Protein–RNA interactions for Protein: Q15306

IRF4, Interferon regulatory factor 4, humanhuman

Predictions only

Length 451 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
IRF4Q15306 RGMA-211ENST00000557420 989 ntTSL 3 BASIC20.63■□□□□ 0.89
IRF4Q15306 ZNF263-205ENST00000574253 1139 ntTSL 2 BASIC20.63■□□□□ 0.89
IRF4Q15306 MIR4758-201ENST00000577688 71 ntBASIC20.63■□□□□ 0.89
IRF4Q15306 PSMC3IP-208ENST00000590760 664 ntTSL 1 (best) BASIC20.63■□□□□ 0.89
IRF4Q15306 MAGIX-202ENST00000595224 1238 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC20.63■□□□□ 0.89
IRF4Q15306 TRAPPC5-203ENST00000595985 411 ntTSL 3 BASIC20.63■□□□□ 0.89
IRF4Q15306 PTGIR-205ENST00000597185 775 ntTSL 3 BASIC20.63■□□□□ 0.89
IRF4Q15306 ITM2C-202ENST00000326427 2078 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.63■□□□□ 0.89
IRF4Q15306 BCAT2-207ENST00000597011 1579 ntTSL 5 BASIC20.63■□□□□ 0.89
IRF4Q15306 AUTS2-203ENST00000406775 5950 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.63■□□□□ 0.89
IRF4Q15306 EP400NL-214ENST00000641289 2402 ntBASIC20.63■□□□□ 0.89
IRF4Q15306 PSIP1-201ENST00000380715 1966 ntTSL 1 (best) BASIC20.63■□□□□ 0.89
IRF4Q15306 C2orf72-201ENST00000373640 3657 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.63■□□□□ 0.89
IRF4Q15306 ZBTB46-202ENST00000302995 2335 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.62■□□□□ 0.89
IRF4Q15306 MTAP-204ENST00000460874 1434 ntTSL 2 BASIC20.62■□□□□ 0.89
IRF4Q15306 HOMER1-202ENST00000334082 5881 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.62■□□□□ 0.89
IRF4Q15306 GAS1-201ENST00000298743 2827 ntAPPRIS P1 BASIC20.62■□□□□ 0.89
IRF4Q15306 PRSS33-202ENST00000570702 1676 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.62■□□□□ 0.89
IRF4Q15306 AC073210.2-201ENST00000430369 194 ntBASIC20.62■□□□□ 0.89
IRF4Q15306 CDV3P1-201ENST00000471403 739 ntBASIC20.62■□□□□ 0.89
IRF4Q15306 WWTR1-AS1-203ENST00000495094 975 ntTSL 1 (best) BASIC20.62■□□□□ 0.89
IRF4Q15306 CASP6-205ENST00000505486 538 ntTSL 4 BASIC20.62■□□□□ 0.89
IRF4Q15306 AP000785.1-201ENST00000527314 613 ntTSL 4 BASIC20.62■□□□□ 0.89
IRF4Q15306 ISCU-212ENST00000547005 795 ntTSL 3 BASIC20.62■□□□□ 0.89
IRF4Q15306 TGIF1-207ENST00000407501 1585 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC20.62■□□□□ 0.89
IRF4Q15306 SPOP-206ENST00000504102 1865 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.62■□□□□ 0.89
IRF4Q15306 SLC4A3-203ENST00000358055 4454 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.62■□□□□ 0.89
IRF4Q15306 PBX4-201ENST00000251203 1724 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.61■□□□□ 0.89
IRF4Q15306 SAC3D1-205ENST00000531072 1362 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.61■□□□□ 0.89
IRF4Q15306 ZGPAT-204ENST00000369967 1890 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.61■□□□□ 0.89
IRF4Q15306 MT3-201ENST00000200691 569 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.61■□□□□ 0.89
IRF4Q15306 GRTP1-201ENST00000326039 1294 ntTSL 1 (best) BASIC20.61■□□□□ 0.89
IRF4Q15306 PPP1CA-202ENST00000358239 1054 ntTSL 2 BASIC20.61■□□□□ 0.89
IRF4Q15306 WIPF1-207ENST00000410117 777 ntTSL 3 BASIC20.61■□□□□ 0.89
IRF4Q15306 CT47A12-201ENST00000419982 1165 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.61■□□□□ 0.89
IRF4Q15306 PTPA-214ENST00000423100 988 ntTSL 2 BASIC20.61■□□□□ 0.89
IRF4Q15306 FAM21FP-204ENST00000608637 956 ntBASIC20.61■□□□□ 0.89
IRF4Q15306 AL772284.2-201ENST00000620151 1147 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.61■□□□□ 0.89
IRF4Q15306 RTCA-201ENST00000260563 1534 ntTSL 1 (best) BASIC20.61■□□□□ 0.89
IRF4Q15306 SCARB2-219ENST00000639738 1517 ntTSL 5 BASIC20.61■□□□□ 0.89
IRF4Q15306 FRAT1-201ENST00000371021 2649 ntAPPRIS P1 BASIC20.61■□□□□ 0.89
IRF4Q15306 PDE9A-212ENST00000398234 1783 ntTSL 1 (best) BASIC20.61■□□□□ 0.89
IRF4Q15306 CAPZB-205ENST00000433834 1462 ntTSL 2 BASIC20.61■□□□□ 0.89
IRF4Q15306 NAT16-204ENST00000455377 1492 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.61■□□□□ 0.89
IRF4Q15306 SH3BP2-204ENST00000452765 2265 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.61■□□□□ 0.89
IRF4Q15306 ZNF622-201ENST00000308683 1699 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.61■□□□□ 0.89
IRF4Q15306 DPF1-201ENST00000355526 1632 ntTSL 1 (best) BASIC20.6■□□□□ 0.89
IRF4Q15306 PPP1R3F-203ENST00000466508 1885 ntTSL 2 BASIC20.6■□□□□ 0.89
IRF4Q15306 MMP23B-202ENST00000378675 1309 ntTSL 1 (best) BASIC20.6■□□□□ 0.89
IRF4Q15306 DUSP18-205ENST00000404885 1306 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.6■□□□□ 0.89
IRF4Q15306 PTX4-203ENST00000447419 1516 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.6■□□□□ 0.89
IRF4Q15306 SLC25A39-212ENST00000590194 1542 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC20.6■□□□□ 0.89
IRF4Q15306 KCNA2-206ENST00000638477 1524 ntTSL 5 BASIC20.6■□□□□ 0.89
IRF4Q15306 GCC2-AS1-201ENST00000322353 558 ntTSL 2 BASIC20.6■□□□□ 0.89
IRF4Q15306 PPP1R14BP2-201ENST00000426284 444 ntBASIC20.6■□□□□ 0.89
IRF4Q15306 CD99P1-205ENST00000527459 561 ntBASIC20.6■□□□□ 0.89
IRF4Q15306 KRT18P6-201ENST00000555540 1265 ntBASIC20.6■□□□□ 0.89
IRF4Q15306 AC092118.2-201ENST00000613495 667 ntBASIC20.6■□□□□ 0.89
IRF4Q15306 SLC35A3-218ENST00000639994 1114 ntTSL 5 BASIC20.6■□□□□ 0.89
IRF4Q15306 MESP1-201ENST00000300057 2369 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.6■□□□□ 0.89
IRF4Q15306 ZIM2-201ENST00000593711 2083 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.6■□□□□ 0.89
IRF4Q15306 DLK2-201ENST00000357338 2038 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC20.6■□□□□ 0.89
IRF4Q15306 ST7-201ENST00000265437 2899 ntTSL 1 (best) BASIC20.6■□□□□ 0.89
IRF4Q15306 BIN1-203ENST00000346226 2401 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.59■□□□□ 0.89
IRF4Q15306 MAP1LC3A-201ENST00000360668 1574 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.59■□□□□ 0.89
IRF4Q15306 KRT18P55-201ENST00000577198 1950 ntTSL 1 (best) BASIC20.59■□□□□ 0.89
IRF4Q15306 CAPN12-212ENST00000601953 2381 ntTSL 5 BASIC20.59■□□□□ 0.89
IRF4Q15306 RFLNA-201ENST00000324038 2148 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC20.59■□□□□ 0.89
IRF4Q15306 FBXL14-201ENST00000339235 2111 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.59■□□□□ 0.89
IRF4Q15306 NOTUM-201ENST00000409678 2329 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.59■□□□□ 0.89
IRF4Q15306 NPDC1-202ENST00000371601 1494 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.59■□□□□ 0.89
IRF4Q15306 TRPT1-201ENST00000317459 962 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.59■□□□□ 0.89
IRF4Q15306 BID-202ENST00000342111 854 ntTSL 1 (best) BASIC20.59■□□□□ 0.89
IRF4Q15306 FAM160B1-201ENST00000369246 666 ntTSL 2 BASIC20.59■□□□□ 0.89
IRF4Q15306 EMC6-202ENST00000397133 762 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.59■□□□□ 0.89
IRF4Q15306 HTT-AS-201ENST00000503893 515 ntTSL 4 BASIC20.59■□□□□ 0.89
IRF4Q15306 BEAN1-AS1-201ENST00000564618 533 ntTSL 4 BASIC20.59■□□□□ 0.89
IRF4Q15306 RAB28-201ENST00000288723 1810 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.59■□□□□ 0.89
IRF4Q15306 PPP2R5E-204ENST00000555899 2164 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC20.59■□□□□ 0.89
IRF4Q15306 DAZAP1-211ENST00000592522 2157 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC20.59■□□□□ 0.89
IRF4Q15306 LAYN-201ENST00000375614 2066 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.58■□□□□ 0.89
IRF4Q15306 SLC2A7-201ENST00000400906 1539 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.58■□□□□ 0.89
IRF4Q15306 C12orf42-208ENST00000548883 1336 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.58■□□□□ 0.89
IRF4Q15306 MCMBP-202ENST00000369077 2465 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC20.58■□□□□ 0.89
IRF4Q15306 GGTLC1-201ENST00000278765 974 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.58■□□□□ 0.89
IRF4Q15306 CD99P1-203ENST00000431582 602 ntTSL 4 BASIC20.58■□□□□ 0.89
IRF4Q15306 ELOVL2-AS1-201ENST00000456190 737 ntTSL 3 BASIC20.58■□□□□ 0.89
IRF4Q15306 SLC25A22-216ENST00000531214 1790 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.58■□□□□ 0.89
IRF4Q15306 DTNB-211ENST00000407661 2420 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC20.58■□□□□ 0.88
IRF4Q15306 PPP3CC-203ENST00000397775 2094 ntTSL 2 BASIC20.58■□□□□ 0.88
IRF4Q15306 AUH-202ENST00000375731 1577 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.58■□□□□ 0.88
IRF4Q15306 TPM1-208ENST00000404484 1568 ntTSL 1 (best) BASIC20.58■□□□□ 0.88
IRF4Q15306 LINC00605-201ENST00000514902 1558 ntTSL 1 (best) BASIC20.58■□□□□ 0.88
IRF4Q15306 SNX7-201ENST00000306121 1734 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.58■□□□□ 0.88
IRF4Q15306 LMLN-210ENST00000482695 2010 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.58■□□□□ 0.88
IRF4Q15306 HLA-C-201ENST00000376228 1536 ntAPPRIS P2 BASIC20.58■□□□□ 0.88
IRF4Q15306 VKORC1L1-202ENST00000434382 1541 ntTSL 2 BASIC20.58■□□□□ 0.88
IRF4Q15306 TMEM9B-201ENST00000309134 1659 ntTSL 1 (best) BASIC20.58■□□□□ 0.88
IRF4Q15306 NUF2-208ENST00000524800 1845 ntTSL 5 BASIC20.57■□□□□ 0.88
IRF4Q15306 FDXR-219ENST00000583917 1762 ntTSL 5 BASIC20.57■□□□□ 0.88
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