Protein–RNA interactions for Protein: Q13099

IFT88, Intraflagellar transport protein 88 homolog, humanhuman

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Length 833 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
IFT88Q13099 pRNA.11-201ENST00000618423 90 ntBASIC21.1■□□□□ 0.97
IFT88Q13099 pRNA.13-201ENST00000619112 90 ntBASIC21.1■□□□□ 0.97
IFT88Q13099 SLC35A3-216ENST00000639221 1032 ntTSL 5 BASIC21.1■□□□□ 0.97
IFT88Q13099 SCARB1-201ENST00000261693 2611 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.1■□□□□ 0.97
IFT88Q13099 C10orf91-202ENST00000392630 1846 ntTSL 2 BASIC21.1■□□□□ 0.97
IFT88Q13099 TMTC1-203ENST00000539277 2758 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.1■□□□□ 0.97
IFT88Q13099 OGG1-202ENST00000302008 2191 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.1■□□□□ 0.97
IFT88Q13099 AL049796.1-201ENST00000565336 1766 ntBASIC21.1■□□□□ 0.97
IFT88Q13099 PRPF39-201ENST00000355765 2868 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.1■□□□□ 0.97
IFT88Q13099 UHRF1-203ENST00000615884 2651 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.1■□□□□ 0.97
IFT88Q13099 PABPC4-204ENST00000372862 2470 ntTSL 5 BASIC21.1■□□□□ 0.97
IFT88Q13099 CASP9-203ENST00000375890 1351 ntTSL 2 BASIC21.1■□□□□ 0.97
IFT88Q13099 LTBP3-217ENST00000530785 2461 ntTSL 2 BASIC21.1■□□□□ 0.97
IFT88Q13099 VAV1-201ENST00000304076 2825 ntTSL 1 (best) BASIC21.1■□□□□ 0.97
IFT88Q13099 LIN54-209ENST00000510557 2257 ntTSL 2 BASIC21.09■□□□□ 0.97
IFT88Q13099 CEP78-202ENST00000376597 2618 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC21.09■□□□□ 0.97
IFT88Q13099 GTSE1-AS1-202ENST00000623117 1518 ntBASIC21.09■□□□□ 0.97
IFT88Q13099 KLHL2-201ENST00000226725 3134 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.09■□□□□ 0.97
IFT88Q13099 ACTR5-201ENST00000243903 2565 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.09■□□□□ 0.97
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IFT88Q13099 CLDN23-201ENST00000519106 2169 ntAPPRIS P1 BASIC21.09■□□□□ 0.97
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IFT88Q13099 LEFTY1-201ENST00000272134 1626 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.09■□□□□ 0.97
IFT88Q13099 POLD2-218ENST00000610533 1619 ntTSL 1 (best) BASIC21.09■□□□□ 0.97
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IFT88Q13099 ZNF331-214ENST00000511154 2120 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.09■□□□□ 0.97
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IFT88Q13099 GRK2-201ENST00000308595 3466 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.07■□□□□ 0.96
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IFT88Q13099 ZNF12-201ENST00000342651 2921 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC21.07■□□□□ 0.96
IFT88Q13099 CERS5-203ENST00000422340 2855 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC21.07■□□□□ 0.96
IFT88Q13099 CNTD2-202ENST00000430325 1817 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC21.06■□□□□ 0.96
IFT88Q13099 FGFR1-238ENST00000532791 5590 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC21.06■□□□□ 0.96
IFT88Q13099 SMG8-203ENST00000578922 2178 ntBASIC21.06■□□□□ 0.96
IFT88Q13099 CHRAC1-203ENST00000519533 1678 ntTSL 1 (best) BASIC21.06■□□□□ 0.96
IFT88Q13099 KCNN1-204ENST00000615435 1691 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC21.06■□□□□ 0.96
IFT88Q13099 SLC6A11-202ENST00000454147 2794 ntTSL 1 (best) BASIC21.06■□□□□ 0.96
IFT88Q13099 PTPA-223ENST00000452489 2526 ntTSL 1 (best) BASIC21.06■□□□□ 0.96
IFT88Q13099 ERLEC1-203ENST00000405123 1756 ntTSL 5 BASIC21.06■□□□□ 0.96
IFT88Q13099 TLK2-202ENST00000343388 3227 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC21.06■□□□□ 0.96
IFT88Q13099 DPP10-AS1-201ENST00000432658 730 ntTSL 1 (best) BASIC21.06■□□□□ 0.96
IFT88Q13099 AC104564.3-201ENST00000582367 638 ntBASIC21.06■□□□□ 0.96
IFT88Q13099 AC092171.4-201ENST00000609130 632 ntBASIC21.06■□□□□ 0.96
IFT88Q13099 RTN4RL2-201ENST00000335099 2203 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.06■□□□□ 0.96
IFT88Q13099 PAIP1-201ENST00000306846 2782 ntTSL 1 (best) BASIC21.06■□□□□ 0.96
IFT88Q13099 FOXC1-201ENST00000380874 3926 ntAPPRIS P1 BASIC21.06■□□□□ 0.96
IFT88Q13099 SRCIN1-213ENST00000617146 7058 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.06■□□□□ 0.96
IFT88Q13099 RGMA-210ENST00000557301 1929 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC21.06■□□□□ 0.96
IFT88Q13099 AC018445.3-201ENST00000624177 1945 ntBASIC21.06■□□□□ 0.96
IFT88Q13099 MAP7D2-203ENST00000443379 2476 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC21.05■□□□□ 0.96
IFT88Q13099 C2CD2-202ENST00000380486 6345 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.05■□□□□ 0.96
IFT88Q13099 VRK2-201ENST00000340157 1888 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.05■□□□□ 0.96
IFT88Q13099 CDHR5-201ENST00000349570 2318 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.05■□□□□ 0.96
IFT88Q13099 ISCA1-203ENST00000375991 1958 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.05■□□□□ 0.96
IFT88Q13099 BACE2-202ENST00000330333 2993 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.05■□□□□ 0.96
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