Protein–RNA interactions for Protein: Q16526

CRY1, Cryptochrome-1, humanhuman

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Length 586 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CRY1Q16526 HAUS4-201ENST00000206474 1642 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.35■■□□□ 1.01
CRY1Q16526 CHADL-201ENST00000216241 2533 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.35■■□□□ 1.01
CRY1Q16526 KRT16P2-201ENST00000414673 1423 ntBASIC21.35■■□□□ 1.01
CRY1Q16526 CASP16P-201ENST00000428155 1433 ntTSL 1 (best) BASIC21.35■■□□□ 1.01
CRY1Q16526 NOX4-209ENST00000527626 1774 ntTSL 2 BASIC21.35■■□□□ 1.01
CRY1Q16526 GSEC-202ENST00000629441 1572 ntTSL 2 BASIC21.35■■□□□ 1.01
CRY1Q16526 MIF4GD-202ENST00000325102 1306 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.34■■□□□ 1.01
CRY1Q16526 PPP5C-201ENST00000012443 2109 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.34■■□□□ 1.01
CRY1Q16526 PLEKHA8-208ENST00000622102 2140 ntTSL 5 BASIC21.34■■□□□ 1.01
CRY1Q16526 ACOT8-201ENST00000217455 1168 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.34■■□□□ 1.01
CRY1Q16526 RARRES2-201ENST00000223271 740 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.34■■□□□ 1.01
CRY1Q16526 LGALS9B-201ENST00000324290 1243 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC21.34■■□□□ 1.01
CRY1Q16526 AC011611.3-201ENST00000552367 569 ntTSL 4 BASIC21.34■■□□□ 1.01
CRY1Q16526 DET1-205ENST00000558413 583 ntTSL 4 BASIC21.34■■□□□ 1.01
CRY1Q16526 LIMD2-206ENST00000578993 602 ntTSL 3 BASIC21.34■■□□□ 1.01
CRY1Q16526 AC003102.1-201ENST00000588279 569 ntTSL 4 BASIC21.34■■□□□ 1.01
CRY1Q16526 ETHE1-205ENST00000600651 1052 ntTSL 1 (best) BASIC21.34■■□□□ 1.01
CRY1Q16526 ADD3-AS1-204ENST00000627565 388 ntTSL 3 BASIC21.34■■□□□ 1.01
CRY1Q16526 DMRT1-201ENST00000382276 2222 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.34■■□□□ 1.01
CRY1Q16526 LOXL1-201ENST00000261921 2351 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.34■■□□□ 1.01
CRY1Q16526 KCNQ2-201ENST00000344425 1426 ntTSL 1 (best) BASIC21.34■■□□□ 1.01
CRY1Q16526 RBM17P2-201ENST00000616397 1405 ntBASIC21.34■■□□□ 1.01
CRY1Q16526 RDX-204ENST00000528498 2511 ntTSL 1 (best) BASIC21.34■■□□□ 1.01
CRY1Q16526 TGFBR1-202ENST00000374994 6516 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.34■■□□□ 1.01
CRY1Q16526 ZNF584-203ENST00000593920 2187 ntTSL 2 BASIC21.34■■□□□ 1.01
CRY1Q16526 KCNA2-206ENST00000638477 1524 ntTSL 5 BASIC21.34■■□□□ 1.01
CRY1Q16526 P4HTM-201ENST00000343546 2268 ntTSL 1 (best) BASIC21.34■■□□□ 1.01
CRY1Q16526 LRRC45-201ENST00000306688 2701 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.34■■□□□ 1.01
CRY1Q16526 ARL13B-205ENST00000471138 2206 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.33■■□□□ 1.01
CRY1Q16526 SHMT1-202ENST00000352886 2437 ntTSL 2 BASIC21.33■■□□□ 1.01
CRY1Q16526 LIPT2-201ENST00000310109 1018 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.33■■□□□ 1.01
CRY1Q16526 MRPL12-201ENST00000333676 1028 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.33■■□□□ 1.01
CRY1Q16526 SPDYE2-201ENST00000341656 1219 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.33■■□□□ 1.01
CRY1Q16526 SPDYE2B-202ENST00000455020 1219 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.33■■□□□ 1.01
CRY1Q16526 ZNF346-203ENST00000503425 1191 ntTSL 2 BASIC21.33■■□□□ 1.01
CRY1Q16526 ZNF263-205ENST00000574253 1139 ntTSL 2 BASIC21.33■■□□□ 1.01
CRY1Q16526 AL591742.1-201ENST00000604433 565 ntBASIC21.33■■□□□ 1.01
CRY1Q16526 CXCL14-201ENST00000337225 1971 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.33■■□□□ 1.01
CRY1Q16526 C11orf96-202ENST00000528572 1834 ntBASIC21.33■■□□□ 1.01
CRY1Q16526 PITX3-201ENST00000370002 1391 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.33■■□□□ 1
CRY1Q16526 SPATA2L-201ENST00000289805 2335 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.33■■□□□ 1
CRY1Q16526 TANGO2-202ENST00000398042 2011 ntTSL 2 BASIC21.33■■□□□ 1
CRY1Q16526 AKT2-234ENST00000579047 2029 ntTSL 1 (best) BASIC21.33■■□□□ 1
CRY1Q16526 TMEM176B-203ENST00000434545 1303 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.32■■□□□ 1
CRY1Q16526 CRTC2-203ENST00000368633 2644 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.32■■□□□ 1
CRY1Q16526 SLC35A3-204ENST00000427993 2062 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.32■■□□□ 1
CRY1Q16526 WRNIP1-203ENST00000380771 2595 ntTSL 1 (best) BASIC21.32■■□□□ 1
CRY1Q16526 MEA1-201ENST00000244711 1089 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.32■■□□□ 1
CRY1Q16526 ZNF580-201ENST00000325333 1261 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.32■■□□□ 1
CRY1Q16526 NAA20-202ENST00000334982 1260 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.32■■□□□ 1
CRY1Q16526 NAT16-202ENST00000443096 1286 ntTSL 1 (best) BASIC21.32■■□□□ 1
CRY1Q16526 DNAJA4-210ENST00000489435 947 ntTSL 3 BASIC21.32■■□□□ 1
CRY1Q16526 KHDRBS1-204ENST00000492989 1215 ntTSL 1 (best) BASIC21.32■■□□□ 1
CRY1Q16526 CTBP1-AS2-203ENST00000507044 739 ntTSL 3 BASIC21.32■■□□□ 1
CRY1Q16526 AC093827.2-201ENST00000512654 315 ntBASIC21.32■■□□□ 1
CRY1Q16526 COX6C-208ENST00000522940 694 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC21.32■■□□□ 1
CRY1Q16526 ZNF324-202ENST00000535298 1006 ntTSL 5 BASIC21.32■■□□□ 1
CRY1Q16526 ZNF580-203ENST00000545125 1025 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC21.32■■□□□ 1
CRY1Q16526 MYC-209ENST00000641252 345 ntBASIC21.32■■□□□ 1
CRY1Q16526 TMEM175-212ENST00000508204 1399 ntTSL 3 BASIC21.32■■□□□ 1
CRY1Q16526 TRAM2-AS1-204ENST00000606714 2453 ntTSL 2 BASIC21.32■■□□□ 1
CRY1Q16526 LETM1-201ENST00000302787 5462 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.32■■□□□ 1
CRY1Q16526 ST3GAL4-215ENST00000532243 1825 ntTSL 1 (best) BASIC21.32■■□□□ 1
CRY1Q16526 SH3GLB2-203ENST00000372564 2982 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.31■■□□□ 1
CRY1Q16526 SH3D19-211ENST00000604030 5228 ntTSL 5 BASIC21.31■■□□□ 1
CRY1Q16526 CACNA1H-202ENST00000358590 8069 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.31■■□□□ 1
CRY1Q16526 C16orf74-201ENST00000284245 906 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.31■■□□□ 1
CRY1Q16526 POLR2J-202ENST00000393794 784 ntTSL 1 (best) BASIC21.31■■□□□ 1
CRY1Q16526 EP300-AS1-201ENST00000420537 457 ntTSL 3 BASIC21.31■■□□□ 1
CRY1Q16526 AC097658.1-201ENST00000475555 843 ntBASIC21.31■■□□□ 1
CRY1Q16526 RAP1B-220ENST00000539091 977 ntTSL 2 BASIC21.31■■□□□ 1
CRY1Q16526 LYRM1-205ENST00000562740 931 ntTSL 1 (best) BASIC21.31■■□□□ 1
CRY1Q16526 C19orf25-213ENST00000592872 1287 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.31■■□□□ 1
CRY1Q16526 AC083880.1-201ENST00000608266 535 ntBASIC21.31■■□□□ 1
CRY1Q16526 FGF8-207ENST00000618991 856 ntTSL 3 BASIC21.31■■□□□ 1
CRY1Q16526 FRAT1-201ENST00000371021 2649 ntAPPRIS P1 BASIC21.31■■□□□ 1
CRY1Q16526 RAB28-201ENST00000288723 1810 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.31■■□□□ 1
CRY1Q16526 RBM38-203ENST00000356208 2382 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.31■■□□□ 1
CRY1Q16526 LMF1-202ENST00000543238 2103 ntTSL 2 BASIC21.31■■□□□ 1
CRY1Q16526 WRNIP1-204ENST00000380773 2670 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.31■■□□□ 1
CRY1Q16526 EEFSEC-201ENST00000254730 2232 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.31■■□□□ 1
CRY1Q16526 MMP23B-201ENST00000356026 1326 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.3■■□□□ 1
CRY1Q16526 AK4-208ENST00000546702 1335 ntTSL 1 (best) BASIC21.3■■□□□ 1
CRY1Q16526 SARDH-203ENST00000371868 2266 ntTSL 2 BASIC21.3■■□□□ 1
CRY1Q16526 TMEM51-203ENST00000400796 1842 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.3■■□□□ 1
CRY1Q16526 NRXN2-204ENST00000377559 6413 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.3■■□□□ 1
CRY1Q16526 PRKAA1-202ENST00000354209 1918 ntTSL 1 (best) BASIC21.3■■□□□ 1
CRY1Q16526 PRORSD1P-201ENST00000295112 541 ntBASIC21.3■■□□□ 1
CRY1Q16526 TTC9B-201ENST00000311308 843 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.3■■□□□ 1
CRY1Q16526 SERF1A-201ENST00000317633 963 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.3■■□□□ 1
CRY1Q16526 GRTP1-201ENST00000326039 1294 ntTSL 1 (best) BASIC21.3■■□□□ 1
CRY1Q16526 RHEB-204ENST00000472642 900 ntTSL 3 BASIC21.3■■□□□ 1
CRY1Q16526 ISCU-212ENST00000547005 795 ntTSL 3 BASIC21.3■■□□□ 1
CRY1Q16526 AC138028.5-201ENST00000566114 558 ntTSL 5 BASIC21.3■■□□□ 1
CRY1Q16526 PRORSD1P-203ENST00000579162 626 ntTSL 5 BASIC21.3■■□□□ 1
CRY1Q16526 AC243732.1-201ENST00000612648 864 ntBASIC21.3■■□□□ 1
CRY1Q16526 AC093762.2-201ENST00000641700 291 ntAPPRIS P1 BASIC21.3■■□□□ 1
CRY1Q16526 RARG-204ENST00000543726 1779 ntTSL 2 BASIC21.3■■□□□ 1
CRY1Q16526 PLPP7-202ENST00000372264 2095 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.3■■□□□ 1
CRY1Q16526 NIPA2-203ENST00000398013 2280 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.3■■□□□ 1
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