Protein–RNA interactions for Protein: Q14549

GBX1, Homeobox protein GBX-1, humanhuman

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Length 363 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
GBX1Q14549 RPS15-210ENST00000592623 873 ntTSL 1 (best) BASIC20.44■□□□□ 0.86
GBX1Q14549 JPT1-206ENST00000476258 2289 ntTSL 1 (best) BASIC20.44■□□□□ 0.86
GBX1Q14549 ADARB1-205ENST00000437626 5032 ntTSL 1 (best) BASIC20.44■□□□□ 0.86
GBX1Q14549 LRCH4-209ENST00000497245 2014 ntTSL 5 BASIC20.44■□□□□ 0.86
GBX1Q14549 POMGNT2-201ENST00000344697 2544 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.44■□□□□ 0.86
GBX1Q14549 NTN4-207ENST00000553059 1818 ntTSL 1 (best) BASIC20.43■□□□□ 0.86
GBX1Q14549 DUSP28-201ENST00000343217 1555 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.43■□□□□ 0.86
GBX1Q14549 UBE2J2-201ENST00000347370 2387 ntTSL 3 BASIC20.43■□□□□ 0.86
GBX1Q14549 PCED1A-202ENST00000360652 2016 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.43■□□□□ 0.86
GBX1Q14549 NUDT16L1-202ENST00000405142 2040 ntTSL 1 (best) BASIC20.43■□□□□ 0.86
GBX1Q14549 E4F1-206ENST00000565090 2028 ntTSL 1 (best) BASIC20.43■□□□□ 0.86
GBX1Q14549 TUBG1-201ENST00000251413 1611 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.43■□□□□ 0.86
GBX1Q14549 EFNA2-201ENST00000215368 949 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.43■□□□□ 0.86
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GBX1Q14549 MLLT10-204ENST00000377091 905 ntTSL 1 (best) BASIC20.43■□□□□ 0.86
GBX1Q14549 LINC01678-201ENST00000411694 863 ntTSL 5 BASIC20.43■□□□□ 0.86
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GBX1Q14549 AP005205.2-201ENST00000577327 491 ntTSL 2 BASIC20.43■□□□□ 0.86
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GBX1Q14549 AC120498.10-201ENST00000621827 505 ntBASIC20.43■□□□□ 0.86
GBX1Q14549 FAM20C-201ENST00000313766 2751 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.43■□□□□ 0.86
GBX1Q14549 ZNF584-201ENST00000306910 2332 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.43■□□□□ 0.86
GBX1Q14549 C14orf79-207ENST00000550614 1912 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.43■□□□□ 0.86
GBX1Q14549 EFHD1-201ENST00000264059 2259 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.42■□□□□ 0.86
GBX1Q14549 NEURL4-201ENST00000315614 5182 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.42■□□□□ 0.86
GBX1Q14549 UNC93B1-201ENST00000227471 2316 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.42■□□□□ 0.86
GBX1Q14549 ZC3HAV1L-201ENST00000275766 1753 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.42■□□□□ 0.86
GBX1Q14549 MAPRE3-203ENST00000405074 1801 ntTSL 3 BASIC20.42■□□□□ 0.86
GBX1Q14549 ZNF668-209ENST00000539836 2469 ntTSL 5 BASIC20.42■□□□□ 0.86
GBX1Q14549 TUBA1A-201ENST00000295766 1887 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.42■□□□□ 0.86
GBX1Q14549 MPRIP-203ENST00000395806 527 ntTSL 3 BASIC20.42■□□□□ 0.86
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GBX1Q14549 AC021660.2-201ENST00000502999 388 ntTSL 3 BASIC20.42■□□□□ 0.86
GBX1Q14549 SEC23A-213ENST00000557280 561 ntTSL 4 BASIC20.42■□□□□ 0.86
GBX1Q14549 AC016888.1-201ENST00000585285 565 ntTSL 3 BASIC20.42■□□□□ 0.86
GBX1Q14549 GABBR2-201ENST00000259455 5788 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.42■□□□□ 0.86
GBX1Q14549 KLF1-201ENST00000264834 1592 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.42■□□□□ 0.86
GBX1Q14549 PARD3-213ENST00000545260 5740 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.41■□□□□ 0.86
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GBX1Q14549 STX7-201ENST00000367937 1090 ntTSL 5 BASIC20.41■□□□□ 0.86
GBX1Q14549 MAP1LC3A-202ENST00000374837 961 ntTSL 3 BASIC20.41■□□□□ 0.86
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GBX1Q14549 NEDD4L-225ENST00000589054 1033 ntTSL 3 BASIC20.41■□□□□ 0.86
GBX1Q14549 F2RL3-202ENST00000599210 613 ntTSL 2 BASIC20.41■□□□□ 0.86
GBX1Q14549 MMP23B-201ENST00000356026 1326 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.41■□□□□ 0.86
GBX1Q14549 TMEM175-212ENST00000508204 1399 ntTSL 3 BASIC20.41■□□□□ 0.86
GBX1Q14549 ABHD12B-202ENST00000353130 1477 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.41■□□□□ 0.86
GBX1Q14549 DPF1-201ENST00000355526 1632 ntTSL 1 (best) BASIC20.41■□□□□ 0.86
GBX1Q14549 WWTR1-AS1-202ENST00000479752 1700 ntTSL 1 (best) BASIC20.41■□□□□ 0.86
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GBX1Q14549 HOXC9-203ENST00000508190 1505 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC20.4■□□□□ 0.86
GBX1Q14549 AC104986.2-201ENST00000521696 380 ntTSL 2 BASIC20.4■□□□□ 0.86
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GBX1Q14549 ABCC6P2-202ENST00000542005 706 ntTSL 1 (best) BASIC20.4■□□□□ 0.86
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GBX1Q14549 ABCC6-204ENST00000575728 714 ntTSL 1 (best) BASIC20.4■□□□□ 0.86
GBX1Q14549 LINC01901-201ENST00000585822 1115 ntTSL 1 (best) BASIC20.4■□□□□ 0.86
GBX1Q14549 AC007773.1-201ENST00000592680 972 ntTSL 2 BASIC20.4■□□□□ 0.86
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GBX1Q14549 EXOC3-AS1-202ENST00000623673 1663 ntBASIC20.4■□□□□ 0.86
GBX1Q14549 STK11-205ENST00000586243 2777 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.4■□□□□ 0.86
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GBX1Q14549 CAMK2B-207ENST00000358707 1895 ntTSL 1 (best) BASIC20.39■□□□□ 0.85
GBX1Q14549 PUS1-203ENST00000443358 1664 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.38■□□□□ 0.85
GBX1Q14549 KCNIP2-207ENST00000358038 2489 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC20.38■□□□□ 0.85
GBX1Q14549 EEF1D-204ENST00000423316 2378 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC20.38■□□□□ 0.85
GBX1Q14549 GNB2-206ENST00000424361 1478 ntTSL 5 BASIC20.38■□□□□ 0.85
GBX1Q14549 ACADVL-202ENST00000350303 2191 ntTSL 1 (best) BASIC20.38■□□□□ 0.85
GBX1Q14549 SPI1-201ENST00000227163 1168 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC20.38■□□□□ 0.85
GBX1Q14549 NFKBIB-201ENST00000313582 1159 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.38■□□□□ 0.85
GBX1Q14549 RPLP2-207ENST00000530797 637 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.38■□□□□ 0.85
GBX1Q14549 AC044860.1-203ENST00000560811 844 ntTSL 3 BASIC20.38■□□□□ 0.85
GBX1Q14549 AC092368.3-201ENST00000562549 1107 ntTSL 5 BASIC20.38■□□□□ 0.85
GBX1Q14549 CIRBP-222ENST00000589235 1073 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC20.38■□□□□ 0.85
GBX1Q14549 AL136982.7-201ENST00000609363 465 ntTSL 4 BASIC20.38■□□□□ 0.85
GBX1Q14549 KCNMA1-224ENST00000618048 1269 ntTSL 1 (best) BASIC20.38■□□□□ 0.85
GBX1Q14549 FGF8-207ENST00000618991 856 ntTSL 3 BASIC20.38■□□□□ 0.85
GBX1Q14549 MYCNOS-205ENST00000641950 531 ntBASIC20.38■□□□□ 0.85
GBX1Q14549 GPAA1-202ENST00000361036 1840 ntTSL 1 (best) BASIC20.38■□□□□ 0.85
GBX1Q14549 NR1H2-204ENST00000593926 1828 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC20.38■□□□□ 0.85
GBX1Q14549 GATA6-AS1-202ENST00000583490 1788 ntTSL 2 BASIC20.38■□□□□ 0.85
GBX1Q14549 GPSM1-206ENST00000616132 2270 ntTSL 1 (best) BASIC20.38■□□□□ 0.85
GBX1Q14549 RABL2B-206ENST00000395598 2169 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.38■□□□□ 0.85
GBX1Q14549 DAPK3-201ENST00000301264 2105 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.38■□□□□ 0.85
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