Protein–RNA interactions for Protein: Q16533

SNAPC1, snRNA-activating protein complex subunit 1, humanhuman

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Length 368 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SNAPC1Q16533 SLC43A3-225ENST00000533524 1879 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC18.93■□□□□ 0.62
SNAPC1Q16533 PANO1-201ENST00000620120 1680 ntAPPRIS P1 BASIC18.93■□□□□ 0.62
SNAPC1Q16533 FSTL3-201ENST00000166139 2542 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.93■□□□□ 0.62
SNAPC1Q16533 SLC47A1P1-202ENST00000449666 945 ntBASIC18.93■□□□□ 0.62
SNAPC1Q16533 MYL5-206ENST00000506838 2956 ntTSL 2 BASIC18.93■□□□□ 0.62
SNAPC1Q16533 DUX4L19-201ENST00000557448 1267 ntBASIC18.93■□□□□ 0.62
SNAPC1Q16533 ZNF264-206ENST00000600531 774 ntTSL 2 BASIC18.93■□□□□ 0.62
SNAPC1Q16533 AL512631.2-201ENST00000604634 923 ntBASIC18.93■□□□□ 0.62
SNAPC1Q16533 MEDAG-201ENST00000380482 2374 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.93■□□□□ 0.62
SNAPC1Q16533 EGLN2-202ENST00000406058 2150 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.93■□□□□ 0.62
SNAPC1Q16533 STARD10-201ENST00000334805 1963 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.93■□□□□ 0.62
SNAPC1Q16533 PABPC4-204ENST00000372862 2470 ntTSL 5 BASIC18.93■□□□□ 0.62
SNAPC1Q16533 PIF1-202ENST00000333425 2278 ntTSL 1 (best) BASIC18.93■□□□□ 0.62
SNAPC1Q16533 PLCD1-201ENST00000334661 2769 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.93■□□□□ 0.62
SNAPC1Q16533 PNMA8B-202ENST00000599531 5308 ntAPPRIS P1 BASIC18.93■□□□□ 0.62
SNAPC1Q16533 POU3F2-201ENST00000328345 4879 ntAPPRIS P1 BASIC18.92■□□□□ 0.62
SNAPC1Q16533 RCN3-201ENST00000270645 1859 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.92■□□□□ 0.62
SNAPC1Q16533 KRTAP5-7-201ENST00000398536 1408 ntAPPRIS P1 BASIC18.92■□□□□ 0.62
SNAPC1Q16533 HPS6-201ENST00000299238 2649 ntAPPRIS P1 BASIC18.92■□□□□ 0.62
SNAPC1Q16533 PHLDA3-202ENST00000367311 2640 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.92■□□□□ 0.62
SNAPC1Q16533 RTL8C-201ENST00000257013 1181 ntAPPRIS P1 BASIC18.92■□□□□ 0.62
SNAPC1Q16533 HYI-204ENST00000372432 1066 ntTSL 1 (best) BASIC18.92■□□□□ 0.62
SNAPC1Q16533 IGFBP3-202ENST00000381083 1050 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC18.92■□□□□ 0.62
SNAPC1Q16533 HOXA11-AS1_1.1-201ENST00000613939 98 ntBASIC18.92■□□□□ 0.62
SNAPC1Q16533 AC136469.2-201ENST00000623944 1028 ntBASIC18.92■□□□□ 0.62
SNAPC1Q16533 SHISA9-205ENST00000639941 1135 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.92■□□□□ 0.62
SNAPC1Q16533 FAM43B-201ENST00000332947 2572 ntAPPRIS P1 BASIC18.92■□□□□ 0.62
SNAPC1Q16533 FAHD1-202ENST00000382668 1845 ntTSL 1 (best) BASIC18.92■□□□□ 0.62
SNAPC1Q16533 SLC2A11-202ENST00000316185 1555 ntTSL 1 (best) BASIC18.92■□□□□ 0.62
SNAPC1Q16533 TMEM8A-204ENST00000431232 3691 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.92■□□□□ 0.62
SNAPC1Q16533 RXFP3-201ENST00000330120 1852 ntAPPRIS P1 BASIC18.92■□□□□ 0.62
SNAPC1Q16533 IQCJ-SCHIP1-204ENST00000485419 2445 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC18.92■□□□□ 0.62
SNAPC1Q16533 CBWD3-201ENST00000360171 2165 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.92■□□□□ 0.62
SNAPC1Q16533 SPOCK3-204ENST00000502330 2180 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.92■□□□□ 0.62
SNAPC1Q16533 SMPD5-201ENST00000528912 1390 ntTSL 5 BASIC18.92■□□□□ 0.62
SNAPC1Q16533 ADAP1-218ENST00000617043 1946 ntTSL 2 BASIC18.92■□□□□ 0.62
SNAPC1Q16533 ABLIM2-204ENST00000407564 2291 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.91■□□□□ 0.62
SNAPC1Q16533 FYN-204ENST00000368678 2573 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC18.91■□□□□ 0.62
SNAPC1Q16533 AC121338.2-201ENST00000622535 1744 ntBASIC18.91■□□□□ 0.62
SNAPC1Q16533 PRELID3B-201ENST00000355937 2626 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.91■□□□□ 0.62
SNAPC1Q16533 HOXC13-201ENST00000243056 2423 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.91■□□□□ 0.62
SNAPC1Q16533 BRD9-202ENST00000467963 2156 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.91■□□□□ 0.62
SNAPC1Q16533 AC092835.1-201ENST00000425953 1850 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.91■□□□□ 0.62
SNAPC1Q16533 EPS8L1-201ENST00000201647 2536 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.91■□□□□ 0.62
SNAPC1Q16533 CTAG1B-202ENST00000359887 998 ntTSL 2 BASIC18.91■□□□□ 0.62
SNAPC1Q16533 NAXE-201ENST00000368233 1012 ntTSL 2 BASIC18.91■□□□□ 0.62
SNAPC1Q16533 SURF2-201ENST00000371964 842 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.91■□□□□ 0.62
SNAPC1Q16533 YJEFN3-201ENST00000436027 878 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.91■□□□□ 0.62
SNAPC1Q16533 AC061979.1-201ENST00000532061 434 ntTSL 5 BASIC18.91■□□□□ 0.62
SNAPC1Q16533 GALNS-211ENST00000568311 703 ntTSL 1 (best) BASIC18.91■□□□□ 0.62
SNAPC1Q16533 IRF7-205ENST00000397574 1968 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.91■□□□□ 0.62
SNAPC1Q16533 ACP4-201ENST00000270593 1347 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.91■□□□□ 0.62
SNAPC1Q16533 TDRD10-202ENST00000368482 2331 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.91■□□□□ 0.62
SNAPC1Q16533 LRRC3B-201ENST00000396641 1696 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.91■□□□□ 0.62
SNAPC1Q16533 SOCS2-206ENST00000549122 2391 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.91■□□□□ 0.62
SNAPC1Q16533 SH2B3-201ENST00000341259 5406 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.91■□□□□ 0.62
SNAPC1Q16533 ADM-207ENST00000530439 1839 ntTSL 2 BASIC18.9■□□□□ 0.62
SNAPC1Q16533 VGF-201ENST00000249330 2575 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.9■□□□□ 0.62
SNAPC1Q16533 FBXL17-205ENST00000542267 5188 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.9■□□□□ 0.62
SNAPC1Q16533 FBXO31-207ENST00000618298 1871 ntTSL 5 BASIC18.9■□□□□ 0.62
SNAPC1Q16533 MUS81-201ENST00000308110 2392 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.9■□□□□ 0.62
SNAPC1Q16533 AL391422.3-201ENST00000603791 2761 ntBASIC18.9■□□□□ 0.62
SNAPC1Q16533 WDR4-202ENST00000398208 2122 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.9■□□□□ 0.62
SNAPC1Q16533 SSR2-210ENST00000480567 895 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.9■□□□□ 0.62
SNAPC1Q16533 VAMP2-204ENST00000488857 874 ntAPPRIS ALT1 TSL 3 BASIC18.9■□□□□ 0.62
SNAPC1Q16533 AL035685.1-201ENST00000636663 812 ntBASIC18.9■□□□□ 0.62
SNAPC1Q16533 TM7SF2-201ENST00000279263 1722 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.9■□□□□ 0.62
SNAPC1Q16533 CBWD6-201ENST00000377391 1792 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.9■□□□□ 0.62
SNAPC1Q16533 SPOCK3-217ENST00000511269 1768 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC18.9■□□□□ 0.62
SNAPC1Q16533 ENKD1-206ENST00000602644 1353 ntTSL 5 BASIC18.9■□□□□ 0.62
SNAPC1Q16533 UAP1-201ENST00000271469 2377 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC18.9■□□□□ 0.62
SNAPC1Q16533 REM2-201ENST00000267396 1923 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.9■□□□□ 0.62
SNAPC1Q16533 BRICD5-201ENST00000328540 1913 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.9■□□□□ 0.62
SNAPC1Q16533 SENP5-204ENST00000445299 2491 ntTSL 2 BASIC18.9■□□□□ 0.62
SNAPC1Q16533 SLC46A3-202ENST00000380814 2121 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC18.89■□□□□ 0.62
SNAPC1Q16533 DR1-201ENST00000370267 1647 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.89■□□□□ 0.62
SNAPC1Q16533 ZNF517-207ENST00000531720 1615 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.89■□□□□ 0.62
SNAPC1Q16533 CLDN23-201ENST00000519106 2169 ntAPPRIS P1 BASIC18.89■□□□□ 0.62
SNAPC1Q16533 SAE1-203ENST00000413379 2313 ntTSL 2 BASIC18.89■□□□□ 0.61
SNAPC1Q16533 PCDHAC2-203ENST00000615316 3011 ntBASIC18.89■□□□□ 0.61
SNAPC1Q16533 KISS1-201ENST00000367194 709 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.89■□□□□ 0.61
SNAPC1Q16533 PEMT-202ENST00000395781 1050 ntTSL 2 BASIC18.89■□□□□ 0.61
SNAPC1Q16533 GUSBP5-201ENST00000418136 578 ntBASIC18.89■□□□□ 0.61
SNAPC1Q16533 AC011298.3-201ENST00000615796 283 ntBASIC18.89■□□□□ 0.61
SNAPC1Q16533 GATA5-201ENST00000252997 2595 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.89■□□□□ 0.61
SNAPC1Q16533 UBALD1-206ENST00000590965 1462 ntTSL 2 BASIC18.89■□□□□ 0.61
SNAPC1Q16533 SH3BP2-204ENST00000452765 2265 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.89■□□□□ 0.61
SNAPC1Q16533 ZNF419-203ENST00000354197 1569 ntTSL 5 BASIC18.89■□□□□ 0.61
SNAPC1Q16533 NDUFB2-212ENST00000476279 1666 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.89■□□□□ 0.61
SNAPC1Q16533 EGFL7-201ENST00000308874 1747 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.88■□□□□ 0.61
SNAPC1Q16533 LGI2-201ENST00000382114 6428 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.88■□□□□ 0.61
SNAPC1Q16533 ZGPAT-204ENST00000369967 1890 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.88■□□□□ 0.61
SNAPC1Q16533 TPCN2-205ENST00000542467 2000 ntTSL 2 BASIC18.88■□□□□ 0.61
SNAPC1Q16533 VSX1-202ENST00000376709 2192 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.88■□□□□ 0.61
SNAPC1Q16533 TAF15-215ENST00000605844 2191 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.88■□□□□ 0.61
SNAPC1Q16533 TBL1Y-201ENST00000346432 2312 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.88■□□□□ 0.61
SNAPC1Q16533 CALM1-202ENST00000447653 1104 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC18.88■□□□□ 0.61
SNAPC1Q16533 SRR-208ENST00000576848 588 ntTSL 4 BASIC18.88■□□□□ 0.61
SNAPC1Q16533 C1orf198-201ENST00000366663 3858 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.88■□□□□ 0.61
SNAPC1Q16533 UBALD1-208ENST00000591401 1305 ntTSL 5 BASIC18.88■□□□□ 0.61
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