Protein–RNA interactions for Protein: Q13332

PTPRS, Receptor-type tyrosine-protein phosphatase S, humanhuman

Predictions only

Length 1,948 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
PTPRSQ13332 RBCK1-213ENST00000475269 1200 ntTSL 1 (best) BASIC22.47■■□□□ 1.19
PTPRSQ13332 PAIP2-208ENST00000511706 468 ntTSL 5 BASIC22.47■■□□□ 1.19
PTPRSQ13332 DHDH-203ENST00000522614 776 ntTSL 5 BASIC22.47■■□□□ 1.19
PTPRSQ13332 CMTM3-207ENST00000564060 824 ntTSL 2 BASIC22.47■■□□□ 1.19
PTPRSQ13332 CMTM3-211ENST00000565922 615 ntTSL 1 (best) BASIC22.47■■□□□ 1.19
PTPRSQ13332 PRSS57-202ENST00000613411 1090 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.47■■□□□ 1.19
PTPRSQ13332 TSPAN3-207ENST00000559494 1326 ntTSL 5 BASIC22.47■■□□□ 1.19
PTPRSQ13332 PHOSPHO1-206ENST00000514112 1587 ntTSL 1 (best) BASIC22.47■■□□□ 1.19
PTPRSQ13332 TMEM204-201ENST00000253934 1686 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.47■■□□□ 1.19
PTPRSQ13332 DUX4-203ENST00000565211 1710 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.47■■□□□ 1.19
PTPRSQ13332 SYNC-201ENST00000373484 1824 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.47■■□□□ 1.19
PTPRSQ13332 TULP1-202ENST00000322263 1941 ntTSL 1 (best) BASIC22.47■■□□□ 1.19
PTPRSQ13332 C14orf80-201ENST00000329886 1947 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.47■■□□□ 1.19
PTPRSQ13332 CACNG2-201ENST00000300105 2384 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.47■■□□□ 1.19
PTPRSQ13332 AP006623.1-201ENST00000506172 2061 ntTSL 5 BASIC22.46■■□□□ 1.19
PTPRSQ13332 CDKN2B-AS1-217ENST00000585267 1337 ntTSL 1 (best) BASIC22.46■■□□□ 1.19
PTPRSQ13332 PLPP2-201ENST00000269812 1228 ntTSL 3 BASIC22.46■■□□□ 1.19
PTPRSQ13332 AC211429.1-201ENST00000415277 523 ntBASIC22.46■■□□□ 1.19
PTPRSQ13332 BNIP3L-204ENST00000520409 739 ntTSL 2 BASIC22.46■■□□□ 1.19
PTPRSQ13332 MMEL1-206ENST00000502556 1943 ntTSL 1 (best) BASIC22.46■■□□□ 1.19
PTPRSQ13332 SNX21-212ENST00000491381 1607 ntTSL 1 (best) BASIC22.46■■□□□ 1.19
PTPRSQ13332 TACO1-201ENST00000258975 1469 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.45■■□□□ 1.19
PTPRSQ13332 COL11A2-204ENST00000395194 1194 ntTSL 1 (best) BASIC22.45■■□□□ 1.18
PTPRSQ13332 SAPCD2P1-201ENST00000395413 1184 ntBASIC22.45■■□□□ 1.18
PTPRSQ13332 FAM163B-202ENST00000496132 811 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC22.45■■□□□ 1.18
PTPRSQ13332 HAGHL-213ENST00000564545 663 ntTSL 3 BASIC22.45■■□□□ 1.18
PTPRSQ13332 FDXR-219ENST00000583917 1762 ntTSL 5 BASIC22.45■■□□□ 1.18
PTPRSQ13332 ARMC10-205ENST00000428183 2445 ntTSL 1 (best) BASIC22.45■■□□□ 1.18
PTPRSQ13332 HYAL2-207ENST00000442581 2318 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.45■■□□□ 1.18
PTPRSQ13332 TRIM73-202ENST00000430211 1321 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.45■■□□□ 1.18
PTPRSQ13332 USF2-203ENST00000379134 648 ntTSL 1 (best) BASIC22.45■■□□□ 1.18
PTPRSQ13332 CSF1-205ENST00000420111 1083 ntTSL 5 BASIC22.45■■□□□ 1.18
PTPRSQ13332 SMIM1-201ENST00000444870 546 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.45■■□□□ 1.18
PTPRSQ13332 ZNF529-AS1-202ENST00000475219 1033 ntTSL 1 (best) BASIC22.45■■□□□ 1.18
PTPRSQ13332 TNFRSF18-204ENST00000486728 727 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.45■■□□□ 1.18
PTPRSQ13332 NAT14-204ENST00000591590 1011 ntTSL 1 (best) BASIC22.45■■□□□ 1.18
PTPRSQ13332 AC008750.8-201ENST00000600067 551 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.45■■□□□ 1.18
PTPRSQ13332 CLDND2-203ENST00000601435 575 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC22.45■■□□□ 1.18
PTPRSQ13332 AC124016.1-201ENST00000609552 612 ntBASIC22.45■■□□□ 1.18
PTPRSQ13332 SLC25A47-202ENST00000557052 1552 ntTSL 1 (best) BASIC22.44■■□□□ 1.18
PTPRSQ13332 NRL-203ENST00000397002 1976 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.44■■□□□ 1.18
PTPRSQ13332 AC138028.2-201ENST00000440406 1539 ntTSL 2 BASIC22.44■■□□□ 1.18
PTPRSQ13332 CAMKMT-201ENST00000378494 1495 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.44■■□□□ 1.18
PTPRSQ13332 AC010173.1-201ENST00000549023 1453 ntTSL 2 BASIC22.44■■□□□ 1.18
PTPRSQ13332 MRPL4-202ENST00000307422 1320 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC22.44■■□□□ 1.18
PTPRSQ13332 AL390719.1-201ENST00000427998 977 ntTSL 1 (best) BASIC22.44■■□□□ 1.18
PTPRSQ13332 LY6E-205ENST00000519611 635 ntTSL 3 BASIC22.44■■□□□ 1.18
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PTPRSQ13332 AL356020.1-201ENST00000554235 1076 ntTSL 5 BASIC22.44■■□□□ 1.18
PTPRSQ13332 RN7SL471P-201ENST00000580476 299 ntBASIC22.44■■□□□ 1.18
PTPRSQ13332 SLC25A11-201ENST00000225665 1897 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.44■■□□□ 1.18
PTPRSQ13332 CD55-205ENST00000367067 1843 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.44■■□□□ 1.18
PTPRSQ13332 LINC02175-201ENST00000571219 1875 ntTSL 1 (best) BASIC22.43■■□□□ 1.18
PTPRSQ13332 HOXA4-202ENST00000428284 1595 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.43■■□□□ 1.18
PTPRSQ13332 DPF1-209ENST00000456296 1562 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.43■■□□□ 1.18
PTPRSQ13332 PRSS3-201ENST00000342836 1144 ntTSL 1 (best) BASIC22.43■■□□□ 1.18
PTPRSQ13332 FAM210CP-201ENST00000445714 574 ntBASIC22.43■■□□□ 1.18
PTPRSQ13332 ADCYAP1-202ENST00000450565 918 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.43■■□□□ 1.18
PTPRSQ13332 AC226101.2-201ENST00000458252 747 ntTSL 2 BASIC22.43■■□□□ 1.18
PTPRSQ13332 AC021087.1-201ENST00000512642 522 ntTSL 2 BASIC22.43■■□□□ 1.18
PTPRSQ13332 TMEM72-203ENST00000544540 1018 ntTSL 1 (best) BASIC22.43■■□□□ 1.18
PTPRSQ13332 PPOX-219ENST00000544598 813 ntTSL 2 BASIC22.43■■□□□ 1.18
PTPRSQ13332 GFOD1-204ENST00000603223 2388 ntTSL 2 BASIC22.43■■□□□ 1.18
PTPRSQ13332 OSCAR-201ENST00000284648 2055 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.43■■□□□ 1.18
PTPRSQ13332 LRRC3B-201ENST00000396641 1696 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.43■■□□□ 1.18
PTPRSQ13332 SUGCT-202ENST00000401647 1369 ntTSL 1 (best) BASIC22.43■■□□□ 1.18
PTPRSQ13332 TMEM256-PLSCR3-204ENST00000573331 2557 ntAPPRIS P5 TSL 2 BASIC22.43■■□□□ 1.18
PTPRSQ13332 SCARB2-219ENST00000639738 1517 ntTSL 5 BASIC22.43■■□□□ 1.18
PTPRSQ13332 LIME1-201ENST00000309546 1178 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.43■■□□□ 1.18
PTPRSQ13332 RPS2P55-201ENST00000397318 883 ntBASIC22.43■■□□□ 1.18
PTPRSQ13332 PTPA-214ENST00000423100 988 ntTSL 2 BASIC22.43■■□□□ 1.18
PTPRSQ13332 SMG1P1-207ENST00000446662 852 ntTSL 5 BASIC22.43■■□□□ 1.18
PTPRSQ13332 AC107956.1-201ENST00000494359 873 ntBASIC22.43■■□□□ 1.18
PTPRSQ13332 AC113189.1-201ENST00000570444 327 ntTSL 3 BASIC22.43■■□□□ 1.18
PTPRSQ13332 TMEM53-205ENST00000372244 1472 ntTSL 2 BASIC22.43■■□□□ 1.18
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PTPRSQ13332 NIPAL4-202ENST00000435489 1600 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.42■■□□□ 1.18
PTPRSQ13332 IL15RA-206ENST00000397248 1799 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.42■■□□□ 1.18
PTPRSQ13332 MFSD6L-201ENST00000329805 2188 ntAPPRIS P1 BASIC22.42■■□□□ 1.18
PTPRSQ13332 GORASP1-220ENST00000479927 1345 ntTSL 2 BASIC22.42■■□□□ 1.18
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PTPRSQ13332 IQCD-203ENST00000546692 1872 ntTSL 5 BASIC22.42■■□□□ 1.18
PTPRSQ13332 STK24-AS1-201ENST00000434547 1278 ntTSL 1 (best) BASIC22.42■■□□□ 1.18
PTPRSQ13332 A3GALT2-201ENST00000442999 1023 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.42■■□□□ 1.18
PTPRSQ13332 AC122129.2-201ENST00000583598 466 ntTSL 5 BASIC22.42■■□□□ 1.18
PTPRSQ13332 UCHL5-205ENST00000367454 1815 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.42■■□□□ 1.18
PTPRSQ13332 CDK5-204ENST00000485972 1758 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.42■■□□□ 1.18
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PTPRSQ13332 CPLX1-203ENST00000505203 2011 ntTSL 2 BASIC22.42■■□□□ 1.18
PTPRSQ13332 BSPRY-201ENST00000374183 2339 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.41■■□□□ 1.18
PTPRSQ13332 CEBPB-201ENST00000303004 1956 ntAPPRIS P1 BASIC22.41■■□□□ 1.18
PTPRSQ13332 PLEKHB2-203ENST00000404460 1167 ntTSL 2 BASIC22.41■■□□□ 1.18
PTPRSQ13332 SERF2-207ENST00000409614 582 ntTSL 2 BASIC22.41■■□□□ 1.18
PTPRSQ13332 PDE9A-212ENST00000398234 1783 ntTSL 1 (best) BASIC22.41■■□□□ 1.18
PTPRSQ13332 ABHD1-201ENST00000316470 1400 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.41■■□□□ 1.18
PTPRSQ13332 OLIG1-201ENST00000382348 2277 ntAPPRIS P1 BASIC22.41■■□□□ 1.18
PTPRSQ13332 CYP21A1P-202ENST00000354927 1481 ntBASIC22.41■■□□□ 1.18
PTPRSQ13332 PADI2-201ENST00000375481 1607 ntTSL 1 (best) BASIC22.41■■□□□ 1.18
PTPRSQ13332 TPSAB1-201ENST00000338844 1175 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.41■■□□□ 1.18
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