Protein–RNA interactions for Protein: Q15270

NKX1-1, NK1 transcription factor-related protein 1, humanhuman

Predicted RBP Predictions only

Length 411 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
NKX1-1Q15270 TMEM53-205ENST00000372244 1472 ntTSL 2 BASIC27.13■■□□□ 1.93
NKX1-1Q15270 NIPAL4-202ENST00000435489 1600 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC27.13■■□□□ 1.93
NKX1-1Q15270 CLN8-213ENST00000637156 1897 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC27.13■■□□□ 1.93
NKX1-1Q15270 GOLGA4-212ENST00000617480 1545 ntTSL 5 BASIC27.13■■□□□ 1.93
NKX1-1Q15270 AGTRAP-203ENST00000376629 1100 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.13■■□□□ 1.93
NKX1-1Q15270 AC091564.5-201ENST00000526456 820 ntTSL 4 BASIC27.13■■□□□ 1.93
NKX1-1Q15270 AC007493.2-201ENST00000568427 478 ntTSL 3 BASIC27.13■■□□□ 1.93
NKX1-1Q15270 CYB5R2-212ENST00000533558 1658 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC27.13■■□□□ 1.93
NKX1-1Q15270 SELENOO-201ENST00000380903 2315 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC27.13■■□□□ 1.93
NKX1-1Q15270 SELENOO-203ENST00000611222 2311 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC27.13■■□□□ 1.93
NKX1-1Q15270 SNX10-207ENST00000446848 2613 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC27.13■■□□□ 1.93
NKX1-1Q15270 HERC2P8-204ENST00000567073 1988 ntTSL 5 BASIC27.13■■□□□ 1.93
NKX1-1Q15270 NXN-202ENST00000537628 1340 ntTSL 3 BASIC27.13■■□□□ 1.93
NKX1-1Q15270 TSPAN3-207ENST00000559494 1326 ntTSL 5 BASIC27.13■■□□□ 1.93
NKX1-1Q15270 DPF1-201ENST00000355526 1632 ntTSL 1 (best) BASIC27.12■■□□□ 1.93
NKX1-1Q15270 SUGCT-202ENST00000401647 1369 ntTSL 1 (best) BASIC27.12■■□□□ 1.93
NKX1-1Q15270 RALGPS1-207ENST00000394022 1672 ntTSL 2 BASIC27.12■■□□□ 1.93
NKX1-1Q15270 RHCE-204ENST00000349320 1810 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC27.12■■□□□ 1.93
NKX1-1Q15270 PTPMT1-202ENST00000326674 768 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.12■■□□□ 1.93
NKX1-1Q15270 RHOC-203ENST00000369632 1026 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC27.12■■□□□ 1.93
NKX1-1Q15270 YWHAZ-209ENST00000419477 891 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC27.12■■□□□ 1.93
NKX1-1Q15270 LTB-210ENST00000429299 897 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.12■■□□□ 1.93
NKX1-1Q15270 AC092849.2-201ENST00000492523 333 ntTSL 3 BASIC27.12■■□□□ 1.93
NKX1-1Q15270 DLEU7-203ENST00000504404 1122 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.12■■□□□ 1.93
NKX1-1Q15270 AC011446.2-202ENST00000592882 756 ntTSL 3 BASIC27.12■■□□□ 1.93
NKX1-1Q15270 PTCD3-220ENST00000627371 210 ntTSL 5 BASIC27.12■■□□□ 1.93
NKX1-1Q15270 RNPEP-202ENST00000367286 2282 ntTSL 5 BASIC27.12■■□□□ 1.93
NKX1-1Q15270 SMPD2-201ENST00000258052 1645 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.12■■□□□ 1.93
NKX1-1Q15270 B4GALNT1-203ENST00000449184 1633 ntTSL 2 BASIC27.12■■□□□ 1.93
NKX1-1Q15270 FBXO6-201ENST00000376753 1520 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.11■■□□□ 1.93
NKX1-1Q15270 RNASET2-214ENST00000620173 1391 ntTSL 5 BASIC27.11■■□□□ 1.93
NKX1-1Q15270 RORA-204ENST00000449337 1701 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.11■■□□□ 1.93
NKX1-1Q15270 PRTN3-201ENST00000234347 1026 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.11■■□□□ 1.93
NKX1-1Q15270 AC068473.1-201ENST00000317008 1111 ntTSL 2 BASIC27.11■■□□□ 1.93
NKX1-1Q15270 C6orf132-202ENST00000356542 894 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC27.11■■□□□ 1.93
NKX1-1Q15270 AC073050.1-201ENST00000442316 462 ntTSL 3 BASIC27.11■■□□□ 1.93
NKX1-1Q15270 CERNA3-201ENST00000521403 557 ntTSL 3 BASIC27.11■■□□□ 1.93
NKX1-1Q15270 TNFRSF1B-204ENST00000536782 557 ntTSL 1 (best) BASIC27.11■■□□□ 1.93
NKX1-1Q15270 AC073896.1-201ENST00000549318 937 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC27.11■■□□□ 1.93
NKX1-1Q15270 AC009052.1-201ENST00000567090 298 ntTSL 3 BASIC27.11■■□□□ 1.93
NKX1-1Q15270 AC233263.1-201ENST00000578059 224 ntBASIC27.11■■□□□ 1.93
NKX1-1Q15270 ZNF668-205ENST00000426488 2282 ntTSL 5 BASIC27.11■■□□□ 1.93
NKX1-1Q15270 PTH1R-201ENST00000313049 2123 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.11■■□□□ 1.93
NKX1-1Q15270 PHB2-201ENST00000399433 1308 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC27.11■■□□□ 1.93
NKX1-1Q15270 DDIT4-201ENST00000307365 1748 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.1■■□□□ 1.93
NKX1-1Q15270 ZNF410-206ENST00000540593 1722 ntTSL 2 BASIC27.1■■□□□ 1.93
NKX1-1Q15270 DUSP28-201ENST00000343217 1555 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC27.1■■□□□ 1.93
NKX1-1Q15270 NELFE-202ENST00000375429 1584 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC27.1■■□□□ 1.93
NKX1-1Q15270 RNF38-205ENST00000377877 1974 ntTSL 2 BASIC27.1■■□□□ 1.93
NKX1-1Q15270 LMF1-212ENST00000568897 1603 ntTSL 5 BASIC27.1■■□□□ 1.93
NKX1-1Q15270 GCHFR-201ENST00000260447 777 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.1■■□□□ 1.93
NKX1-1Q15270 TPSAB1-201ENST00000338844 1175 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC27.1■■□□□ 1.93
NKX1-1Q15270 PRSS3-202ENST00000361005 966 ntTSL 1 (best) BASIC27.1■■□□□ 1.93
NKX1-1Q15270 KRT17P3-201ENST00000420566 1262 ntBASIC27.1■■□□□ 1.93
NKX1-1Q15270 AC226101.2-201ENST00000458252 747 ntTSL 2 BASIC27.1■■□□□ 1.93
NKX1-1Q15270 CKLF-CMTM1-204ENST00000532838 587 ntAPPRIS ALT2 TSL 4 BASIC27.1■■□□□ 1.93
NKX1-1Q15270 TGIF1-219ENST00000551541 990 ntTSL 2 BASIC27.1■■□□□ 1.93
NKX1-1Q15270 AC127496.6-201ENST00000576215 338 ntTSL 3 BASIC27.1■■□□□ 1.93
NKX1-1Q15270 MFSD14C-208ENST00000637864 1802 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC27.1■■□□□ 1.93
NKX1-1Q15270 TMEM44-202ENST00000347147 2245 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.1■■□□□ 1.93
NKX1-1Q15270 TM7SF2-201ENST00000279263 1722 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.1■■□□□ 1.93
NKX1-1Q15270 MOK-226ENST00000522874 1890 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC27.09■■□□□ 1.93
NKX1-1Q15270 PPP1R14A-202ENST00000347262 637 ntTSL 1 (best) BASIC27.09■■□□□ 1.93
NKX1-1Q15270 MFF-205ENST00000354503 1085 ntTSL 2 BASIC27.09■■□□□ 1.93
NKX1-1Q15270 HOXD12-201ENST00000404162 841 ntTSL 1 (best) BASIC27.09■■□□□ 1.93
NKX1-1Q15270 RPL29-209ENST00000495383 713 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC27.09■■□□□ 1.93
NKX1-1Q15270 DIMT1-202ENST00000506390 1208 ntTSL 1 (best) BASIC27.09■■□□□ 1.93
NKX1-1Q15270 OCIAD2-205ENST00000508632 1163 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.09■■□□□ 1.93
NKX1-1Q15270 ANP32AP1-202ENST00000560832 1074 ntTSL 1 (best) BASIC27.09■■□□□ 1.93
NKX1-1Q15270 KLF2-202ENST00000592003 564 ntTSL 3 BASIC27.09■■□□□ 1.93
NKX1-1Q15270 AC010531.6-201ENST00000602282 401 ntTSL 2 BASIC27.09■■□□□ 1.93
NKX1-1Q15270 AL024498.1-202ENST00000606652 480 ntTSL 2 BASIC27.09■■□□□ 1.93
NKX1-1Q15270 CDC123-201ENST00000281141 1542 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.09■■□□□ 1.93
NKX1-1Q15270 FAM99A-202ENST00000538190 1989 ntBASIC27.09■■□□□ 1.93
NKX1-1Q15270 RDX-204ENST00000528498 2511 ntTSL 1 (best) BASIC27.09■■□□□ 1.93
NKX1-1Q15270 CCNG2-204ENST00000502280 1459 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC27.08■■□□□ 1.93
NKX1-1Q15270 CELF2-213ENST00000633077 1733 ntTSL 1 (best) BASIC27.08■■□□□ 1.93
NKX1-1Q15270 POTED-202ENST00000620442 1988 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.08■■□□□ 1.93
NKX1-1Q15270 AC098864.1-205ENST00000315302 2260 ntTSL 2 BASIC27.08■■□□□ 1.93
NKX1-1Q15270 FDXR-219ENST00000583917 1762 ntTSL 5 BASIC27.08■■□□□ 1.93
NKX1-1Q15270 C1QBPP2-201ENST00000528754 825 ntBASIC27.08■■□□□ 1.93
NKX1-1Q15270 METTL23-208ENST00000588822 1049 ntTSL 3 BASIC27.08■■□□□ 1.93
NKX1-1Q15270 ASF1B-201ENST00000263382 2059 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.08■■□□□ 1.93
NKX1-1Q15270 PITX2-209ENST00000557119 1889 ntTSL 2 BASIC27.08■■□□□ 1.93
NKX1-1Q15270 LYPLA1-201ENST00000316963 2585 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.07■■□□□ 1.92
NKX1-1Q15270 EXTL3-213ENST00000523149 1779 ntTSL 5 BASIC27.07■■□□□ 1.92
NKX1-1Q15270 ARL2-201ENST00000246747 979 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.07■■□□□ 1.92
NKX1-1Q15270 N4BP2L1-203ENST00000380133 903 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.07■■□□□ 1.92
NKX1-1Q15270 AC004889.1-203ENST00000464929 819 ntTSL 5 BASIC27.07■■□□□ 1.92
NKX1-1Q15270 OR2A1-AS1-207ENST00000486094 819 ntBASIC27.07■■□□□ 1.92
NKX1-1Q15270 THAP6-213ENST00000514480 1161 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC27.07■■□□□ 1.92
NKX1-1Q15270 AC105020.6-201ENST00000621523 1217 ntBASIC27.07■■□□□ 1.92
NKX1-1Q15270 PLEKHA8-201ENST00000258679 2293 ntTSL 1 (best) BASIC27.07■■□□□ 1.92
NKX1-1Q15270 PLSCR3-201ENST00000324822 1689 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.07■■□□□ 1.92
NKX1-1Q15270 AC013269.1-201ENST00000409259 1653 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.07■■□□□ 1.92
NKX1-1Q15270 TISP43-206ENST00000623376 1653 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.07■■□□□ 1.92
NKX1-1Q15270 AMZ2-202ENST00000359904 2402 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC27.07■■□□□ 1.92
NKX1-1Q15270 STOML1-201ENST00000316900 2169 ntTSL 2 BASIC27.07■■□□□ 1.92
NKX1-1Q15270 R3HCC1-210ENST00000625275 1489 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.06■■□□□ 1.92
NKX1-1Q15270 SYT7-203ENST00000539008 2061 ntTSL 5 BASIC27.06■■□□□ 1.92
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 22 ms