Protein–RNA interactions for Protein: Q15544

TAF11, Transcription initiation factor TFIID subunit 11, humanhuman

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Length 211 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
TAF11Q15544 LMAN2-201ENST00000303127 1800 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.18■□□□□ 0.82
TAF11Q15544 ATPIF1-202ENST00000465645 1855 ntTSL 1 (best) BASIC20.18■□□□□ 0.82
TAF11Q15544 IRF3-207ENST00000593922 1494 ntTSL 1 (best) BASIC20.18■□□□□ 0.82
TAF11Q15544 FAHD1-201ENST00000382666 1964 ntTSL 2 BASIC20.17■□□□□ 0.82
TAF11Q15544 ECHDC1-214ENST00000474289 2443 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC20.17■□□□□ 0.82
TAF11Q15544 SNN-201ENST00000329565 3312 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.17■□□□□ 0.82
TAF11Q15544 NFIB-208ENST00000397581 3318 ntTSL 5 BASIC20.17■□□□□ 0.82
TAF11Q15544 MAP7D2-203ENST00000443379 2476 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC20.17■□□□□ 0.82
TAF11Q15544 EDEM1-201ENST00000256497 6146 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.17■□□□□ 0.82
TAF11Q15544 AC064853.3-201ENST00000641801 1658 ntAPPRIS P1 BASIC20.17■□□□□ 0.82
TAF11Q15544 FAM239A-202ENST00000438107 2155 ntTSL 5 BASIC20.17■□□□□ 0.82
TAF11Q15544 RCCD1-201ENST00000394258 2689 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.17■□□□□ 0.82
TAF11Q15544 ARHGAP28-203ENST00000383472 2295 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.17■□□□□ 0.82
TAF11Q15544 TMEM147-203ENST00000392205 767 ntTSL 2 BASIC20.17■□□□□ 0.82
TAF11Q15544 SENP5-202ENST00000419026 973 ntTSL 3 BASIC20.17■□□□□ 0.82
TAF11Q15544 PRTG-204ENST00000561292 833 ntTSL 3 BASIC20.17■□□□□ 0.82
TAF11Q15544 ZNF180-205ENST00000587047 525 ntTSL 4 BASIC20.17■□□□□ 0.82
TAF11Q15544 TMEM240-203ENST00000624426 796 ntTSL 3 BASIC20.17■□□□□ 0.82
TAF11Q15544 WDR90-201ENST00000293879 5488 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC20.17■□□□□ 0.82
TAF11Q15544 PDK3-201ENST00000379162 1809 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.17■□□□□ 0.82
TAF11Q15544 C6orf89-201ENST00000355190 1309 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.17■□□□□ 0.82
TAF11Q15544 REPS1-203ENST00000409812 2511 ntTSL 1 (best) BASIC20.17■□□□□ 0.82
TAF11Q15544 SCARF1-202ENST00000348987 2619 ntTSL 1 (best) BASIC20.17■□□□□ 0.82
TAF11Q15544 CREB3L3-205ENST00000602257 1475 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.17■□□□□ 0.82
TAF11Q15544 ADAM9-203ENST00000466936 2053 ntTSL 2 BASIC20.17■□□□□ 0.82
TAF11Q15544 TPST1-201ENST00000304842 2116 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.17■□□□□ 0.82
TAF11Q15544 FBXL17-205ENST00000542267 5188 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.17■□□□□ 0.82
TAF11Q15544 SIGLEC15-201ENST00000389474 1573 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.17■□□□□ 0.82
TAF11Q15544 ITGA6-201ENST00000264107 5618 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.16■□□□□ 0.82
TAF11Q15544 CFAP99-206ENST00000616117 1941 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.16■□□□□ 0.82
TAF11Q15544 FAM213B-201ENST00000378424 2765 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.16■□□□□ 0.82
TAF11Q15544 C1QTNF12-201ENST00000330388 1036 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.16■□□□□ 0.82
TAF11Q15544 TMEM170A-202ENST00000561878 1072 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.16■□□□□ 0.82
TAF11Q15544 AC009163.4-201ENST00000567194 530 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.16■□□□□ 0.82
TAF11Q15544 Z92544.1-202ENST00000571933 1220 ntBASIC20.16■□□□□ 0.82
TAF11Q15544 INPP1-202ENST00000392329 2162 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.16■□□□□ 0.82
TAF11Q15544 SNX4-201ENST00000251775 2513 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.16■□□□□ 0.82
TAF11Q15544 GATM-201ENST00000396659 2597 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.16■□□□□ 0.82
TAF11Q15544 ASGR1-208ENST00000574388 1552 ntTSL 1 (best) BASIC20.16■□□□□ 0.82
TAF11Q15544 ODF3L2-201ENST00000315489 1604 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.16■□□□□ 0.82
TAF11Q15544 GOLPH3-201ENST00000265070 2721 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.16■□□□□ 0.82
TAF11Q15544 TDRKH-203ENST00000368824 2824 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.16■□□□□ 0.82
TAF11Q15544 PHLDB2-210ENST00000478922 1861 ntTSL 1 (best) BASIC20.16■□□□□ 0.82
TAF11Q15544 SAMD14-203ENST00000503131 1938 ntTSL 1 (best) BASIC20.15■□□□□ 0.82
TAF11Q15544 RGMA-210ENST00000557301 1929 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC20.15■□□□□ 0.82
TAF11Q15544 SPOCK3-215ENST00000510741 1963 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.15■□□□□ 0.82
TAF11Q15544 LHX3-202ENST00000371748 2365 ntTSL 1 (best) BASIC20.15■□□□□ 0.82
TAF11Q15544 AGTR1-209ENST00000497524 2359 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.15■□□□□ 0.82
TAF11Q15544 SENP6-202ENST00000370010 4644 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.15■□□□□ 0.82
TAF11Q15544 EBPL-205ENST00000378284 967 ntTSL 1 (best) BASIC20.15■□□□□ 0.82
TAF11Q15544 TMEM179-204ENST00000556573 1430 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC20.15■□□□□ 0.82
TAF11Q15544 RAP1B-207ENST00000450214 1466 ntTSL 2 BASIC20.15■□□□□ 0.82
TAF11Q15544 RPP38-207ENST00000616640 1537 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.15■□□□□ 0.82
TAF11Q15544 MFSD7-202ENST00000347950 1599 ntTSL 2 BASIC20.15■□□□□ 0.82
TAF11Q15544 AC233992.2-201ENST00000531225 1596 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.15■□□□□ 0.82
TAF11Q15544 NECAB1-201ENST00000417640 5289 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.15■□□□□ 0.82
TAF11Q15544 TRH-201ENST00000302649 1978 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.15■□□□□ 0.82
TAF11Q15544 MIR210HG-201ENST00000500447 1965 ntTSL 2 BASIC20.15■□□□□ 0.82
TAF11Q15544 BAG5-201ENST00000299204 4848 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.15■□□□□ 0.82
TAF11Q15544 LSM11-201ENST00000286307 6584 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.14■□□□□ 0.82
TAF11Q15544 TLX1-201ENST00000370196 2906 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.14■□□□□ 0.82
TAF11Q15544 AC004408.2-201ENST00000623613 2777 ntBASIC20.14■□□□□ 0.82
TAF11Q15544 SLC27A1-204ENST00000598424 2681 ntTSL 2 BASIC20.14■□□□□ 0.82
TAF11Q15544 PIANP-201ENST00000320591 2323 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.14■□□□□ 0.82
TAF11Q15544 DNAAF3-202ENST00000455045 2318 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.14■□□□□ 0.82
TAF11Q15544 POLD2-202ENST00000406581 2158 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.14■□□□□ 0.81
TAF11Q15544 GPT-205ENST00000528431 1822 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.14■□□□□ 0.81
TAF11Q15544 MAP2K5-204ENST00000395476 1689 ntTSL 1 (best) BASIC20.14■□□□□ 0.81
TAF11Q15544 AC012645.1-201ENST00000515455 1650 ntTSL 1 (best) BASIC20.14■□□□□ 0.81
TAF11Q15544 CACNG6-203ENST00000352529 1635 ntTSL 5 BASIC20.14■□□□□ 0.81
TAF11Q15544 PPP4C-214ENST00000627746 1301 ntTSL 5 BASIC20.14■□□□□ 0.81
TAF11Q15544 AL160276.1-201ENST00000636672 1312 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.14■□□□□ 0.81
TAF11Q15544 RAB33A-201ENST00000257017 1258 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.14■□□□□ 0.81
TAF11Q15544 GUCD1-202ENST00000402766 865 ntTSL 2 BASIC20.14■□□□□ 0.81
TAF11Q15544 LINC01925-201ENST00000579492 500 ntTSL 5 BASIC20.14■□□□□ 0.81
TAF11Q15544 FAM91A1-201ENST00000334705 5511 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.14■□□□□ 0.81
TAF11Q15544 NPTX1-201ENST00000306773 5122 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.14■□□□□ 0.81
TAF11Q15544 TTC19-201ENST00000261647 3002 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.14■□□□□ 0.81
TAF11Q15544 MYH7B-201ENST00000262873 6293 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.13■□□□□ 0.81
TAF11Q15544 NPW-201ENST00000329610 498 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.13■□□□□ 0.81
TAF11Q15544 PRR7-204ENST00000510492 1285 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.13■□□□□ 0.81
TAF11Q15544 AC026785.2-201ENST00000511821 867 ntTSL 2 BASIC20.13■□□□□ 0.81
TAF11Q15544 KLC2-204ENST00000394067 2898 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.13■□□□□ 0.81
TAF11Q15544 ARHGAP23-222ENST00000622683 5964 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC20.13■□□□□ 0.81
TAF11Q15544 MARK1-202ENST00000366918 5169 ntTSL 1 (best) BASIC20.13■□□□□ 0.81
TAF11Q15544 TPST2-202ENST00000398110 1968 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.13■□□□□ 0.81
TAF11Q15544 BEST2-201ENST00000042931 1908 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.13■□□□□ 0.81
TAF11Q15544 PLPPR2-208ENST00000591608 2552 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC20.13■□□□□ 0.81
TAF11Q15544 AL049796.1-201ENST00000565336 1766 ntBASIC20.13■□□□□ 0.81
TAF11Q15544 FAM151B-201ENST00000282226 1717 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.13■□□□□ 0.81
TAF11Q15544 AP3S1-201ENST00000316788 1730 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.13■□□□□ 0.81
TAF11Q15544 FAM3A-202ENST00000359889 1712 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.13■□□□□ 0.81
TAF11Q15544 SIGMAR1-201ENST00000277010 1656 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.13■□□□□ 0.81
TAF11Q15544 FGFRL1-203ENST00000504138 1663 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.13■□□□□ 0.81
TAF11Q15544 CALY-201ENST00000252939 2271 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.13■□□□□ 0.81
TAF11Q15544 MFSD6L-201ENST00000329805 2188 ntAPPRIS P1 BASIC20.12■□□□□ 0.81
TAF11Q15544 SLC25A43-201ENST00000217909 2783 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.12■□□□□ 0.81
TAF11Q15544 TTC34-201ENST00000401095 8814 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.12■□□□□ 0.81
TAF11Q15544 DMWD-201ENST00000270223 3305 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.12■□□□□ 0.81
TAF11Q15544 C7orf43-206ENST00000456769 2046 ntTSL 2 BASIC20.12■□□□□ 0.81
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 33.9 ms