Protein–RNA interactions for Protein: Q17RM4

CCDC142, Coiled-coil domain-containing protein 142, humanhuman

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Length 750 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CCDC142Q17RM4 BST1-202ENST00000382346 1993 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.29■■□□□ 1.16
CCDC142Q17RM4 ZNF696-204ENST00000520333 605 ntTSL 5 BASIC22.29■■□□□ 1.16
CCDC142Q17RM4 DHRS4-207ENST00000559632 1003 ntTSL 1 (best) BASIC22.29■■□□□ 1.16
CCDC142Q17RM4 HERC2P5-204ENST00000569697 1214 ntTSL 2 BASIC22.29■■□□□ 1.16
CCDC142Q17RM4 SMAGP-205ENST00000603864 1518 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.29■■□□□ 1.16
CCDC142Q17RM4 PGAM5-204ENST00000543955 1773 ntTSL 2 BASIC22.29■■□□□ 1.16
CCDC142Q17RM4 SPTBN4-203ENST00000392023 2419 ntTSL 1 (best) BASIC22.29■■□□□ 1.16
CCDC142Q17RM4 MYBL1-204ENST00000522677 5192 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.29■■□□□ 1.16
CCDC142Q17RM4 SCLY-201ENST00000254663 2562 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.29■■□□□ 1.16
CCDC142Q17RM4 C7orf25-201ENST00000350427 2451 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.29■■□□□ 1.16
CCDC142Q17RM4 TFG-201ENST00000240851 1978 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.29■■□□□ 1.16
CCDC142Q17RM4 CELF2-213ENST00000633077 1733 ntTSL 1 (best) BASIC22.28■■□□□ 1.16
CCDC142Q17RM4 AOC3-207ENST00000617500 2392 ntTSL 4 BASIC22.28■■□□□ 1.16
CCDC142Q17RM4 ST3GAL4-201ENST00000227495 1790 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC22.28■■□□□ 1.16
CCDC142Q17RM4 PMPCA-201ENST00000371717 2174 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.28■■□□□ 1.16
CCDC142Q17RM4 KHDC3L-201ENST00000370367 1018 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.28■■□□□ 1.16
CCDC142Q17RM4 METTL26-203ENST00000397664 604 ntTSL 2 BASIC22.28■■□□□ 1.16
CCDC142Q17RM4 POU5F1P4-201ENST00000413175 1085 ntBASIC22.28■■□□□ 1.16
CCDC142Q17RM4 TRNT1-207ENST00000420393 854 ntTSL 3 BASIC22.28■■□□□ 1.16
CCDC142Q17RM4 AC007322.1-201ENST00000426983 750 ntBASIC22.28■■□□□ 1.16
CCDC142Q17RM4 SLC7A5P1-201ENST00000568957 537 ntBASIC22.28■■□□□ 1.16
CCDC142Q17RM4 AC012313.6-201ENST00000599889 790 ntTSL 3 BASIC22.28■■□□□ 1.16
CCDC142Q17RM4 AC005181.1-201ENST00000604782 1256 ntBASIC22.28■■□□□ 1.16
CCDC142Q17RM4 PABPC1L2A-201ENST00000373519 2237 ntAPPRIS P1 BASIC22.28■■□□□ 1.16
CCDC142Q17RM4 OAF-201ENST00000328965 2525 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.28■■□□□ 1.16
CCDC142Q17RM4 DDIT4-201ENST00000307365 1748 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.28■■□□□ 1.16
CCDC142Q17RM4 UBE2I-205ENST00000402301 1708 ntTSL 1 (best) BASIC22.28■■□□□ 1.16
CCDC142Q17RM4 BASP1-201ENST00000322611 1878 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.28■■□□□ 1.16
CCDC142Q17RM4 HLA-G-204ENST00000376828 1490 ntAPPRIS ALT2 BASIC22.28■■□□□ 1.16
CCDC142Q17RM4 FASTK-217ENST00000540185 1609 ntTSL 5 BASIC22.28■■□□□ 1.16
CCDC142Q17RM4 ATG4D-201ENST00000309469 1949 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.27■■□□□ 1.16
CCDC142Q17RM4 AUTS2-203ENST00000406775 5950 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.27■■□□□ 1.16
CCDC142Q17RM4 FAM171A2-201ENST00000293443 3160 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.27■■□□□ 1.16
CCDC142Q17RM4 ANKS6-201ENST00000353234 7164 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.27■■□□□ 1.16
CCDC142Q17RM4 CD8B-205ENST00000393761 932 ntTSL 1 (best) BASIC22.27■■□□□ 1.16
CCDC142Q17RM4 PIGP-203ENST00000399098 972 ntTSL 1 (best) BASIC22.27■■□□□ 1.16
CCDC142Q17RM4 APTR-203ENST00000430801 583 ntTSL 5 BASIC22.27■■□□□ 1.16
CCDC142Q17RM4 CD8B-206ENST00000431506 692 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.27■■□□□ 1.16
CCDC142Q17RM4 TERF1P5-201ENST00000477545 1207 ntBASIC22.27■■□□□ 1.16
CCDC142Q17RM4 SNX24-211ENST00000513881 1563 ntTSL 1 (best) BASIC22.27■■□□□ 1.16
CCDC142Q17RM4 MDK-213ENST00000617138 635 ntTSL 2 BASIC22.27■■□□□ 1.16
CCDC142Q17RM4 APOC3-205ENST00000630701 541 ntTSL 1 (best) BASIC22.27■■□□□ 1.16
CCDC142Q17RM4 SPR-201ENST00000234454 1480 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.27■■□□□ 1.16
CCDC142Q17RM4 TRIM3-214ENST00000536344 2704 ntTSL 2 BASIC22.27■■□□□ 1.16
CCDC142Q17RM4 MMP23B-201ENST00000356026 1326 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.27■■□□□ 1.16
CCDC142Q17RM4 SH2B2-202ENST00000536178 2113 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.27■■□□□ 1.15
CCDC142Q17RM4 AC132008.2-203ENST00000418868 1552 ntTSL 1 (best) BASIC22.26■■□□□ 1.15
CCDC142Q17RM4 AL024507.2-201ENST00000606070 2574 ntBASIC22.26■■□□□ 1.15
CCDC142Q17RM4 RFLNA-201ENST00000324038 2148 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC22.26■■□□□ 1.15
CCDC142Q17RM4 LINC01117-201ENST00000443670 699 ntTSL 5 BASIC22.26■■□□□ 1.15
CCDC142Q17RM4 AC104771.1-201ENST00000603335 964 ntBASIC22.26■■□□□ 1.15
CCDC142Q17RM4 AL161421.1-201ENST00000619666 1101 ntTSL 1 (best) BASIC22.26■■□□□ 1.15
CCDC142Q17RM4 AC231657.2-201ENST00000624556 255 ntBASIC22.26■■□□□ 1.15
CCDC142Q17RM4 GOLGA2P6-201ENST00000340929 2049 ntBASIC22.26■■□□□ 1.15
CCDC142Q17RM4 TMEM204-201ENST00000253934 1686 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.26■■□□□ 1.15
CCDC142Q17RM4 ARRB2-201ENST00000269260 1895 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.26■■□□□ 1.15
CCDC142Q17RM4 NR2F2-204ENST00000453270 1712 ntTSL 1 (best) BASIC22.26■■□□□ 1.15
CCDC142Q17RM4 TMEM175-212ENST00000508204 1399 ntTSL 3 BASIC22.25■■□□□ 1.15
CCDC142Q17RM4 CA7-201ENST00000338437 1555 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.25■■□□□ 1.15
CCDC142Q17RM4 PPP3CC-201ENST00000240139 2189 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.25■■□□□ 1.15
CCDC142Q17RM4 SPIRE2-202ENST00000393062 2172 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.25■■□□□ 1.15
CCDC142Q17RM4 FAH-202ENST00000407106 2152 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.25■■□□□ 1.15
CCDC142Q17RM4 KRT16P2-201ENST00000414673 1423 ntBASIC22.25■■□□□ 1.15
CCDC142Q17RM4 RBM17P2-201ENST00000616397 1405 ntBASIC22.25■■□□□ 1.15
CCDC142Q17RM4 OTUB1-211ENST00000543004 1647 ntTSL 5 BASIC22.25■■□□□ 1.15
CCDC142Q17RM4 RARRES2-201ENST00000223271 740 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.25■■□□□ 1.15
CCDC142Q17RM4 EIF5A-205ENST00000419711 1271 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.25■■□□□ 1.15
CCDC142Q17RM4 ARL5A-202ENST00000428992 747 ntTSL 2 BASIC22.25■■□□□ 1.15
CCDC142Q17RM4 NCF1B-203ENST00000435988 1254 ntBASIC22.25■■□□□ 1.15
CCDC142Q17RM4 C11orf24-209ENST00000533310 980 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.25■■□□□ 1.15
CCDC142Q17RM4 GDF6-203ENST00000621429 1179 ntTSL 5 BASIC22.25■■□□□ 1.15
CCDC142Q17RM4 PPP3CC-203ENST00000397775 2094 ntTSL 2 BASIC22.25■■□□□ 1.15
CCDC142Q17RM4 ANAPC4-201ENST00000315368 2685 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.25■■□□□ 1.15
CCDC142Q17RM4 E2F1-201ENST00000343380 2503 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.25■■□□□ 1.15
CCDC142Q17RM4 MFF-203ENST00000349901 1716 ntTSL 2 BASIC22.25■■□□□ 1.15
CCDC142Q17RM4 HPCAL1-201ENST00000307845 1751 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.25■■□□□ 1.15
CCDC142Q17RM4 RWDD4-206ENST00000512740 1393 ntTSL 5 BASIC22.25■■□□□ 1.15
CCDC142Q17RM4 FBXL19-205ENST00000562319 2462 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.24■■□□□ 1.15
CCDC142Q17RM4 PHF7-201ENST00000327906 2130 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.24■■□□□ 1.15
CCDC142Q17RM4 ELOA-201ENST00000418390 5154 ntTSL 1 (best) BASIC22.24■■□□□ 1.15
CCDC142Q17RM4 SCO2-201ENST00000252785 992 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.24■■□□□ 1.15
CCDC142Q17RM4 CFD-201ENST00000327726 1201 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.24■■□□□ 1.15
CCDC142Q17RM4 UMAD1-202ENST00000463725 559 ntTSL 4 BASIC22.24■■□□□ 1.15
CCDC142Q17RM4 DENND3-207ENST00000518347 850 ntTSL 2 BASIC22.24■■□□□ 1.15
CCDC142Q17RM4 SLC25A29-212ENST00000555927 960 ntTSL 2 BASIC22.24■■□□□ 1.15
CCDC142Q17RM4 NDUFA6-AS1-207ENST00000595777 833 ntTSL 5 BASIC22.24■■□□□ 1.15
CCDC142Q17RM4 PARP1-210ENST00000629232 477 ntTSL 5 BASIC22.24■■□□□ 1.15
CCDC142Q17RM4 EPHX3-202ENST00000435261 1771 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.24■■□□□ 1.15
CCDC142Q17RM4 MAF1-205ENST00000534585 1754 ntTSL 5 BASIC22.24■■□□□ 1.15
CCDC142Q17RM4 TRIM28-201ENST00000253024 2960 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.24■■□□□ 1.15
CCDC142Q17RM4 OLIG3-201ENST00000367734 2049 ntAPPRIS P1 BASIC22.24■■□□□ 1.15
CCDC142Q17RM4 LRCH4-209ENST00000497245 2014 ntTSL 5 BASIC22.24■■□□□ 1.15
CCDC142Q17RM4 STX5-203ENST00000394690 1568 ntTSL 5 BASIC22.24■■□□□ 1.15
CCDC142Q17RM4 GRINA-202ENST00000395068 1814 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.24■■□□□ 1.15
CCDC142Q17RM4 P4HTM-202ENST00000383729 2127 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.24■■□□□ 1.15
CCDC142Q17RM4 GSG1L-202ENST00000395724 1399 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.24■■□□□ 1.15
CCDC142Q17RM4 CSNK1G2-201ENST00000255641 2918 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.24■■□□□ 1.15
CCDC142Q17RM4 TEAD2-201ENST00000311227 2164 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.23■■□□□ 1.15
CCDC142Q17RM4 AC084757.3-201ENST00000558061 1943 ntTSL 3 BASIC22.23■■□□□ 1.15
CCDC142Q17RM4 DUSP2-201ENST00000288943 1688 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.23■■□□□ 1.15
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