Protein–RNA interactions for Protein: Q12872

SFSWAP, Splicing factor, suppressor of white-apricot homolog, humanhuman

Known RBP Predictions only

Length 951 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SFSWAPQ12872 NKX6-3-202ENST00000524115 1683 ntTSL 2 BASIC21.12■□□□□ 0.97
SFSWAPQ12872 SLC39A14-202ENST00000289952 2137 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC21.11■□□□□ 0.97
SFSWAPQ12872 COMMD5-207ENST00000543949 1571 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC21.11■□□□□ 0.97
SFSWAPQ12872 MMP23B-201ENST00000356026 1326 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.11■□□□□ 0.97
SFSWAPQ12872 BIN1-209ENST00000393040 2293 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.11■□□□□ 0.97
SFSWAPQ12872 UHRF1BP1L-202ENST00000356828 2023 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.11■□□□□ 0.97
SFSWAPQ12872 CCM2-206ENST00000474617 1532 ntTSL 5 BASIC21.11■□□□□ 0.97
SFSWAPQ12872 NKX2-4-201ENST00000351817 2238 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.11■□□□□ 0.97
SFSWAPQ12872 PPP1CA-202ENST00000358239 1054 ntTSL 2 BASIC21.11■□□□□ 0.97
SFSWAPQ12872 COA6-202ENST00000366613 641 ntTSL 1 (best) BASIC21.11■□□□□ 0.97
SFSWAPQ12872 AL121761.1-202ENST00000412571 415 ntTSL 2 BASIC21.11■□□□□ 0.97
SFSWAPQ12872 AC106738.2-202ENST00000558156 533 ntTSL 4 BASIC21.11■□□□□ 0.97
SFSWAPQ12872 WT1-204ENST00000448076 2114 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC21.11■□□□□ 0.97
SFSWAPQ12872 LRRC3B-201ENST00000396641 1696 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.11■□□□□ 0.97
SFSWAPQ12872 CTDP1-208ENST00000613122 5866 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.11■□□□□ 0.97
SFSWAPQ12872 CRHR1-202ENST00000314537 2535 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.11■□□□□ 0.97
SFSWAPQ12872 RBM17P2-201ENST00000616397 1405 ntBASIC21.11■□□□□ 0.97
SFSWAPQ12872 GPSM1-204ENST00000429455 2057 ntTSL 3 BASIC21.11■□□□□ 0.97
SFSWAPQ12872 AKT1S1-206ENST00000391834 1849 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.11■□□□□ 0.97
SFSWAPQ12872 MREG-201ENST00000263268 1314 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.1■□□□□ 0.97
SFSWAPQ12872 DUSP18-205ENST00000404885 1306 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.1■□□□□ 0.97
SFSWAPQ12872 RNF180-201ENST00000296615 1727 ntTSL 1 (best) BASIC21.1■□□□□ 0.97
SFSWAPQ12872 PEX10-204ENST00000507596 1941 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC21.1■□□□□ 0.97
SFSWAPQ12872 AP006623.1-201ENST00000506172 2061 ntTSL 5 BASIC21.1■□□□□ 0.97
SFSWAPQ12872 XXYLT1-202ENST00000356740 564 ntTSL 2 BASIC21.1■□□□□ 0.97
SFSWAPQ12872 CUEDC2-201ENST00000369937 1191 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.1■□□□□ 0.97
SFSWAPQ12872 UQCRFS1P1-201ENST00000435169 820 ntBASIC21.1■□□□□ 0.97
SFSWAPQ12872 TRAPPC5-203ENST00000595985 411 ntTSL 3 BASIC21.1■□□□□ 0.97
SFSWAPQ12872 AP2S1-207ENST00000599990 829 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC21.1■□□□□ 0.97
SFSWAPQ12872 MTAP-204ENST00000460874 1434 ntTSL 2 BASIC21.1■□□□□ 0.97
SFSWAPQ12872 PKM-201ENST00000319622 2717 ntAPPRIS P5 TSL 2 BASIC21.1■□□□□ 0.97
SFSWAPQ12872 AC003102.1-202ENST00000563394 1796 ntBASIC21.1■□□□□ 0.97
SFSWAPQ12872 AC093323.1-201ENST00000307533 2311 ntTSL 1 (best) BASIC21.1■□□□□ 0.97
SFSWAPQ12872 HAS1-202ENST00000540069 2110 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.1■□□□□ 0.97
SFSWAPQ12872 RWDD4-206ENST00000512740 1393 ntTSL 5 BASIC21.1■□□□□ 0.97
SFSWAPQ12872 DLL3-202ENST00000356433 2055 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.09■□□□□ 0.97
SFSWAPQ12872 FAM120A-201ENST00000277165 5118 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.09■□□□□ 0.97
SFSWAPQ12872 GNS-207ENST00000542058 2020 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC21.09■□□□□ 0.97
SFSWAPQ12872 ZBED3-201ENST00000255198 6172 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.09■□□□□ 0.97
SFSWAPQ12872 NARF-202ENST00000345415 1487 ntTSL 1 (best) BASIC21.09■□□□□ 0.97
SFSWAPQ12872 STARD10-201ENST00000334805 1963 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.09■□□□□ 0.97
SFSWAPQ12872 KCNIP2-207ENST00000358038 2489 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC21.09■□□□□ 0.97
SFSWAPQ12872 TRIM35-203ENST00000521253 1215 ntTSL 1 (best) BASIC21.09■□□□□ 0.97
SFSWAPQ12872 AP000785.1-201ENST00000527314 613 ntTSL 4 BASIC21.09■□□□□ 0.97
SFSWAPQ12872 PSMC3IP-208ENST00000590760 664 ntTSL 1 (best) BASIC21.09■□□□□ 0.97
SFSWAPQ12872 ETHE1-205ENST00000600651 1052 ntTSL 1 (best) BASIC21.09■□□□□ 0.97
SFSWAPQ12872 MAPKAPK5-AS1-201ENST00000428207 2290 ntTSL 1 (best) BASIC21.09■□□□□ 0.97
SFSWAPQ12872 CAPN12-201ENST00000328867 2762 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.09■□□□□ 0.97
SFSWAPQ12872 MMEL1-206ENST00000502556 1943 ntTSL 1 (best) BASIC21.09■□□□□ 0.97
SFSWAPQ12872 IRX5-201ENST00000320990 2061 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC21.09■□□□□ 0.97
SFSWAPQ12872 SERTAD3-201ENST00000322354 1734 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.09■□□□□ 0.97
SFSWAPQ12872 AKT2-234ENST00000579047 2029 ntTSL 1 (best) BASIC21.09■□□□□ 0.97
SFSWAPQ12872 GSG1L-202ENST00000395724 1399 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.09■□□□□ 0.97
SFSWAPQ12872 C1orf174-201ENST00000361605 1666 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.09■□□□□ 0.97
SFSWAPQ12872 C12orf42-208ENST00000548883 1336 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.08■□□□□ 0.97
SFSWAPQ12872 RNF39-201ENST00000244360 2206 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.08■□□□□ 0.97
SFSWAPQ12872 TRAPPC5-201ENST00000317378 790 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.08■□□□□ 0.97
SFSWAPQ12872 NAA20-202ENST00000334982 1260 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.08■□□□□ 0.97
SFSWAPQ12872 AC025754.1-201ENST00000507566 407 ntTSL 3 BASIC21.08■□□□□ 0.97
SFSWAPQ12872 CD44-222ENST00000526025 1052 ntTSL 2 BASIC21.08■□□□□ 0.97
SFSWAPQ12872 FAHD1-202ENST00000382668 1845 ntTSL 1 (best) BASIC21.08■□□□□ 0.96
SFSWAPQ12872 FGFR1-241ENST00000619564 5482 ntTSL 5 BASIC21.08■□□□□ 0.96
SFSWAPQ12872 CXCL16-203ENST00000574412 1668 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.08■□□□□ 0.96
SFSWAPQ12872 AC090360.1-201ENST00000569722 2218 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC21.08■□□□□ 0.96
SFSWAPQ12872 CITED2-202ENST00000536159 1797 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC21.08■□□□□ 0.96
SFSWAPQ12872 CITED2-203ENST00000537332 1780 ntTSL 3 BASIC21.08■□□□□ 0.96
SFSWAPQ12872 TSPAN3-202ENST00000346495 1647 ntTSL 2 BASIC21.07■□□□□ 0.96
SFSWAPQ12872 NAA20-203ENST00000398602 1604 ntTSL 5 BASIC21.07■□□□□ 0.96
SFSWAPQ12872 TMEM200B-201ENST00000420504 2553 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.07■□□□□ 0.96
SFSWAPQ12872 ARHGEF4-202ENST00000355771 1872 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.07■□□□□ 0.96
SFSWAPQ12872 LINC02175-201ENST00000571219 1875 ntTSL 1 (best) BASIC21.07■□□□□ 0.96
SFSWAPQ12872 FGFR1-214ENST00000447712 5900 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.07■□□□□ 0.96
SFSWAPQ12872 DNAJB11-202ENST00000439351 2398 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.07■□□□□ 0.96
SFSWAPQ12872 KCNN4-201ENST00000262888 2240 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.07■□□□□ 0.96
SFSWAPQ12872 RNPS1-201ENST00000301730 1276 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.07■□□□□ 0.96
SFSWAPQ12872 MIPEPP3-201ENST00000412105 444 ntBASIC21.07■□□□□ 0.96
SFSWAPQ12872 CT47A12-201ENST00000419982 1165 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.07■□□□□ 0.96
SFSWAPQ12872 AC099522.1-201ENST00000505955 881 ntTSL 3 BASIC21.07■□□□□ 0.96
SFSWAPQ12872 C17orf107-202ENST00000521575 1275 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.07■□□□□ 0.96
SFSWAPQ12872 AC138028.5-201ENST00000566114 558 ntTSL 5 BASIC21.07■□□□□ 0.96
SFSWAPQ12872 FGF8-207ENST00000618991 856 ntTSL 3 BASIC21.07■□□□□ 0.96
SFSWAPQ12872 RALGPS1-207ENST00000394022 1672 ntTSL 2 BASIC21.07■□□□□ 0.96
SFSWAPQ12872 ABHD6-205ENST00000478253 2482 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.07■□□□□ 0.96
SFSWAPQ12872 HEXB-201ENST00000261416 1901 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.07■□□□□ 0.96
SFSWAPQ12872 SH2D5-202ENST00000444387 1934 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.07■□□□□ 0.96
SFSWAPQ12872 CACNA1B-201ENST00000277549 7158 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.07■□□□□ 0.96
SFSWAPQ12872 CACNA1B-202ENST00000277551 7158 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.07■□□□□ 0.96
SFSWAPQ12872 WEE1-202ENST00000450114 2799 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.06■□□□□ 0.96
SFSWAPQ12872 ST8SIA6-201ENST00000377602 2276 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.06■□□□□ 0.96
SFSWAPQ12872 CAMKK2-208ENST00000412367 2006 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.06■□□□□ 0.96
SFSWAPQ12872 PFKFB3-216ENST00000625260 1752 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC21.06■□□□□ 0.96
SFSWAPQ12872 KIAA0895-204ENST00000415803 2865 ntTSL 1 (best) BASIC21.06■□□□□ 0.96
SFSWAPQ12872 SH3GLB2-203ENST00000372564 2982 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.06■□□□□ 0.96
SFSWAPQ12872 AC245052.3-201ENST00000450182 901 ntBASIC21.06■□□□□ 0.96
SFSWAPQ12872 PLLP-204ENST00000569059 665 ntTSL 3 BASIC21.06■□□□□ 0.96
SFSWAPQ12872 AC092118.2-201ENST00000613495 667 ntBASIC21.06■□□□□ 0.96
SFSWAPQ12872 AC244517.4-202ENST00000624089 484 ntTSL 3 BASIC21.06■□□□□ 0.96
SFSWAPQ12872 TMEM191A-211ENST00000637163 1067 ntBASIC21.06■□□□□ 0.96
SFSWAPQ12872 LTB4R-201ENST00000345363 1616 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.06■□□□□ 0.96
SFSWAPQ12872 DUSP5-201ENST00000369583 2557 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.06■□□□□ 0.96
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