Protein–RNA interactions for Protein: Q13367

AP3B2, AP-3 complex subunit beta-2, humanhuman

Predictions only

Length 1,082 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
AP3B2Q13367 CRTC2-203ENST00000368633 2644 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.73■■□□□ 1.39
AP3B2Q13367 TPTEP1-205ENST00000558085 1738 ntTSL 2 BASIC23.73■■□□□ 1.39
AP3B2Q13367 GRTP1-202ENST00000375430 1834 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.73■■□□□ 1.39
AP3B2Q13367 DEDD2-201ENST00000336034 1882 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC23.73■■□□□ 1.39
AP3B2Q13367 SH3BP2-204ENST00000452765 2265 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.72■■□□□ 1.39
AP3B2Q13367 SLC25A42-201ENST00000318596 3120 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.72■■□□□ 1.39
AP3B2Q13367 HRASLS-201ENST00000264735 1066 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.72■■□□□ 1.39
AP3B2Q13367 C19orf81-201ENST00000425202 765 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC23.72■■□□□ 1.39
AP3B2Q13367 CDKN2A-205ENST00000479692 544 ntTSL 5 BASIC23.72■■□□□ 1.39
AP3B2Q13367 DHRS4-207ENST00000559632 1003 ntTSL 1 (best) BASIC23.72■■□□□ 1.39
AP3B2Q13367 Z92544.1-201ENST00000567091 730 ntTSL 3 BASIC23.72■■□□□ 1.39
AP3B2Q13367 VIM-AS1-202ENST00000605833 918 ntTSL 3 BASIC23.72■■□□□ 1.39
AP3B2Q13367 STEAP1-201ENST00000297205 1313 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.72■■□□□ 1.39
AP3B2Q13367 GNB2-206ENST00000424361 1478 ntTSL 5 BASIC23.72■■□□□ 1.39
AP3B2Q13367 CLN3-240ENST00000631023 1586 ntTSL 5 BASIC23.72■■□□□ 1.39
AP3B2Q13367 FADS6-204ENST00000614223 2044 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.72■■□□□ 1.39
AP3B2Q13367 SPIRE2-202ENST00000393062 2172 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.72■■□□□ 1.39
AP3B2Q13367 PABPC1L2A-201ENST00000373519 2237 ntAPPRIS P1 BASIC23.72■■□□□ 1.39
AP3B2Q13367 TERF2-201ENST00000254942 2983 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.72■■□□□ 1.39
AP3B2Q13367 NFIX-203ENST00000397661 3143 ntTSL 5 BASIC23.71■■□□□ 1.39
AP3B2Q13367 CACYBP-201ENST00000367679 2766 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.71■■□□□ 1.39
AP3B2Q13367 C7orf49-213ENST00000617987 1727 ntTSL 5 BASIC23.71■■□□□ 1.39
AP3B2Q13367 THOC3-201ENST00000265097 1589 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.71■■□□□ 1.39
AP3B2Q13367 LINC00605-201ENST00000514902 1558 ntTSL 1 (best) BASIC23.71■■□□□ 1.39
AP3B2Q13367 MGST3-205ENST00000367889 1015 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.71■■□□□ 1.39
AP3B2Q13367 EIF5A-205ENST00000419711 1271 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.71■■□□□ 1.39
AP3B2Q13367 PTPA-214ENST00000423100 988 ntTSL 2 BASIC23.71■■□□□ 1.39
AP3B2Q13367 FAM47E-204ENST00000510328 1002 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC23.71■■□□□ 1.39
AP3B2Q13367 C12orf75-205ENST00000549893 719 ntTSL 3 BASIC23.71■■□□□ 1.39
AP3B2Q13367 MYO19-221ENST00000620640 1186 ntTSL 2 BASIC23.71■■□□□ 1.39
AP3B2Q13367 PRKACA-201ENST00000308677 2677 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.71■■□□□ 1.39
AP3B2Q13367 TMEM178A-201ENST00000281961 1662 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.7■■□□□ 1.39
AP3B2Q13367 ABCG4-204ENST00000615496 2459 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.7■■□□□ 1.38
AP3B2Q13367 MAN2C1-244ENST00000618257 1346 ntTSL 5 BASIC23.7■■□□□ 1.38
AP3B2Q13367 DPYS-201ENST00000351513 2127 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.7■■□□□ 1.38
AP3B2Q13367 NCF1B-203ENST00000435988 1254 ntBASIC23.7■■□□□ 1.38
AP3B2Q13367 AC133552.2-202ENST00000575694 574 ntBASIC23.7■■□□□ 1.38
AP3B2Q13367 ANAPC11-219ENST00000583839 499 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.7■■□□□ 1.38
AP3B2Q13367 TRAPPC3-208ENST00000616074 1114 ntTSL 5 BASIC23.7■■□□□ 1.38
AP3B2Q13367 GDF6-203ENST00000621429 1179 ntTSL 5 BASIC23.7■■□□□ 1.38
AP3B2Q13367 IER5L-201ENST00000372491 2711 ntAPPRIS P1 BASIC23.7■■□□□ 1.38
AP3B2Q13367 S1PR5-204ENST00000617721 1698 ntTSL 5 BASIC23.7■■□□□ 1.38
AP3B2Q13367 SYNGR2-201ENST00000225777 2325 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.7■■□□□ 1.38
AP3B2Q13367 SEPT1-201ENST00000321367 1592 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.69■■□□□ 1.38
AP3B2Q13367 WWC2-AS2-201ENST00000578387 2183 ntBASIC23.69■■□□□ 1.38
AP3B2Q13367 MRGBP-201ENST00000370487 2781 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.69■■□□□ 1.38
AP3B2Q13367 FAM66C-208ENST00000541558 2087 ntTSL 2 BASIC23.69■■□□□ 1.38
AP3B2Q13367 ZIM2-201ENST00000593711 2083 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.69■■□□□ 1.38
AP3B2Q13367 OTOP1-201ENST00000296358 1864 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.69■■□□□ 1.38
AP3B2Q13367 ST7-201ENST00000265437 2899 ntTSL 1 (best) BASIC23.69■■□□□ 1.38
AP3B2Q13367 ARF3-202ENST00000447318 1089 ntTSL 2 BASIC23.69■■□□□ 1.38
AP3B2Q13367 PBX1-209ENST00000485769 834 ntTSL 2 BASIC23.69■■□□□ 1.38
AP3B2Q13367 AC091138.1-202ENST00000578967 457 ntTSL 2 BASIC23.69■■□□□ 1.38
AP3B2Q13367 PANO1-201ENST00000620120 1680 ntAPPRIS P1 BASIC23.69■■□□□ 1.38
AP3B2Q13367 SNX24-211ENST00000513881 1563 ntTSL 1 (best) BASIC23.69■■□□□ 1.38
AP3B2Q13367 CRIM1-201ENST00000280527 5912 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.69■■□□□ 1.38
AP3B2Q13367 CCDC189-206ENST00000543610 1967 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.69■■□□□ 1.38
AP3B2Q13367 SLC4A3-203ENST00000358055 4454 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.69■■□□□ 1.38
AP3B2Q13367 GUSB-201ENST00000304895 2300 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.68■■□□□ 1.38
AP3B2Q13367 SLC35F5-203ENST00000409342 2284 ntTSL 2 BASIC23.68■■□□□ 1.38
AP3B2Q13367 FBXO25-202ENST00000350302 2229 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC23.68■■□□□ 1.38
AP3B2Q13367 PAQR6-205ENST00000368270 1765 ntTSL 1 (best) BASIC23.68■■□□□ 1.38
AP3B2Q13367 SSTR3-202ENST00000617123 1781 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.68■■□□□ 1.38
AP3B2Q13367 CACNA1H-201ENST00000348261 8208 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC23.68■■□□□ 1.38
AP3B2Q13367 ARL5A-202ENST00000428992 747 ntTSL 2 BASIC23.68■■□□□ 1.38
AP3B2Q13367 MAP2K4P1-201ENST00000438453 1195 ntBASIC23.68■■□□□ 1.38
AP3B2Q13367 CDV3P1-201ENST00000471403 739 ntBASIC23.68■■□□□ 1.38
AP3B2Q13367 AC069236.1-201ENST00000604339 616 ntBASIC23.68■■□□□ 1.38
AP3B2Q13367 UBXN2B-206ENST00000638450 591 ntTSL 5 BASIC23.68■■□□□ 1.38
AP3B2Q13367 RBKS-201ENST00000302188 1973 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.68■■□□□ 1.38
AP3B2Q13367 KCNK15-201ENST00000372861 2599 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.68■■□□□ 1.38
AP3B2Q13367 NTN4-207ENST00000553059 1818 ntTSL 1 (best) BASIC23.68■■□□□ 1.38
AP3B2Q13367 KCNAB3-201ENST00000303790 2458 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.68■■□□□ 1.38
AP3B2Q13367 PALM-207ENST00000590161 2137 ntTSL 4 BASIC23.68■■□□□ 1.38
AP3B2Q13367 KCNC3-201ENST00000376959 5447 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.67■■□□□ 1.38
AP3B2Q13367 GRTP1-203ENST00000375431 1384 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.67■■□□□ 1.38
AP3B2Q13367 CCDC38-201ENST00000344280 2277 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.67■■□□□ 1.38
AP3B2Q13367 ARHGEF25-201ENST00000286494 2552 ntTSL 1 (best) BASIC23.67■■□□□ 1.38
AP3B2Q13367 MPPED1-203ENST00000443721 2507 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.67■■□□□ 1.38
AP3B2Q13367 CD247-201ENST00000362089 1609 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC23.67■■□□□ 1.38
AP3B2Q13367 MREG-201ENST00000263268 1314 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.67■■□□□ 1.38
AP3B2Q13367 DUSP28-201ENST00000343217 1555 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.67■■□□□ 1.38
AP3B2Q13367 DESI2-201ENST00000263831 859 ntTSL 1 (best) BASIC23.67■■□□□ 1.38
AP3B2Q13367 RNPS1-201ENST00000301730 1276 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.67■■□□□ 1.38
AP3B2Q13367 ZNF644-203ENST00000361321 1253 ntTSL 2 BASIC23.67■■□□□ 1.38
AP3B2Q13367 C2orf50-202ENST00000405022 980 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.67■■□□□ 1.38
AP3B2Q13367 OAS3-207ENST00000551007 998 ntTSL 2 BASIC23.67■■□□□ 1.38
AP3B2Q13367 CPEB1-AS1-201ENST00000560650 2138 ntTSL 1 (best) BASIC23.67■■□□□ 1.38
AP3B2Q13367 NDUFA6-AS1-207ENST00000595777 833 ntTSL 5 BASIC23.67■■□□□ 1.38
AP3B2Q13367 FAM21FP-204ENST00000608637 956 ntBASIC23.67■■□□□ 1.38
AP3B2Q13367 AL121832.2-201ENST00000610979 668 ntBASIC23.67■■□□□ 1.38
AP3B2Q13367 GXYLT1P5-201ENST00000614548 1189 ntBASIC23.67■■□□□ 1.38
AP3B2Q13367 OR10C1-204ENST00000622521 1039 ntBASIC23.67■■□□□ 1.38
AP3B2Q13367 WRNIP1-203ENST00000380771 2595 ntTSL 1 (best) BASIC23.67■■□□□ 1.38
AP3B2Q13367 VIL1-204ENST00000440053 1454 ntTSL 1 (best) BASIC23.67■■□□□ 1.38
AP3B2Q13367 ARSA-205ENST00000453344 1650 ntTSL 2 BASIC23.67■■□□□ 1.38
AP3B2Q13367 NPTXR-201ENST00000333039 5784 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.67■■□□□ 1.38
AP3B2Q13367 FNDC10-201ENST00000422725 2085 ntAPPRIS P1 BASIC23.66■■□□□ 1.38
AP3B2Q13367 MAMSTR-202ENST00000356751 1825 ntTSL 2 BASIC23.66■■□□□ 1.38
AP3B2Q13367 MSANTD1-204ENST00000510580 2039 ntTSL 5 BASIC23.66■■□□□ 1.38
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