Protein–RNA interactions for Protein: Q09470

KCNA1, Potassium voltage-gated channel subfamily A member 1, humanhuman

Predictions only

Length 495 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
KCNA1Q09470 APLP1-203ENST00000586861 2052 ntTSL 2 BASIC22.94■■□□□ 1.26
KCNA1Q09470 NUDT16L1-202ENST00000405142 2040 ntTSL 1 (best) BASIC22.94■■□□□ 1.26
KCNA1Q09470 DMRT2-203ENST00000358146 1965 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.94■■□□□ 1.26
KCNA1Q09470 HNRNPLL-204ENST00000409328 1908 ntTSL 1 (best) BASIC22.94■■□□□ 1.26
KCNA1Q09470 MXRA7-201ENST00000355797 5661 ntAPPRIS P4 TSL 2 BASIC22.94■■□□□ 1.26
KCNA1Q09470 SLC4A3-203ENST00000358055 4454 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.94■■□□□ 1.26
KCNA1Q09470 LIN7B-201ENST00000221459 755 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.93■■□□□ 1.26
KCNA1Q09470 FAM207A-201ENST00000291634 927 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.93■■□□□ 1.26
KCNA1Q09470 PARP1-202ENST00000366792 553 ntTSL 3 BASIC22.93■■□□□ 1.26
KCNA1Q09470 AC006015.1-201ENST00000429970 570 ntBASIC22.93■■□□□ 1.26
KCNA1Q09470 AC044860.1-203ENST00000560811 844 ntTSL 3 BASIC22.93■■□□□ 1.26
KCNA1Q09470 RARRES2P11-201ENST00000635158 484 ntBASIC22.93■■□□□ 1.26
KCNA1Q09470 MAMSTR-202ENST00000356751 1825 ntTSL 2 BASIC22.93■■□□□ 1.26
KCNA1Q09470 NTN4-207ENST00000553059 1818 ntTSL 1 (best) BASIC22.93■■□□□ 1.26
KCNA1Q09470 RELL2-207ENST00000521367 1780 ntTSL 5 BASIC22.93■■□□□ 1.26
KCNA1Q09470 DBX2-201ENST00000332700 2806 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.93■■□□□ 1.26
KCNA1Q09470 PABPC1L2B-201ENST00000373521 2197 ntAPPRIS P1 BASIC22.93■■□□□ 1.26
KCNA1Q09470 MEIS2-207ENST00000557796 2666 ntTSL 5 BASIC22.93■■□□□ 1.26
KCNA1Q09470 OSR2-203ENST00000457907 2126 ntTSL 2 BASIC22.93■■□□□ 1.26
KCNA1Q09470 AC010616.1-201ENST00000597630 2078 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.93■■□□□ 1.26
KCNA1Q09470 ABHD12B-202ENST00000353130 1477 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.92■■□□□ 1.26
KCNA1Q09470 HAUS4-203ENST00000347758 1428 ntTSL 2 BASIC22.92■■□□□ 1.26
KCNA1Q09470 DNAJB11-202ENST00000439351 2398 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.92■■□□□ 1.26
KCNA1Q09470 FIP1L1-201ENST00000306932 1878 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.92■■□□□ 1.26
KCNA1Q09470 KLC2-207ENST00000421552 2721 ntTSL 5 BASIC22.92■■□□□ 1.26
KCNA1Q09470 ZC3HAV1L-201ENST00000275766 1753 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.92■■□□□ 1.26
KCNA1Q09470 SH3GL1-206ENST00000598564 2194 ntTSL 2 BASIC22.92■■□□□ 1.26
KCNA1Q09470 SPI1-203ENST00000533030 661 ntTSL 2 BASIC22.92■■□□□ 1.26
KCNA1Q09470 SEC11A-208ENST00000559729 1256 ntTSL 2 BASIC22.92■■□□□ 1.26
KCNA1Q09470 AC024267.6-201ENST00000580603 583 ntTSL 3 BASIC22.92■■□□□ 1.26
KCNA1Q09470 WWOX-218ENST00000627394 894 ntTSL 5 BASIC22.92■■□□□ 1.26
KCNA1Q09470 MYCNOS-205ENST00000641950 531 ntBASIC22.92■■□□□ 1.26
KCNA1Q09470 POMGNT2-202ENST00000441964 2531 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC22.92■■□□□ 1.26
KCNA1Q09470 PUS1-203ENST00000443358 1664 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.92■■□□□ 1.26
KCNA1Q09470 TRIM3-201ENST00000345851 2879 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.92■■□□□ 1.26
KCNA1Q09470 OTUB1-211ENST00000543004 1647 ntTSL 5 BASIC22.92■■□□□ 1.26
KCNA1Q09470 FAM118B-209ENST00000533050 2402 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.92■■□□□ 1.26
KCNA1Q09470 PHOSPHO1-206ENST00000514112 1587 ntTSL 1 (best) BASIC22.92■■□□□ 1.26
KCNA1Q09470 RELA-201ENST00000308639 2681 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.92■■□□□ 1.26
KCNA1Q09470 HOXC9-203ENST00000508190 1505 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC22.92■■□□□ 1.26
KCNA1Q09470 BSN-AS2-201ENST00000421598 2603 ntTSL 2 BASIC22.92■■□□□ 1.26
KCNA1Q09470 CHN1-203ENST00000409156 1761 ntTSL 2 BASIC22.91■■□□□ 1.26
KCNA1Q09470 EPHX3-202ENST00000435261 1771 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.91■■□□□ 1.26
KCNA1Q09470 GPR108-201ENST00000264080 2057 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.91■■□□□ 1.26
KCNA1Q09470 CENPU-201ENST00000281453 1998 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.91■■□□□ 1.26
KCNA1Q09470 TTC9-201ENST00000256367 5217 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.91■■□□□ 1.26
KCNA1Q09470 PARL-206ENST00000435888 1098 ntTSL 5 BASIC22.91■■□□□ 1.26
KCNA1Q09470 AC021660.2-201ENST00000502999 388 ntTSL 3 BASIC22.91■■□□□ 1.26
KCNA1Q09470 LINC01901-201ENST00000585822 1115 ntTSL 1 (best) BASIC22.91■■□□□ 1.26
KCNA1Q09470 IMPA2-212ENST00000625802 500 ntTSL 2 BASIC22.91■■□□□ 1.26
KCNA1Q09470 AC090360.1-201ENST00000569722 2218 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.91■■□□□ 1.26
KCNA1Q09470 ANAPC4-201ENST00000315368 2685 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.91■■□□□ 1.26
KCNA1Q09470 POLR2J3-220ENST00000613744 2096 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.91■■□□□ 1.26
KCNA1Q09470 CCDC130-201ENST00000221554 1792 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.91■■□□□ 1.26
KCNA1Q09470 REPS2-202ENST00000357277 7953 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.91■■□□□ 1.26
KCNA1Q09470 ABLIM2-204ENST00000407564 2291 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.91■■□□□ 1.26
KCNA1Q09470 EEF1D-204ENST00000423316 2378 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC22.9■■□□□ 1.26
KCNA1Q09470 ECE2-203ENST00000359140 3147 ntTSL 1 (best) BASIC22.9■■□□□ 1.26
KCNA1Q09470 MAD2L2-204ENST00000376667 872 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.9■■□□□ 1.26
KCNA1Q09470 IZUMO4-203ENST00000395307 944 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.9■■□□□ 1.26
KCNA1Q09470 INTS11-205ENST00000429572 1104 ntTSL 2 BASIC22.9■■□□□ 1.26
KCNA1Q09470 UQCRFS1P1-201ENST00000435169 820 ntBASIC22.9■■□□□ 1.26
KCNA1Q09470 CDKN3-204ENST00000442975 727 ntTSL 1 (best) BASIC22.9■■□□□ 1.26
KCNA1Q09470 SNAP23-214ENST00000567094 834 ntTSL 3 BASIC22.9■■□□□ 1.26
KCNA1Q09470 RNASEH2B-206ENST00000611510 1257 ntTSL 5 BASIC22.9■■□□□ 1.26
KCNA1Q09470 FGF8-207ENST00000618991 856 ntTSL 3 BASIC22.9■■□□□ 1.26
KCNA1Q09470 NAA10-208ENST00000464845 1772 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.9■■□□□ 1.26
KCNA1Q09470 TNIP1-205ENST00000518977 2200 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.9■■□□□ 1.26
KCNA1Q09470 C14orf79-207ENST00000550614 1912 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.9■■□□□ 1.26
KCNA1Q09470 ALG1-201ENST00000262374 2132 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.9■■□□□ 1.26
KCNA1Q09470 MMP23B-201ENST00000356026 1326 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.89■■□□□ 1.26
KCNA1Q09470 KEAP1-202ENST00000393623 2648 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.89■■□□□ 1.26
KCNA1Q09470 LGALS9C-201ENST00000328114 1730 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.89■■□□□ 1.26
KCNA1Q09470 ZNF48-201ENST00000320159 3234 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.89■■□□□ 1.25
KCNA1Q09470 UMAD1-202ENST00000463725 559 ntTSL 4 BASIC22.89■■□□□ 1.25
KCNA1Q09470 SLC7A5P1-201ENST00000568957 537 ntBASIC22.89■■□□□ 1.25
KCNA1Q09470 DM1-AS-203ENST00000590076 730 ntTSL 4 BASIC22.89■■□□□ 1.25
KCNA1Q09470 TMEM230-210ENST00000612323 1231 ntTSL 1 (best) BASIC22.89■■□□□ 1.25
KCNA1Q09470 AC011767.1-201ENST00000617410 1153 ntBASIC22.89■■□□□ 1.25
KCNA1Q09470 AC120498.10-201ENST00000621827 505 ntBASIC22.89■■□□□ 1.25
KCNA1Q09470 CCDC88B-203ENST00000359902 2326 ntTSL 1 (best) BASIC22.89■■□□□ 1.25
KCNA1Q09470 ADD1-202ENST00000355842 4743 ntTSL 1 (best) BASIC22.89■■□□□ 1.25
KCNA1Q09470 PLAGL1-207ENST00000417959 1645 ntTSL 1 (best) BASIC22.89■■□□□ 1.25
KCNA1Q09470 ONECUT3-201ENST00000382349 8318 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.89■■□□□ 1.25
KCNA1Q09470 SRSF11-203ENST00000370951 2385 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.89■■□□□ 1.25
KCNA1Q09470 C1QL4-201ENST00000334221 2071 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.88■■□□□ 1.25
KCNA1Q09470 SPR-201ENST00000234454 1480 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.88■■□□□ 1.25
KCNA1Q09470 SMIM12-202ENST00000423898 897 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.88■■□□□ 1.25
KCNA1Q09470 COL19A1-203ENST00000478620 589 ntTSL 1 (best) BASIC22.88■■□□□ 1.25
KCNA1Q09470 EDA-209ENST00000525810 843 ntTSL 1 (best) BASIC22.88■■□□□ 1.25
KCNA1Q09470 EDA-210ENST00000527388 927 ntTSL 1 (best) BASIC22.88■■□□□ 1.25
KCNA1Q09470 MFSD11-216ENST00000590393 1141 ntBASIC22.88■■□□□ 1.25
KCNA1Q09470 AL136982.7-201ENST00000609363 465 ntTSL 4 BASIC22.88■■□□□ 1.25
KCNA1Q09470 SLC16A10-202ENST00000368851 2508 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.88■■□□□ 1.25
KCNA1Q09470 TMEM206-205ENST00000535273 2119 ntTSL 2 BASIC22.88■■□□□ 1.25
KCNA1Q09470 MATK-203ENST00000395045 2073 ntAPPRIS P4 TSL 2 BASIC22.88■■□□□ 1.25
KCNA1Q09470 TMEM175-212ENST00000508204 1399 ntTSL 3 BASIC22.88■■□□□ 1.25
KCNA1Q09470 DLEU2-208ENST00000621282 3068 ntTSL 1 (best) BASIC22.88■■□□□ 1.25
KCNA1Q09470 PCED1A-202ENST00000360652 2016 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.87■■□□□ 1.25
KCNA1Q09470 BOK-201ENST00000318407 2657 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.87■■□□□ 1.25
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 29.9 ms