Protein–RNA interactions for Protein: Q15032

R3HDM1, R3H domain-containing protein 1, humanhuman

Known RBP Predictions only

Length 1,099 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
R3HDM1Q15032 PRTN3-201ENST00000234347 1026 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.68■■□□□ 1.86
R3HDM1Q15032 KHDC1-201ENST00000257765 1134 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC26.68■■□□□ 1.86
R3HDM1Q15032 CDV3P1-201ENST00000471403 739 ntBASIC26.68■■□□□ 1.86
R3HDM1Q15032 CES1P1-204ENST00000574030 877 ntTSL 1 (best) BASIC26.68■■□□□ 1.86
R3HDM1Q15032 KHDC1-207ENST00000610435 1101 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC26.68■■□□□ 1.86
R3HDM1Q15032 AC013269.1-201ENST00000409259 1653 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.68■■□□□ 1.86
R3HDM1Q15032 TISP43-206ENST00000623376 1653 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.68■■□□□ 1.86
R3HDM1Q15032 WDR88-201ENST00000355868 1718 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC26.68■■□□□ 1.86
R3HDM1Q15032 GORASP1-220ENST00000479927 1345 ntTSL 2 BASIC26.67■■□□□ 1.86
R3HDM1Q15032 TBX1-202ENST00000332710 2084 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC26.67■■□□□ 1.86
R3HDM1Q15032 NPDC1-201ENST00000371600 2187 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.67■■□□□ 1.86
R3HDM1Q15032 EPS8L1-209ENST00000588359 1407 ntTSL 5 BASIC26.67■■□□□ 1.86
R3HDM1Q15032 RNF166-202ENST00000537718 1525 ntTSL 2 BASIC26.67■■□□□ 1.86
R3HDM1Q15032 PEX11G-201ENST00000221480 1062 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.67■■□□□ 1.86
R3HDM1Q15032 HRAS-201ENST00000311189 894 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.67■■□□□ 1.86
R3HDM1Q15032 TSTD1-201ENST00000318289 626 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC26.67■■□□□ 1.86
R3HDM1Q15032 AL954642.1-201ENST00000428088 538 ntTSL 3 BASIC26.67■■□□□ 1.86
R3HDM1Q15032 C5orf38-206ENST00000505778 509 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.67■■□□□ 1.86
R3HDM1Q15032 AC019257.1-201ENST00000517676 557 ntTSL 5 BASIC26.67■■□□□ 1.86
R3HDM1Q15032 FOSL1-204ENST00000532401 1132 ntTSL 2 BASIC26.67■■□□□ 1.86
R3HDM1Q15032 RAP1B-228ENST00000542145 1060 ntTSL 2 BASIC26.67■■□□□ 1.86
R3HDM1Q15032 METRN-205ENST00000568415 612 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC26.67■■□□□ 1.86
R3HDM1Q15032 ZNF561-AS1-202ENST00000586614 568 ntTSL 5 BASIC26.67■■□□□ 1.86
R3HDM1Q15032 KRTAP5-11-203ENST00000617152 558 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC26.67■■□□□ 1.86
R3HDM1Q15032 OTUB1-211ENST00000543004 1647 ntTSL 5 BASIC26.67■■□□□ 1.86
R3HDM1Q15032 IGFBP7-AS1-201ENST00000499667 1389 ntTSL 1 (best) BASIC26.67■■□□□ 1.86
R3HDM1Q15032 SYT6-209ENST00000610222 1707 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC26.67■■□□□ 1.86
R3HDM1Q15032 HOXA4-204ENST00000610970 1728 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.67■■□□□ 1.86
R3HDM1Q15032 NEU4-204ENST00000405370 1907 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.67■■□□□ 1.86
R3HDM1Q15032 DUX4-204ENST00000569241 1574 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC26.67■■□□□ 1.86
R3HDM1Q15032 RASSF5-202ENST00000579436 2064 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.66■■□□□ 1.86
R3HDM1Q15032 LMO2-201ENST00000257818 2294 ntTSL 1 (best) BASIC26.66■■□□□ 1.86
R3HDM1Q15032 NDUFB1-201ENST00000329559 528 ntTSL 1 (best) BASIC26.66■■□□□ 1.86
R3HDM1Q15032 C5orf56-203ENST00000378953 942 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC26.66■■□□□ 1.86
R3HDM1Q15032 GGT1-206ENST00000404223 952 ntTSL 2 BASIC26.66■■□□□ 1.86
R3HDM1Q15032 AC009487.1-202ENST00000437683 402 ntTSL 2 BASIC26.66■■□□□ 1.86
R3HDM1Q15032 IMMP2L-207ENST00000452895 833 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC26.66■■□□□ 1.86
R3HDM1Q15032 AC120498.8-201ENST00000614275 531 ntBASIC26.66■■□□□ 1.86
R3HDM1Q15032 AC012366.1-201ENST00000615411 473 ntTSL 5 BASIC26.66■■□□□ 1.86
R3HDM1Q15032 AKR7A2-201ENST00000235835 1362 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.66■■□□□ 1.86
R3HDM1Q15032 NPHS2-201ENST00000367615 1855 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.66■■□□□ 1.86
R3HDM1Q15032 RFLNA-205ENST00000546355 2354 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC26.65■■□□□ 1.86
R3HDM1Q15032 H19-210ENST00000439725 1929 ntTSL 2 BASIC26.65■■□□□ 1.86
R3HDM1Q15032 RPLP0-201ENST00000228306 1257 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.65■■□□□ 1.86
R3HDM1Q15032 GAMT-201ENST00000252288 1121 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.65■■□□□ 1.86
R3HDM1Q15032 PYCR3-202ENST00000377579 985 ntTSL 2 BASIC26.65■■□□□ 1.86
R3HDM1Q15032 NELFE-206ENST00000444811 1202 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC26.65■■□□□ 1.86
R3HDM1Q15032 CUTA-210ENST00000488034 769 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC26.65■■□□□ 1.86
R3HDM1Q15032 AF131216.3-201ENST00000525867 1099 ntTSL 2 BASIC26.65■■□□□ 1.86
R3HDM1Q15032 AC132938.3-201ENST00000579095 357 ntTSL 2 BASIC26.65■■□□□ 1.86
R3HDM1Q15032 AC011247.3-202ENST00000605062 570 ntTSL 4 BASIC26.65■■□□□ 1.86
R3HDM1Q15032 GOLGA7-201ENST00000357743 2027 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.65■■□□□ 1.86
R3HDM1Q15032 GNPTG-201ENST00000204679 1983 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.64■■□□□ 1.86
R3HDM1Q15032 KLC3-204ENST00000585434 1764 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC26.64■■□□□ 1.86
R3HDM1Q15032 C22orf34-203ENST00000405854 1593 ntTSL 5 BASIC26.64■■□□□ 1.86
R3HDM1Q15032 TPPP3-202ENST00000393957 1058 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.64■■□□□ 1.86
R3HDM1Q15032 RAB6B-203ENST00000469959 500 ntTSL 3 BASIC26.64■■□□□ 1.86
R3HDM1Q15032 TPD52L1-207ENST00000527711 999 ntTSL 2 BASIC26.64■■□□□ 1.86
R3HDM1Q15032 FAM181A-204ENST00000557000 1652 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.63■■□□□ 1.85
R3HDM1Q15032 FADD-201ENST00000301838 1841 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.63■■□□□ 1.85
R3HDM1Q15032 TYMSOS-201ENST00000323813 844 ntTSL 1 (best) BASIC26.63■■□□□ 1.85
R3HDM1Q15032 SPATA22-202ENST00000355380 1216 ntTSL 1 (best) BASIC26.63■■□□□ 1.85
R3HDM1Q15032 NDUFA1-201ENST00000371437 766 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.63■■□□□ 1.85
R3HDM1Q15032 VMO1-204ENST00000441199 741 ntTSL 2 BASIC26.63■■□□□ 1.85
R3HDM1Q15032 AC008443.1-203ENST00000505151 886 ntTSL 2 BASIC26.63■■□□□ 1.85
R3HDM1Q15032 DECR2-212ENST00000627716 352 ntTSL 2 BASIC26.63■■□□□ 1.85
R3HDM1Q15032 AL358472.4-201ENST00000633140 710 ntBASIC26.63■■□□□ 1.85
R3HDM1Q15032 NOXO1-201ENST00000354249 1618 ntTSL 1 (best) BASIC26.63■■□□□ 1.85
R3HDM1Q15032 ZNF837-201ENST00000427624 2038 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.63■■□□□ 1.85
R3HDM1Q15032 ZNF205-201ENST00000219091 1947 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC26.63■■□□□ 1.85
R3HDM1Q15032 C4orf19-202ENST00000381980 1943 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.63■■□□□ 1.85
R3HDM1Q15032 ECEL1-202ENST00000409941 2322 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC26.62■■□□□ 1.85
R3HDM1Q15032 AC079598.2-202ENST00000546624 1451 ntBASIC26.62■■□□□ 1.85
R3HDM1Q15032 PTPRCAP-201ENST00000326294 1292 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.62■■□□□ 1.85
R3HDM1Q15032 ING1-202ENST00000338450 1189 ntTSL 1 (best) BASIC26.62■■□□□ 1.85
R3HDM1Q15032 DHRS4L2-202ENST00000397071 1117 ntTSL 2 BASIC26.62■■□□□ 1.85
R3HDM1Q15032 RBM17P1-201ENST00000453646 1190 ntBASIC26.62■■□□□ 1.85
R3HDM1Q15032 SURF4-206ENST00000485435 1206 ntTSL 1 (best) BASIC26.62■■□□□ 1.85
R3HDM1Q15032 DYNLL1-205ENST00000548342 662 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC26.62■■□□□ 1.85
R3HDM1Q15032 AKTIP-212ENST00000570004 1162 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC26.62■■□□□ 1.85
R3HDM1Q15032 CHST6-202ENST00000390664 2093 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.62■■□□□ 1.85
R3HDM1Q15032 CAMKMT-201ENST00000378494 1495 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.62■■□□□ 1.85
R3HDM1Q15032 OXER1-201ENST00000378661 1781 ntAPPRIS P1 BASIC26.61■■□□□ 1.85
R3HDM1Q15032 PDE9A-212ENST00000398234 1783 ntTSL 1 (best) BASIC26.61■■□□□ 1.85
R3HDM1Q15032 NPY4R-201ENST00000374312 1956 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.61■■□□□ 1.85
R3HDM1Q15032 NPY4R2-201ENST00000576178 1956 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.61■■□□□ 1.85
R3HDM1Q15032 TSPY8-202ENST00000383000 1125 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.61■■□□□ 1.85
R3HDM1Q15032 TSPY2-202ENST00000383042 1125 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.61■■□□□ 1.85
R3HDM1Q15032 CACYBP-202ENST00000405362 1059 ntTSL 5 BASIC26.61■■□□□ 1.85
R3HDM1Q15032 TSPY1-201ENST00000423647 1171 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.61■■□□□ 1.85
R3HDM1Q15032 TSPY3-201ENST00000424594 1125 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.61■■□□□ 1.85
R3HDM1Q15032 TSPY10-202ENST00000444056 1125 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.61■■□□□ 1.85
R3HDM1Q15032 RARRES2-205ENST00000482669 563 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.61■■□□□ 1.85
R3HDM1Q15032 AP001972.3-201ENST00000530792 495 ntTSL 3 BASIC26.61■■□□□ 1.85
R3HDM1Q15032 ARF3-208ENST00000541959 807 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC26.61■■□□□ 1.85
R3HDM1Q15032 C12orf76-204ENST00000547573 607 ntTSL 3 BASIC26.61■■□□□ 1.85
R3HDM1Q15032 AP000525.1-201ENST00000608286 694 ntBASIC26.61■■□□□ 1.85
R3HDM1Q15032 CAV3-201ENST00000343849 1431 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.61■■□□□ 1.85
R3HDM1Q15032 AC087633.2-202ENST00000565166 1439 ntBASIC26.61■■□□□ 1.85
R3HDM1Q15032 SLC22A31-206ENST00000614943 1860 ntTSL 5 BASIC26.61■■□□□ 1.85
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