Protein–RNA interactions for Protein: Q12981

BNIP1, Vesicle transport protein SEC20, humanhuman

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Length 228 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
BNIP1Q12981 CNOT11-201ENST00000289382 2599 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.3■□□□□ 0.84
BNIP1Q12981 AC026471.1-201ENST00000564629 3026 ntBASIC20.29■□□□□ 0.84
BNIP1Q12981 SNX4-201ENST00000251775 2513 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.29■□□□□ 0.84
BNIP1Q12981 RHOT2-201ENST00000315082 2539 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.29■□□□□ 0.84
BNIP1Q12981 FOLH1-203ENST00000343844 2258 ntTSL 2 BASIC20.29■□□□□ 0.84
BNIP1Q12981 RND1-201ENST00000309739 1681 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.29■□□□□ 0.84
BNIP1Q12981 KLHDC4-204ENST00000353170 1663 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.29■□□□□ 0.84
BNIP1Q12981 RTKN-201ENST00000233330 2220 ntTSL 1 (best) BASIC20.29■□□□□ 0.84
BNIP1Q12981 CACNG6-203ENST00000352529 1635 ntTSL 5 BASIC20.29■□□□□ 0.84
BNIP1Q12981 AC009102.2-201ENST00000606772 1639 ntBASIC20.29■□□□□ 0.84
BNIP1Q12981 PSMG4-207ENST00000451246 824 ntTSL 3 BASIC20.29■□□□□ 0.84
BNIP1Q12981 EIF3J-203ENST00000535391 925 ntTSL 2 BASIC20.29■□□□□ 0.84
BNIP1Q12981 CLN8-208ENST00000635751 1807 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.29■□□□□ 0.84
BNIP1Q12981 ACAP3-201ENST00000353662 2280 ntTSL 1 (best) BASIC20.29■□□□□ 0.84
BNIP1Q12981 NRN1-203ENST00000616243 1556 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC20.29■□□□□ 0.84
BNIP1Q12981 NANOS2-201ENST00000341294 1657 ntAPPRIS P1 BASIC20.29■□□□□ 0.84
BNIP1Q12981 MPZL1-201ENST00000359523 5010 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.29■□□□□ 0.84
BNIP1Q12981 RNF126P1-201ENST00000567452 1320 ntBASIC20.28■□□□□ 0.84
BNIP1Q12981 DLEU7-201ENST00000400393 2092 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.28■□□□□ 0.84
BNIP1Q12981 RTBDN-207ENST00000589272 2076 ntTSL 2 BASIC20.28■□□□□ 0.84
BNIP1Q12981 MAPK9-208ENST00000455781 4336 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC20.28■□□□□ 0.84
BNIP1Q12981 SCUBE1-208ENST00000615096 1119 ntTSL 2 BASIC20.28■□□□□ 0.84
BNIP1Q12981 WT1-210ENST00000639563 1494 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.28■□□□□ 0.84
BNIP1Q12981 FAM76B-204ENST00000536839 2546 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC20.28■□□□□ 0.84
BNIP1Q12981 COMMD5-207ENST00000543949 1571 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC20.28■□□□□ 0.84
BNIP1Q12981 GNB1L-202ENST00000403325 1699 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.28■□□□□ 0.84
BNIP1Q12981 MTCL1-201ENST00000306329 5718 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.28■□□□□ 0.84
BNIP1Q12981 RAB11FIP4-201ENST00000394744 1968 ntTSL 2 BASIC20.28■□□□□ 0.84
BNIP1Q12981 ACHE-207ENST00000428317 2159 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.28■□□□□ 0.84
BNIP1Q12981 NKX2-1-203ENST00000518149 2583 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.28■□□□□ 0.84
BNIP1Q12981 ZFAND2B-201ENST00000289528 1314 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.27■□□□□ 0.84
BNIP1Q12981 EGFL8-220ENST00000395512 1312 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.27■□□□□ 0.84
BNIP1Q12981 HOXA11-AS-204ENST00000522674 1549 ntTSL 1 (best) BASIC20.27■□□□□ 0.84
BNIP1Q12981 PCDHGB3-202ENST00000618934 2445 ntAPPRIS P1 BASIC20.27■□□□□ 0.84
BNIP1Q12981 YTHDC2-207ENST00000515883 2629 ntTSL 1 (best) BASIC20.27■□□□□ 0.84
BNIP1Q12981 DIP2A-203ENST00000435722 2760 ntTSL 2 BASIC20.27■□□□□ 0.84
BNIP1Q12981 HAGHL-212ENST00000564537 1667 ntTSL 2 BASIC20.27■□□□□ 0.84
BNIP1Q12981 TTYH3-201ENST00000258796 4840 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.27■□□□□ 0.84
BNIP1Q12981 FKBP1B-202ENST00000380991 1010 ntTSL 1 (best) BASIC20.27■□□□□ 0.84
BNIP1Q12981 ACYP1-205ENST00000555463 789 ntTSL 2 BASIC20.27■□□□□ 0.84
BNIP1Q12981 AL158211.5-201ENST00000623583 2518 ntBASIC20.27■□□□□ 0.84
BNIP1Q12981 SMPD1-201ENST00000342245 2452 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC20.27■□□□□ 0.83
BNIP1Q12981 FGF22-201ENST00000215530 1311 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.27■□□□□ 0.83
BNIP1Q12981 TINAGL1-201ENST00000271064 2187 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.27■□□□□ 0.83
BNIP1Q12981 DMPK-203ENST00000354227 1982 ntTSL 2 BASIC20.26■□□□□ 0.83
BNIP1Q12981 KREMEN2-202ENST00000319500 1882 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.26■□□□□ 0.83
BNIP1Q12981 TBXA2R-201ENST00000375190 2608 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.26■□□□□ 0.83
BNIP1Q12981 S1PR5-204ENST00000617721 1698 ntTSL 5 BASIC20.26■□□□□ 0.83
BNIP1Q12981 UNC5D-204ENST00000420357 2966 ntTSL 5 BASIC20.26■□□□□ 0.83
BNIP1Q12981 MIS18A-201ENST00000290130 1575 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.26■□□□□ 0.83
BNIP1Q12981 EI24-201ENST00000278903 2455 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.26■□□□□ 0.83
BNIP1Q12981 TPCN2-201ENST00000294309 2931 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.26■□□□□ 0.83
BNIP1Q12981 ACOT4-201ENST00000326303 2362 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.26■□□□□ 0.83
BNIP1Q12981 SPOCK2-209ENST00000536168 1824 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.26■□□□□ 0.83
BNIP1Q12981 SUSD3-202ENST00000375472 1195 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.26■□□□□ 0.83
BNIP1Q12981 AC139795.1-202ENST00000500444 432 ntBASIC20.26■□□□□ 0.83
BNIP1Q12981 LETM1P2-201ENST00000597330 2178 ntBASIC20.26■□□□□ 0.83
BNIP1Q12981 TPM1-204ENST00000334895 1637 ntTSL 1 (best) BASIC20.26■□□□□ 0.83
BNIP1Q12981 VGF-203ENST00000611537 1622 ntTSL 5 BASIC20.26■□□□□ 0.83
BNIP1Q12981 LARGE2-201ENST00000325468 2522 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.26■□□□□ 0.83
BNIP1Q12981 MRM1-204ENST00000614766 1857 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.26■□□□□ 0.83
BNIP1Q12981 SHANK1-203ENST00000391813 4785 ntTSL 1 (best) BASIC20.26■□□□□ 0.83
BNIP1Q12981 MAPK9-206ENST00000425491 2266 ntTSL 5 BASIC20.25■□□□□ 0.83
BNIP1Q12981 NTN5-201ENST00000270235 1836 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.25■□□□□ 0.83
BNIP1Q12981 LRCH4-211ENST00000619071 2098 ntTSL 5 BASIC20.25■□□□□ 0.83
BNIP1Q12981 METTL21A-210ENST00000458426 1366 ntTSL 1 (best) BASIC20.25■□□□□ 0.83
BNIP1Q12981 LDHD-202ENST00000450168 1966 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.25■□□□□ 0.83
BNIP1Q12981 MLX-201ENST00000246912 2586 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.25■□□□□ 0.83
BNIP1Q12981 TDRKH-203ENST00000368824 2824 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.25■□□□□ 0.83
BNIP1Q12981 KIF22-201ENST00000160827 2113 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.25■□□□□ 0.83
BNIP1Q12981 ERFE-207ENST00000546354 1065 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.25■□□□□ 0.83
BNIP1Q12981 LPAR2-202ENST00000542587 2546 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.25■□□□□ 0.83
BNIP1Q12981 MARK2-201ENST00000350490 2903 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.25■□□□□ 0.83
BNIP1Q12981 TMEM53-202ENST00000372237 2310 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.25■□□□□ 0.83
BNIP1Q12981 CLIP3-206ENST00000593074 2080 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.25■□□□□ 0.83
BNIP1Q12981 HSPB2-201ENST00000304298 1335 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.25■□□□□ 0.83
BNIP1Q12981 PGR-201ENST00000263463 2496 ntTSL 1 (best) BASIC20.25■□□□□ 0.83
BNIP1Q12981 FP700111.2-201ENST00000619190 1892 ntBASIC20.24■□□□□ 0.83
BNIP1Q12981 POLD2-218ENST00000610533 1619 ntTSL 1 (best) BASIC20.24■□□□□ 0.83
BNIP1Q12981 MIDN-206ENST00000591446 3243 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.24■□□□□ 0.83
BNIP1Q12981 SENP5-202ENST00000419026 973 ntTSL 3 BASIC20.24■□□□□ 0.83
BNIP1Q12981 ZNF428-201ENST00000300811 1412 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.24■□□□□ 0.83
BNIP1Q12981 UBL7-202ENST00000395081 1427 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.24■□□□□ 0.83
BNIP1Q12981 MESP2-201ENST00000341735 1552 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.24■□□□□ 0.83
BNIP1Q12981 BCR-202ENST00000359540 4708 ntTSL 1 (best) BASIC20.24■□□□□ 0.83
BNIP1Q12981 AL161756.1-202ENST00000359491 1717 ntTSL 1 (best) BASIC20.24■□□□□ 0.83
BNIP1Q12981 SLC1A6-210ENST00000600144 1735 ntTSL 1 (best) BASIC20.24■□□□□ 0.83
BNIP1Q12981 ANKRD53-204ENST00000457410 1671 ntTSL 5 BASIC20.23■□□□□ 0.83
BNIP1Q12981 KLF2-201ENST00000248071 2018 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.23■□□□□ 0.83
BNIP1Q12981 GATAD1-201ENST00000287957 3361 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.23■□□□□ 0.83
BNIP1Q12981 QPCT-201ENST00000338415 1739 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.23■□□□□ 0.83
BNIP1Q12981 ARRDC1-AS1-201ENST00000371417 1409 ntTSL 1 (best) BASIC20.23■□□□□ 0.83
BNIP1Q12981 CASP16P-202ENST00000575497 2161 ntTSL 2 BASIC20.23■□□□□ 0.83
BNIP1Q12981 UQCR11-202ENST00000589880 504 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC20.23■□□□□ 0.83
BNIP1Q12981 ANXA8-208ENST00000611843 2174 ntTSL 2 BASIC20.23■□□□□ 0.83
BNIP1Q12981 SAMD11-211ENST00000616125 2230 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.23■□□□□ 0.83
BNIP1Q12981 HTR1E-201ENST00000305344 2052 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.23■□□□□ 0.83
BNIP1Q12981 OXER1-201ENST00000378661 1781 ntAPPRIS P1 BASIC20.23■□□□□ 0.83
BNIP1Q12981 PFKFB4-202ENST00000383734 1491 ntTSL 1 (best) BASIC20.23■□□□□ 0.83
BNIP1Q12981 KCNH2-201ENST00000262186 4286 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.23■□□□□ 0.83
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