Protein–RNA interactions for Protein: Q0VD83

APOBR, Apolipoprotein B receptor, humanhuman

Predictions only

Length 1,088 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
APOBRQ0VD83 SCARB2-219ENST00000639738 1517 ntTSL 5 BASIC24.49■■□□□ 1.51
APOBRQ0VD83 AC132008.2-203ENST00000418868 1552 ntTSL 1 (best) BASIC24.49■■□□□ 1.51
APOBRQ0VD83 FAM69B-202ENST00000371692 1668 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.49■■□□□ 1.51
APOBRQ0VD83 NUTF2-201ENST00000219169 2321 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.49■■□□□ 1.51
APOBRQ0VD83 FOXD4L3-201ENST00000342833 2039 ntAPPRIS P1 BASIC24.48■■□□□ 1.51
APOBRQ0VD83 SMTNL2-202ENST00000389313 2280 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.48■■□□□ 1.51
APOBRQ0VD83 USP39-203ENST00000409470 2034 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.48■■□□□ 1.51
APOBRQ0VD83 LINC00094-201ENST00000432807 2300 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC24.48■■□□□ 1.51
APOBRQ0VD83 NAA10-208ENST00000464845 1772 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.48■■□□□ 1.51
APOBRQ0VD83 TMEM70-203ENST00000517439 617 ntTSL 2 BASIC24.48■■□□□ 1.51
APOBRQ0VD83 LINC01942-201ENST00000521373 513 ntTSL 4 BASIC24.48■■□□□ 1.51
APOBRQ0VD83 FAM66A-201ENST00000525829 921 ntTSL 2 BASIC24.48■■□□□ 1.51
APOBRQ0VD83 TMEM204-202ENST00000566264 1938 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.48■■□□□ 1.51
APOBRQ0VD83 DLEU2-208ENST00000621282 3068 ntTSL 1 (best) BASIC24.48■■□□□ 1.51
APOBRQ0VD83 AC243965.2-201ENST00000612576 2671 ntTSL 5 BASIC24.48■■□□□ 1.51
APOBRQ0VD83 RAP2C-202ENST00000370874 2333 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.47■■□□□ 1.51
APOBRQ0VD83 AC090360.1-201ENST00000569722 2218 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC24.47■■□□□ 1.51
APOBRQ0VD83 S1PR5-202ENST00000439028 2191 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.47■■□□□ 1.51
APOBRQ0VD83 PLK5-205ENST00000642079 1969 ntBASIC24.47■■□□□ 1.51
APOBRQ0VD83 CAMK2B-207ENST00000358707 1895 ntTSL 1 (best) BASIC24.47■■□□□ 1.51
APOBRQ0VD83 KRT7-201ENST00000331817 1754 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.47■■□□□ 1.51
APOBRQ0VD83 DR1-201ENST00000370267 1647 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.47■■□□□ 1.51
APOBRQ0VD83 DCK-201ENST00000286648 2716 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.47■■□□□ 1.51
APOBRQ0VD83 COX5B-201ENST00000258424 712 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.47■■□□□ 1.51
APOBRQ0VD83 UCHL1-201ENST00000284440 1172 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.47■■□□□ 1.51
APOBRQ0VD83 UCHL1-210ENST00000512788 785 ntTSL 3 BASIC24.47■■□□□ 1.51
APOBRQ0VD83 SKI-201ENST00000378536 5613 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.47■■□□□ 1.51
APOBRQ0VD83 DNAJA4-202ENST00000394852 3116 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.47■■□□□ 1.51
APOBRQ0VD83 LPAR1-201ENST00000358883 2687 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC24.47■■□□□ 1.51
APOBRQ0VD83 LRP5-201ENST00000294304 5159 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.47■■□□□ 1.51
APOBRQ0VD83 ZNF331-202ENST00000411977 2248 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.46■■□□□ 1.51
APOBRQ0VD83 MAFF-204ENST00000426621 2216 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC24.46■■□□□ 1.51
APOBRQ0VD83 DCPS-201ENST00000263579 1479 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.46■■□□□ 1.51
APOBRQ0VD83 SAMD10-201ENST00000369886 2181 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.46■■□□□ 1.51
APOBRQ0VD83 NKX6-1-202ENST00000515820 2194 ntTSL 3 BASIC24.46■■□□□ 1.51
APOBRQ0VD83 HFE2-202ENST00000357836 2123 ntTSL 1 (best) BASIC24.46■■□□□ 1.51
APOBRQ0VD83 MIF4GD-202ENST00000325102 1306 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.46■■□□□ 1.51
APOBRQ0VD83 HRASLS5-201ENST00000301790 1166 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.46■■□□□ 1.51
APOBRQ0VD83 PARL-206ENST00000435888 1098 ntTSL 5 BASIC24.46■■□□□ 1.51
APOBRQ0VD83 H2AFB3-201ENST00000615853 591 ntAPPRIS P1 BASIC24.46■■□□□ 1.51
APOBRQ0VD83 FGF7P6-201ENST00000377614 1890 ntTSL 1 (best) BASIC24.46■■□□□ 1.51
APOBRQ0VD83 BX664615.2-202ENST00000639056 1888 ntTSL 1 (best) BASIC24.46■■□□□ 1.51
APOBRQ0VD83 TRIM3-202ENST00000359518 3042 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.46■■□□□ 1.51
APOBRQ0VD83 FAM3A-208ENST00000419205 1763 ntTSL 2 BASIC24.46■■□□□ 1.51
APOBRQ0VD83 HNF4A-205ENST00000443598 1603 ntTSL 1 (best) BASIC24.46■■□□□ 1.51
APOBRQ0VD83 AC110285.2-201ENST00000571724 1565 ntTSL 2 BASIC24.46■■□□□ 1.51
APOBRQ0VD83 MMP17-201ENST00000360564 2411 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.45■■□□□ 1.51
APOBRQ0VD83 MXRA7-201ENST00000355797 5661 ntAPPRIS P4 TSL 2 BASIC24.45■■□□□ 1.51
APOBRQ0VD83 DNAJB5-203ENST00000453597 2589 ntTSL 2 BASIC24.45■■□□□ 1.5
APOBRQ0VD83 EMC7-201ENST00000256545 1155 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.45■■□□□ 1.5
APOBRQ0VD83 GP9-201ENST00000307395 889 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.45■■□□□ 1.5
APOBRQ0VD83 C5orf38-201ENST00000334000 890 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.45■■□□□ 1.5
APOBRQ0VD83 RAP1B-202ENST00000341355 714 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC24.45■■□□□ 1.5
APOBRQ0VD83 SPOCK2-203ENST00000412663 1284 ntTSL 5 BASIC24.45■■□□□ 1.5
APOBRQ0VD83 GPR108-201ENST00000264080 2057 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.45■■□□□ 1.5
APOBRQ0VD83 HAUS4-205ENST00000541587 1637 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.45■■□□□ 1.5
APOBRQ0VD83 CERS1-202ENST00000542296 1947 ntTSL 1 (best) BASIC24.45■■□□□ 1.5
APOBRQ0VD83 TMEM121-201ENST00000392519 1532 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.45■■□□□ 1.5
APOBRQ0VD83 AL606970.3-201ENST00000446811 2246 ntTSL 2 BASIC24.45■■□□□ 1.5
APOBRQ0VD83 SPATA22-214ENST00000575375 1374 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.44■■□□□ 1.5
APOBRQ0VD83 ZMYND11-210ENST00000403354 1664 ntTSL 5 BASIC24.44■■□□□ 1.5
APOBRQ0VD83 ARL6IP4-204ENST00000392435 1339 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.44■■□□□ 1.5
APOBRQ0VD83 CELF2-211ENST00000632065 1952 ntTSL 1 (best) BASIC24.44■■□□□ 1.5
APOBRQ0VD83 SLC12A5-217ENST00000626937 1224 ntTSL 1 (best) BASIC24.44■■□□□ 1.5
APOBRQ0VD83 RARRES2P11-201ENST00000635158 484 ntBASIC24.44■■□□□ 1.5
APOBRQ0VD83 DISC1-224ENST00000639374 1071 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.44■■□□□ 1.5
APOBRQ0VD83 PHOSPHO1-206ENST00000514112 1587 ntTSL 1 (best) BASIC24.44■■□□□ 1.5
APOBRQ0VD83 DNAJB5-201ENST00000312316 2391 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.44■■□□□ 1.5
APOBRQ0VD83 ZNF668-207ENST00000535577 2396 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.44■■□□□ 1.5
APOBRQ0VD83 GATA6-AS1-202ENST00000583490 1788 ntTSL 2 BASIC24.44■■□□□ 1.5
APOBRQ0VD83 FMNL2-201ENST00000288670 5575 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.44■■□□□ 1.5
APOBRQ0VD83 WWTR1-AS1-202ENST00000479752 1700 ntTSL 1 (best) BASIC24.44■■□□□ 1.5
APOBRQ0VD83 KRT16P2-201ENST00000414673 1423 ntBASIC24.44■■□□□ 1.5
APOBRQ0VD83 ENTPD5-206ENST00000556242 1437 ntTSL 5 BASIC24.44■■□□□ 1.5
APOBRQ0VD83 STRADB-201ENST00000194530 2293 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.44■■□□□ 1.5
APOBRQ0VD83 GPAA1-202ENST00000361036 1840 ntTSL 1 (best) BASIC24.43■■□□□ 1.5
APOBRQ0VD83 RARRES2-201ENST00000223271 740 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.43■■□□□ 1.5
APOBRQ0VD83 UBE2D3-201ENST00000321805 1087 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC24.43■■□□□ 1.5
APOBRQ0VD83 KRT19P1-201ENST00000405746 1186 ntBASIC24.43■■□□□ 1.5
APOBRQ0VD83 LINC01816-201ENST00000414141 662 ntTSL 1 (best) BASIC24.43■■□□□ 1.5
APOBRQ0VD83 KRT18P5-201ENST00000436075 1291 ntBASIC24.43■■□□□ 1.5
APOBRQ0VD83 AL162430.1-201ENST00000480705 870 ntBASIC24.43■■□□□ 1.5
APOBRQ0VD83 AC068385.1-201ENST00000533218 409 ntTSL 3 BASIC24.43■■□□□ 1.5
APOBRQ0VD83 AP001005.4-202ENST00000575325 560 ntTSL 4 BASIC24.43■■□□□ 1.5
APOBRQ0VD83 SLC35A2-212ENST00000634665 486 ntTSL 4 BASIC24.43■■□□□ 1.5
APOBRQ0VD83 GMPPA-201ENST00000313597 1544 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.43■■□□□ 1.5
APOBRQ0VD83 HOXA11-AS-204ENST00000522674 1549 ntTSL 1 (best) BASIC24.43■■□□□ 1.5
APOBRQ0VD83 SMAGP-205ENST00000603864 1518 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.43■■□□□ 1.5
APOBRQ0VD83 DCAF4-202ENST00000358377 2024 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC24.43■■□□□ 1.5
APOBRQ0VD83 TRMT2A-204ENST00000439169 2473 ntTSL 5 BASIC24.43■■□□□ 1.5
APOBRQ0VD83 FBXO25-203ENST00000352684 2360 ntTSL 5 BASIC24.43■■□□□ 1.5
APOBRQ0VD83 DUSP5-201ENST00000369583 2557 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.43■■□□□ 1.5
APOBRQ0VD83 DUSP28-201ENST00000343217 1555 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.42■■□□□ 1.5
APOBRQ0VD83 RELL2-207ENST00000521367 1780 ntTSL 5 BASIC24.42■■□□□ 1.5
APOBRQ0VD83 HOXC9-203ENST00000508190 1505 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC24.42■■□□□ 1.5
APOBRQ0VD83 MRPL37-201ENST00000336230 1179 ntTSL 1 (best) BASIC24.42■■□□□ 1.5
APOBRQ0VD83 MAD2L2-204ENST00000376667 872 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.42■■□□□ 1.5
APOBRQ0VD83 AC106820.5-201ENST00000566085 789 ntTSL 3 BASIC24.42■■□□□ 1.5
APOBRQ0VD83 CASTOR1-201ENST00000404953 1460 ntTSL 5 BASIC24.42■■□□□ 1.5
APOBRQ0VD83 CYB5R2-212ENST00000533558 1658 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.42■■□□□ 1.5
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 20.8 ms