Protein–RNA interactions for Protein: Q16600

ZNF239, Zinc finger protein 239, humanhuman

Known RBP Predictions only

Length 458 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
ZNF239Q16600 LYPD1-202ENST00000397463 1891 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.78■□□□□ 0.6
ZNF239Q16600 IQSEC3-201ENST00000382841 2701 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC18.78■□□□□ 0.6
ZNF239Q16600 ARL6IP4-220ENST00000543566 1591 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.78■□□□□ 0.6
ZNF239Q16600 BCKDK-201ENST00000219794 2128 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.78■□□□□ 0.6
ZNF239Q16600 DPYS-201ENST00000351513 2127 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.78■□□□□ 0.6
ZNF239Q16600 STYXL1-204ENST00000360591 1127 ntTSL 5 BASIC18.78■□□□□ 0.6
ZNF239Q16600 MAP1LC3A-202ENST00000374837 961 ntTSL 3 BASIC18.78■□□□□ 0.6
ZNF239Q16600 FGF12-AS2-201ENST00000443165 580 ntTSL 4 BASIC18.78■□□□□ 0.6
ZNF239Q16600 AC080013.1-202ENST00000465477 674 ntTSL 5 BASIC18.78■□□□□ 0.6
ZNF239Q16600 MVB12A-212ENST00000543795 1154 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.78■□□□□ 0.6
ZNF239Q16600 CPEB1-AS1-201ENST00000560650 2138 ntTSL 1 (best) BASIC18.78■□□□□ 0.6
ZNF239Q16600 SLC7A5P1-201ENST00000568957 537 ntBASIC18.78■□□□□ 0.6
ZNF239Q16600 VPS53-216ENST00000574029 585 ntTSL 4 BASIC18.78■□□□□ 0.6
ZNF239Q16600 AP005205.2-201ENST00000577327 491 ntTSL 2 BASIC18.78■□□□□ 0.6
ZNF239Q16600 LINC01901-201ENST00000585822 1115 ntTSL 1 (best) BASIC18.78■□□□□ 0.6
ZNF239Q16600 SLC35A2-211ENST00000634461 533 ntTSL 4 BASIC18.78■□□□□ 0.6
ZNF239Q16600 PLSCR3-201ENST00000324822 1689 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.78■□□□□ 0.6
ZNF239Q16600 PUS1-203ENST00000443358 1664 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.78■□□□□ 0.6
ZNF239Q16600 C19orf12-201ENST00000323670 2464 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.78■□□□□ 0.6
ZNF239Q16600 HAUS4-205ENST00000541587 1637 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.78■□□□□ 0.6
ZNF239Q16600 BX322557.1-202ENST00000400362 1460 ntTSL 1 (best) BASIC18.77■□□□□ 0.6
ZNF239Q16600 TM7SF2-201ENST00000279263 1722 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.77■□□□□ 0.6
ZNF239Q16600 MIF4GD-202ENST00000325102 1306 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.77■□□□□ 0.6
ZNF239Q16600 DRAM2-201ENST00000286692 2246 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.77■□□□□ 0.6
ZNF239Q16600 SLC1A6-203ENST00000544886 2420 ntTSL 1 (best) BASIC18.77■□□□□ 0.6
ZNF239Q16600 UTF1-201ENST00000304477 1157 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.77■□□□□ 0.6
ZNF239Q16600 MANBAL-202ENST00000373606 1208 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.77■□□□□ 0.6
ZNF239Q16600 MT1M-201ENST00000379818 829 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.77■□□□□ 0.6
ZNF239Q16600 ZNF717-203ENST00000477374 1169 ntTSL 2 BASIC18.77■□□□□ 0.6
ZNF239Q16600 FAM66A-201ENST00000525829 921 ntTSL 2 BASIC18.77■□□□□ 0.6
ZNF239Q16600 BRI3-207ENST00000539286 699 ntTSL 2 BASIC18.77■□□□□ 0.6
ZNF239Q16600 AL845552.2-201ENST00000553301 553 ntTSL 4 BASIC18.77■□□□□ 0.6
ZNF239Q16600 AC092143.4-201ENST00000570217 559 ntTSL 4 BASIC18.77■□□□□ 0.6
ZNF239Q16600 F2RL3-202ENST00000599210 613 ntTSL 2 BASIC18.77■□□□□ 0.6
ZNF239Q16600 TMEM230-210ENST00000612323 1231 ntTSL 1 (best) BASIC18.77■□□□□ 0.6
ZNF239Q16600 AC011767.1-201ENST00000617410 1153 ntBASIC18.77■□□□□ 0.6
ZNF239Q16600 GSN-204ENST00000373818 2657 ntTSL 1 (best) BASIC18.77■□□□□ 0.6
ZNF239Q16600 CHN1-203ENST00000409156 1761 ntTSL 2 BASIC18.77■□□□□ 0.6
ZNF239Q16600 PDXDC1-205ENST00000535621 2048 ntTSL 1 (best) BASIC18.77■□□□□ 0.6
ZNF239Q16600 TMEM200B-202ENST00000521452 2501 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.77■□□□□ 0.6
ZNF239Q16600 FIP1L1-201ENST00000306932 1878 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.77■□□□□ 0.6
ZNF239Q16600 LINC01184-201ENST00000499346 1380 ntTSL 1 (best) BASIC18.77■□□□□ 0.6
ZNF239Q16600 TSPAN17-207ENST00000508164 2457 ntTSL 1 (best) BASIC18.77■□□□□ 0.59
ZNF239Q16600 HNRNPUL2-201ENST00000301785 5106 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.77■□□□□ 0.59
ZNF239Q16600 PARD3-214ENST00000545693 5962 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.77■□□□□ 0.59
ZNF239Q16600 AC132008.2-203ENST00000418868 1552 ntTSL 1 (best) BASIC18.76■□□□□ 0.59
ZNF239Q16600 CCDC130-201ENST00000221554 1792 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.76■□□□□ 0.59
ZNF239Q16600 AC007128.1-201ENST00000424460 1853 ntTSL 5 BASIC18.76■□□□□ 0.59
ZNF239Q16600 TMEM125-201ENST00000432792 1850 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.76■□□□□ 0.59
ZNF239Q16600 RBKS-201ENST00000302188 1973 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.76■□□□□ 0.59
ZNF239Q16600 RARRES2-201ENST00000223271 740 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.76■□□□□ 0.59
ZNF239Q16600 UMAD1-202ENST00000463725 559 ntTSL 4 BASIC18.76■□□□□ 0.59
ZNF239Q16600 AC080038.1-201ENST00000611274 1154 ntBASIC18.76■□□□□ 0.59
ZNF239Q16600 SPINT2-202ENST00000454580 1367 ntTSL 1 (best) BASIC18.76■□□□□ 0.59
ZNF239Q16600 CARM1-201ENST00000327064 3330 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.76■□□□□ 0.59
ZNF239Q16600 RARRES2-202ENST00000466675 1618 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.75■□□□□ 0.59
ZNF239Q16600 GNB1-209ENST00000610897 3145 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.75■□□□□ 0.59
ZNF239Q16600 WRNIP1-204ENST00000380773 2670 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.75■□□□□ 0.59
ZNF239Q16600 RAP1B-204ENST00000393436 2049 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.75■□□□□ 0.59
ZNF239Q16600 GATA3-AS1-204ENST00000438755 675 ntTSL 1 (best) BASIC18.75■□□□□ 0.59
ZNF239Q16600 COL19A1-203ENST00000478620 589 ntTSL 1 (best) BASIC18.75■□□□□ 0.59
ZNF239Q16600 AC021660.2-201ENST00000502999 388 ntTSL 3 BASIC18.75■□□□□ 0.59
ZNF239Q16600 UBE2Q2P2-204ENST00000618775 648 ntTSL 1 (best) BASIC18.75■□□□□ 0.59
ZNF239Q16600 ORAI3-204ENST00000566237 1393 ntTSL 5 BASIC18.75■□□□□ 0.59
ZNF239Q16600 GPR137-201ENST00000313074 1485 ntTSL 5 BASIC18.75■□□□□ 0.59
ZNF239Q16600 GPR137-203ENST00000411458 1495 ntTSL 2 BASIC18.75■□□□□ 0.59
ZNF239Q16600 C18orf8-214ENST00000615148 1958 ntTSL 5 BASIC18.75■□□□□ 0.59
ZNF239Q16600 NAA20-203ENST00000398602 1604 ntTSL 5 BASIC18.74■□□□□ 0.59
ZNF239Q16600 OSR1-201ENST00000272223 1936 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.74■□□□□ 0.59
ZNF239Q16600 AC007375.3-201ENST00000600936 2314 ntBASIC18.74■□□□□ 0.59
ZNF239Q16600 AKT2-210ENST00000424901 5170 ntTSL 5 BASIC18.74■□□□□ 0.59
ZNF239Q16600 ZIM2-201ENST00000593711 2083 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.74■□□□□ 0.59
ZNF239Q16600 PMPCA-203ENST00000399219 1987 ntTSL 2 BASIC18.74■□□□□ 0.59
ZNF239Q16600 KLF1-201ENST00000264834 1592 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.74■□□□□ 0.59
ZNF239Q16600 FMR1-201ENST00000218200 4333 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.74■□□□□ 0.59
ZNF239Q16600 CEACAM4-201ENST00000221954 1205 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.74■□□□□ 0.59
ZNF239Q16600 RHOD-201ENST00000308831 1129 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.74■□□□□ 0.59
ZNF239Q16600 TNFRSF18-201ENST00000328596 851 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC18.74■□□□□ 0.59
ZNF239Q16600 PPA1-202ENST00000373232 1295 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.74■□□□□ 0.59
ZNF239Q16600 MAD2L2-204ENST00000376667 872 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.74■□□□□ 0.59
ZNF239Q16600 INTS11-205ENST00000429572 1104 ntTSL 2 BASIC18.74■□□□□ 0.59
ZNF239Q16600 AC037459.4-201ENST00000517384 585 ntTSL 4 BASIC18.74■□□□□ 0.59
ZNF239Q16600 EDA-209ENST00000525810 843 ntTSL 1 (best) BASIC18.74■□□□□ 0.59
ZNF239Q16600 EDA-210ENST00000527388 927 ntTSL 1 (best) BASIC18.74■□□□□ 0.59
ZNF239Q16600 SEC23A-213ENST00000557280 561 ntTSL 4 BASIC18.74■□□□□ 0.59
ZNF239Q16600 NMRAL1-212ENST00000574425 1240 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.74■□□□□ 0.59
ZNF239Q16600 CEACAM4-203ENST00000600925 899 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC18.74■□□□□ 0.59
ZNF239Q16600 AL136982.7-201ENST00000609363 465 ntTSL 4 BASIC18.74■□□□□ 0.59
ZNF239Q16600 USP48-205ENST00000421625 2818 ntTSL 2 BASIC18.74■□□□□ 0.59
ZNF239Q16600 SPTBN4-203ENST00000392023 2419 ntTSL 1 (best) BASIC18.74■□□□□ 0.59
ZNF239Q16600 GRK3-203ENST00000619906 2873 ntTSL 5 BASIC18.74■□□□□ 0.59
ZNF239Q16600 TRIM67-203ENST00000449018 2166 ntTSL 1 (best) BASIC18.74■□□□□ 0.59
ZNF239Q16600 BSN-AS2-201ENST00000421598 2603 ntTSL 2 BASIC18.73■□□□□ 0.59
ZNF239Q16600 DUX4-204ENST00000569241 1574 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.73■□□□□ 0.59
ZNF239Q16600 PTOV1-212ENST00000599732 1577 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.73■□□□□ 0.59
ZNF239Q16600 CREB3L3-202ENST00000595923 1491 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.73■□□□□ 0.59
ZNF239Q16600 EPHX3-204ENST00000602233 1805 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.73■□□□□ 0.59
ZNF239Q16600 SCO2-201ENST00000252785 992 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.73■□□□□ 0.59
ZNF239Q16600 GGTLC1-202ENST00000286890 1028 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.73■□□□□ 0.59
ZNF239Q16600 AC009086.2-201ENST00000449759 610 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC18.73■□□□□ 0.59
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