Protein–RNA interactions for Protein: Q15650

TRIP4, Activating signal cointegrator 1, humanhuman

Predicted RBP Predictions only

Length 581 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
TRIP4Q15650 ZBTB42-202ENST00000555360 1411 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.67■■□□□ 1.06
TRIP4Q15650 NXNL2-201ENST00000375854 805 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.67■■□□□ 1.06
TRIP4Q15650 ARL5A-202ENST00000428992 747 ntTSL 2 BASIC21.67■■□□□ 1.06
TRIP4Q15650 AC092171.1-201ENST00000455866 753 ntTSL 2 BASIC21.67■■□□□ 1.06
TRIP4Q15650 DHRS4-207ENST00000559632 1003 ntTSL 1 (best) BASIC21.67■■□□□ 1.06
TRIP4Q15650 LIMS2-201ENST00000324938 2111 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.67■■□□□ 1.06
TRIP4Q15650 COL8A2-203ENST00000481785 2036 ntTSL 1 (best) BASIC21.67■■□□□ 1.06
TRIP4Q15650 KLHL17-205ENST00000622660 1950 ntTSL 5 BASIC21.67■■□□□ 1.06
TRIP4Q15650 B3GALT6-201ENST00000379198 2777 ntAPPRIS P1 BASIC21.66■■□□□ 1.06
TRIP4Q15650 BCAT2-207ENST00000597011 1579 ntTSL 5 BASIC21.66■■□□□ 1.06
TRIP4Q15650 HOXC9-203ENST00000508190 1505 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC21.66■■□□□ 1.06
TRIP4Q15650 PPCS-203ENST00000372561 1431 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.66■■□□□ 1.06
TRIP4Q15650 GPX1P1-201ENST00000388829 606 ntBASIC21.66■■□□□ 1.06
TRIP4Q15650 NRXN2-205ENST00000409571 6381 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.66■■□□□ 1.06
TRIP4Q15650 C19orf81-201ENST00000425202 765 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC21.66■■□□□ 1.06
TRIP4Q15650 AC133552.2-202ENST00000575694 574 ntBASIC21.66■■□□□ 1.06
TRIP4Q15650 AC104771.1-201ENST00000603335 964 ntBASIC21.66■■□□□ 1.06
TRIP4Q15650 AL121832.2-201ENST00000610979 668 ntBASIC21.66■■□□□ 1.06
TRIP4Q15650 TMEM191B-201ENST00000612978 1220 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC21.66■■□□□ 1.06
TRIP4Q15650 WT1-AS_3.1-201ENST00000613262 234 ntBASIC21.66■■□□□ 1.06
TRIP4Q15650 GDF6-203ENST00000621429 1179 ntTSL 5 BASIC21.66■■□□□ 1.06
TRIP4Q15650 FARP2-223ENST00000627550 2122 ntTSL 2 BASIC21.66■■□□□ 1.06
TRIP4Q15650 PPP3CC-203ENST00000397775 2094 ntTSL 2 BASIC21.66■■□□□ 1.06
TRIP4Q15650 ADORA2A-AS1-203ENST00000427813 2027 ntTSL 1 (best) BASIC21.66■■□□□ 1.06
TRIP4Q15650 USP12-201ENST00000282344 4511 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.66■■□□□ 1.06
TRIP4Q15650 TDRKH-205ENST00000368827 2318 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.66■■□□□ 1.06
TRIP4Q15650 OTUB1-211ENST00000543004 1647 ntTSL 5 BASIC21.66■■□□□ 1.06
TRIP4Q15650 ABHD12B-202ENST00000353130 1477 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.65■■□□□ 1.06
TRIP4Q15650 POC1B-209ENST00000549035 2038 ntTSL 2 BASIC21.65■■□□□ 1.06
TRIP4Q15650 NEIL1-206ENST00000564784 2019 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.65■■□□□ 1.06
TRIP4Q15650 ZGPAT-204ENST00000369967 1890 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.65■■□□□ 1.06
TRIP4Q15650 AC083906.2-201ENST00000511578 360 ntBASIC21.65■■□□□ 1.06
TRIP4Q15650 CD44-222ENST00000526025 1052 ntTSL 2 BASIC21.65■■□□□ 1.06
TRIP4Q15650 OAS3-207ENST00000551007 998 ntTSL 2 BASIC21.65■■□□□ 1.06
TRIP4Q15650 CACNB3-205ENST00000547392 2237 ntTSL 5 BASIC21.65■■□□□ 1.06
TRIP4Q15650 DOK3-202ENST00000357198 1729 ntTSL 2 BASIC21.65■■□□□ 1.06
TRIP4Q15650 BCKDK-201ENST00000219794 2128 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.65■■□□□ 1.06
TRIP4Q15650 BCL11B-203ENST00000443726 2599 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.65■■□□□ 1.06
TRIP4Q15650 YAP1-210ENST00000615667 5398 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.65■■□□□ 1.06
TRIP4Q15650 SNX24-211ENST00000513881 1563 ntTSL 1 (best) BASIC21.65■■□□□ 1.06
TRIP4Q15650 NRXN2-203ENST00000377551 6373 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.65■■□□□ 1.06
TRIP4Q15650 CDCA4-202ENST00000392590 1536 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.65■■□□□ 1.06
TRIP4Q15650 P4HA3-202ENST00000427714 2248 ntTSL 2 BASIC21.64■■□□□ 1.06
TRIP4Q15650 UBTF-213ENST00000533177 3011 ntTSL 5 BASIC21.64■■□□□ 1.06
TRIP4Q15650 STEAP1-201ENST00000297205 1313 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.64■■□□□ 1.05
TRIP4Q15650 MTHFS-201ENST00000258874 907 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.64■■□□□ 1.05
TRIP4Q15650 METTL15-202ENST00000403099 795 ntTSL 5 BASIC21.64■■□□□ 1.05
TRIP4Q15650 C4orf48-201ENST00000409248 433 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.64■■□□□ 1.05
TRIP4Q15650 CYP2T1P-201ENST00000432607 1285 ntBASIC21.64■■□□□ 1.05
TRIP4Q15650 AL162412.1-201ENST00000567129 965 ntBASIC21.64■■□□□ 1.05
TRIP4Q15650 AL109923.1-201ENST00000618799 583 ntBASIC21.64■■□□□ 1.05
TRIP4Q15650 MYO19-221ENST00000620640 1186 ntTSL 2 BASIC21.64■■□□□ 1.05
TRIP4Q15650 UBXN2B-206ENST00000638450 591 ntTSL 5 BASIC21.64■■□□□ 1.05
TRIP4Q15650 SMG7-AS1-201ENST00000421703 2220 ntTSL 1 (best) BASIC21.64■■□□□ 1.05
TRIP4Q15650 LYPD1-202ENST00000397463 1891 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.64■■□□□ 1.05
TRIP4Q15650 GRK3-203ENST00000619906 2873 ntTSL 5 BASIC21.64■■□□□ 1.05
TRIP4Q15650 CCSAP-201ENST00000284617 5121 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.63■■□□□ 1.05
TRIP4Q15650 ST3GAL3-207ENST00000353126 1969 ntTSL 5 BASIC21.63■■□□□ 1.05
TRIP4Q15650 Z98882.1-201ENST00000622160 2253 ntBASIC21.63■■□□□ 1.05
TRIP4Q15650 CDK18-203ENST00000429964 1648 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.63■■□□□ 1.05
TRIP4Q15650 AC007128.1-201ENST00000424460 1853 ntTSL 5 BASIC21.63■■□□□ 1.05
TRIP4Q15650 ADARB1-205ENST00000437626 5032 ntTSL 1 (best) BASIC21.63■■□□□ 1.05
TRIP4Q15650 ARL6IP4-220ENST00000543566 1591 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.63■■□□□ 1.05
TRIP4Q15650 IRAK3-203ENST00000545837 1579 ntTSL 1 (best) BASIC21.63■■□□□ 1.05
TRIP4Q15650 AC091799.1-201ENST00000422823 811 ntBASIC21.63■■□□□ 1.05
TRIP4Q15650 DYM-203ENST00000442713 2147 ntTSL 2 BASIC21.63■■□□□ 1.05
TRIP4Q15650 ETHE1-205ENST00000600651 1052 ntTSL 1 (best) BASIC21.63■■□□□ 1.05
TRIP4Q15650 AL591742.1-201ENST00000604433 565 ntBASIC21.63■■□□□ 1.05
TRIP4Q15650 AC244517.4-202ENST00000624089 484 ntTSL 3 BASIC21.63■■□□□ 1.05
TRIP4Q15650 PPP1R12B-212ENST00000480184 1808 ntTSL 1 (best) BASIC21.63■■□□□ 1.05
TRIP4Q15650 SCARB2-219ENST00000639738 1517 ntTSL 5 BASIC21.63■■□□□ 1.05
TRIP4Q15650 CASP16P-201ENST00000428155 1433 ntTSL 1 (best) BASIC21.63■■□□□ 1.05
TRIP4Q15650 HAUS3-202ENST00000443786 2430 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.63■■□□□ 1.05
TRIP4Q15650 P4HTM-202ENST00000383729 2127 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.62■■□□□ 1.05
TRIP4Q15650 IGFBP1-203ENST00000468955 1369 ntTSL 5 BASIC21.62■■□□□ 1.05
TRIP4Q15650 ARNTL2-209ENST00000546179 1861 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC21.62■■□□□ 1.05
TRIP4Q15650 CERS4-209ENST00000559450 1637 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.62■■□□□ 1.05
TRIP4Q15650 MREG-201ENST00000263268 1314 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.62■■□□□ 1.05
TRIP4Q15650 MRGPRF-203ENST00000441623 2282 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.62■■□□□ 1.05
TRIP4Q15650 SKIDA1-201ENST00000444772 2667 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.62■■□□□ 1.05
TRIP4Q15650 GRM6-202ENST00000517717 2673 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.62■■□□□ 1.05
TRIP4Q15650 MGST3-205ENST00000367889 1015 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.62■■□□□ 1.05
TRIP4Q15650 CD58-201ENST00000369487 892 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.62■■□□□ 1.05
TRIP4Q15650 CD58-202ENST00000369489 1098 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.62■■□□□ 1.05
TRIP4Q15650 BET1L-204ENST00000410108 637 ntTSL 3 BASIC21.62■■□□□ 1.05
TRIP4Q15650 TRNT1-207ENST00000420393 854 ntTSL 3 BASIC21.62■■□□□ 1.05
TRIP4Q15650 NELFCD-213ENST00000602795 2305 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.62■■□□□ 1.05
TRIP4Q15650 ARRB2-201ENST00000269260 1895 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.62■■□□□ 1.05
TRIP4Q15650 RWDD4-206ENST00000512740 1393 ntTSL 5 BASIC21.61■■□□□ 1.05
TRIP4Q15650 CLN3-240ENST00000631023 1586 ntTSL 5 BASIC21.61■■□□□ 1.05
TRIP4Q15650 RYK-208ENST00000620660 2942 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.61■■□□□ 1.05
TRIP4Q15650 UNC119-201ENST00000301032 1653 ntTSL 1 (best) BASIC21.61■■□□□ 1.05
TRIP4Q15650 ZNF644-203ENST00000361321 1253 ntTSL 2 BASIC21.61■■□□□ 1.05
TRIP4Q15650 CD8B-205ENST00000393761 932 ntTSL 1 (best) BASIC21.61■■□□□ 1.05
TRIP4Q15650 CD8B-206ENST00000431506 692 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.61■■□□□ 1.05
TRIP4Q15650 GUSBP6-202ENST00000438529 1198 ntBASIC21.61■■□□□ 1.05
TRIP4Q15650 TSPY6P-201ENST00000448518 926 ntBASIC21.61■■□□□ 1.05
TRIP4Q15650 FAM47E-204ENST00000510328 1002 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC21.61■■□□□ 1.05
TRIP4Q15650 AF201337.1-201ENST00000520239 748 ntBASIC21.61■■□□□ 1.05
TRIP4Q15650 CAMTA1-216ENST00000557126 486 ntTSL 2 BASIC21.61■■□□□ 1.05
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