Protein–RNA interactions for Protein: Q16799

RTN1, Reticulon-1, humanhuman

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Length 776 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
RTN1Q16799 CHN1-203ENST00000409156 1761 ntTSL 2 BASIC24.29■■□□□ 1.48
RTN1Q16799 TATDN2-201ENST00000287652 5342 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.29■■□□□ 1.48
RTN1Q16799 CTNNAL1-202ENST00000374593 761 ntTSL 3 BASIC24.29■■□□□ 1.48
RTN1Q16799 INTS11-205ENST00000429572 1104 ntTSL 2 BASIC24.29■■□□□ 1.48
RTN1Q16799 AC006015.1-201ENST00000429970 570 ntBASIC24.29■■□□□ 1.48
RTN1Q16799 KRT18P11-201ENST00000435214 1283 ntBASIC24.29■■□□□ 1.48
RTN1Q16799 WWOX-218ENST00000627394 894 ntTSL 5 BASIC24.29■■□□□ 1.48
RTN1Q16799 RARRES2P11-201ENST00000635158 484 ntBASIC24.29■■□□□ 1.48
RTN1Q16799 PUS1-203ENST00000443358 1664 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.29■■□□□ 1.48
RTN1Q16799 ARSA-205ENST00000453344 1650 ntTSL 2 BASIC24.29■■□□□ 1.48
RTN1Q16799 JPT1-206ENST00000476258 2289 ntTSL 1 (best) BASIC24.29■■□□□ 1.48
RTN1Q16799 NAAA-201ENST00000286733 1900 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC24.29■■□□□ 1.48
RTN1Q16799 SCARB2-219ENST00000639738 1517 ntTSL 5 BASIC24.29■■□□□ 1.48
RTN1Q16799 MMP23B-201ENST00000356026 1326 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.29■■□□□ 1.48
RTN1Q16799 TEAD2-201ENST00000311227 2164 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.29■■□□□ 1.48
RTN1Q16799 CCDC130-201ENST00000221554 1792 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.29■■□□□ 1.48
RTN1Q16799 NAA10-208ENST00000464845 1772 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.29■■□□□ 1.48
RTN1Q16799 TMEM175-212ENST00000508204 1399 ntTSL 3 BASIC24.29■■□□□ 1.48
RTN1Q16799 SEPT5-209ENST00000438754 2241 ntTSL 2 BASIC24.29■■□□□ 1.48
RTN1Q16799 NTN4-207ENST00000553059 1818 ntTSL 1 (best) BASIC24.28■■□□□ 1.48
RTN1Q16799 HNRNPLL-204ENST00000409328 1908 ntTSL 1 (best) BASIC24.28■■□□□ 1.48
RTN1Q16799 KIF12-207ENST00000640217 2194 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC24.28■■□□□ 1.48
RTN1Q16799 AC245052.3-201ENST00000450182 901 ntBASIC24.28■■□□□ 1.48
RTN1Q16799 FGF8-207ENST00000618991 856 ntTSL 3 BASIC24.28■■□□□ 1.48
RTN1Q16799 HOXC9-203ENST00000508190 1505 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC24.28■■□□□ 1.48
RTN1Q16799 EPHX3-202ENST00000435261 1771 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.28■■□□□ 1.48
RTN1Q16799 MAMSTR-202ENST00000356751 1825 ntTSL 2 BASIC24.28■■□□□ 1.48
RTN1Q16799 POLR2F-205ENST00000442738 2106 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.28■■□□□ 1.48
RTN1Q16799 CENPU-201ENST00000281453 1998 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.27■■□□□ 1.48
RTN1Q16799 SPR-201ENST00000234454 1480 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.27■■□□□ 1.48
RTN1Q16799 AL136982.7-201ENST00000609363 465 ntTSL 4 BASIC24.27■■□□□ 1.48
RTN1Q16799 IMPA2-212ENST00000625802 500 ntTSL 2 BASIC24.27■■□□□ 1.48
RTN1Q16799 SQLE-206ENST00000523430 1879 ntTSL 2 BASIC24.27■■□□□ 1.48
RTN1Q16799 KIF12-202ENST00000468460 2162 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.27■■□□□ 1.48
RTN1Q16799 SPRED3-202ENST00000586301 1366 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.27■■□□□ 1.48
RTN1Q16799 ABHD12B-202ENST00000353130 1477 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.26■■□□□ 1.47
RTN1Q16799 ANO8-201ENST00000159087 4152 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.26■■□□□ 1.47
RTN1Q16799 BRI3-207ENST00000539286 699 ntTSL 2 BASIC24.26■■□□□ 1.47
RTN1Q16799 MVB12A-212ENST00000543795 1154 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.26■■□□□ 1.47
RTN1Q16799 SEC11A-208ENST00000559729 1256 ntTSL 2 BASIC24.26■■□□□ 1.47
RTN1Q16799 HAS1-203ENST00000594621 760 ntTSL 1 (best) BASIC24.26■■□□□ 1.47
RTN1Q16799 UBE2Q2P2-204ENST00000618775 648 ntTSL 1 (best) BASIC24.26■■□□□ 1.47
RTN1Q16799 PALM-208ENST00000592155 2272 ntTSL 4 BASIC24.26■■□□□ 1.47
RTN1Q16799 DR1-201ENST00000370267 1647 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.25■■□□□ 1.47
RTN1Q16799 KCNN4-201ENST00000262888 2240 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.25■■□□□ 1.47
RTN1Q16799 C19orf24-201ENST00000409293 983 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.25■■□□□ 1.47
RTN1Q16799 SMIM12-202ENST00000423898 897 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.25■■□□□ 1.47
RTN1Q16799 GLI3-203ENST00000437480 451 ntTSL 2 BASIC24.25■■□□□ 1.47
RTN1Q16799 LTB-211ENST00000446745 853 ntTSL 1 (best) BASIC24.25■■□□□ 1.47
RTN1Q16799 TRIQK-221ENST00000524107 737 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC24.25■■□□□ 1.47
RTN1Q16799 SUZ12P1-202ENST00000578070 929 ntTSL 5 BASIC24.25■■□□□ 1.47
RTN1Q16799 ZNF584-201ENST00000306910 2332 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.25■■□□□ 1.47
RTN1Q16799 ZNF668-209ENST00000539836 2469 ntTSL 5 BASIC24.25■■□□□ 1.47
RTN1Q16799 ZBTB42-202ENST00000555360 1411 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.25■■□□□ 1.47
RTN1Q16799 RBM17P2-201ENST00000616397 1405 ntBASIC24.25■■□□□ 1.47
RTN1Q16799 TMEM9B-205ENST00000534025 2083 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.25■■□□□ 1.47
RTN1Q16799 DPF1-201ENST00000355526 1632 ntTSL 1 (best) BASIC24.24■■□□□ 1.47
RTN1Q16799 REPS2-202ENST00000357277 7953 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.24■■□□□ 1.47
RTN1Q16799 RELL2-207ENST00000521367 1780 ntTSL 5 BASIC24.24■■□□□ 1.47
RTN1Q16799 IZUMO4-203ENST00000395307 944 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.24■■□□□ 1.47
RTN1Q16799 LINC02199-202ENST00000510067 1008 ntTSL 2 BASIC24.24■■□□□ 1.47
RTN1Q16799 AC024267.6-201ENST00000580603 583 ntTSL 3 BASIC24.24■■□□□ 1.47
RTN1Q16799 MFSD11-216ENST00000590393 1141 ntBASIC24.24■■□□□ 1.47
RTN1Q16799 IKBKGP1-201ENST00000612193 1073 ntBASIC24.24■■□□□ 1.47
RTN1Q16799 ABHD1-207ENST00000621324 1078 ntTSL 5 BASIC24.24■■□□□ 1.47
RTN1Q16799 LTK-201ENST00000263800 3046 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC24.24■■□□□ 1.47
RTN1Q16799 PKD1P6-201ENST00000343738 4769 ntBASIC24.24■■□□□ 1.47
RTN1Q16799 PABPC1L2B-201ENST00000373521 2197 ntAPPRIS P1 BASIC24.24■■□□□ 1.47
RTN1Q16799 LSM14A-202ENST00000540746 2152 ntTSL 2 BASIC24.24■■□□□ 1.47
RTN1Q16799 DUSP28-201ENST00000343217 1555 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.24■■□□□ 1.47
RTN1Q16799 OTUB1-211ENST00000543004 1647 ntTSL 5 BASIC24.24■■□□□ 1.47
RTN1Q16799 C14orf79-207ENST00000550614 1912 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.23■■□□□ 1.47
RTN1Q16799 DMRT2-203ENST00000358146 1965 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.23■■□□□ 1.47
RTN1Q16799 SLC13A3-204ENST00000413164 2008 ntTSL 2 BASIC24.23■■□□□ 1.47
RTN1Q16799 FOXK2-201ENST00000335255 5265 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.23■■□□□ 1.47
RTN1Q16799 UBE2Q1-201ENST00000292211 3210 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.23■■□□□ 1.47
RTN1Q16799 AP001363.2-201ENST00000538101 391 ntTSL 3 BASIC24.23■■□□□ 1.47
RTN1Q16799 NMRAL1-212ENST00000574425 1240 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.23■■□□□ 1.47
RTN1Q16799 DHPS-223ENST00000614126 1124 ntTSL 5 BASIC24.23■■□□□ 1.47
RTN1Q16799 AC092437.1-201ENST00000624794 1048 ntBASIC24.23■■□□□ 1.47
RTN1Q16799 PLAGL1-207ENST00000417959 1645 ntTSL 1 (best) BASIC24.23■■□□□ 1.47
RTN1Q16799 RNH1-222ENST00000533410 1829 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.23■■□□□ 1.47
RTN1Q16799 APLP1-203ENST00000586861 2052 ntTSL 2 BASIC24.23■■□□□ 1.47
RTN1Q16799 SOX3-201ENST00000370536 2132 ntAPPRIS P1 BASIC24.23■■□□□ 1.47
RTN1Q16799 SMURF1-201ENST00000361125 5737 ntTSL 1 (best) BASIC24.22■■□□□ 1.47
RTN1Q16799 FAM69B-202ENST00000371692 1668 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.22■■□□□ 1.47
RTN1Q16799 HOXA11-AS-204ENST00000522674 1549 ntTSL 1 (best) BASIC24.22■■□□□ 1.47
RTN1Q16799 WT1-AS-205ENST00000494911 1320 ntTSL 4 BASIC24.22■■□□□ 1.47
RTN1Q16799 EDA-209ENST00000525810 843 ntTSL 1 (best) BASIC24.22■■□□□ 1.47
RTN1Q16799 EDA-210ENST00000527388 927 ntTSL 1 (best) BASIC24.22■■□□□ 1.47
RTN1Q16799 RNASEH2B-206ENST00000611510 1257 ntTSL 5 BASIC24.22■■□□□ 1.47
RTN1Q16799 AC010536.3-201ENST00000620306 533 ntBASIC24.22■■□□□ 1.47
RTN1Q16799 EFS-203ENST00000429593 2610 ntTSL 2 BASIC24.22■■□□□ 1.47
RTN1Q16799 PPP1R13B-201ENST00000202556 4958 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.22■■□□□ 1.47
RTN1Q16799 OSR2-203ENST00000457907 2126 ntTSL 2 BASIC24.22■■□□□ 1.47
RTN1Q16799 NUDT16L1-202ENST00000405142 2040 ntTSL 1 (best) BASIC24.22■■□□□ 1.47
RTN1Q16799 C18orf8-214ENST00000615148 1958 ntTSL 5 BASIC24.22■■□□□ 1.47
RTN1Q16799 C7orf49-213ENST00000617987 1727 ntTSL 5 BASIC24.21■■□□□ 1.47
RTN1Q16799 C19orf67-203ENST00000548523 1427 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC24.21■■□□□ 1.47
RTN1Q16799 RASGRP2-209ENST00000394429 453 ntTSL 3 BASIC24.21■■□□□ 1.47
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