Protein–RNA interactions for Protein: Q15911

ZFHX3, Zinc finger homeobox protein 3, humanhuman

Predictions only

Length 3,703 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
ZFHX3Q15911 AC027031.2-201ENST00000521369 1318 ntTSL 1 (best) BASIC17.39■□□□□ 0.38
ZFHX3Q15911 TRH-201ENST00000302649 1978 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.39■□□□□ 0.37
ZFHX3Q15911 RABEP2-201ENST00000357573 2175 ntTSL 1 (best) BASIC17.39■□□□□ 0.37
ZFHX3Q15911 FAM47E-204ENST00000510328 1002 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC17.39■□□□□ 0.37
ZFHX3Q15911 LINC01962-201ENST00000513771 411 ntTSL 2 BASIC17.39■□□□□ 0.37
ZFHX3Q15911 RAP1B-221ENST00000540209 1264 ntTSL 2 BASIC17.39■□□□□ 0.37
ZFHX3Q15911 RAP1B-228ENST00000542145 1060 ntTSL 2 BASIC17.39■□□□□ 0.37
ZFHX3Q15911 ANAPC11-208ENST00000572851 686 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.39■□□□□ 0.37
ZFHX3Q15911 MIR6786-201ENST00000616843 113 ntBASIC17.39■□□□□ 0.37
ZFHX3Q15911 CCM2L-201ENST00000262659 2523 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.39■□□□□ 0.37
ZFHX3Q15911 PGF-206ENST00000555567 1927 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.39■□□□□ 0.37
ZFHX3Q15911 AC010980.2-201ENST00000587099 1412 ntBASIC17.39■□□□□ 0.37
ZFHX3Q15911 ODF3B-201ENST00000329363 970 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.39■□□□□ 0.37
ZFHX3Q15911 PFN3-201ENST00000358571 530 ntAPPRIS P1 BASIC17.39■□□□□ 0.37
ZFHX3Q15911 CCDC7-201ENST00000277657 1899 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.39■□□□□ 0.37
ZFHX3Q15911 TMEM53-205ENST00000372244 1472 ntTSL 2 BASIC17.39■□□□□ 0.37
ZFHX3Q15911 FMR1-AS1-201ENST00000594922 2005 ntTSL 1 (best) BASIC17.39■□□□□ 0.37
ZFHX3Q15911 NTAN1-201ENST00000287706 1204 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.38■□□□□ 0.37
ZFHX3Q15911 ETHE1-201ENST00000292147 963 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.38■□□□□ 0.37
ZFHX3Q15911 TMSB4X-201ENST00000380633 495 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC17.38■□□□□ 0.37
ZFHX3Q15911 KRT18P20-201ENST00000548986 1279 ntBASIC17.38■□□□□ 0.37
ZFHX3Q15911 AL136982.7-201ENST00000609363 465 ntTSL 4 BASIC17.38■□□□□ 0.37
ZFHX3Q15911 C3orf58-207ENST00000495414 1876 ntTSL 2 BASIC17.38■□□□□ 0.37
ZFHX3Q15911 KRT18P57-201ENST00000443599 1254 ntBASIC17.38■□□□□ 0.37
ZFHX3Q15911 CFL2-205ENST00000555765 632 ntTSL 2 BASIC17.38■□□□□ 0.37
ZFHX3Q15911 PDCD5-207ENST00000590247 699 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.38■□□□□ 0.37
ZFHX3Q15911 AL158152.2-201ENST00000602703 235 ntTSL 3 BASIC17.38■□□□□ 0.37
ZFHX3Q15911 MAPK12-211ENST00000622558 1779 ntTSL 1 (best) BASIC17.38■□□□□ 0.37
ZFHX3Q15911 SPATA2L-202ENST00000335360 1001 ntTSL 1 (best) BASIC17.38■□□□□ 0.37
ZFHX3Q15911 FAM207A-202ENST00000397826 880 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC17.38■□□□□ 0.37
ZFHX3Q15911 SNX5-213ENST00000486039 602 ntTSL 1 (best) BASIC17.38■□□□□ 0.37
ZFHX3Q15911 ADAMTS19-AS1-201ENST00000502827 786 ntTSL 4 BASIC17.38■□□□□ 0.37
ZFHX3Q15911 NOC4L-201ENST00000330579 1632 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.38■□□□□ 0.37
ZFHX3Q15911 SPATA22-202ENST00000355380 1216 ntTSL 1 (best) BASIC17.37■□□□□ 0.37
ZFHX3Q15911 C4orf48-201ENST00000409248 433 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.37■□□□□ 0.37
ZFHX3Q15911 PRDX5-201ENST00000265462 893 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.37■□□□□ 0.37
ZFHX3Q15911 BCL7B-206ENST00000455335 985 ntTSL 3 BASIC17.37■□□□□ 0.37
ZFHX3Q15911 USP45-205ENST00000472914 1617 ntTSL 5 BASIC17.37■□□□□ 0.37
ZFHX3Q15911 MIR210HG-201ENST00000500447 1965 ntTSL 2 BASIC17.37■□□□□ 0.37
ZFHX3Q15911 SNF8-202ENST00000502492 2319 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.37■□□□□ 0.37
ZFHX3Q15911 PCSK6-218ENST00000619160 3093 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.37■□□□□ 0.37
ZFHX3Q15911 KLC1-227ENST00000634686 2229 ntTSL 5 BASIC17.37■□□□□ 0.37
ZFHX3Q15911 ACAT1-201ENST00000265838 1761 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.37■□□□□ 0.37
ZFHX3Q15911 MAIP1-201ENST00000295079 1495 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC17.37■□□□□ 0.37
ZFHX3Q15911 MPC2-201ENST00000271373 798 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.37■□□□□ 0.37
ZFHX3Q15911 TRPT1-201ENST00000317459 962 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.37■□□□□ 0.37
ZFHX3Q15911 CD58-201ENST00000369487 892 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.37■□□□□ 0.37
ZFHX3Q15911 CD58-202ENST00000369489 1098 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.37■□□□□ 0.37
ZFHX3Q15911 HTT-AS-201ENST00000503893 515 ntTSL 4 BASIC17.37■□□□□ 0.37
ZFHX3Q15911 AC064807.1-201ENST00000518942 816 ntTSL 3 BASIC17.37■□□□□ 0.37
ZFHX3Q15911 HTATIP2-208ENST00000532505 595 ntTSL 2 BASIC17.37■□□□□ 0.37
ZFHX3Q15911 POLR2J2-202ENST00000358438 2065 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.37■□□□□ 0.37
ZFHX3Q15911 SRPK3-203ENST00000370104 1753 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.37■□□□□ 0.37
ZFHX3Q15911 QPCT-201ENST00000338415 1739 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.37■□□□□ 0.37
ZFHX3Q15911 TACO1-201ENST00000258975 1469 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.36■□□□□ 0.37
ZFHX3Q15911 AL135905.2-201ENST00000584934 1404 ntBASIC17.36■□□□□ 0.37
ZFHX3Q15911 HRASLS5-201ENST00000301790 1166 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.36■□□□□ 0.37
ZFHX3Q15911 TNFRSF18-204ENST00000486728 727 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.36■□□□□ 0.37
ZFHX3Q15911 C12orf76-208ENST00000551185 496 ntTSL 2 BASIC17.36■□□□□ 0.37
ZFHX3Q15911 AL162412.1-201ENST00000567129 965 ntBASIC17.36■□□□□ 0.37
ZFHX3Q15911 MTMR14-202ENST00000351233 2105 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.36■□□□□ 0.37
ZFHX3Q15911 LHX2-201ENST00000373615 2554 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.36■□□□□ 0.37
ZFHX3Q15911 AL645608.1-202ENST00000417705 1389 ntTSL 3 BASIC17.36■□□□□ 0.37
ZFHX3Q15911 KRT17P3-201ENST00000420566 1262 ntBASIC17.36■□□□□ 0.37
ZFHX3Q15911 AC099805.1-201ENST00000523987 1797 ntTSL 1 (best) BASIC17.36■□□□□ 0.37
ZFHX3Q15911 SOCS7-202ENST00000613678 1827 ntTSL 5 BASIC17.36■□□□□ 0.37
ZFHX3Q15911 AP006623.1-201ENST00000506172 2061 ntTSL 5 BASIC17.36■□□□□ 0.37
ZFHX3Q15911 ELOB-202ENST00000409477 997 ntTSL 1 (best) BASIC17.36■□□□□ 0.37
ZFHX3Q15911 SERPINH1P1-201ENST00000419794 1249 ntBASIC17.36■□□□□ 0.37
ZFHX3Q15911 PHF11-218ENST00000496623 1173 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC17.36■□□□□ 0.37
ZFHX3Q15911 TRAF3IP2-AS1-208ENST00000525151 609 ntTSL 1 (best) BASIC17.36■□□□□ 0.37
ZFHX3Q15911 ADAP2-204ENST00000580525 1598 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.36■□□□□ 0.37
ZFHX3Q15911 CRTAC1-202ENST00000370591 2348 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC17.36■□□□□ 0.37
ZFHX3Q15911 CRHR1-201ENST00000293493 2621 ntTSL 5 BASIC17.36■□□□□ 0.37
ZFHX3Q15911 RILPL1-205ENST00000636882 2258 ntTSL 5 BASIC17.35■□□□□ 0.37
ZFHX3Q15911 C20orf27-201ENST00000217195 1302 ntTSL 2 BASIC17.35■□□□□ 0.37
ZFHX3Q15911 AC004540.1-203ENST00000421862 907 ntTSL 5 BASIC17.35■□□□□ 0.37
ZFHX3Q15911 AC103564.1-201ENST00000437330 562 ntTSL 5 BASIC17.35■□□□□ 0.37
ZFHX3Q15911 MIF4GD-205ENST00000578305 569 ntTSL 5 BASIC17.35■□□□□ 0.37
ZFHX3Q15911 AC026471.6-201ENST00000622954 1905 ntBASIC17.35■□□□□ 0.37
ZFHX3Q15911 RENBP-202ENST00000393700 1388 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.35■□□□□ 0.37
ZFHX3Q15911 HSD11B1L-204ENST00000411793 1362 ntTSL 1 (best) BASIC17.35■□□□□ 0.37
ZFHX3Q15911 BACE1-203ENST00000428381 1333 ntTSL 1 (best) BASIC17.35■□□□□ 0.37
ZFHX3Q15911 AC115618.1-201ENST00000376775 549 ntTSL 3 BASIC17.35■□□□□ 0.37
ZFHX3Q15911 KRTAP5-11-201ENST00000398530 1021 ntAPPRIS P2 BASIC17.35■□□□□ 0.37
ZFHX3Q15911 PENK-204ENST00000518770 863 ntTSL 2 BASIC17.35■□□□□ 0.37
ZFHX3Q15911 KRTAP5-11-203ENST00000617152 558 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.35■□□□□ 0.37
ZFHX3Q15911 AC005906.2-202ENST00000638821 2168 ntTSL 5 BASIC17.35■□□□□ 0.37
ZFHX3Q15911 CASP16P-201ENST00000428155 1433 ntTSL 1 (best) BASIC17.35■□□□□ 0.37
ZFHX3Q15911 AC073508.3-201ENST00000619697 1419 ntBASIC17.35■□□□□ 0.37
ZFHX3Q15911 BBC3-201ENST00000300880 1347 ntTSL 1 (best) BASIC17.35■□□□□ 0.37
ZFHX3Q15911 LGALS9B-202ENST00000423676 1713 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.35■□□□□ 0.37
ZFHX3Q15911 AL513320.1-201ENST00000435049 622 ntTSL 3 BASIC17.35■□□□□ 0.37
ZFHX3Q15911 CUTA-210ENST00000488034 769 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC17.35■□□□□ 0.37
ZFHX3Q15911 AC087742.1-201ENST00000575880 1738 ntBASIC17.35■□□□□ 0.37
ZFHX3Q15911 P4HB-223ENST00000576390 439 ntTSL 4 BASIC17.34■□□□□ 0.37
ZFHX3Q15911 HNRNPM-202ENST00000348943 2568 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.34■□□□□ 0.37
ZFHX3Q15911 NTSR2-201ENST00000306928 1569 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.34■□□□□ 0.37
ZFHX3Q15911 MAZ-201ENST00000219782 2698 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC17.34■□□□□ 0.37
ZFHX3Q15911 C1orf174-201ENST00000361605 1666 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.34■□□□□ 0.37
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