Protein–RNA interactions for Protein: Q14699

RFTN1, Raftlin, humanhuman

Predicted RBP Predictions only

Length 578 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
RFTN1Q14699 RASGRP2-209ENST00000394429 453 ntTSL 3 BASIC21.25■□□□□ 0.99
RFTN1Q14699 IZUMO4-203ENST00000395307 944 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.25■□□□□ 0.99
RFTN1Q14699 AC037459.4-201ENST00000517384 585 ntTSL 4 BASIC21.25■□□□□ 0.99
RFTN1Q14699 SEC11A-208ENST00000559729 1256 ntTSL 2 BASIC21.25■□□□□ 0.99
RFTN1Q14699 DUX4-204ENST00000569241 1574 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.25■□□□□ 0.99
RFTN1Q14699 AL137784.2-201ENST00000607332 1000 ntBASIC21.25■□□□□ 0.99
RFTN1Q14699 BID-214ENST00000617586 542 ntTSL 5 BASIC21.25■□□□□ 0.99
RFTN1Q14699 AC092437.1-201ENST00000624794 1048 ntBASIC21.25■□□□□ 0.99
RFTN1Q14699 AC026310.3-201ENST00000625186 2373 ntBASIC21.25■□□□□ 0.99
RFTN1Q14699 MMP23B-201ENST00000356026 1326 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.25■□□□□ 0.99
RFTN1Q14699 MED17-221ENST00000639724 2317 ntTSL 5 BASIC21.24■□□□□ 0.99
RFTN1Q14699 GNS-207ENST00000542058 2020 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC21.24■□□□□ 0.99
RFTN1Q14699 AC245052.3-201ENST00000450182 901 ntBASIC21.24■□□□□ 0.99
RFTN1Q14699 IKBKGP1-201ENST00000612193 1073 ntBASIC21.24■□□□□ 0.99
RFTN1Q14699 TRIM2-212ENST00000632856 656 ntTSL 3 BASIC21.24■□□□□ 0.99
RFTN1Q14699 PDXDC1-205ENST00000535621 2048 ntTSL 1 (best) BASIC21.24■□□□□ 0.99
RFTN1Q14699 TMEM125-201ENST00000432792 1850 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.24■□□□□ 0.99
RFTN1Q14699 FBXO27-202ENST00000509137 2130 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.23■□□□□ 0.99
RFTN1Q14699 CCDC189-206ENST00000543610 1967 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.23■□□□□ 0.99
RFTN1Q14699 WAS-201ENST00000376701 1849 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.23■□□□□ 0.99
RFTN1Q14699 BRI3-207ENST00000539286 699 ntTSL 2 BASIC21.23■□□□□ 0.99
RFTN1Q14699 SEC23A-213ENST00000557280 561 ntTSL 4 BASIC21.23■□□□□ 0.99
RFTN1Q14699 RNASEH2B-206ENST00000611510 1257 ntTSL 5 BASIC21.23■□□□□ 0.99
RFTN1Q14699 AC092666.2-201ENST00000613287 246 ntBASIC21.23■□□□□ 0.99
RFTN1Q14699 FBXL19-205ENST00000562319 2462 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC21.23■□□□□ 0.99
RFTN1Q14699 DPYS-201ENST00000351513 2127 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.23■□□□□ 0.99
RFTN1Q14699 FBXO25-202ENST00000350302 2229 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC21.23■□□□□ 0.99
RFTN1Q14699 LONP1-203ENST00000585374 2882 ntTSL 5 BASIC21.22■□□□□ 0.99
RFTN1Q14699 GPC1-202ENST00000420138 1835 ntTSL 5 BASIC21.22■□□□□ 0.99
RFTN1Q14699 PTPRJ-201ENST00000418331 5122 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.22■□□□□ 0.99
RFTN1Q14699 BRSK2-212ENST00000531197 3163 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.22■□□□□ 0.99
RFTN1Q14699 SYNGR2-201ENST00000225777 2325 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.22■□□□□ 0.99
RFTN1Q14699 NKX6-1-202ENST00000515820 2194 ntTSL 3 BASIC21.22■□□□□ 0.99
RFTN1Q14699 PARD3-202ENST00000346874 5894 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.22■□□□□ 0.99
RFTN1Q14699 PARD3-203ENST00000350537 5867 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.22■□□□□ 0.99
RFTN1Q14699 CPEB1-218ENST00000620182 2422 ntTSL 2 BASIC21.22■□□□□ 0.99
RFTN1Q14699 CEACAM4-201ENST00000221954 1205 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.22■□□□□ 0.99
RFTN1Q14699 NEDD8-201ENST00000250495 708 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.22■□□□□ 0.99
RFTN1Q14699 UTF1-201ENST00000304477 1157 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.22■□□□□ 0.99
RFTN1Q14699 RHOD-201ENST00000308831 1129 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.22■□□□□ 0.99
RFTN1Q14699 SOCS1-201ENST00000332029 1225 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.22■□□□□ 0.99
RFTN1Q14699 LINC02199-202ENST00000510067 1008 ntTSL 2 BASIC21.22■□□□□ 0.99
RFTN1Q14699 MFSD11-216ENST00000590393 1141 ntBASIC21.22■□□□□ 0.99
RFTN1Q14699 CEACAM4-203ENST00000600925 899 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC21.22■□□□□ 0.99
RFTN1Q14699 AC011767.1-201ENST00000617410 1153 ntBASIC21.22■□□□□ 0.99
RFTN1Q14699 AC010536.3-201ENST00000620306 533 ntBASIC21.22■□□□□ 0.99
RFTN1Q14699 CCDC130-201ENST00000221554 1792 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.22■□□□□ 0.99
RFTN1Q14699 AKT2-206ENST00000392038 5300 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.22■□□□□ 0.99
RFTN1Q14699 OTOP1-201ENST00000296358 1864 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.22■□□□□ 0.99
RFTN1Q14699 PPP3CC-201ENST00000240139 2189 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.21■□□□□ 0.99
RFTN1Q14699 TMEM204-201ENST00000253934 1686 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.21■□□□□ 0.99
RFTN1Q14699 PPCS-203ENST00000372561 1431 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.21■□□□□ 0.99
RFTN1Q14699 THEM6-201ENST00000336138 2259 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.21■□□□□ 0.99
RFTN1Q14699 LGR4-201ENST00000379214 5206 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.21■□□□□ 0.99
RFTN1Q14699 SPR-201ENST00000234454 1480 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.21■□□□□ 0.99
RFTN1Q14699 CCDC74A-201ENST00000295171 1543 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.21■□□□□ 0.99
RFTN1Q14699 CCDC74B-201ENST00000310463 1549 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC21.21■□□□□ 0.99
RFTN1Q14699 GFI1-203ENST00000427103 2693 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.21■□□□□ 0.99
RFTN1Q14699 TRIM28-201ENST00000253024 2960 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.21■□□□□ 0.99
RFTN1Q14699 GGTLC1-202ENST00000286890 1028 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.21■□□□□ 0.99
RFTN1Q14699 TNFRSF18-201ENST00000328596 851 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC21.21■□□□□ 0.99
RFTN1Q14699 METTL26-203ENST00000397664 604 ntTSL 2 BASIC21.21■□□□□ 0.99
RFTN1Q14699 CPEB1-AS1-201ENST00000560650 2138 ntTSL 1 (best) BASIC21.21■□□□□ 0.99
RFTN1Q14699 C5AR2-202ENST00000600626 1287 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.21■□□□□ 0.99
RFTN1Q14699 SLC35A2-211ENST00000634461 533 ntTSL 4 BASIC21.21■□□□□ 0.99
RFTN1Q14699 GNB3-201ENST00000229264 1923 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC21.21■□□□□ 0.99
RFTN1Q14699 RBKS-201ENST00000302188 1973 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.21■□□□□ 0.99
RFTN1Q14699 TCP11-203ENST00000373974 1689 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC21.21■□□□□ 0.99
RFTN1Q14699 ZBTB42-202ENST00000555360 1411 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.21■□□□□ 0.99
RFTN1Q14699 LOXL1-AS1-210ENST00000567257 2358 ntTSL 2 BASIC21.21■□□□□ 0.99
RFTN1Q14699 RBM17P2-201ENST00000616397 1405 ntBASIC21.21■□□□□ 0.99
RFTN1Q14699 BASP1-201ENST00000322611 1878 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.2■□□□□ 0.98
RFTN1Q14699 CA7-201ENST00000338437 1555 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.2■□□□□ 0.98
RFTN1Q14699 PLAGL1-207ENST00000417959 1645 ntTSL 1 (best) BASIC21.2■□□□□ 0.98
RFTN1Q14699 ATPIF1-203ENST00000468425 539 ntTSL 2 BASIC21.2■□□□□ 0.98
RFTN1Q14699 ZNF717-203ENST00000477374 1169 ntTSL 2 BASIC21.2■□□□□ 0.98
RFTN1Q14699 TERF1P5-201ENST00000477545 1207 ntBASIC21.2■□□□□ 0.98
RFTN1Q14699 ZFPL1-203ENST00000525509 478 ntTSL 2 BASIC21.2■□□□□ 0.98
RFTN1Q14699 ASRGL1-210ENST00000534571 639 ntTSL 2 BASIC21.2■□□□□ 0.98
RFTN1Q14699 AP001363.2-201ENST00000538101 391 ntTSL 3 BASIC21.2■□□□□ 0.98
RFTN1Q14699 AC005697.1-201ENST00000582441 582 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC21.2■□□□□ 0.98
RFTN1Q14699 AC243773.2-201ENST00000616341 490 ntTSL 2 BASIC21.2■□□□□ 0.98
RFTN1Q14699 UBE2Q2P2-204ENST00000618775 648 ntTSL 1 (best) BASIC21.2■□□□□ 0.98
RFTN1Q14699 FGF8-207ENST00000618991 856 ntTSL 3 BASIC21.2■□□□□ 0.98
RFTN1Q14699 GPX1-204ENST00000620890 897 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.2■□□□□ 0.98
RFTN1Q14699 RARRES2P11-201ENST00000635158 484 ntBASIC21.2■□□□□ 0.98
RFTN1Q14699 CERKL-203ENST00000374969 1330 ntTSL 1 (best) BASIC21.2■□□□□ 0.98
RFTN1Q14699 DYNC1I1-211ENST00000537881 2146 ntTSL 5 BASIC21.2■□□□□ 0.98
RFTN1Q14699 PABPC1L2B-201ENST00000373521 2197 ntAPPRIS P1 BASIC21.2■□□□□ 0.98
RFTN1Q14699 MSANTD1-204ENST00000510580 2039 ntTSL 5 BASIC21.19■□□□□ 0.98
RFTN1Q14699 VSX1-201ENST00000376707 943 ntTSL 1 (best) BASIC21.19■□□□□ 0.98
RFTN1Q14699 GRPEL2-202ENST00000416916 1006 ntTSL 2 BASIC21.19■□□□□ 0.98
RFTN1Q14699 VSX1-206ENST00000444511 1197 ntTSL 1 (best) BASIC21.19■□□□□ 0.98
RFTN1Q14699 CMTM8-202ENST00000458535 996 ntTSL 1 (best) BASIC21.19■□□□□ 0.98
RFTN1Q14699 RAP1B-220ENST00000539091 977 ntTSL 2 BASIC21.19■□□□□ 0.98
RFTN1Q14699 NMRAL1-212ENST00000574425 1240 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.19■□□□□ 0.98
RFTN1Q14699 MDK-213ENST00000617138 635 ntTSL 2 BASIC21.19■□□□□ 0.98
RFTN1Q14699 CD99-212ENST00000624481 1089 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC21.19■□□□□ 0.98
RFTN1Q14699 MAG-202ENST00000392213 2390 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC21.19■□□□□ 0.98
RFTN1Q14699 FIP1L1-201ENST00000306932 1878 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.19■□□□□ 0.98
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