Protein–RNA interactions for Protein: Q12860

CNTN1, Contactin-1, humanhuman

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CNTN1Q12860 PTPRJ-208ENST00000615445 4773 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.98■□□□□ 0.95
CNTN1Q12860 TM7SF2-201ENST00000279263 1722 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.98■□□□□ 0.95
CNTN1Q12860 UBE2I-205ENST00000402301 1708 ntTSL 1 (best) BASIC20.98■□□□□ 0.95
CNTN1Q12860 TMEM25-205ENST00000411589 2442 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC20.98■□□□□ 0.95
CNTN1Q12860 CHST7-201ENST00000276055 2289 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.98■□□□□ 0.95
CNTN1Q12860 C19orf68-201ENST00000328759 2277 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.98■□□□□ 0.95
CNTN1Q12860 ME2-206ENST00000638410 2289 ntTSL 5 BASIC20.98■□□□□ 0.95
CNTN1Q12860 ME2-210ENST00000639255 2262 ntTSL 5 BASIC20.98■□□□□ 0.95
CNTN1Q12860 TPST1-201ENST00000304842 2116 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.98■□□□□ 0.95
CNTN1Q12860 SPHK1-201ENST00000323374 2138 ntTSL 1 (best) BASIC20.98■□□□□ 0.95
CNTN1Q12860 MIPEPP3-201ENST00000412105 444 ntBASIC20.98■□□□□ 0.95
CNTN1Q12860 AL512625.2-201ENST00000417533 625 ntBASIC20.98■□□□□ 0.95
CNTN1Q12860 AL162412.1-201ENST00000567129 965 ntBASIC20.98■□□□□ 0.95
CNTN1Q12860 PSMC3IP-208ENST00000590760 664 ntTSL 1 (best) BASIC20.98■□□□□ 0.95
CNTN1Q12860 ALDH3A2-224ENST00000626500 995 ntTSL 5 BASIC20.98■□□□□ 0.95
CNTN1Q12860 GJB6-203ENST00000400065 1805 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.98■□□□□ 0.95
CNTN1Q12860 RNF39-201ENST00000244360 2206 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.98■□□□□ 0.95
CNTN1Q12860 CLN8-213ENST00000637156 1897 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.98■□□□□ 0.95
CNTN1Q12860 TMEM176B-203ENST00000434545 1303 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.98■□□□□ 0.95
CNTN1Q12860 TMEM165-201ENST00000381334 1928 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.98■□□□□ 0.95
CNTN1Q12860 RPL13-202ENST00000393099 2385 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.97■□□□□ 0.95
CNTN1Q12860 AFDN-AS1-201ENST00000359760 2238 ntTSL 1 (best) BASIC20.97■□□□□ 0.95
CNTN1Q12860 ZBTB42-202ENST00000555360 1411 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.97■□□□□ 0.95
CNTN1Q12860 FBRS-202ENST00000356166 5200 ntTSL 5 BASIC20.97■□□□□ 0.95
CNTN1Q12860 SBK2-201ENST00000344158 1056 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.97■□□□□ 0.95
CNTN1Q12860 SBK2-202ENST00000413299 1085 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.97■□□□□ 0.95
CNTN1Q12860 AC099522.1-201ENST00000505955 881 ntTSL 3 BASIC20.97■□□□□ 0.95
CNTN1Q12860 CD44-222ENST00000526025 1052 ntTSL 2 BASIC20.97■□□□□ 0.95
CNTN1Q12860 RGMA-211ENST00000557420 989 ntTSL 3 BASIC20.97■□□□□ 0.95
CNTN1Q12860 TNNI3-207ENST00000588882 669 ntTSL 2 BASIC20.97■□□□□ 0.95
CNTN1Q12860 AC093762.2-201ENST00000641700 291 ntAPPRIS P1 BASIC20.97■□□□□ 0.95
CNTN1Q12860 AC133041.1-202ENST00000642053 222 ntBASIC20.97■□□□□ 0.95
CNTN1Q12860 HTATSF1-201ENST00000218364 2775 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.97■□□□□ 0.95
CNTN1Q12860 GRIN1-208ENST00000371561 5149 ntTSL 1 (best) BASIC20.97■□□□□ 0.95
CNTN1Q12860 RNF38-205ENST00000377877 1974 ntTSL 2 BASIC20.97■□□□□ 0.95
CNTN1Q12860 STX5-203ENST00000394690 1568 ntTSL 5 BASIC20.97■□□□□ 0.95
CNTN1Q12860 GAL3ST3-201ENST00000312006 2133 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.96■□□□□ 0.95
CNTN1Q12860 PDS5A-202ENST00000503396 2685 ntTSL 1 (best) BASIC20.96■□□□□ 0.95
CNTN1Q12860 ZNF444-201ENST00000337080 2042 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.96■□□□□ 0.95
CNTN1Q12860 MT3-201ENST00000200691 569 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.96■□□□□ 0.95
CNTN1Q12860 CT47A12-201ENST00000419982 1165 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.96■□□□□ 0.95
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CNTN1Q12860 CELF2-213ENST00000633077 1733 ntTSL 1 (best) BASIC20.95■□□□□ 0.94
CNTN1Q12860 SOX17-201ENST00000297316 2342 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.95■□□□□ 0.94
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CNTN1Q12860 HACD1-202ENST00000361271 2237 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.95■□□□□ 0.94
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CNTN1Q12860 CD99P1-205ENST00000527459 561 ntBASIC20.95■□□□□ 0.94
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CNTN1Q12860 RNF39-202ENST00000376751 1970 ntTSL 1 (best) BASIC20.95■□□□□ 0.94
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CNTN1Q12860 DMPK-220ENST00000618091 2503 ntTSL 1 (best) BASIC20.94■□□□□ 0.94
CNTN1Q12860 MED10-201ENST00000255764 1141 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.94■□□□□ 0.94
CNTN1Q12860 PET117-201ENST00000432901 1141 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.94■□□□□ 0.94
CNTN1Q12860 PBX1-209ENST00000485769 834 ntTSL 2 BASIC20.94■□□□□ 0.94
CNTN1Q12860 SLC35A3-218ENST00000639994 1114 ntTSL 5 BASIC20.94■□□□□ 0.94
CNTN1Q12860 MAN2C1-244ENST00000618257 1346 ntTSL 5 BASIC20.94■□□□□ 0.94
CNTN1Q12860 MTAP-204ENST00000460874 1434 ntTSL 2 BASIC20.94■□□□□ 0.94
CNTN1Q12860 CDC42BPB-201ENST00000361246 6758 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.94■□□□□ 0.94
CNTN1Q12860 FAM120A-201ENST00000277165 5118 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.93■□□□□ 0.94
CNTN1Q12860 PHOSPHO1-206ENST00000514112 1587 ntTSL 1 (best) BASIC20.93■□□□□ 0.94
CNTN1Q12860 PSMD7-201ENST00000219313 1670 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.93■□□□□ 0.94
CNTN1Q12860 KAT5-201ENST00000341318 2296 ntTSL 1 (best) BASIC20.93■□□□□ 0.94
CNTN1Q12860 SMARCD2-201ENST00000225742 1800 ntTSL 1 (best) BASIC20.93■□□□□ 0.94
CNTN1Q12860 DGAT2-201ENST00000228027 2453 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.93■□□□□ 0.94
CNTN1Q12860 BID-202ENST00000342111 854 ntTSL 1 (best) BASIC20.93■□□□□ 0.94
CNTN1Q12860 BX276092.2-201ENST00000417668 665 ntBASIC20.93■□□□□ 0.94
CNTN1Q12860 TPT1-AS1-210ENST00000520590 873 ntTSL 5 BASIC20.93■□□□□ 0.94
CNTN1Q12860 AP000785.1-201ENST00000527314 613 ntTSL 4 BASIC20.93■□□□□ 0.94
CNTN1Q12860 TADA2B-204ENST00000512388 1343 ntTSL 5 BASIC20.93■□□□□ 0.94
CNTN1Q12860 ASRGL1-202ENST00000415229 2270 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.93■□□□□ 0.94
CNTN1Q12860 CERS4-209ENST00000559450 1637 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.93■□□□□ 0.94
CNTN1Q12860 HOMEZ-201ENST00000357460 4971 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.92■□□□□ 0.94
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