Protein–RNA interactions for Protein: Q13619

CUL4A, Cullin-4A, humanhuman

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Length 759 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CUL4AQ13619 CA7-201ENST00000338437 1555 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.43■■□□□ 1.5
CUL4AQ13619 DET1-207ENST00000564406 2315 ntTSL 2 BASIC24.43■■□□□ 1.5
CUL4AQ13619 HES6-202ENST00000409002 1286 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.43■■□□□ 1.5
CUL4AQ13619 GRAMD4P2-201ENST00000423297 1097 ntBASIC24.43■■□□□ 1.5
CUL4AQ13619 AP001330.3-201ENST00000520123 633 ntBASIC24.43■■□□□ 1.5
CUL4AQ13619 PLEKHJ1-213ENST00000591099 1092 ntTSL 2 BASIC24.43■■□□□ 1.5
CUL4AQ13619 AC053503.5-201ENST00000601508 636 ntBASIC24.43■■□□□ 1.5
CUL4AQ13619 SMIM10L2B-201ENST00000433425 2737 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.43■■□□□ 1.5
CUL4AQ13619 SYTL1-211ENST00000618673 1712 ntTSL 5 BASIC24.43■■□□□ 1.5
CUL4AQ13619 SIMC1-203ENST00000429602 2694 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.43■■□□□ 1.5
CUL4AQ13619 VSX1-202ENST00000376709 2192 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.43■■□□□ 1.5
CUL4AQ13619 NSUN5-204ENST00000438747 1663 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC24.43■■□□□ 1.5
CUL4AQ13619 TMEM11-201ENST00000317635 2095 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.42■■□□□ 1.5
CUL4AQ13619 RAB24-202ENST00000303270 1385 ntTSL 2 BASIC24.42■■□□□ 1.5
CUL4AQ13619 GNA14-201ENST00000341700 2482 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.42■■□□□ 1.5
CUL4AQ13619 EIF4EBP1-201ENST00000338825 1020 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.42■■□□□ 1.5
CUL4AQ13619 FAM66D-201ENST00000434078 918 ntTSL 5 BASIC24.42■■□□□ 1.5
CUL4AQ13619 PITPNB-205ENST00000455418 2963 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC24.42■■□□□ 1.5
CUL4AQ13619 FAM174B-207ENST00000555748 866 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC24.42■■□□□ 1.5
CUL4AQ13619 LHX9-206ENST00000561173 2144 ntTSL 5 BASIC24.42■■□□□ 1.5
CUL4AQ13619 AC006538.2-201ENST00000586572 543 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC24.42■■□□□ 1.5
CUL4AQ13619 MAG-206ENST00000597035 542 ntTSL 4 BASIC24.42■■□□□ 1.5
CUL4AQ13619 MAMSTR-203ENST00000594582 1693 ntTSL 1 (best) BASIC24.42■■□□□ 1.5
CUL4AQ13619 SPON2-201ENST00000290902 1869 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.42■■□□□ 1.5
CUL4AQ13619 PRMT2-210ENST00000458387 1874 ntTSL 1 (best) BASIC24.42■■□□□ 1.5
CUL4AQ13619 TRPV6-209ENST00000638686 2298 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.42■■□□□ 1.5
CUL4AQ13619 PRELID3B-201ENST00000355937 2626 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.42■■□□□ 1.5
CUL4AQ13619 C7orf49-213ENST00000617987 1727 ntTSL 5 BASIC24.41■■□□□ 1.5
CUL4AQ13619 CALY-201ENST00000252939 2271 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.41■■□□□ 1.5
CUL4AQ13619 AC016065.1-201ENST00000500118 2413 ntTSL 2 BASIC24.41■■□□□ 1.5
CUL4AQ13619 TPBGL-201ENST00000562197 2793 ntAPPRIS P1 BASIC24.41■■□□□ 1.5
CUL4AQ13619 BYSL-201ENST00000230340 2029 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.41■■□□□ 1.5
CUL4AQ13619 PACSIN3-201ENST00000298838 1843 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.41■■□□□ 1.5
CUL4AQ13619 SMCO4-201ENST00000298966 1104 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.41■■□□□ 1.5
CUL4AQ13619 CTAG2-202ENST00000369585 748 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.41■■□□□ 1.5
CUL4AQ13619 CHTF8-208ENST00000522091 863 ntTSL 2 BASIC24.41■■□□□ 1.5
CUL4AQ13619 OGG1-202ENST00000302008 2191 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.41■■□□□ 1.5
CUL4AQ13619 SUSD1-203ENST00000374264 2754 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.41■■□□□ 1.5
CUL4AQ13619 PRSS22-201ENST00000161006 1386 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.41■■□□□ 1.5
CUL4AQ13619 MTX2-201ENST00000249442 1364 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.41■■□□□ 1.5
CUL4AQ13619 SUMF2-201ENST00000275607 1894 ntTSL 1 (best) BASIC24.41■■□□□ 1.5
CUL4AQ13619 TMPRSS5-212ENST00000545579 2163 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.4■■□□□ 1.5
CUL4AQ13619 C11orf96-201ENST00000339446 1308 ntTSL 5 BASIC24.4■■□□□ 1.5
CUL4AQ13619 AC011484.1-201ENST00000377652 1995 ntBASIC24.4■■□□□ 1.5
CUL4AQ13619 C19orf66-201ENST00000253110 2117 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC24.4■■□□□ 1.5
CUL4AQ13619 BRD4-202ENST00000360016 3240 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.4■■□□□ 1.5
CUL4AQ13619 EIF6-201ENST00000374436 1252 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.4■■□□□ 1.5
CUL4AQ13619 NDUFS3-206ENST00000528192 561 ntTSL 5 BASIC24.4■■□□□ 1.5
CUL4AQ13619 AL359317.1-201ENST00000556316 578 ntTSL 4 BASIC24.4■■□□□ 1.5
CUL4AQ13619 AC104564.5-201ENST00000584986 278 ntTSL 3 BASIC24.4■■□□□ 1.5
CUL4AQ13619 GRAMD4P4-201ENST00000613563 1115 ntBASIC24.4■■□□□ 1.5
CUL4AQ13619 NFYC-204ENST00000372653 1862 ntTSL 2 BASIC24.4■■□□□ 1.5
CUL4AQ13619 CPT2-203ENST00000635862 2319 ntTSL 5 BASIC24.4■■□□□ 1.5
CUL4AQ13619 PTGER3-212ENST00000628037 1815 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.4■■□□□ 1.5
CUL4AQ13619 CACTIN-202ENST00000248420 2671 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.39■■□□□ 1.5
CUL4AQ13619 CACNB2-203ENST00000352115 1911 ntTSL 1 (best) BASIC24.39■■□□□ 1.5
CUL4AQ13619 RAB1A-202ENST00000409751 1333 ntTSL 5 BASIC24.39■■□□□ 1.5
CUL4AQ13619 PCBP4-212ENST00000484633 2009 ntTSL 5 BASIC24.39■■□□□ 1.5
CUL4AQ13619 AC061975.6-201ENST00000579045 1553 ntBASIC24.39■■□□□ 1.5
CUL4AQ13619 AP004608.1-201ENST00000531319 1402 ntTSL 2 BASIC24.39■■□□□ 1.5
CUL4AQ13619 FUBP3-201ENST00000319725 3124 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.39■■□□□ 1.5
CUL4AQ13619 AL357078.1-201ENST00000448344 310 ntTSL 4 BASIC24.39■■□□□ 1.49
CUL4AQ13619 AL121603.2-201ENST00000557373 2117 ntBASIC24.39■■□□□ 1.49
CUL4AQ13619 AC106739.1-201ENST00000617035 715 ntBASIC24.39■■□□□ 1.49
CUL4AQ13619 UAP1-201ENST00000271469 2377 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC24.39■■□□□ 1.49
CUL4AQ13619 MUS81-201ENST00000308110 2392 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.39■■□□□ 1.49
CUL4AQ13619 TMEM204-201ENST00000253934 1686 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.39■■□□□ 1.49
CUL4AQ13619 CSPG5-203ENST00000456150 2089 ntTSL 1 (best) BASIC24.39■■□□□ 1.49
CUL4AQ13619 TBR1-202ENST00000410035 1454 ntTSL 2 BASIC24.38■■□□□ 1.49
CUL4AQ13619 AC092835.1-201ENST00000425953 1850 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.38■■□□□ 1.49
CUL4AQ13619 DYNC1I1-211ENST00000537881 2146 ntTSL 5 BASIC24.38■■□□□ 1.49
CUL4AQ13619 EHBP1L1-201ENST00000309295 5185 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.38■■□□□ 1.49
CUL4AQ13619 ACBD4-201ENST00000321854 1806 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.38■■□□□ 1.49
CUL4AQ13619 SENP5-204ENST00000445299 2491 ntTSL 2 BASIC24.38■■□□□ 1.49
CUL4AQ13619 OR10C1-203ENST00000444197 1672 ntAPPRIS P1 BASIC24.38■■□□□ 1.49
CUL4AQ13619 BCL7A-201ENST00000261822 2581 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.38■■□□□ 1.49
CUL4AQ13619 HBM-201ENST00000356815 506 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.38■■□□□ 1.49
CUL4AQ13619 PTGDR-202ENST00000553372 1216 ntTSL 3 BASIC24.38■■□□□ 1.49
CUL4AQ13619 NEDD4L-237ENST00000617539 728 ntTSL 2 BASIC24.38■■□□□ 1.49
CUL4AQ13619 SPG7-202ENST00000341316 2288 ntTSL 1 (best) BASIC24.38■■□□□ 1.49
CUL4AQ13619 TTC9-201ENST00000256367 5217 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.38■■□□□ 1.49
CUL4AQ13619 ANO8-201ENST00000159087 4152 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.38■■□□□ 1.49
CUL4AQ13619 TANGO2-217ENST00000456048 2439 ntTSL 2 BASIC24.37■■□□□ 1.49
CUL4AQ13619 AGAP4-207ENST00000616763 2784 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.37■■□□□ 1.49
CUL4AQ13619 MEIS3-212ENST00000561293 1918 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.37■■□□□ 1.49
CUL4AQ13619 NEU4-202ENST00000391969 2526 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.37■■□□□ 1.49
CUL4AQ13619 AL512408.1-201ENST00000569378 2000 ntBASIC24.37■■□□□ 1.49
CUL4AQ13619 SLC38A7-205ENST00000564010 1437 ntTSL 2 BASIC24.37■■□□□ 1.49
CUL4AQ13619 DTX2-212ENST00000446820 1770 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.37■■□□□ 1.49
CUL4AQ13619 FP700111.2-201ENST00000619190 1892 ntBASIC24.37■■□□□ 1.49
CUL4AQ13619 ZNF276-208ENST00000568064 2203 ntTSL 5 BASIC24.37■■□□□ 1.49
CUL4AQ13619 HES4-201ENST00000304952 899 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.37■■□□□ 1.49
CUL4AQ13619 EDA-201ENST00000338901 1233 ntBASIC24.37■■□□□ 1.49
CUL4AQ13619 NUDT14-202ENST00000392568 845 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.37■■□□□ 1.49
CUL4AQ13619 AC096631.2-201ENST00000436136 790 ntBASIC24.37■■□□□ 1.49
CUL4AQ13619 PBX2P1-201ENST00000493219 1291 ntBASIC24.37■■□□□ 1.49
CUL4AQ13619 AC012414.1-201ENST00000556676 535 ntBASIC24.37■■□□□ 1.49
CUL4AQ13619 RAB5A-201ENST00000273047 2536 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.37■■□□□ 1.49
CUL4AQ13619 TPST2-202ENST00000398110 1968 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.36■■□□□ 1.49
CUL4AQ13619 PQLC2-201ENST00000375153 2153 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.36■■□□□ 1.49
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