Protein–RNA interactions for Protein: Q15003

NCAPH, Condensin complex subunit 2, humanhuman

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Length 741 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
NCAPHQ15003 SCUBE1-201ENST00000290460 2258 ntTSL 1 (best) BASIC23.05■■□□□ 1.28
NCAPHQ15003 INSM1-201ENST00000310227 2829 ntAPPRIS P1 BASIC23.04■■□□□ 1.28
NCAPHQ15003 KIRREL2-202ENST00000347900 2015 ntTSL 1 (best) BASIC23.04■■□□□ 1.28
NCAPHQ15003 ANKRD16-203ENST00000380094 2738 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.04■■□□□ 1.28
NCAPHQ15003 KCNQ5-208ENST00000414165 6236 ntTSL 5 BASIC23.04■■□□□ 1.28
NCAPHQ15003 AC005224.4-201ENST00000583262 1652 ntBASIC23.04■■□□□ 1.28
NCAPHQ15003 DCTPP1-201ENST00000319285 1222 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.04■■□□□ 1.28
NCAPHQ15003 LYPD2-201ENST00000359228 594 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.04■■□□□ 1.28
NCAPHQ15003 MRPL41-201ENST00000371443 1262 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.04■■□□□ 1.28
NCAPHQ15003 MAST4-206ENST00000406374 1066 ntTSL 1 (best) BASIC23.04■■□□□ 1.28
NCAPHQ15003 KDELR3-202ENST00000409006 931 ntTSL 1 (best) BASIC23.04■■□□□ 1.28
NCAPHQ15003 RALB-203ENST00000420510 1252 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.04■■□□□ 1.28
NCAPHQ15003 MGAT5B-207ENST00000565675 872 ntTSL 1 (best) BASIC23.04■■□□□ 1.28
NCAPHQ15003 RAB24-201ENST00000303251 1311 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.04■■□□□ 1.28
NCAPHQ15003 PYCR1-203ENST00000402252 1346 ntTSL 2 BASIC23.04■■□□□ 1.28
NCAPHQ15003 ZDHHC7-203ENST00000564466 1488 ntTSL 5 BASIC23.04■■□□□ 1.28
NCAPHQ15003 AC007952.6-201ENST00000573168 2673 ntBASIC23.04■■□□□ 1.28
NCAPHQ15003 AC003957.1-201ENST00000625108 2673 ntBASIC23.04■■□□□ 1.28
NCAPHQ15003 MAMSTR-203ENST00000594582 1693 ntTSL 1 (best) BASIC23.03■■□□□ 1.28
NCAPHQ15003 RASGRP2-211ENST00000394432 2304 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.03■■□□□ 1.28
NCAPHQ15003 PACSIN3-211ENST00000539589 2009 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.03■■□□□ 1.28
NCAPHQ15003 TSPAN17-202ENST00000310032 2550 ntTSL 5 BASIC23.03■■□□□ 1.28
NCAPHQ15003 DTX2-212ENST00000446820 1770 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.03■■□□□ 1.28
NCAPHQ15003 PACRGL-227ENST00000513459 1773 ntTSL 5 BASIC23.03■■□□□ 1.28
NCAPHQ15003 AC112907.3-201ENST00000577781 2400 ntBASIC23.03■■□□□ 1.28
NCAPHQ15003 TYMP-202ENST00000395678 1614 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.03■■□□□ 1.28
NCAPHQ15003 ADD1-202ENST00000355842 4743 ntTSL 1 (best) BASIC23.03■■□□□ 1.28
NCAPHQ15003 ACBD4-201ENST00000321854 1806 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.03■■□□□ 1.28
NCAPHQ15003 NARS2-201ENST00000281038 2519 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.03■■□□□ 1.28
NCAPHQ15003 USP39-204ENST00000409766 2033 ntTSL 2 BASIC23.03■■□□□ 1.28
NCAPHQ15003 ZNF771-201ENST00000319296 2371 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.03■■□□□ 1.28
NCAPHQ15003 TMEM11-201ENST00000317635 2095 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.02■■□□□ 1.28
NCAPHQ15003 HPS6-201ENST00000299238 2649 ntAPPRIS P1 BASIC23.02■■□□□ 1.28
NCAPHQ15003 STARD10-201ENST00000334805 1963 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.02■■□□□ 1.28
NCAPHQ15003 DMWD-202ENST00000377735 3292 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.02■■□□□ 1.28
NCAPHQ15003 CLTB-201ENST00000310418 1215 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC23.02■■□□□ 1.28
NCAPHQ15003 NAA38-201ENST00000333775 999 ntTSL 1 (best) BASIC23.02■■□□□ 1.28
NCAPHQ15003 CLTB-202ENST00000345807 1161 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC23.02■■□□□ 1.28
NCAPHQ15003 RPRD1A-207ENST00000588737 1264 ntTSL 2 BASIC23.02■■□□□ 1.28
NCAPHQ15003 Z98883.1-202ENST00000635107 1289 ntTSL 5 BASIC23.02■■□□□ 1.28
NCAPHQ15003 ANAPC13-204ENST00000510994 1840 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.02■■□□□ 1.28
NCAPHQ15003 PCID2-203ENST00000375457 2372 ntTSL 1 (best) BASIC23.02■■□□□ 1.28
NCAPHQ15003 HLA-G-204ENST00000376828 1490 ntAPPRIS ALT2 BASIC23.02■■□□□ 1.28
NCAPHQ15003 KLHDC4-204ENST00000353170 1663 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.02■■□□□ 1.28
NCAPHQ15003 EXOC3-AS1-202ENST00000623673 1663 ntBASIC23.02■■□□□ 1.28
NCAPHQ15003 PYCR3-207ENST00000495276 2332 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.02■■□□□ 1.28
NCAPHQ15003 MAGI2-201ENST00000354212 6880 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.01■■□□□ 1.27
NCAPHQ15003 LLGL2-202ENST00000375227 1374 ntTSL 1 (best) BASIC23.01■■□□□ 1.27
NCAPHQ15003 CSNK1G3-206ENST00000511130 1356 ntTSL 2 BASIC23.01■■□□□ 1.27
NCAPHQ15003 SDR39U1-208ENST00000554698 1364 ntTSL 1 (best) BASIC23.01■■□□□ 1.27
NCAPHQ15003 NRN1-203ENST00000616243 1556 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC23.01■■□□□ 1.27
NCAPHQ15003 IL17RE-206ENST00000454190 2757 ntTSL 2 BASIC23.01■■□□□ 1.27
NCAPHQ15003 DISC1-215ENST00000602281 2761 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.01■■□□□ 1.27
NCAPHQ15003 PRKCD-202ENST00000394729 2810 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.01■■□□□ 1.27
NCAPHQ15003 ATOH8-201ENST00000306279 2438 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.01■■□□□ 1.27
NCAPHQ15003 MRFAP1-201ENST00000320912 2049 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.01■■□□□ 1.27
NCAPHQ15003 NGEF-202ENST00000373552 2286 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.01■■□□□ 1.27
NCAPHQ15003 PRMT2-210ENST00000458387 1874 ntTSL 1 (best) BASIC23.01■■□□□ 1.27
NCAPHQ15003 UNC93B3-201ENST00000308076 687 ntBASIC23.01■■□□□ 1.27
NCAPHQ15003 CRLF3-201ENST00000324238 2957 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.01■■□□□ 1.27
NCAPHQ15003 ITGA9-AS1-210ENST00000457661 738 ntTSL 4 BASIC23.01■■□□□ 1.27
NCAPHQ15003 RNF146-206ENST00000480444 843 ntTSL 2 BASIC23.01■■□□□ 1.27
NCAPHQ15003 ZNF419-210ENST00000520540 568 ntTSL 4 BASIC23.01■■□□□ 1.27
NCAPHQ15003 HRH3-203ENST00000611492 900 ntTSL 1 (best) BASIC23.01■■□□□ 1.27
NCAPHQ15003 CORO1B-202ENST00000393893 1931 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.01■■□□□ 1.27
NCAPHQ15003 SYTL1-211ENST00000618673 1712 ntTSL 5 BASIC23.01■■□□□ 1.27
NCAPHQ15003 SCARB2-219ENST00000639738 1517 ntTSL 5 BASIC23.01■■□□□ 1.27
NCAPHQ15003 MAPK15-201ENST00000338033 1961 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.01■■□□□ 1.27
NCAPHQ15003 GSR-204ENST00000537535 1323 ntTSL 1 (best) BASIC23.01■■□□□ 1.27
NCAPHQ15003 SSH3-202ENST00000308298 2046 ntTSL 2 BASIC23.01■■□□□ 1.27
NCAPHQ15003 C7orf43-206ENST00000456769 2046 ntTSL 2 BASIC23.01■■□□□ 1.27
NCAPHQ15003 BCAT2-207ENST00000597011 1579 ntTSL 5 BASIC23.01■■□□□ 1.27
NCAPHQ15003 FP700111.2-201ENST00000619190 1892 ntBASIC23■■□□□ 1.27
NCAPHQ15003 INPPL1-201ENST00000298229 4733 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23■■□□□ 1.27
NCAPHQ15003 CLN3-207ENST00000395653 1430 ntTSL 5 BASIC23■■□□□ 1.27
NCAPHQ15003 BRSK2-208ENST00000528841 3586 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23■■□□□ 1.27
NCAPHQ15003 HMOX2-218ENST00000619913 1908 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23■■□□□ 1.27
NCAPHQ15003 TMEM121-202ENST00000431372 1519 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23■■□□□ 1.27
NCAPHQ15003 U2AF1-202ENST00000380276 940 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23■■□□□ 1.27
NCAPHQ15003 OTUB1-212ENST00000543988 1259 ntTSL 1 (best) BASIC23■■□□□ 1.27
NCAPHQ15003 AC024257.2-201ENST00000549699 147 ntBASIC23■■□□□ 1.27
NCAPHQ15003 AC131212.1-201ENST00000613771 668 ntBASIC23■■□□□ 1.27
NCAPHQ15003 AUTS2-203ENST00000406775 5950 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23■■□□□ 1.27
NCAPHQ15003 PTOV1-212ENST00000599732 1577 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23■■□□□ 1.27
NCAPHQ15003 SMG1P5-201ENST00000411546 2362 ntTSL 1 (best) BASIC23■■□□□ 1.27
NCAPHQ15003 MZF1-203ENST00000594234 2385 ntTSL 1 (best) BASIC23■■□□□ 1.27
NCAPHQ15003 LINC00682-201ENST00000498940 1625 ntTSL 3 BASIC23■■□□□ 1.27
NCAPHQ15003 FAM53A-202ENST00000461064 2159 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23■■□□□ 1.27
NCAPHQ15003 SH3GL1-206ENST00000598564 2194 ntTSL 2 BASIC23■■□□□ 1.27
NCAPHQ15003 NSUN5-204ENST00000438747 1663 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC23■■□□□ 1.27
NCAPHQ15003 TTC12-202ENST00000393020 2541 ntTSL 5 BASIC23■■□□□ 1.27
NCAPHQ15003 SLC39A5-209ENST00000454355 1968 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23■■□□□ 1.27
NCAPHQ15003 TRAF4-205ENST00000444415 1456 ntTSL 5 BASIC22.99■■□□□ 1.27
NCAPHQ15003 GRB14-201ENST00000263915 2382 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.99■■□□□ 1.27
NCAPHQ15003 PTGER3-212ENST00000628037 1815 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.99■■□□□ 1.27
NCAPHQ15003 NFYC-204ENST00000372653 1862 ntTSL 2 BASIC22.99■■□□□ 1.27
NCAPHQ15003 YIF1A-201ENST00000359461 943 ntTSL 2 BASIC22.99■■□□□ 1.27
NCAPHQ15003 YIF1A-203ENST00000376901 1124 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.99■■□□□ 1.27
NCAPHQ15003 SRM-201ENST00000376957 1266 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.99■■□□□ 1.27
NCAPHQ15003 CREB3L2-203ENST00000452463 1105 ntTSL 1 (best) BASIC22.99■■□□□ 1.27
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