Protein–RNA interactions for Protein: Q15113

PCOLCE, Procollagen C-endopeptidase enhancer 1, humanhuman

Predictions only

Length 449 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
PCOLCEQ15113 VKORC1L1-202ENST00000434382 1541 ntTSL 2 BASIC19.31■□□□□ 0.68
PCOLCEQ15113 SLC25A39-212ENST00000590194 1542 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC19.31■□□□□ 0.68
PCOLCEQ15113 ARMC10-202ENST00000323716 2635 ntTSL 1 (best) BASIC19.31■□□□□ 0.68
PCOLCEQ15113 AFDN-AS1-201ENST00000359760 2238 ntTSL 1 (best) BASIC19.31■□□□□ 0.68
PCOLCEQ15113 NPDC1-202ENST00000371601 1494 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.31■□□□□ 0.68
PCOLCEQ15113 RAB28-201ENST00000288723 1810 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.31■□□□□ 0.68
PCOLCEQ15113 DESI2-201ENST00000263831 859 ntTSL 1 (best) BASIC19.31■□□□□ 0.68
PCOLCEQ15113 TRPT1-201ENST00000317459 962 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.31■□□□□ 0.68
PCOLCEQ15113 PSIP1-201ENST00000380715 1966 ntTSL 1 (best) BASIC19.31■□□□□ 0.68
PCOLCEQ15113 LMTK3-201ENST00000270238 4972 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.31■□□□□ 0.68
PCOLCEQ15113 BMP2K-204ENST00000502871 3195 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.31■□□□□ 0.68
PCOLCEQ15113 SMUG1-202ENST00000337581 1571 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC19.31■□□□□ 0.68
PCOLCEQ15113 MAP1LC3A-201ENST00000360668 1574 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.31■□□□□ 0.68
PCOLCEQ15113 AUH-202ENST00000375731 1577 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.31■□□□□ 0.68
PCOLCEQ15113 LINC00605-201ENST00000514902 1558 ntTSL 1 (best) BASIC19.31■□□□□ 0.68
PCOLCEQ15113 AC006455.5-202ENST00000615248 2284 ntTSL 1 (best) BASIC19.31■□□□□ 0.68
PCOLCEQ15113 ZIM2-201ENST00000593711 2083 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.31■□□□□ 0.68
PCOLCEQ15113 EHBP1L1-201ENST00000309295 5185 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.31■□□□□ 0.68
PCOLCEQ15113 WDR88-201ENST00000355868 1718 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC19.31■□□□□ 0.68
PCOLCEQ15113 PPP1R3F-203ENST00000466508 1885 ntTSL 2 BASIC19.31■□□□□ 0.68
PCOLCEQ15113 PTX4-203ENST00000447419 1516 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.3■□□□□ 0.68
PCOLCEQ15113 SOAT2-201ENST00000301466 2044 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.3■□□□□ 0.68
PCOLCEQ15113 FAM193A-211ENST00000637812 4885 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.3■□□□□ 0.68
PCOLCEQ15113 GGTLC1-201ENST00000278765 974 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.3■□□□□ 0.68
PCOLCEQ15113 CUEDC2-201ENST00000369937 1191 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.3■□□□□ 0.68
PCOLCEQ15113 LINC01191-201ENST00000412690 844 ntTSL 2 BASIC19.3■□□□□ 0.68
PCOLCEQ15113 CD99P1-203ENST00000431582 602 ntTSL 4 BASIC19.3■□□□□ 0.68
PCOLCEQ15113 LINC01637-201ENST00000444039 684 ntTSL 2 BASIC19.3■□□□□ 0.68
PCOLCEQ15113 ELOVL2-AS1-201ENST00000456190 737 ntTSL 3 BASIC19.3■□□□□ 0.68
PCOLCEQ15113 AL691442.1-201ENST00000505139 1042 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC19.3■□□□□ 0.68
PCOLCEQ15113 ZNF324-202ENST00000535298 1006 ntTSL 5 BASIC19.3■□□□□ 0.68
PCOLCEQ15113 MYB-221ENST00000527615 2381 ntTSL 5 BASIC19.3■□□□□ 0.68
PCOLCEQ15113 TPM1-208ENST00000404484 1568 ntTSL 1 (best) BASIC19.3■□□□□ 0.68
PCOLCEQ15113 MAGI2-217ENST00000629359 6704 ntTSL 5 BASIC19.3■□□□□ 0.68
PCOLCEQ15113 RNF149-201ENST00000295317 2458 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.3■□□□□ 0.68
PCOLCEQ15113 SLC2A7-201ENST00000400906 1539 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.3■□□□□ 0.68
PCOLCEQ15113 KRT18P55-201ENST00000577198 1950 ntTSL 1 (best) BASIC19.3■□□□□ 0.68
PCOLCEQ15113 RFLNA-201ENST00000324038 2148 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC19.3■□□□□ 0.68
PCOLCEQ15113 ITM2C-202ENST00000326427 2078 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.29■□□□□ 0.68
PCOLCEQ15113 SLC25A22-216ENST00000531214 1790 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC19.29■□□□□ 0.68
PCOLCEQ15113 BRWD1-202ENST00000341322 2495 ntTSL 1 (best) BASIC19.29■□□□□ 0.68
PCOLCEQ15113 SH3BP2-204ENST00000452765 2265 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.29■□□□□ 0.68
PCOLCEQ15113 FBXL14-201ENST00000339235 2111 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.29■□□□□ 0.68
PCOLCEQ15113 SAPCD2P1-201ENST00000395413 1184 ntBASIC19.29■□□□□ 0.68
PCOLCEQ15113 RAMP1-202ENST00000403885 650 ntTSL 3 BASIC19.29■□□□□ 0.68
PCOLCEQ15113 C4orf48-202ENST00000409860 477 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.29■□□□□ 0.68
PCOLCEQ15113 STAG3L3-201ENST00000423834 1262 ntTSL 2 BASIC19.29■□□□□ 0.68
PCOLCEQ15113 AC007322.3-201ENST00000426526 701 ntBASIC19.29■□□□□ 0.68
PCOLCEQ15113 DNAJA4-210ENST00000489435 947 ntTSL 3 BASIC19.29■□□□□ 0.68
PCOLCEQ15113 AC016588.1-201ENST00000591533 542 ntTSL 4 BASIC19.29■□□□□ 0.68
PCOLCEQ15113 OGFR-204ENST00000621591 1194 ntTSL 5 BASIC19.29■□□□□ 0.68
PCOLCEQ15113 NUF2-208ENST00000524800 1845 ntTSL 5 BASIC19.29■□□□□ 0.68
PCOLCEQ15113 CENPN-201ENST00000299572 1398 ntTSL 1 (best) BASIC19.29■□□□□ 0.68
PCOLCEQ15113 ZBTB46-202ENST00000302995 2335 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC19.29■□□□□ 0.68
PCOLCEQ15113 TUB-203ENST00000534099 1759 ntTSL 2 BASIC19.29■□□□□ 0.68
PCOLCEQ15113 ALG1L9P-201ENST00000508969 2165 ntTSL 1 (best) BASIC19.29■□□□□ 0.68
PCOLCEQ15113 MYBL1-204ENST00000522677 5192 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.28■□□□□ 0.68
PCOLCEQ15113 TADA2B-204ENST00000512388 1343 ntTSL 5 BASIC19.28■□□□□ 0.68
PCOLCEQ15113 CAPN12-212ENST00000601953 2381 ntTSL 5 BASIC19.28■□□□□ 0.68
PCOLCEQ15113 CEBPE-201ENST00000206513 1554 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.28■□□□□ 0.68
PCOLCEQ15113 PRICKLE3-206ENST00000599218 2062 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.28■□□□□ 0.68
PCOLCEQ15113 TMEM9B-201ENST00000309134 1659 ntTSL 1 (best) BASIC19.28■□□□□ 0.68
PCOLCEQ15113 NAA20-202ENST00000334982 1260 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.28■□□□□ 0.68
PCOLCEQ15113 ABHD17AP1-201ENST00000358206 933 ntBASIC19.28■□□□□ 0.68
PCOLCEQ15113 FTCDNL1-202ENST00000420128 1021 ntTSL 5 BASIC19.28■□□□□ 0.68
PCOLCEQ15113 EIF4E3-203ENST00000421769 777 ntTSL 1 (best) BASIC19.28■□□□□ 0.68
PCOLCEQ15113 AL391244.2-201ENST00000428932 543 ntTSL 2 BASIC19.28■□□□□ 0.68
PCOLCEQ15113 VMO1-204ENST00000441199 741 ntTSL 2 BASIC19.28■□□□□ 0.68
PCOLCEQ15113 AP000282.1-201ENST00000454622 682 ntTSL 2 BASIC19.28■□□□□ 0.68
PCOLCEQ15113 FADS3-204ENST00000525588 1254 ntTSL 5 BASIC19.28■□□□□ 0.68
PCOLCEQ15113 JOSD2-205ENST00000601423 802 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.28■□□□□ 0.68
PCOLCEQ15113 AC100791.3-201ENST00000617619 330 ntBASIC19.28■□□□□ 0.68
PCOLCEQ15113 AC068987.5-201ENST00000642069 987 ntAPPRIS P1 BASIC19.28■□□□□ 0.68
PCOLCEQ15113 FDXR-219ENST00000583917 1762 ntTSL 5 BASIC19.28■□□□□ 0.68
PCOLCEQ15113 SNX7-201ENST00000306121 1734 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.28■□□□□ 0.68
PCOLCEQ15113 C7orf49-213ENST00000617987 1727 ntTSL 5 BASIC19.28■□□□□ 0.68
PCOLCEQ15113 LAYN-201ENST00000375614 2066 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.28■□□□□ 0.68
PCOLCEQ15113 EP400NL-214ENST00000641289 2402 ntBASIC19.27■□□□□ 0.68
PCOLCEQ15113 PPP2R5E-204ENST00000555899 2164 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC19.27■□□□□ 0.68
PCOLCEQ15113 CCS-208ENST00000533244 1430 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.27■□□□□ 0.68
PCOLCEQ15113 ATP5G2-201ENST00000338662 1792 ntTSL 2 BASIC19.27■□□□□ 0.68
PCOLCEQ15113 SSTR3-202ENST00000617123 1781 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.27■□□□□ 0.68
PCOLCEQ15113 AC007128.1-201ENST00000424460 1853 ntTSL 5 BASIC19.27■□□□□ 0.68
PCOLCEQ15113 C16orf74-201ENST00000284245 906 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.27■□□□□ 0.68
PCOLCEQ15113 ZNF295-AS1-201ENST00000412906 952 ntTSL 1 (best) BASIC19.27■□□□□ 0.68
PCOLCEQ15113 AL355472.2-201ENST00000422958 438 ntBASIC19.27■□□□□ 0.68
PCOLCEQ15113 DCTPP1-205ENST00000568973 878 ntTSL 2 BASIC19.27■□□□□ 0.68
PCOLCEQ15113 ANAPC11-212ENST00000577425 603 ntTSL 3 BASIC19.27■□□□□ 0.68
PCOLCEQ15113 MYC-209ENST00000641252 345 ntBASIC19.27■□□□□ 0.68
PCOLCEQ15113 PPP3CC-203ENST00000397775 2094 ntTSL 2 BASIC19.27■□□□□ 0.68
PCOLCEQ15113 ARL6IP4-220ENST00000543566 1591 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.27■□□□□ 0.67
PCOLCEQ15113 FOXN3-209ENST00000555353 1595 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.27■□□□□ 0.67
PCOLCEQ15113 NOTUM-201ENST00000409678 2329 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.26■□□□□ 0.67
PCOLCEQ15113 GAS1-201ENST00000298743 2827 ntAPPRIS P1 BASIC19.26■□□□□ 0.67
PCOLCEQ15113 MDFI-203ENST00000373051 1622 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.26■□□□□ 0.67
PCOLCEQ15113 RARA-202ENST00000394081 2285 ntTSL 1 (best) BASIC19.26■□□□□ 0.67
PCOLCEQ15113 MESP1-201ENST00000300057 2369 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.26■□□□□ 0.67
PCOLCEQ15113 BAG4-202ENST00000432471 1943 ntTSL 1 (best) BASIC19.26■□□□□ 0.67
PCOLCEQ15113 PXK-211ENST00000484288 2031 ntTSL 1 (best) BASIC19.26■□□□□ 0.67
PCOLCEQ15113 LINC00471-201ENST00000313064 1282 ntTSL 1 (best) BASIC19.26■□□□□ 0.67
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