5 BASIC17.81■□□□□ 0.44
MSMPQ1L6U9 MPV17L-202ENST00000396385 1037 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.81■□□□□ 0.44
MSMPQ1L6U9 TSPY6P-201ENST00000448518 926 ntBASIC17.81■□□□□ 0.44
MSMPQ1L6U9 TRIM35-203ENST00000521253 1215 ntTSL 1 (best) BASIC17.81■□□□□ 0.44
MSMPQ1L6U9 RAP1B-220ENST00000539091 977 ntTSL 2 BASIC17.81■□□□□ 0.44
MSMPQ1L6U9 AC105036.2-201ENST00000569468 176 ntBASIC17.81■□□□□ 0.44
MSMPQ1L6U9 AC133552.2-202ENST00000575694 574 ntBASIC17.81■□□□□ 0.44
MSMPQ1L6U9 AL591742.1-201ENST00000604433 565 ntBASIC17.81■□□□□ 0.44
MSMPQ1L6U9 SH2B1-204ENST00000395532 2529 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.81■□□□□ 0.44
MSMPQ1L6U9 SH3GL1-206ENST00000598564 2194 ntTSL 2 BASIC17.81■□□□□ 0.44
MSMPQ1L6U9 NOXO1-202ENST00000356120 1539 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.81■□□□□ 0.44
MSMPQ1L6U9 LOXL1-AS1-210ENST00000567257 2358 ntTSL 2 BASIC17.81■□□□□ 0.44
MSMPQ1L6U9 FNDC10-201ENST00000422725 2085 ntAPPRIS P1 BASIC17.81■□□□□ 0.44
MSMPQ1L6U9 AL024507.2-201ENST00000606070 2574 ntBASIC17.81■□□□□ 0.44
MSMPQ1L6U9 S1PR5-204ENST00000617721 1698 ntTSL 5 BASIC17.8■□□□□ 0.44
MSMPQ1L6U9 GRTP1-203ENST00000375431 1384 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.8■□□□□ 0.44
MSMPQ1L6U9 CLN3-240ENST00000631023 1586 ntTSL 5 BASIC17.8■□□□□ 0.44
MSMPQ1L6U9 NUF2-208ENST00000524800 1845 ntTSL 5 BASIC17.8■□□□□ 0.44
MSMPQ1L6U9 RNH1-222ENST00000533410 1829 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.8■□□□□ 0.44
MSMPQ1L6U9 NFS1-201ENST00000306750 738 ntTSL 1 (best) BASIC17.8■□□□□ 0.44
MSMPQ1L6U9 CD58-201ENST00000369487 892 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.8■□□□□ 0.44
MSMPQ1L6U9 CD58-202ENST00000369489 1098 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.8■□□□□ 0.44
MSMPQ1L6U9 FAM47E-204ENST00000510328 1002 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC17.8■□□□□ 0.44
MSMPQ1L6U9 AF201337.1-201ENST00000520239 748 ntBASIC17.8■□□□□ 0.44
MSMPQ1L6U9 AC106738.2-202ENST00000558156 533 ntTSL 4 BASIC17.8■□□□□ 0.44
MSMPQ1L6U9 AC027307.1-201ENST00000590252 457 ntTSL 5 BASIC17.8■□□□□ 0.44
MSMPQ1L6U9 CIRBP-246ENST00000628979 1043 ntTSL 2 BASIC17.8■□□□□ 0.44
MSMPQ1L6U9 VKORC1L1-202ENST00000434382 1541 ntTSL 2 BASIC17.8■□□□□ 0.44
MSMPQ1L6U9 FDXR-219ENST00000583917 1762 ntTSL 5 BASIC17.8■□□□□ 0.44
MSMPQ1L6U9 SLC35F5-203ENST00000409342 2284 ntTSL 2 BASIC17.8■□□□□ 0.44
MSMPQ1L6U9 RASSF1-203ENST00000359365 1923 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC17.8■□□□□ 0.44
MSMPQ1L6U9 RAPSN-205ENST00000529341 1408 ntTSL 1 (best) BASIC17.8■□□□□ 0.44
MSMPQ1L6U9 TSC22D3-205ENST00000372390 1812 ntTSL 1 (best) BASIC17.79■□□□□ 0.44
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