Protein–RNA interactions for Protein: Q12947

FOXF2, Forkhead box protein F2, humanhuman

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Length 444 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
FOXF2Q12947 TRAM2-AS1-204ENST00000606714 2453 ntTSL 2 BASIC18.44■□□□□ 0.54
FOXF2Q12947 DUSP18-205ENST00000404885 1306 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.44■□□□□ 0.54
FOXF2Q12947 FAH-202ENST00000407106 2152 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.44■□□□□ 0.54
FOXF2Q12947 PSMD7-201ENST00000219313 1670 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.44■□□□□ 0.54
FOXF2Q12947 ARX-201ENST00000379044 2876 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.44■□□□□ 0.54
FOXF2Q12947 SAC3D1-205ENST00000531072 1362 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.43■□□□□ 0.54
FOXF2Q12947 ECEL1P1-201ENST00000373592 1742 ntBASIC18.43■□□□□ 0.54
FOXF2Q12947 NR2F2-204ENST00000453270 1712 ntTSL 1 (best) BASIC18.43■□□□□ 0.54
FOXF2Q12947 SMUG1-202ENST00000337581 1571 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.43■□□□□ 0.54
FOXF2Q12947 KAT5-201ENST00000341318 2296 ntTSL 1 (best) BASIC18.43■□□□□ 0.54
FOXF2Q12947 PTOV1-212ENST00000599732 1577 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.43■□□□□ 0.54
FOXF2Q12947 BIN1-207ENST00000357970 2497 ntTSL 1 (best) BASIC18.43■□□□□ 0.54
FOXF2Q12947 PDE9A-212ENST00000398234 1783 ntTSL 1 (best) BASIC18.43■□□□□ 0.54
FOXF2Q12947 POU2F2-215ENST00000560398 1788 ntTSL 5 BASIC18.43■□□□□ 0.54
FOXF2Q12947 LSR-203ENST00000360798 1963 ntTSL 2 BASIC18.43■□□□□ 0.54
FOXF2Q12947 GGTLC1-201ENST00000278765 974 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.43■□□□□ 0.54
FOXF2Q12947 DNAJA4-210ENST00000489435 947 ntTSL 3 BASIC18.43■□□□□ 0.54
FOXF2Q12947 C17orf107-202ENST00000521575 1275 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.43■□□□□ 0.54
FOXF2Q12947 ZNF467-201ENST00000302017 2553 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.43■□□□□ 0.54
FOXF2Q12947 DNAJC25-201ENST00000313525 2268 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.43■□□□□ 0.54
FOXF2Q12947 RNF149-201ENST00000295317 2458 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.43■□□□□ 0.54
FOXF2Q12947 HTATSF1-201ENST00000218364 2775 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.42■□□□□ 0.54
FOXF2Q12947 PLSCR3-201ENST00000324822 1689 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.42■□□□□ 0.54
FOXF2Q12947 CAPZB-205ENST00000433834 1462 ntTSL 2 BASIC18.42■□□□□ 0.54
FOXF2Q12947 ZNF843-201ENST00000315678 2137 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC18.42■□□□□ 0.54
FOXF2Q12947 NAA20-202ENST00000334982 1260 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.42■□□□□ 0.54
FOXF2Q12947 SDHC-201ENST00000342751 1127 ntTSL 1 (best) BASIC18.42■□□□□ 0.54
FOXF2Q12947 GUK1-209ENST00000366730 937 ntAPPRIS P3 TSL 3 BASIC18.42■□□□□ 0.54
FOXF2Q12947 CBY3-201ENST00000376974 785 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.42■□□□□ 0.54
FOXF2Q12947 C2orf82-203ENST00000409533 561 ntAPPRIS P2 TSL 4 BASIC18.42■□□□□ 0.54
FOXF2Q12947 AL355472.2-201ENST00000422958 438 ntBASIC18.42■□□□□ 0.54
FOXF2Q12947 CD99P1-203ENST00000431582 602 ntTSL 4 BASIC18.42■□□□□ 0.54
FOXF2Q12947 ELOVL2-AS1-201ENST00000456190 737 ntTSL 3 BASIC18.42■□□□□ 0.54
FOXF2Q12947 CASP6-205ENST00000505486 538 ntTSL 4 BASIC18.42■□□□□ 0.54
FOXF2Q12947 RNA5SP413-201ENST00000516373 109 ntBASIC18.42■□□□□ 0.54
FOXF2Q12947 TMEM191A-211ENST00000637163 1067 ntBASIC18.42■□□□□ 0.54
FOXF2Q12947 WDR88-201ENST00000355868 1718 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC18.42■□□□□ 0.54
FOXF2Q12947 ASRGL1-201ENST00000301776 2182 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.42■□□□□ 0.54
FOXF2Q12947 SLC25A39-212ENST00000590194 1542 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC18.42■□□□□ 0.54
FOXF2Q12947 ARMC6-201ENST00000269932 2412 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.42■□□□□ 0.54
FOXF2Q12947 EIPR1-206ENST00000443925 1771 ntTSL 3 BASIC18.42■□□□□ 0.54
FOXF2Q12947 AFDN-AS1-201ENST00000359760 2238 ntTSL 1 (best) BASIC18.42■□□□□ 0.54
FOXF2Q12947 BEST2-204ENST00000553030 2000 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.42■□□□□ 0.54
FOXF2Q12947 PPCS-203ENST00000372561 1431 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.41■□□□□ 0.54
FOXF2Q12947 SEPT8-207ENST00000378719 2889 ntTSL 1 (best) BASIC18.41■□□□□ 0.54
FOXF2Q12947 CHRNA10-204ENST00000534359 1474 ntTSL 1 (best) BASIC18.41■□□□□ 0.54
FOXF2Q12947 C8orf82-202ENST00000524821 2476 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.41■□□□□ 0.54
FOXF2Q12947 GFRA3-201ENST00000274721 2039 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.41■□□□□ 0.54
FOXF2Q12947 HPCAL1-201ENST00000307845 1751 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.41■□□□□ 0.54
FOXF2Q12947 IPO13-201ENST00000372339 1201 ntTSL 2 BASIC18.41■□□□□ 0.54
FOXF2Q12947 BET1L-207ENST00000529614 560 ntTSL 5 BASIC18.41■□□□□ 0.54
FOXF2Q12947 PLEKHJ1-205ENST00000587394 937 ntTSL 2 BASIC18.41■□□□□ 0.54
FOXF2Q12947 PSME3-210ENST00000590720 998 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.41■□□□□ 0.54
FOXF2Q12947 AC083880.1-201ENST00000608266 535 ntBASIC18.41■□□□□ 0.54
FOXF2Q12947 RFXAP-201ENST00000255476 2304 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.41■□□□□ 0.54
FOXF2Q12947 ADCK2-203ENST00000476491 2092 ntTSL 1 (best) BASIC18.41■□□□□ 0.54
FOXF2Q12947 AUH-202ENST00000375731 1577 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.41■□□□□ 0.54
FOXF2Q12947 GNB4-204ENST00000468623 1360 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.41■□□□□ 0.54
FOXF2Q12947 DUSP2-201ENST00000288943 1688 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.41■□□□□ 0.54
FOXF2Q12947 AC133555.3-201ENST00000549950 1693 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC18.41■□□□□ 0.54
FOXF2Q12947 AC106782.1-201ENST00000550538 1693 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC18.41■□□□□ 0.54
FOXF2Q12947 CCNL1-203ENST00000461804 1998 ntTSL 2 BASIC18.41■□□□□ 0.54
FOXF2Q12947 SH3BP2-204ENST00000452765 2265 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.4■□□□□ 0.54
FOXF2Q12947 MAGIX-207ENST00000615915 1757 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC18.4■□□□□ 0.54
FOXF2Q12947 TM9SF3-201ENST00000371142 6141 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.4■□□□□ 0.54
FOXF2Q12947 PGRMC2-201ENST00000296425 2767 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.4■□□□□ 0.54
FOXF2Q12947 CENPB-201ENST00000379751 2840 ntAPPRIS P1 BASIC18.4■□□□□ 0.54
FOXF2Q12947 HACD1-202ENST00000361271 2237 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.4■□□□□ 0.54
FOXF2Q12947 GUK1-201ENST00000312726 1084 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.4■□□□□ 0.54
FOXF2Q12947 FAM72A-203ENST00000367129 676 ntTSL 3 BASIC18.4■□□□□ 0.54
FOXF2Q12947 FAM72A-205ENST00000468509 629 ntTSL 5 BASIC18.4■□□□□ 0.54
FOXF2Q12947 CDV3P1-201ENST00000471403 739 ntBASIC18.4■□□□□ 0.54
FOXF2Q12947 RHEB-204ENST00000472642 900 ntTSL 3 BASIC18.4■□□□□ 0.54
FOXF2Q12947 ZNF324-202ENST00000535298 1006 ntTSL 5 BASIC18.4■□□□□ 0.54
FOXF2Q12947 LIMD2-206ENST00000578993 602 ntTSL 3 BASIC18.4■□□□□ 0.54
FOXF2Q12947 FAM21FP-204ENST00000608637 956 ntBASIC18.4■□□□□ 0.54
FOXF2Q12947 OGFR-204ENST00000621591 1194 ntTSL 5 BASIC18.4■□□□□ 0.54
FOXF2Q12947 AL160396.2-202ENST00000636692 566 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.4■□□□□ 0.54
FOXF2Q12947 AC079834.2-201ENST00000609776 1949 ntBASIC18.4■□□□□ 0.54
FOXF2Q12947 GOLGA2P6-201ENST00000340929 2049 ntBASIC18.4■□□□□ 0.54
FOXF2Q12947 HAND1-201ENST00000231121 1738 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.4■□□□□ 0.54
FOXF2Q12947 SLC35A3-204ENST00000427993 2062 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.4■□□□□ 0.54
FOXF2Q12947 PIP5KL1-202ENST00000388747 2198 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.4■□□□□ 0.54
FOXF2Q12947 FAM19A5-202ENST00000358295 2638 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.39■□□□□ 0.54
FOXF2Q12947 ZIM2-201ENST00000593711 2083 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.39■□□□□ 0.53
FOXF2Q12947 LIPT2-201ENST00000310109 1018 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.39■□□□□ 0.53
FOXF2Q12947 LINC00471-201ENST00000313064 1282 ntTSL 1 (best) BASIC18.39■□□□□ 0.53
FOXF2Q12947 NUDT8-202ENST00000376693 728 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC18.39■□□□□ 0.53
FOXF2Q12947 PLPP5-203ENST00000424479 2130 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.39■□□□□ 0.53
FOXF2Q12947 DUSP5P2-201ENST00000426873 1033 ntBASIC18.39■□□□□ 0.53
FOXF2Q12947 AKAIN1-201ENST00000434239 575 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.39■□□□□ 0.53
FOXF2Q12947 OR2A1-AS1-201ENST00000462305 773 ntBASIC18.39■□□□□ 0.53
FOXF2Q12947 AC004889.1-204ENST00000474656 773 ntTSL 3 BASIC18.39■□□□□ 0.53
FOXF2Q12947 AC097658.1-201ENST00000475555 843 ntBASIC18.39■□□□□ 0.53
FOXF2Q12947 CDKN2A-205ENST00000479692 544 ntTSL 5 BASIC18.39■□□□□ 0.53
FOXF2Q12947 AC091874.3-201ENST00000512672 1195 ntBASIC18.39■□□□□ 0.53
FOXF2Q12947 AC016588.1-201ENST00000591533 542 ntTSL 4 BASIC18.39■□□□□ 0.53
FOXF2Q12947 TARDBP-228ENST00000629725 1031 ntTSL 5 BASIC18.39■□□□□ 0.53
FOXF2Q12947 MYC-209ENST00000641252 345 ntBASIC18.39■□□□□ 0.53
FOXF2Q12947 SMARCD2-201ENST00000225742 1800 ntTSL 1 (best) BASIC18.39■□□□□ 0.53
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