Protein–RNA interactions for Protein: Q12791

KCNMA1, Calcium-activated potassium channel subunit alpha-1, humanhuman

Predictions only

Length 1,236 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
KCNMA1Q12791 NEK3-208ENST00000618534 2414 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC22.57■■□□□ 1.2
KCNMA1Q12791 IL17RC-205ENST00000413608 2147 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.57■■□□□ 1.2
KCNMA1Q12791 FMR1-AS1-202ENST00000596112 1845 ntTSL 1 (best) BASIC22.57■■□□□ 1.2
KCNMA1Q12791 CHRNB2-205ENST00000637900 2390 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC22.56■■□□□ 1.2
KCNMA1Q12791 ADGRB1-202ENST00000517894 6241 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.56■■□□□ 1.2
KCNMA1Q12791 MRPL37-206ENST00000605337 1582 ntTSL 5 BASIC22.56■■□□□ 1.2
KCNMA1Q12791 KCTD13-207ENST00000568000 2528 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.56■■□□□ 1.2
KCNMA1Q12791 TMED4-203ENST00000457408 2322 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.56■■□□□ 1.2
KCNMA1Q12791 GPR35-204ENST00000430267 1399 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.56■■□□□ 1.2
KCNMA1Q12791 TSPY4-201ENST00000383008 1143 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.56■■□□□ 1.2
KCNMA1Q12791 AC145207.2-202ENST00000576554 565 ntTSL 5 BASIC22.56■■□□□ 1.2
KCNMA1Q12791 TUBGCP3-204ENST00000464139 2461 ntTSL 1 (best) BASIC22.56■■□□□ 1.2
KCNMA1Q12791 ANTXR2-202ENST00000346652 1343 ntTSL 1 (best) BASIC22.56■■□□□ 1.2
KCNMA1Q12791 EXOC3-AS1-202ENST00000623673 1663 ntBASIC22.55■■□□□ 1.2
KCNMA1Q12791 FAM129C-203ENST00000449408 2004 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.55■■□□□ 1.2
KCNMA1Q12791 SLC12A2-201ENST00000262461 6885 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.55■■□□□ 1.2
KCNMA1Q12791 MON1A-201ENST00000296473 2370 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.55■■□□□ 1.2
KCNMA1Q12791 PKIB-206ENST00000392490 1811 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.55■■□□□ 1.2
KCNMA1Q12791 CLPSL2-201ENST00000360454 488 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.55■■□□□ 1.2
KCNMA1Q12791 AC027612.3-201ENST00000413684 1047 ntBASIC22.55■■□□□ 1.2
KCNMA1Q12791 ZFP69B-202ENST00000411995 2109 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.55■■□□□ 1.2
KCNMA1Q12791 RGMA-210ENST00000557301 1929 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.55■■□□□ 1.2
KCNMA1Q12791 SNUPN-205ENST00000564644 1931 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.55■■□□□ 1.2
KCNMA1Q12791 RLBP1-201ENST00000268125 1810 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.54■■□□□ 1.2
KCNMA1Q12791 AP005212.1-201ENST00000581547 1997 ntBASIC22.54■■□□□ 1.2
KCNMA1Q12791 TTYH1-202ENST00000376530 1885 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.54■■□□□ 1.2
KCNMA1Q12791 PHLDA3-201ENST00000367309 896 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.54■■□□□ 1.2
KCNMA1Q12791 ADAMTS13-204ENST00000371911 1155 ntTSL 1 (best) BASIC22.54■■□□□ 1.2
KCNMA1Q12791 AES-207ENST00000586839 942 ntTSL 1 (best) BASIC22.54■■□□□ 1.2
KCNMA1Q12791 RNF32-207ENST00000405335 1938 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.54■■□□□ 1.2
KCNMA1Q12791 SPATS2L-204ENST00000409140 2463 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.54■■□□□ 1.2
KCNMA1Q12791 DUX4-204ENST00000569241 1574 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.54■■□□□ 1.2
KCNMA1Q12791 AC135048.1-201ENST00000566056 1318 ntTSL 2 BASIC22.54■■□□□ 1.2
KCNMA1Q12791 SP3-208ENST00000640958 2142 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.54■■□□□ 1.2
KCNMA1Q12791 HGH1-201ENST00000347708 2531 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.54■■□□□ 1.2
KCNMA1Q12791 PKMYT1-213ENST00000574385 1892 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.54■■□□□ 1.2
KCNMA1Q12791 AP004607.4-201ENST00000530158 1459 ntBASIC22.54■■□□□ 1.2
KCNMA1Q12791 LYSMD2-201ENST00000267838 1759 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.53■■□□□ 1.2
KCNMA1Q12791 DBNDD1-201ENST00000002501 2079 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.53■■□□□ 1.2
KCNMA1Q12791 CERS4-208ENST00000559336 1515 ntTSL 1 (best) BASIC22.53■■□□□ 1.2
KCNMA1Q12791 WAS-201ENST00000376701 1849 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.53■■□□□ 1.2
KCNMA1Q12791 SCO2-201ENST00000252785 992 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.53■■□□□ 1.2
KCNMA1Q12791 RPL8-201ENST00000262584 1041 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.53■■□□□ 1.2
KCNMA1Q12791 CRB3-202ENST00000356762 733 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC22.53■■□□□ 1.2
KCNMA1Q12791 EXOC3L2-202ENST00000413988 2964 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.53■■□□□ 1.2
KCNMA1Q12791 SDHAP3-201ENST00000436493 736 ntTSL 1 (best) BASIC22.53■■□□□ 1.2
KCNMA1Q12791 AC079140.4-201ENST00000507448 529 ntBASIC22.53■■□□□ 1.2
KCNMA1Q12791 TSPAN11-202ENST00000535215 988 ntTSL 2 BASIC22.53■■□□□ 1.2
KCNMA1Q12791 AL137779.2-201ENST00000554859 448 ntTSL 2 BASIC22.53■■□□□ 1.2
KCNMA1Q12791 AL512625.3-202ENST00000591993 1091 ntTSL 1 (best) BASIC22.53■■□□□ 1.2
KCNMA1Q12791 AL138963.3-201ENST00000610057 588 ntTSL 4 BASIC22.53■■□□□ 1.2
KCNMA1Q12791 GALK1-201ENST00000225614 1445 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.53■■□□□ 1.2
KCNMA1Q12791 RASD1-202ENST00000579152 1404 ntTSL 2 BASIC22.53■■□□□ 1.2
KCNMA1Q12791 PHLPP1-201ENST00000262719 6390 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.53■■□□□ 1.2
KCNMA1Q12791 SPOCK3-217ENST00000511269 1768 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC22.53■■□□□ 1.2
KCNMA1Q12791 CTU2-210ENST00000567949 1905 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.53■■□□□ 1.2
KCNMA1Q12791 MATR3-206ENST00000503811 2518 ntTSL 2 BASIC22.53■■□□□ 1.2
KCNMA1Q12791 INPPL1-201ENST00000298229 4733 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.52■■□□□ 1.2
KCNMA1Q12791 EIF3J-202ENST00000424492 1550 ntTSL 4 BASIC22.52■■□□□ 1.2
KCNMA1Q12791 NUDT11-201ENST00000375992 2385 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.52■■□□□ 1.2
KCNMA1Q12791 PRMT8-202ENST00000382622 2366 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.52■■□□□ 1.2
KCNMA1Q12791 SSBP3-216ENST00000610401 3168 ntTSL 5 BASIC22.52■■□□□ 1.2
KCNMA1Q12791 TMED4-201ENST00000289577 2203 ntTSL 2 BASIC22.52■■□□□ 1.2
KCNMA1Q12791 CCDC28B-201ENST00000373602 1089 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.52■■□□□ 1.2
KCNMA1Q12791 NMRAL1-202ENST00000404295 1233 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.52■■□□□ 1.2
KCNMA1Q12791 CDKN2A-210ENST00000530628 748 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.52■■□□□ 1.2
KCNMA1Q12791 AC011511.3-201ENST00000587088 355 ntTSL 2 BASIC22.52■■□□□ 1.2
KCNMA1Q12791 KAT2B-201ENST00000263754 4833 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.52■■□□□ 1.2
KCNMA1Q12791 NDOR1-201ENST00000344894 1794 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.52■■□□□ 1.2
KCNMA1Q12791 RDX-202ENST00000405097 2761 ntTSL 1 (best) BASIC22.52■■□□□ 1.2
KCNMA1Q12791 TUSC3-203ENST00000503731 1498 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC22.52■■□□□ 1.2
KCNMA1Q12791 KRT87P-202ENST00000534226 1464 ntBASIC22.52■■□□□ 1.2
KCNMA1Q12791 C17orf67-201ENST00000397861 2013 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.52■■□□□ 1.19
KCNMA1Q12791 PLEKHB1-204ENST00000398494 2061 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.51■■□□□ 1.19
KCNMA1Q12791 TAF6L-201ENST00000294168 2116 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.51■■□□□ 1.19
KCNMA1Q12791 FOXO1-201ENST00000379561 5735 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.51■■□□□ 1.19
KCNMA1Q12791 SAV1-201ENST00000324679 3063 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.51■■□□□ 1.19
KCNMA1Q12791 ANO8-201ENST00000159087 4152 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.51■■□□□ 1.19
KCNMA1Q12791 POMGNT1-201ENST00000371984 2728 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.51■■□□□ 1.19
KCNMA1Q12791 JTB-203ENST00000368589 1216 ntTSL 2 BASIC22.51■■□□□ 1.19
KCNMA1Q12791 AC073343.2-201ENST00000413182 548 ntTSL 4 BASIC22.51■■□□□ 1.19
KCNMA1Q12791 AGAP1-IT1-201ENST00000440498 664 ntTSL 3 BASIC22.51■■□□□ 1.19
KCNMA1Q12791 AC093833.1-201ENST00000442821 553 ntTSL 5 BASIC22.51■■□□□ 1.19
KCNMA1Q12791 HIST1H2AL-201ENST00000613174 393 ntAPPRIS P1 BASIC22.51■■□□□ 1.19
KCNMA1Q12791 PACSIN3-201ENST00000298838 1843 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.51■■□□□ 1.19
KCNMA1Q12791 CATSPER2-201ENST00000321596 1820 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC22.51■■□□□ 1.19
KCNMA1Q12791 AC007225.1-201ENST00000566331 1836 ntBASIC22.51■■□□□ 1.19
KCNMA1Q12791 ATAD3A-202ENST00000378755 2612 ntTSL 2 BASIC22.51■■□□□ 1.19
KCNMA1Q12791 GABARAPL3-202ENST00000624044 1851 ntBASIC22.51■■□□□ 1.19
KCNMA1Q12791 RBM34-201ENST00000408888 2054 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.51■■□□□ 1.19
KCNMA1Q12791 CALY-201ENST00000252939 2271 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.51■■□□□ 1.19
KCNMA1Q12791 STARD3-202ENST00000394250 1949 ntTSL 2 BASIC22.51■■□□□ 1.19
KCNMA1Q12791 MYO1D-213ENST00000583621 1916 ntTSL 1 (best) BASIC22.51■■□□□ 1.19
KCNMA1Q12791 INTS11-208ENST00000435064 2148 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.51■■□□□ 1.19
KCNMA1Q12791 SSX2IP-203ENST00000437941 5843 ntTSL 2 BASIC22.51■■□□□ 1.19
KCNMA1Q12791 HNRNPLL-203ENST00000378915 2523 ntTSL 5 BASIC22.51■■□□□ 1.19
KCNMA1Q12791 SLC17A7-201ENST00000221485 2973 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.5■■□□□ 1.19
KCNMA1Q12791 HMOX1-201ENST00000216117 1822 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.5■■□□□ 1.19
KCNMA1Q12791 B3GAT3-202ENST00000531383 2056 ntTSL 2 BASIC22.5■■□□□ 1.19
KCNMA1Q12791 TPCN2-209ENST00000637504 2736 ntTSL 5 BASIC22.5■■□□□ 1.19
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