Protein–RNA interactions for Protein: Q13562

NEUROD1, Neurogenic differentiation factor 1, humanhuman

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Length 356 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
NEUROD1Q13562 UCHL1-201ENST00000284440 1172 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.72■■■□□ 2.51
NEUROD1Q13562 UCHL1-210ENST00000512788 785 ntTSL 3 BASIC30.72■■■□□ 2.51
NEUROD1Q13562 AC108002.2-201ENST00000519782 340 ntTSL 4 BASIC30.72■■■□□ 2.51
NEUROD1Q13562 IGFALS-203ENST00000568221 730 ntTSL 4 BASIC30.72■■■□□ 2.51
NEUROD1Q13562 AC053503.5-201ENST00000601508 636 ntBASIC30.72■■■□□ 2.51
NEUROD1Q13562 FARSA-201ENST00000314606 1814 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.72■■■□□ 2.51
NEUROD1Q13562 AL157384.1-201ENST00000445995 2473 ntBASIC30.72■■■□□ 2.51
NEUROD1Q13562 COCH-205ENST00000475087 1997 ntTSL 1 (best) BASIC30.72■■■□□ 2.51
NEUROD1Q13562 CCDC189-206ENST00000543610 1967 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.72■■■□□ 2.51
NEUROD1Q13562 TUB-203ENST00000534099 1759 ntTSL 2 BASIC30.71■■■□□ 2.51
NEUROD1Q13562 GNB1L-202ENST00000403325 1699 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.71■■■□□ 2.51
NEUROD1Q13562 Z98882.1-201ENST00000622160 2253 ntBASIC30.71■■■□□ 2.51
NEUROD1Q13562 ANAPC13-204ENST00000510994 1840 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC30.71■■■□□ 2.51
NEUROD1Q13562 NR2F2-204ENST00000453270 1712 ntTSL 1 (best) BASIC30.71■■■□□ 2.51
NEUROD1Q13562 AC068385.1-201ENST00000533218 409 ntTSL 3 BASIC30.71■■■□□ 2.51
NEUROD1Q13562 DISC1-224ENST00000639374 1071 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC30.71■■■□□ 2.51
NEUROD1Q13562 YBX1-201ENST00000321358 1514 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.71■■■□□ 2.51
NEUROD1Q13562 FBXO27-202ENST00000509137 2130 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC30.71■■■□□ 2.51
NEUROD1Q13562 SPI1-202ENST00000378538 1403 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC30.71■■■□□ 2.51
NEUROD1Q13562 BCAM-201ENST00000270233 2402 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.71■■■□□ 2.51
NEUROD1Q13562 LMAN2-201ENST00000303127 1800 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC30.7■■■□□ 2.51
NEUROD1Q13562 SPATA5L1-201ENST00000305560 2570 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.7■■■□□ 2.51
NEUROD1Q13562 CBR1-201ENST00000290349 1293 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.7■■■□□ 2.51
NEUROD1Q13562 TSPAN2-201ENST00000369515 793 ntTSL 3 BASIC30.7■■■□□ 2.51
NEUROD1Q13562 MPRIP-203ENST00000395806 527 ntTSL 3 BASIC30.7■■■□□ 2.51
NEUROD1Q13562 PRSS33-202ENST00000570702 1676 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.7■■■□□ 2.5
NEUROD1Q13562 PITPNB-205ENST00000455418 2963 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC30.7■■■□□ 2.5
NEUROD1Q13562 MTMR9LP-204ENST00000441044 2624 ntTSL 1 (best) BASIC30.7■■■□□ 2.5
NEUROD1Q13562 CYB561D2-205ENST00000425346 1319 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.7■■■□□ 2.5
NEUROD1Q13562 UBTD2-201ENST00000393792 3301 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.7■■■□□ 2.5
NEUROD1Q13562 PPP1R3F-203ENST00000466508 1885 ntTSL 2 BASIC30.7■■■□□ 2.5
NEUROD1Q13562 VAV3-202ENST00000370056 4990 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.69■■■□□ 2.5
NEUROD1Q13562 PLEKHH3-201ENST00000293349 2987 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC30.69■■■□□ 2.5
NEUROD1Q13562 ARFRP1-214ENST00000622789 2559 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.69■■■□□ 2.5
NEUROD1Q13562 HSF4-215ENST00000521374 1515 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.69■■■□□ 2.5
NEUROD1Q13562 CDK13-207ENST00000613626 3099 ntTSL 5 BASIC30.69■■■□□ 2.5
NEUROD1Q13562 NFKBIB-201ENST00000313582 1159 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.69■■■□□ 2.5
NEUROD1Q13562 C19orf12-205ENST00000392278 895 ntTSL 2 BASIC30.69■■■□□ 2.5
NEUROD1Q13562 DYM-203ENST00000442713 2147 ntTSL 2 BASIC30.69■■■□□ 2.5
NEUROD1Q13562 AP006621.1-202ENST00000528982 464 ntTSL 2 BASIC30.69■■■□□ 2.5
NEUROD1Q13562 FP565260.3-201ENST00000612610 1162 ntAPPRIS P5 TSL 1 (best) BASIC30.69■■■□□ 2.5
NEUROD1Q13562 MRPL37-206ENST00000605337 1582 ntTSL 5 BASIC30.69■■■□□ 2.5
NEUROD1Q13562 SPOP-206ENST00000504102 1865 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.69■■■□□ 2.5
NEUROD1Q13562 LINC00094-201ENST00000432807 2300 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC30.69■■■□□ 2.5
NEUROD1Q13562 CCDC130-201ENST00000221554 1792 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.69■■■□□ 2.5
NEUROD1Q13562 C12orf76-203ENST00000546651 1755 ntTSL 2 BASIC30.69■■■□□ 2.5
NEUROD1Q13562 C10orf55-202ENST00000412307 2360 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC30.69■■■□□ 2.5
NEUROD1Q13562 DUSP2-201ENST00000288943 1688 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.68■■■□□ 2.5
NEUROD1Q13562 PRKG2-207ENST00000628926 2623 ntTSL 2 BASIC30.68■■■□□ 2.5
NEUROD1Q13562 GXYLT1P2-201ENST00000433312 1230 ntBASIC30.68■■■□□ 2.5
NEUROD1Q13562 LSM14A-202ENST00000540746 2152 ntTSL 2 BASIC30.68■■■□□ 2.5
NEUROD1Q13562 C7orf43-201ENST00000316937 2520 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.68■■■□□ 2.5
NEUROD1Q13562 AC061975.6-201ENST00000579045 1553 ntBASIC30.67■■■□□ 2.5
NEUROD1Q13562 VPS13B-204ENST00000441350 1626 ntTSL 1 (best) BASIC30.67■■■□□ 2.5
NEUROD1Q13562 SPI1-201ENST00000227163 1168 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC30.67■■■□□ 2.5
NEUROD1Q13562 IL15RA-201ENST00000379971 588 ntTSL 3 BASIC30.67■■■□□ 2.5
NEUROD1Q13562 FAM71E1-204ENST00000600100 1281 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC30.67■■■□□ 2.5
NEUROD1Q13562 AP001160.3-201ENST00000601484 763 ntBASIC30.67■■■□□ 2.5
NEUROD1Q13562 KCNMA1-224ENST00000618048 1269 ntTSL 1 (best) BASIC30.67■■■□□ 2.5
NEUROD1Q13562 AC093762.3-201ENST00000641918 318 ntAPPRIS P1 BASIC30.67■■■□□ 2.5
NEUROD1Q13562 LRRC3B-201ENST00000396641 1696 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.67■■■□□ 2.5
NEUROD1Q13562 HPCAL1-201ENST00000307845 1751 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.66■■■□□ 2.5
NEUROD1Q13562 NARF-205ENST00000412079 1760 ntTSL 5 BASIC30.66■■■□□ 2.5
NEUROD1Q13562 EFCAB6-202ENST00000356087 1129 ntTSL 5 BASIC30.66■■■□□ 2.5
NEUROD1Q13562 GABRA2-214ENST00000515082 2366 ntTSL 1 (best) BASIC30.66■■■□□ 2.5
NEUROD1Q13562 GSTM3-202ENST00000361066 1565 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.66■■■□□ 2.5
NEUROD1Q13562 MDFI-203ENST00000373051 1622 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC30.65■■■□□ 2.5
NEUROD1Q13562 USP45-202ENST00000329966 1444 ntTSL 1 (best) BASIC30.65■■■□□ 2.5
NEUROD1Q13562 MFSD3-201ENST00000301327 1548 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.65■■■□□ 2.5
NEUROD1Q13562 NAA20-201ENST00000310450 920 ntTSL 2 BASIC30.65■■■□□ 2.5
NEUROD1Q13562 TNFRSF18-202ENST00000379265 705 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC30.65■■■□□ 2.5
NEUROD1Q13562 AC106738.1-201ENST00000560487 359 ntTSL 3 BASIC30.65■■■□□ 2.5
NEUROD1Q13562 AC011825.4-201ENST00000582233 473 ntTSL 2 BASIC30.65■■■□□ 2.5
NEUROD1Q13562 PPP1R12B-212ENST00000480184 1808 ntTSL 1 (best) BASIC30.65■■■□□ 2.5
NEUROD1Q13562 HNF4A-205ENST00000443598 1603 ntTSL 1 (best) BASIC30.65■■■□□ 2.5
NEUROD1Q13562 SH3BP2-204ENST00000452765 2265 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC30.64■■■□□ 2.5
NEUROD1Q13562 CELF2-213ENST00000633077 1733 ntTSL 1 (best) BASIC30.64■■■□□ 2.5
NEUROD1Q13562 DYNC1I1-211ENST00000537881 2146 ntTSL 5 BASIC30.64■■■□□ 2.5
NEUROD1Q13562 GRINA-202ENST00000395068 1814 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.64■■■□□ 2.5
NEUROD1Q13562 EMC7-201ENST00000256545 1155 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.64■■■□□ 2.5
NEUROD1Q13562 UBE2D3-201ENST00000321805 1087 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC30.64■■■□□ 2.5
NEUROD1Q13562 AC138907.5-202ENST00000569484 235 ntBASIC30.64■■■□□ 2.5
NEUROD1Q13562 TUBG1-201ENST00000251413 1611 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.64■■■□□ 2.5
NEUROD1Q13562 ANKLE2-201ENST00000357997 4646 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.64■■■□□ 2.5
NEUROD1Q13562 DGKZ-214ENST00000527911 3337 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC30.64■■■□□ 2.5
NEUROD1Q13562 KANK3-203ENST00000593649 2672 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC30.64■■■□□ 2.5
NEUROD1Q13562 ADAMTS10-205ENST00000595838 2458 ntTSL 2 BASIC30.64■■■□□ 2.49
NEUROD1Q13562 ATP6AP1-201ENST00000369762 2099 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.63■■■□□ 2.49
NEUROD1Q13562 AC133555.3-201ENST00000549950 1693 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC30.63■■■□□ 2.49
NEUROD1Q13562 AC106782.1-201ENST00000550538 1693 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC30.63■■■□□ 2.49
NEUROD1Q13562 RAMP1-203ENST00000404910 857 ntTSL 2 BASIC30.63■■■□□ 2.49
NEUROD1Q13562 IDNK-204ENST00000454393 1210 ntTSL 3 BASIC30.63■■■□□ 2.49
NEUROD1Q13562 TSPAN11-202ENST00000535215 988 ntTSL 2 BASIC30.63■■■□□ 2.49
NEUROD1Q13562 COX4I1-216ENST00000568794 794 ntTSL 5 BASIC30.63■■■□□ 2.49
NEUROD1Q13562 AF106564.1-201ENST00000607058 2553 ntBASIC30.63■■■□□ 2.49
NEUROD1Q13562 TM7SF2-201ENST00000279263 1722 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.63■■■□□ 2.49
NEUROD1Q13562 MAF1-205ENST00000534585 1754 ntTSL 5 BASIC30.63■■■□□ 2.49
NEUROD1Q13562 OIP5-AS1-202ENST00000501665 1384 ntTSL 2 BASIC30.63■■■□□ 2.49
NEUROD1Q13562 TBL1Y-201ENST00000346432 2312 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.63■■■□□ 2.49
NEUROD1Q13562 CRTAC1-203ENST00000370597 2890 ntTSL 1 (best) BASIC30.63■■■□□ 2.49
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