Protein–RNA interactions for Protein: Q15643

TRIP11, Thyroid receptor-interacting protein 11, humanhuman

Predictions only

Length 1,979 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
TRIP11Q15643 EIF5A-205ENST00000419711 1271 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.51■■□□□ 1.19
TRIP11Q15643 RAP1B-220ENST00000539091 977 ntTSL 2 BASIC22.51■■□□□ 1.19
TRIP11Q15643 FBXW4P1-201ENST00000426721 2239 ntBASIC22.51■■□□□ 1.19
TRIP11Q15643 RFLNA-201ENST00000324038 2148 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC22.51■■□□□ 1.19
TRIP11Q15643 ZNF707-222ENST00000532158 2218 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.51■■□□□ 1.19
TRIP11Q15643 FBXW11-203ENST00000393802 2181 ntTSL 1 (best) BASIC22.51■■□□□ 1.19
TRIP11Q15643 ABHD12B-202ENST00000353130 1477 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.51■■□□□ 1.19
TRIP11Q15643 SYNGR2-201ENST00000225777 2325 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.51■■□□□ 1.19
TRIP11Q15643 DPF1-201ENST00000355526 1632 ntTSL 1 (best) BASIC22.5■■□□□ 1.19
TRIP11Q15643 MTHFS-201ENST00000258874 907 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.5■■□□□ 1.19
TRIP11Q15643 BX276092.2-201ENST00000417668 665 ntBASIC22.5■■□□□ 1.19
TRIP11Q15643 KLF13-207ENST00000560473 489 ntTSL 3 BASIC22.5■■□□□ 1.19
TRIP11Q15643 LYRM1-205ENST00000562740 931 ntTSL 1 (best) BASIC22.5■■□□□ 1.19
TRIP11Q15643 AC069236.1-201ENST00000604339 616 ntBASIC22.5■■□□□ 1.19
TRIP11Q15643 ILDR2-205ENST00000526687 2299 ntTSL 5 BASIC22.5■■□□□ 1.19
TRIP11Q15643 SLC25A24P1-201ENST00000411846 1569 ntTSL 5 BASIC22.5■■□□□ 1.19
TRIP11Q15643 PHOSPHO1-206ENST00000514112 1587 ntTSL 1 (best) BASIC22.5■■□□□ 1.19
TRIP11Q15643 ZGPAT-204ENST00000369967 1890 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.5■■□□□ 1.19
TRIP11Q15643 GRTP1-203ENST00000375431 1384 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.5■■□□□ 1.19
TRIP11Q15643 SAC3D1-205ENST00000531072 1362 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.5■■□□□ 1.19
TRIP11Q15643 DOCK5-208ENST00000481100 2166 ntTSL 1 (best) BASIC22.5■■□□□ 1.19
TRIP11Q15643 BIN1-207ENST00000357970 2497 ntTSL 1 (best) BASIC22.5■■□□□ 1.19
TRIP11Q15643 SPTBN4-203ENST00000392023 2419 ntTSL 1 (best) BASIC22.5■■□□□ 1.19
TRIP11Q15643 EPHX3-202ENST00000435261 1771 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.5■■□□□ 1.19
TRIP11Q15643 KIF2A-202ENST00000401507 2539 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.5■■□□□ 1.19
TRIP11Q15643 CD99P1-203ENST00000431582 602 ntTSL 4 BASIC22.5■■□□□ 1.19
TRIP11Q15643 FAM66A-201ENST00000525829 921 ntTSL 2 BASIC22.5■■□□□ 1.19
TRIP11Q15643 PDXDC1-205ENST00000535621 2048 ntTSL 1 (best) BASIC22.5■■□□□ 1.19
TRIP11Q15643 ULK4P1-204ENST00000565949 721 ntTSL 4 BASIC22.5■■□□□ 1.19
TRIP11Q15643 LIMD2-206ENST00000578993 602 ntTSL 3 BASIC22.5■■□□□ 1.19
TRIP11Q15643 PHACTR3-202ENST00000359926 2252 ntTSL 2 BASIC22.5■■□□□ 1.19
TRIP11Q15643 PPT2-244ENST00000324816 2053 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.5■■□□□ 1.19
TRIP11Q15643 YY1AP1-214ENST00000407221 2705 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.49■■□□□ 1.19
TRIP11Q15643 TRIM3-214ENST00000536344 2704 ntTSL 2 BASIC22.49■■□□□ 1.19
TRIP11Q15643 LYPD1-202ENST00000397463 1891 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.49■■□□□ 1.19
TRIP11Q15643 PAXIP1-AS1-201ENST00000608317 2256 ntBASIC22.49■■□□□ 1.19
TRIP11Q15643 FAM72A-202ENST00000367128 2398 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.49■■□□□ 1.19
TRIP11Q15643 FAM72D-201ENST00000400889 2397 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.49■■□□□ 1.19
TRIP11Q15643 CRTC2-203ENST00000368633 2644 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.49■■□□□ 1.19
TRIP11Q15643 ALDH3A2-224ENST00000626500 995 ntTSL 5 BASIC22.49■■□□□ 1.19
TRIP11Q15643 GNB4-204ENST00000468623 1360 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.49■■□□□ 1.19
TRIP11Q15643 MMP23B-202ENST00000378675 1309 ntTSL 1 (best) BASIC22.49■■□□□ 1.19
TRIP11Q15643 TCP11-203ENST00000373974 1689 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.49■■□□□ 1.19
TRIP11Q15643 CHPF-202ENST00000373891 1079 ntTSL 2 BASIC22.49■■□□□ 1.19
TRIP11Q15643 DGCR6L-202ENST00000405465 962 ntTSL 3 BASIC22.49■■□□□ 1.19
TRIP11Q15643 PALM-207ENST00000590161 2137 ntTSL 4 BASIC22.49■■□□□ 1.19
TRIP11Q15643 AL772284.2-201ENST00000620151 1147 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.49■■□□□ 1.19
TRIP11Q15643 AC000035.1-201ENST00000634116 343 ntTSL 5 BASIC22.49■■□□□ 1.19
TRIP11Q15643 IER5L-201ENST00000372491 2711 ntAPPRIS P1 BASIC22.49■■□□□ 1.19
TRIP11Q15643 FNDC10-201ENST00000422725 2085 ntAPPRIS P1 BASIC22.48■■□□□ 1.19
TRIP11Q15643 TPD52L1-201ENST00000304877 1468 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.48■■□□□ 1.19
TRIP11Q15643 CLDN23-201ENST00000519106 2169 ntAPPRIS P1 BASIC22.48■■□□□ 1.19
TRIP11Q15643 MAP1LC3A-201ENST00000360668 1574 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.48■■□□□ 1.19
TRIP11Q15643 Z98882.1-201ENST00000622160 2253 ntBASIC22.48■■□□□ 1.19
TRIP11Q15643 TMPRSS5-208ENST00000544476 1320 ntTSL 2 BASIC22.48■■□□□ 1.19
TRIP11Q15643 NUDT8-202ENST00000376693 728 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.48■■□□□ 1.19
TRIP11Q15643 MIR4651-201ENST00000582622 73 ntBASIC22.48■■□□□ 1.19
TRIP11Q15643 GRINA-202ENST00000395068 1814 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.48■■□□□ 1.19
TRIP11Q15643 CBLN3-201ENST00000267406 2346 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.48■■□□□ 1.19
TRIP11Q15643 PRSS33-202ENST00000570702 1676 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.48■■□□□ 1.19
TRIP11Q15643 POU2F2-215ENST00000560398 1788 ntTSL 5 BASIC22.48■■□□□ 1.19
TRIP11Q15643 SPOP-206ENST00000504102 1865 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.48■■□□□ 1.19
TRIP11Q15643 ST3GAL3-207ENST00000353126 1969 ntTSL 5 BASIC22.48■■□□□ 1.19
TRIP11Q15643 GRK3-203ENST00000619906 2873 ntTSL 5 BASIC22.47■■□□□ 1.19
TRIP11Q15643 BCKDK-201ENST00000219794 2128 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.47■■□□□ 1.19
TRIP11Q15643 WWTR1-AS1-203ENST00000495094 975 ntTSL 1 (best) BASIC22.47■■□□□ 1.19
TRIP11Q15643 TRIM35-203ENST00000521253 1215 ntTSL 1 (best) BASIC22.47■■□□□ 1.19
TRIP11Q15643 ACBD4-202ENST00000376955 1453 ntTSL 2 BASIC22.47■■□□□ 1.19
TRIP11Q15643 NELFE-202ENST00000375429 1584 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.47■■□□□ 1.19
TRIP11Q15643 EXOC3-AS1-202ENST00000623673 1663 ntBASIC22.47■■□□□ 1.19
TRIP11Q15643 TTYH1-201ENST00000301194 2088 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.47■■□□□ 1.19
TRIP11Q15643 C8orf82-201ENST00000313465 2186 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.47■■□□□ 1.19
TRIP11Q15643 TMEM9B-201ENST00000309134 1659 ntTSL 1 (best) BASIC22.47■■□□□ 1.19
TRIP11Q15643 EMC6-202ENST00000397133 762 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.47■■□□□ 1.19
TRIP11Q15643 AC093787.1-201ENST00000450396 207 ntBASIC22.47■■□□□ 1.19
TRIP11Q15643 AP000282.1-201ENST00000454622 682 ntTSL 2 BASIC22.47■■□□□ 1.19
TRIP11Q15643 ZNF324-202ENST00000535298 1006 ntTSL 5 BASIC22.47■■□□□ 1.19
TRIP11Q15643 SNAP23-210ENST00000564153 775 ntTSL 2 BASIC22.47■■□□□ 1.19
TRIP11Q15643 SLC35A3-218ENST00000639994 1114 ntTSL 5 BASIC22.47■■□□□ 1.19
TRIP11Q15643 FAM129C-211ENST00000600871 1822 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.47■■□□□ 1.19
TRIP11Q15643 NOXO1-202ENST00000356120 1539 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.46■■□□□ 1.19
TRIP11Q15643 HOXA10-201ENST00000283921 2541 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.46■■□□□ 1.19
TRIP11Q15643 DUSP9-201ENST00000342782 2433 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.46■■□□□ 1.19
TRIP11Q15643 TDRKH-205ENST00000368827 2318 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.46■■□□□ 1.19
TRIP11Q15643 KCNK15-201ENST00000372861 2599 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.46■■□□□ 1.19
TRIP11Q15643 LINC00605-201ENST00000514902 1558 ntTSL 1 (best) BASIC22.46■■□□□ 1.19
TRIP11Q15643 ARL6IP4-220ENST00000543566 1591 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.46■■□□□ 1.19
TRIP11Q15643 KCNQ5-213ENST00000629977 2830 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.46■■□□□ 1.19
TRIP11Q15643 C10orf91-202ENST00000392630 1846 ntTSL 2 BASIC22.46■■□□□ 1.19
TRIP11Q15643 RHEB-204ENST00000472642 900 ntTSL 3 BASIC22.46■■□□□ 1.19
TRIP11Q15643 ALKBH6-212ENST00000485128 959 ntTSL 5 BASIC22.46■■□□□ 1.19
TRIP11Q15643 CDK18-203ENST00000429964 1648 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.46■■□□□ 1.19
TRIP11Q15643 EIF2B4-211ENST00000616081 1754 ntTSL 5 BASIC22.46■■□□□ 1.19
TRIP11Q15643 NEIL1-206ENST00000564784 2019 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.46■■□□□ 1.19
TRIP11Q15643 SH2D3A-201ENST00000245908 2296 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.46■■□□□ 1.19
TRIP11Q15643 NRG3-201ENST00000372141 2158 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.46■■□□□ 1.19
TRIP11Q15643 P4HA3-202ENST00000427714 2248 ntTSL 2 BASIC22.45■■□□□ 1.19
TRIP11Q15643 KCNAB3-201ENST00000303790 2458 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.45■■□□□ 1.19
TRIP11Q15643 KCNA2-206ENST00000638477 1524 ntTSL 5 BASIC22.45■■□□□ 1.18
TRIP11Q15643 AC025754.1-201ENST00000507566 407 ntTSL 3 BASIC22.45■■□□□ 1.18
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 25.5 ms