Protein–RNA interactions for Protein: Q15223

NECTIN1, Nectin-1, humanhuman

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Length 517 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
NECTIN1Q15223 HNF4A-205ENST00000443598 1603 ntTSL 1 (best) BASIC24.81■■□□□ 1.56
NECTIN1Q15223 DCPS-201ENST00000263579 1479 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.81■■□□□ 1.56
NECTIN1Q15223 MIF4GD-202ENST00000325102 1306 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.81■■□□□ 1.56
NECTIN1Q15223 RXFP3-201ENST00000330120 1852 ntAPPRIS P1 BASIC24.81■■□□□ 1.56
NECTIN1Q15223 DNAAF3-201ENST00000391720 2169 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC24.8■■□□□ 1.56
NECTIN1Q15223 ABLIM2-205ENST00000428004 2573 ntTSL 1 (best) BASIC24.8■■□□□ 1.56
NECTIN1Q15223 GMPPA-205ENST00000373917 1630 ntTSL 5 BASIC24.8■■□□□ 1.56
NECTIN1Q15223 CERKL-205ENST00000409440 2425 ntTSL 2 BASIC24.8■■□□□ 1.56
NECTIN1Q15223 LINC01816-201ENST00000414141 662 ntTSL 1 (best) BASIC24.8■■□□□ 1.56
NECTIN1Q15223 CENPVL3-201ENST00000417339 864 ntAPPRIS P1 BASIC24.8■■□□□ 1.56
NECTIN1Q15223 GALNS-213ENST00000569433 723 ntTSL 3 BASIC24.8■■□□□ 1.56
NECTIN1Q15223 DET1-201ENST00000268148 2267 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.8■■□□□ 1.56
NECTIN1Q15223 RTP5-201ENST00000343216 2296 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.8■■□□□ 1.56
NECTIN1Q15223 GMPPA-201ENST00000313597 1544 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.8■■□□□ 1.56
NECTIN1Q15223 HOXC9-203ENST00000508190 1505 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC24.8■■□□□ 1.56
NECTIN1Q15223 ZNF497-202ENST00000425453 2261 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.79■■□□□ 1.56
NECTIN1Q15223 ZGPAT-206ENST00000448100 1881 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.79■■□□□ 1.56
NECTIN1Q15223 ZDHHC8P1-201ENST00000255890 2382 ntTSL 2 BASIC24.79■■□□□ 1.56
NECTIN1Q15223 IRF7-204ENST00000397570 1943 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.79■■□□□ 1.56
NECTIN1Q15223 BAG4-202ENST00000432471 1943 ntTSL 1 (best) BASIC24.79■■□□□ 1.56
NECTIN1Q15223 AC034268.1-201ENST00000441047 882 ntBASIC24.79■■□□□ 1.56
NECTIN1Q15223 HTATIP2-208ENST00000532505 595 ntTSL 2 BASIC24.79■■□□□ 1.56
NECTIN1Q15223 PYCARD-AS1-201ENST00000561916 1095 ntTSL 2 BASIC24.79■■□□□ 1.56
NECTIN1Q15223 MIF4GD-211ENST00000580571 952 ntTSL 2 BASIC24.79■■□□□ 1.56
NECTIN1Q15223 FAM222B-208ENST00000581381 556 ntTSL 4 BASIC24.79■■□□□ 1.56
NECTIN1Q15223 PAQR6-215ENST00000623241 1961 ntTSL 1 (best) BASIC24.79■■□□□ 1.56
NECTIN1Q15223 CCDC102A-201ENST00000258214 2463 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.79■■□□□ 1.56
NECTIN1Q15223 ADAMTS2-202ENST00000274609 2044 ntTSL 1 (best) BASIC24.79■■□□□ 1.56
NECTIN1Q15223 RAB1B-201ENST00000311481 2007 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.79■■□□□ 1.56
NECTIN1Q15223 LINC00605-201ENST00000514902 1558 ntTSL 1 (best) BASIC24.79■■□□□ 1.56
NECTIN1Q15223 OLA1-204ENST00000409546 2071 ntTSL 5 BASIC24.79■■□□□ 1.56
NECTIN1Q15223 DLEU2-208ENST00000621282 3068 ntTSL 1 (best) BASIC24.79■■□□□ 1.56
NECTIN1Q15223 SLC1A5-203ENST00000542575 2882 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.79■■□□□ 1.56
NECTIN1Q15223 VEGFA-204ENST00000372064 2909 ntTSL 1 (best) BASIC24.79■■□□□ 1.56
NECTIN1Q15223 ENTPD6-203ENST00000376652 2750 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.78■■□□□ 1.56
NECTIN1Q15223 C7orf49-213ENST00000617987 1727 ntTSL 5 BASIC24.78■■□□□ 1.56
NECTIN1Q15223 GNB2-206ENST00000424361 1478 ntTSL 5 BASIC24.78■■□□□ 1.56
NECTIN1Q15223 ARFRP1-214ENST00000622789 2559 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.78■■□□□ 1.56
NECTIN1Q15223 PKIB-206ENST00000392490 1811 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.78■■□□□ 1.56
NECTIN1Q15223 IVD-206ENST00000487418 1809 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.78■■□□□ 1.56
NECTIN1Q15223 UBE2D3-201ENST00000321805 1087 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC24.78■■□□□ 1.56
NECTIN1Q15223 GUK1-207ENST00000366726 873 ntAPPRIS P3 TSL 3 BASIC24.78■■□□□ 1.56
NECTIN1Q15223 TMEM70-203ENST00000517439 617 ntTSL 2 BASIC24.78■■□□□ 1.56
NECTIN1Q15223 LINC01942-201ENST00000521373 513 ntTSL 4 BASIC24.78■■□□□ 1.56
NECTIN1Q15223 ATOX1-207ENST00000524142 749 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.78■■□□□ 1.56
NECTIN1Q15223 COMT-202ENST00000361682 2437 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.78■■□□□ 1.56
NECTIN1Q15223 AP005233.1-201ENST00000562341 2424 ntTSL 2 BASIC24.78■■□□□ 1.56
NECTIN1Q15223 TRIM3-202ENST00000359518 3042 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.78■■□□□ 1.56
NECTIN1Q15223 PKMYT1-213ENST00000574385 1892 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.78■■□□□ 1.56
NECTIN1Q15223 UGP2-201ENST00000337130 2338 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.78■■□□□ 1.56
NECTIN1Q15223 ZNF821-202ENST00000425432 2000 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.78■■□□□ 1.56
NECTIN1Q15223 SNAP23-202ENST00000349777 2480 ntTSL 2 BASIC24.77■■□□□ 1.56
NECTIN1Q15223 SACM1L-202ENST00000418611 2164 ntTSL 2 BASIC24.77■■□□□ 1.56
NECTIN1Q15223 TMEM121-201ENST00000392519 1532 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.77■■□□□ 1.56
NECTIN1Q15223 PLD6-201ENST00000321560 2560 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.77■■□□□ 1.56
NECTIN1Q15223 KLF1-201ENST00000264834 1592 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.77■■□□□ 1.56
NECTIN1Q15223 LAG3-202ENST00000441671 1576 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.77■■□□□ 1.56
NECTIN1Q15223 MAP7-206ENST00000611373 2317 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.77■■□□□ 1.56
NECTIN1Q15223 GPRIN2-202ENST00000374317 1966 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC24.77■■□□□ 1.56
NECTIN1Q15223 AP006621.1-202ENST00000528982 464 ntTSL 2 BASIC24.77■■□□□ 1.56
NECTIN1Q15223 AL133516.1-201ENST00000633012 540 ntTSL 5 BASIC24.77■■□□□ 1.56
NECTIN1Q15223 ZMYND11-210ENST00000403354 1664 ntTSL 5 BASIC24.77■■□□□ 1.56
NECTIN1Q15223 MGAT4B-201ENST00000292591 2446 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.77■■□□□ 1.56
NECTIN1Q15223 EGFL7-201ENST00000308874 1747 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.77■■□□□ 1.56
NECTIN1Q15223 ACOT2-201ENST00000238651 1774 ntTSL 1 (best) BASIC24.77■■□□□ 1.56
NECTIN1Q15223 RELL2-207ENST00000521367 1780 ntTSL 5 BASIC24.77■■□□□ 1.56
NECTIN1Q15223 SSTR3-202ENST00000617123 1781 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.77■■□□□ 1.56
NECTIN1Q15223 GAS2-202ENST00000454584 2286 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.77■■□□□ 1.56
NECTIN1Q15223 ME3-212ENST00000543262 2311 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.77■■□□□ 1.56
NECTIN1Q15223 CEL-201ENST00000372080 2384 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.76■■□□□ 1.55
NECTIN1Q15223 SLC35A3-208ENST00000638336 2438 ntTSL 1 (best) BASIC24.76■■□□□ 1.55
NECTIN1Q15223 KCNIP2-207ENST00000358038 2489 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC24.76■■□□□ 1.55
NECTIN1Q15223 CDK5R2-201ENST00000302625 2508 ntAPPRIS P1 BASIC24.76■■□□□ 1.55
NECTIN1Q15223 TCP11-202ENST00000311875 2166 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.76■■□□□ 1.55
NECTIN1Q15223 FADS6-203ENST00000612771 2154 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.76■■□□□ 1.55
NECTIN1Q15223 PTRH1-201ENST00000335223 759 ntTSL 1 (best) BASIC24.76■■□□□ 1.55
NECTIN1Q15223 SLC25A45-206ENST00000526432 894 ntTSL 1 (best) BASIC24.76■■□□□ 1.55
NECTIN1Q15223 SEC23A-213ENST00000557280 561 ntTSL 4 BASIC24.76■■□□□ 1.55
NECTIN1Q15223 SLC7A5P1-201ENST00000568957 537 ntBASIC24.76■■□□□ 1.55
NECTIN1Q15223 NTF6G-201ENST00000591094 616 ntBASIC24.76■■□□□ 1.55
NECTIN1Q15223 H2AFB3-201ENST00000615853 591 ntAPPRIS P1 BASIC24.76■■□□□ 1.55
NECTIN1Q15223 TTYH1-202ENST00000376530 1885 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.76■■□□□ 1.55
NECTIN1Q15223 DUSP9-201ENST00000342782 2433 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.76■■□□□ 1.55
NECTIN1Q15223 AL157384.1-201ENST00000445995 2473 ntBASIC24.76■■□□□ 1.55
NECTIN1Q15223 KIRREL2-201ENST00000262625 1969 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.76■■□□□ 1.55
NECTIN1Q15223 ENTPD5-206ENST00000556242 1437 ntTSL 5 BASIC24.76■■□□□ 1.55
NECTIN1Q15223 ADAM9-203ENST00000466936 2053 ntTSL 2 BASIC24.76■■□□□ 1.55
NECTIN1Q15223 KLHDC1-201ENST00000359332 2691 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.76■■□□□ 1.55
NECTIN1Q15223 OTUB1-211ENST00000543004 1647 ntTSL 5 BASIC24.75■■□□□ 1.55
NECTIN1Q15223 AC011484.1-201ENST00000377652 1995 ntBASIC24.75■■□□□ 1.55
NECTIN1Q15223 AP2S1-201ENST00000263270 935 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.75■■□□□ 1.55
NECTIN1Q15223 UCHL1-201ENST00000284440 1172 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.75■■□□□ 1.55
NECTIN1Q15223 FAM207A-201ENST00000291634 927 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.75■■□□□ 1.55
NECTIN1Q15223 KRT19P1-201ENST00000405746 1186 ntBASIC24.75■■□□□ 1.55
NECTIN1Q15223 UMAD1-202ENST00000463725 559 ntTSL 4 BASIC24.75■■□□□ 1.55
NECTIN1Q15223 UCHL1-210ENST00000512788 785 ntTSL 3 BASIC24.75■■□□□ 1.55
NECTIN1Q15223 C19orf84-201ENST00000570516 788 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.75■■□□□ 1.55
NECTIN1Q15223 TFG-210ENST00000620299 1289 ntTSL 5 BASIC24.75■■□□□ 1.55
NECTIN1Q15223 AC120498.10-201ENST00000621827 505 ntBASIC24.75■■□□□ 1.55
NECTIN1Q15223 DISC1-224ENST00000639374 1071 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.75■■□□□ 1.55
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