Protein–RNA interactions for Protein: Q16676

FOXD1, Forkhead box protein D1, humanhuman

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Length 465 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
FOXD1Q16676 GPX1-204ENST00000620890 897 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC30.7■■■□□ 2.51
FOXD1Q16676 PAXBP1-201ENST00000290178 2564 ntTSL 1 (best) BASIC30.7■■■□□ 2.5
FOXD1Q16676 PSMD7-201ENST00000219313 1670 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.7■■■□□ 2.5
FOXD1Q16676 P4HA2-202ENST00000360568 2313 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC30.7■■■□□ 2.5
FOXD1Q16676 FRMD3-204ENST00000376438 2198 ntTSL 2 BASIC30.69■■■□□ 2.5
FOXD1Q16676 HOXC9-203ENST00000508190 1505 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC30.69■■■□□ 2.5
FOXD1Q16676 DCTD-202ENST00000438320 1972 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.69■■■□□ 2.5
FOXD1Q16676 TRAPPC5-203ENST00000595985 411 ntTSL 3 BASIC30.69■■■□□ 2.5
FOXD1Q16676 AL353729.2-201ENST00000605859 1249 ntBASIC30.69■■■□□ 2.5
FOXD1Q16676 CCDC106-207ENST00000591578 1592 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.69■■■□□ 2.5
FOXD1Q16676 LAYN-201ENST00000375614 2066 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC30.69■■■□□ 2.5
FOXD1Q16676 NKX2-4-201ENST00000351817 2238 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC30.69■■■□□ 2.5
FOXD1Q16676 KRT18P55-201ENST00000577198 1950 ntTSL 1 (best) BASIC30.68■■■□□ 2.5
FOXD1Q16676 IGFBP1-203ENST00000468955 1369 ntTSL 5 BASIC30.68■■■□□ 2.5
FOXD1Q16676 MT3-201ENST00000200691 569 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.68■■■□□ 2.5
FOXD1Q16676 SLC29A4P1-201ENST00000398760 971 ntBASIC30.68■■■□□ 2.5
FOXD1Q16676 C4orf48-201ENST00000409248 433 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC30.68■■■□□ 2.5
FOXD1Q16676 AC106738.2-202ENST00000558156 533 ntTSL 4 BASIC30.68■■■□□ 2.5
FOXD1Q16676 SNAP23-210ENST00000564153 775 ntTSL 2 BASIC30.68■■■□□ 2.5
FOXD1Q16676 ETHE1-205ENST00000600651 1052 ntTSL 1 (best) BASIC30.68■■■□□ 2.5
FOXD1Q16676 SMIM11B-202ENST00000619874 843 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.68■■■□□ 2.5
FOXD1Q16676 TMEM165-201ENST00000381334 1928 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.68■■■□□ 2.5
FOXD1Q16676 MAGIX-207ENST00000615915 1757 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC30.68■■■□□ 2.5
FOXD1Q16676 UBE2E3-201ENST00000392415 1347 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC30.68■■■□□ 2.5
FOXD1Q16676 TADA2B-204ENST00000512388 1343 ntTSL 5 BASIC30.68■■■□□ 2.5
FOXD1Q16676 SPATA2L-201ENST00000289805 2335 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.68■■■□□ 2.5
FOXD1Q16676 NELFCD-213ENST00000602795 2305 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.68■■■□□ 2.5
FOXD1Q16676 ARNTL2-209ENST00000546179 1861 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC30.67■■■□□ 2.5
FOXD1Q16676 GSG1L-202ENST00000395724 1399 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC30.67■■■□□ 2.5
FOXD1Q16676 CRTC2-203ENST00000368633 2644 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.67■■■□□ 2.5
FOXD1Q16676 C2orf72-201ENST00000373640 3657 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC30.67■■■□□ 2.5
FOXD1Q16676 CENPB-201ENST00000379751 2840 ntAPPRIS P1 BASIC30.67■■■□□ 2.5
FOXD1Q16676 ZNF843-201ENST00000315678 2137 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC30.67■■■□□ 2.5
FOXD1Q16676 AC004980.1-201ENST00000418663 2667 ntTSL 1 (best) BASIC30.67■■■□□ 2.5
FOXD1Q16676 HAGH-201ENST00000397353 1257 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC30.67■■■□□ 2.5
FOXD1Q16676 FAM47E-204ENST00000510328 1002 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC30.67■■■□□ 2.5
FOXD1Q16676 DHPS-223ENST00000614126 1124 ntTSL 5 BASIC30.67■■■□□ 2.5
FOXD1Q16676 PFKL-212ENST00000628044 129 ntTSL 3 BASIC30.67■■■□□ 2.5
FOXD1Q16676 B3GALT6-201ENST00000379198 2777 ntAPPRIS P1 BASIC30.67■■■□□ 2.5
FOXD1Q16676 ITM2C-202ENST00000326427 2078 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.67■■■□□ 2.5
FOXD1Q16676 PRICKLE3-206ENST00000599218 2062 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC30.67■■■□□ 2.5
FOXD1Q16676 STX5-203ENST00000394690 1568 ntTSL 5 BASIC30.66■■■□□ 2.5
FOXD1Q16676 PPP2R5E-204ENST00000555899 2164 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC30.66■■■□□ 2.5
FOXD1Q16676 LIMS2-202ENST00000355119 2045 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC30.66■■■□□ 2.5
FOXD1Q16676 MOK-226ENST00000522874 1890 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC30.66■■■□□ 2.5
FOXD1Q16676 ATXN3-201ENST00000340660 1205 ntTSL 1 (best) BASIC30.66■■■□□ 2.5
FOXD1Q16676 SMNDC1-201ENST00000369592 1110 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC30.66■■■□□ 2.5
FOXD1Q16676 MIPEPP3-201ENST00000412105 444 ntBASIC30.66■■■□□ 2.5
FOXD1Q16676 IL34-204ENST00000566361 1001 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC30.66■■■□□ 2.5
FOXD1Q16676 AC243732.1-201ENST00000612648 864 ntBASIC30.66■■■□□ 2.5
FOXD1Q16676 AC244517.4-202ENST00000624089 484 ntTSL 3 BASIC30.66■■■□□ 2.5
FOXD1Q16676 AL117328.2-201ENST00000624617 1940 ntBASIC30.66■■■□□ 2.5
FOXD1Q16676 FDFT1-201ENST00000220584 2176 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.66■■■□□ 2.5
FOXD1Q16676 ASRGL1-201ENST00000301776 2182 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.66■■■□□ 2.5
FOXD1Q16676 RNPEP-201ENST00000295640 2427 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.66■■■□□ 2.5
FOXD1Q16676 PHACTR3-202ENST00000359926 2252 ntTSL 2 BASIC30.65■■■□□ 2.5
FOXD1Q16676 HIKESHI-201ENST00000278483 1113 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.65■■■□□ 2.5
FOXD1Q16676 TMEM218-201ENST00000279968 1034 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.65■■■□□ 2.5
FOXD1Q16676 COA6-202ENST00000366613 641 ntTSL 1 (best) BASIC30.65■■■□□ 2.5
FOXD1Q16676 WIPF1-207ENST00000410117 777 ntTSL 3 BASIC30.65■■■□□ 2.5
FOXD1Q16676 CT47A12-201ENST00000419982 1165 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.65■■■□□ 2.5
FOXD1Q16676 AC010967.1-201ENST00000421575 489 ntTSL 5 BASIC30.65■■■□□ 2.5
FOXD1Q16676 AC091799.1-201ENST00000422823 811 ntBASIC30.65■■■□□ 2.5
FOXD1Q16676 ZCCHC9-204ENST00000438268 1248 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.65■■■□□ 2.5
FOXD1Q16676 LINC01014-203ENST00000455307 548 ntTSL 2 BASIC30.65■■■□□ 2.5
FOXD1Q16676 AC108693.2-201ENST00000492981 303 ntTSL 3 BASIC30.65■■■□□ 2.5
FOXD1Q16676 CDH18-AS1-201ENST00000513573 424 ntTSL 2 BASIC30.65■■■□□ 2.5
FOXD1Q16676 FAM66A-201ENST00000525829 921 ntTSL 2 BASIC30.65■■■□□ 2.5
FOXD1Q16676 Z92544.1-201ENST00000567091 730 ntTSL 3 BASIC30.65■■■□□ 2.5
FOXD1Q16676 AL391262.2-201ENST00000622466 494 ntBASIC30.65■■■□□ 2.5
FOXD1Q16676 KCNK15-201ENST00000372861 2599 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.64■■■□□ 2.5
FOXD1Q16676 NR2F2-204ENST00000453270 1712 ntTSL 1 (best) BASIC30.64■■■□□ 2.5
FOXD1Q16676 CAPZB-205ENST00000433834 1462 ntTSL 2 BASIC30.64■■■□□ 2.5
FOXD1Q16676 MAF1-205ENST00000534585 1754 ntTSL 5 BASIC30.64■■■□□ 2.5
FOXD1Q16676 MKRN4P-201ENST00000444706 1521 ntBASIC30.64■■■□□ 2.5
FOXD1Q16676 CLN3-240ENST00000631023 1586 ntTSL 5 BASIC30.64■■■□□ 2.5
FOXD1Q16676 AC069152.1-201ENST00000438030 544 ntBASIC30.64■■■□□ 2.5
FOXD1Q16676 MIR583HG-201ENST00000507997 704 ntTSL 2 BASIC30.64■■■□□ 2.5
FOXD1Q16676 ULK4P1-204ENST00000565949 721 ntTSL 4 BASIC30.64■■■□□ 2.5
FOXD1Q16676 WDR88-201ENST00000355868 1718 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC30.64■■■□□ 2.5
FOXD1Q16676 SHMT1-201ENST00000316694 2464 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.64■■■□□ 2.49
FOXD1Q16676 P2RY2-203ENST00000393597 2107 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.64■■■□□ 2.49
FOXD1Q16676 FAH-202ENST00000407106 2152 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC30.64■■■□□ 2.49
FOXD1Q16676 ALG1L9P-201ENST00000508969 2165 ntTSL 1 (best) BASIC30.64■■■□□ 2.49
FOXD1Q16676 GRINA-202ENST00000395068 1814 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.63■■■□□ 2.49
FOXD1Q16676 GRM6-202ENST00000517717 2673 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC30.63■■■□□ 2.49
FOXD1Q16676 SLC25A24P1-201ENST00000411846 1569 ntTSL 5 BASIC30.63■■■□□ 2.49
FOXD1Q16676 KLRF1-201ENST00000279545 1091 ntTSL 1 (best) BASIC30.63■■■□□ 2.49
FOXD1Q16676 AC099522.1-201ENST00000505955 881 ntTSL 3 BASIC30.63■■■□□ 2.49
FOXD1Q16676 AC025754.1-201ENST00000507566 407 ntTSL 3 BASIC30.63■■■□□ 2.49
FOXD1Q16676 TP53I11-215ENST00000531928 1078 ntTSL 3 BASIC30.63■■■□□ 2.49
FOXD1Q16676 AL079304.1-201ENST00000554595 828 ntTSL 2 BASIC30.63■■■□□ 2.49
FOXD1Q16676 KLRF1-208ENST00000617889 1241 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.63■■■□□ 2.49
FOXD1Q16676 EIPR1-206ENST00000443925 1771 ntTSL 3 BASIC30.63■■■□□ 2.49
FOXD1Q16676 GRAMD1A-201ENST00000317991 2695 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC30.63■■■□□ 2.49
FOXD1Q16676 SH3GLB2-203ENST00000372564 2982 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.63■■■□□ 2.49
FOXD1Q16676 PTX4-203ENST00000447419 1516 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC30.63■■■□□ 2.49
FOXD1Q16676 PGRMC2-201ENST00000296425 2767 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.62■■■□□ 2.49
FOXD1Q16676 NIPA2-203ENST00000398013 2280 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.62■■■□□ 2.49
FOXD1Q16676 MESP1-201ENST00000300057 2369 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.62■■■□□ 2.49
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