Protein–RNA interactions for Protein: Q13029

PRDM2, PR domain zinc finger protein 2, humanhuman

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Length 1,718 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
PRDM2Q13029 POLDIP2-201ENST00000540200 2121 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC35.98■■■■□ 3.35
PRDM2Q13029 CEACAM3-202ENST00000357396 1316 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC35.97■■■■□ 3.35
PRDM2Q13029 FMR1-AS1-201ENST00000594922 2005 ntTSL 1 (best) BASIC35.97■■■■□ 3.35
PRDM2Q13029 SMIM19-201ENST00000414154 793 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC35.97■■■■□ 3.35
PRDM2Q13029 AC211429.1-201ENST00000415277 523 ntBASIC35.97■■■■□ 3.35
PRDM2Q13029 LY6E-205ENST00000519611 635 ntTSL 3 BASIC35.97■■■■□ 3.35
PRDM2Q13029 LY6E-212ENST00000522024 868 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC35.97■■■■□ 3.35
PRDM2Q13029 AC138028.2-201ENST00000440406 1539 ntTSL 2 BASIC35.97■■■■□ 3.35
PRDM2Q13029 TMEM53-205ENST00000372244 1472 ntTSL 2 BASIC35.97■■■■□ 3.35
PRDM2Q13029 SRR-201ENST00000344595 2728 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC35.97■■■■□ 3.35
PRDM2Q13029 CA7-201ENST00000338437 1555 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC35.97■■■■□ 3.35
PRDM2Q13029 USF2-203ENST00000379134 648 ntTSL 1 (best) BASIC35.97■■■■□ 3.35
PRDM2Q13029 AL109797.1-201ENST00000452501 835 ntTSL 2 BASIC35.97■■■■□ 3.35
PRDM2Q13029 SNX18-201ENST00000326277 2063 ntTSL 2 BASIC35.97■■■■□ 3.35
PRDM2Q13029 EPHX3-202ENST00000435261 1771 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC35.96■■■■□ 3.35
PRDM2Q13029 CREB1-205ENST00000430624 2005 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC35.96■■■■□ 3.35
PRDM2Q13029 AC091729.3-201ENST00000423008 1401 ntTSL 2 BASIC35.96■■■■□ 3.35
PRDM2Q13029 IQCD-203ENST00000546692 1872 ntTSL 5 BASIC35.96■■■■□ 3.35
PRDM2Q13029 ZFP91-CNTF-201ENST00000389919 2319 ntAPPRIS P5 TSL 2 BASIC35.96■■■■□ 3.35
PRDM2Q13029 NFE2L3P1-201ENST00000588207 1959 ntBASIC35.96■■■■□ 3.35
PRDM2Q13029 AGTRAP-203ENST00000376629 1100 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC35.96■■■■□ 3.35
PRDM2Q13029 MRPS26-201ENST00000380325 1127 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC35.96■■■■□ 3.35
PRDM2Q13029 COL11A2-204ENST00000395194 1194 ntTSL 1 (best) BASIC35.96■■■■□ 3.35
PRDM2Q13029 RCN1P1-201ENST00000400413 996 ntBASIC35.96■■■■□ 3.35
PRDM2Q13029 CCDC74B-204ENST00000409234 871 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC35.96■■■■□ 3.35
PRDM2Q13029 AC087499.1-201ENST00000418141 1075 ntBASIC35.96■■■■□ 3.35
PRDM2Q13029 SMIM1-201ENST00000444870 546 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC35.96■■■■□ 3.35
PRDM2Q13029 LINC00969-221ENST00000457233 1279 ntTSL 1 (best) BASIC35.96■■■■□ 3.35
PRDM2Q13029 AC226101.2-201ENST00000458252 747 ntTSL 2 BASIC35.96■■■■□ 3.35
PRDM2Q13029 JOSD2-202ENST00000595669 733 ntTSL 2 BASIC35.96■■■■□ 3.35
PRDM2Q13029 MTDHP1-201ENST00000605323 784 ntBASIC35.96■■■■□ 3.35
PRDM2Q13029 GTF2IRD2B-206ENST00000614064 573 ntTSL 1 (best) BASIC35.96■■■■□ 3.35
PRDM2Q13029 PRKAA1-202ENST00000354209 1918 ntTSL 1 (best) BASIC35.96■■■■□ 3.35
PRDM2Q13029 SNX21-212ENST00000491381 1607 ntTSL 1 (best) BASIC35.96■■■■□ 3.35
PRDM2Q13029 GADD45GIP1-201ENST00000316939 1782 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC35.95■■■■□ 3.35
PRDM2Q13029 NTAN1-201ENST00000287706 1204 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC35.95■■■■□ 3.35
PRDM2Q13029 TMEM72-203ENST00000544540 1018 ntTSL 1 (best) BASIC35.95■■■■□ 3.35
PRDM2Q13029 AC091551.1-201ENST00000590722 1228 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC35.95■■■■□ 3.35
PRDM2Q13029 C5orf58-204ENST00000521850 2113 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC35.95■■■■□ 3.35
PRDM2Q13029 BCL7B-206ENST00000455335 985 ntTSL 3 BASIC35.94■■■■□ 3.34
PRDM2Q13029 ARMC4P1-202ENST00000576034 643 ntTSL 2 BASIC35.94■■■■□ 3.34
PRDM2Q13029 DPF1-209ENST00000456296 1562 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC35.94■■■■□ 3.34
PRDM2Q13029 NIPAL4-202ENST00000435489 1600 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC35.94■■■■□ 3.34
PRDM2Q13029 PTS-201ENST00000280362 935 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC35.94■■■■□ 3.34
PRDM2Q13029 AC239809.2-201ENST00000415381 517 ntBASIC35.94■■■■□ 3.34
PRDM2Q13029 ABHD17AP6-201ENST00000458502 1044 ntBASIC35.94■■■■□ 3.34
PRDM2Q13029 TNFRSF18-204ENST00000486728 727 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC35.94■■■■□ 3.34
PRDM2Q13029 AP001972.3-201ENST00000530792 495 ntTSL 3 BASIC35.94■■■■□ 3.34
PRDM2Q13029 DUX4-203ENST00000565211 1710 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC35.94■■■■□ 3.34
PRDM2Q13029 ARMC10-204ENST00000425331 2443 ntTSL 2 BASIC35.94■■■■□ 3.34
PRDM2Q13029 AC013269.1-201ENST00000409259 1653 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC35.93■■■■□ 3.34
PRDM2Q13029 TISP43-206ENST00000623376 1653 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC35.93■■■■□ 3.34
PRDM2Q13029 MTFP1-201ENST00000266263 1370 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC35.93■■■■□ 3.34
PRDM2Q13029 MADCAM1-201ENST00000215637 1572 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC35.93■■■■□ 3.34
PRDM2Q13029 PARL-201ENST00000311101 1240 ntTSL 1 (best) BASIC35.93■■■■□ 3.34
PRDM2Q13029 TCTEX1D2-201ENST00000325318 673 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC35.93■■■■□ 3.34
PRDM2Q13029 LRRC3B-201ENST00000396641 1696 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC35.93■■■■□ 3.34
PRDM2Q13029 C14orf80-201ENST00000329886 1947 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC35.93■■■■□ 3.34
PRDM2Q13029 GSG1L-202ENST00000395724 1399 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC35.93■■■■□ 3.34
PRDM2Q13029 THAP4-204ENST00000407315 2367 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC35.93■■■■□ 3.34
PRDM2Q13029 SLC41A3-202ENST00000346785 1705 ntTSL 2 BASIC35.93■■■■□ 3.34
PRDM2Q13029 DDRGK1-201ENST00000354488 1306 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC35.92■■■■□ 3.34
PRDM2Q13029 HOXB2-201ENST00000330070 1562 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC35.92■■■■□ 3.34
PRDM2Q13029 SLC25A47-202ENST00000557052 1552 ntTSL 1 (best) BASIC35.92■■■■□ 3.34
PRDM2Q13029 ALDH5A1-204ENST00000491546 1699 ntTSL 5 BASIC35.92■■■■□ 3.34
PRDM2Q13029 PPCS-203ENST00000372561 1431 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC35.92■■■■□ 3.34
PRDM2Q13029 DGCR6-201ENST00000331444 1214 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC35.92■■■■□ 3.34
PRDM2Q13029 FOXN3-AS1-201ENST00000555562 1077 ntTSL 1 (best) BASIC35.92■■■■□ 3.34
PRDM2Q13029 COX4I1-202ENST00000561569 716 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC35.92■■■■□ 3.34
PRDM2Q13029 ANAPC11-223ENST00000612413 964 ntTSL 3 BASIC35.92■■■■□ 3.34
PRDM2Q13029 B4GALNT1-202ENST00000418555 1861 ntTSL 2 BASIC35.92■■■■□ 3.34
PRDM2Q13029 C1orf122-202ENST00000373043 2229 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC35.92■■■■□ 3.34
PRDM2Q13029 FAM21EP-202ENST00000456967 2177 ntTSL 2 BASIC35.92■■■■□ 3.34
PRDM2Q13029 HOXA4-202ENST00000428284 1595 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC35.92■■■■□ 3.34
PRDM2Q13029 CUTC-202ENST00000370476 1346 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC35.92■■■■□ 3.34
PRDM2Q13029 TSPAN3-207ENST00000559494 1326 ntTSL 5 BASIC35.92■■■■□ 3.34
PRDM2Q13029 DBNL-207ENST00000440166 1415 ntTSL 2 BASIC35.92■■■■□ 3.34
PRDM2Q13029 COX7A2L-201ENST00000234301 1112 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC35.91■■■■□ 3.34
PRDM2Q13029 C16orf90-202ENST00000437192 907 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC35.91■■■■□ 3.34
PRDM2Q13029 BX322234.1-201ENST00000444188 980 ntTSL 3 BASIC35.91■■■■□ 3.34
PRDM2Q13029 CBFB-203ENST00000561924 584 ntTSL 5 BASIC35.91■■■■□ 3.34
PRDM2Q13029 PDK3-201ENST00000379162 1809 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC35.91■■■■□ 3.34
PRDM2Q13029 KCNQ4-204ENST00000509682 1926 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC35.91■■■■□ 3.34
PRDM2Q13029 SPHK2-213ENST00000601712 1394 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC35.91■■■■□ 3.34
PRDM2Q13029 PTGER3-203ENST00000354608 1470 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC35.91■■■■□ 3.34
PRDM2Q13029 MARC2-201ENST00000359316 1335 ntTSL 1 (best) BASIC35.91■■■■□ 3.34
PRDM2Q13029 MFSD7-201ENST00000322224 2123 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC35.91■■■■□ 3.34
PRDM2Q13029 HAUS1-201ENST00000282058 1125 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC35.91■■■■□ 3.34
PRDM2Q13029 AC008105.2-201ENST00000420431 579 ntTSL 4 BASIC35.91■■■■□ 3.34
PRDM2Q13029 SEC23A-AS1-201ENST00000557350 500 ntTSL 3 BASIC35.91■■■■□ 3.34
PRDM2Q13029 FLT3LG-211ENST00000600429 984 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC35.91■■■■□ 3.34
PRDM2Q13029 PNRC1-201ENST00000336032 2065 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC35.91■■■■□ 3.34
PRDM2Q13029 DYNC1I1-211ENST00000537881 2146 ntTSL 5 BASIC35.9■■■■□ 3.34
PRDM2Q13029 TMEM198B-205ENST00000487582 1581 ntTSL 1 (best) BASIC35.9■■■■□ 3.34
PRDM2Q13029 LEF1-203ENST00000438313 1488 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC35.9■■■■□ 3.34
PRDM2Q13029 GCFC2-207ENST00000470503 1066 ntTSL 1 (best) BASIC35.9■■■■□ 3.34
PRDM2Q13029 KRT18P21-201ENST00000515767 1272 ntBASIC35.9■■■■□ 3.34
PRDM2Q13029 MOK-228ENST00000523231 1114 ntTSL 1 (best) BASIC35.9■■■■□ 3.34
PRDM2Q13029 AC073896.1-201ENST00000549318 937 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC35.9■■■■□ 3.34
PRDM2Q13029 WT1-211ENST00000639907 1545 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC35.9■■■■□ 3.34
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