Protein–RNA interactions for Protein: Q08945

SSRP1, FACT complex subunit SSRP1, humanhuman

Known RBP Predictions only

Length 709 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SSRP1Q08945 ZC3HAV1L-201ENST00000275766 1753 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.19■■□□□ 1.46
SSRP1Q08945 NAA10-208ENST00000464845 1772 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.19■■□□□ 1.46
SSRP1Q08945 TTC7A-201ENST00000319190 5157 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.18■■□□□ 1.46
SSRP1Q08945 PCED1A-202ENST00000360652 2016 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.18■■□□□ 1.46
SSRP1Q08945 FAM207A-201ENST00000291634 927 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.18■■□□□ 1.46
SSRP1Q08945 ATE1-AS1-201ENST00000437593 951 ntTSL 2 BASIC24.18■■□□□ 1.46
SSRP1Q08945 OSR2-203ENST00000457907 2126 ntTSL 2 BASIC24.18■■□□□ 1.46
SSRP1Q08945 SLC12A5-217ENST00000626937 1224 ntTSL 1 (best) BASIC24.18■■□□□ 1.46
SSRP1Q08945 AC010616.1-201ENST00000597630 2078 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.18■■□□□ 1.46
SSRP1Q08945 KRT7-201ENST00000331817 1754 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.18■■□□□ 1.46
SSRP1Q08945 FAM69B-202ENST00000371692 1668 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.18■■□□□ 1.46
SSRP1Q08945 DAPK3-201ENST00000301264 2105 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.17■■□□□ 1.46
SSRP1Q08945 ARL6IP4-204ENST00000392435 1339 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.17■■□□□ 1.46
SSRP1Q08945 SCARB2-219ENST00000639738 1517 ntTSL 5 BASIC24.17■■□□□ 1.46
SSRP1Q08945 C5orf38-201ENST00000334000 890 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.17■■□□□ 1.46
SSRP1Q08945 TNFRSF18-202ENST00000379265 705 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.17■■□□□ 1.46
SSRP1Q08945 RPLP2-207ENST00000530797 637 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.17■■□□□ 1.46
SSRP1Q08945 MIR5787-201ENST00000611784 55 ntBASIC24.17■■□□□ 1.46
SSRP1Q08945 DCPS-201ENST00000263579 1479 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.17■■□□□ 1.46
SSRP1Q08945 MYO1C-203ENST00000438665 4898 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC24.17■■□□□ 1.46
SSRP1Q08945 TUBA1A-201ENST00000295766 1887 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.17■■□□□ 1.46
SSRP1Q08945 TCF7L1-201ENST00000282111 2968 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.17■■□□□ 1.46
SSRP1Q08945 CSNK1G2-201ENST00000255641 2918 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.17■■□□□ 1.46
SSRP1Q08945 KLF1-201ENST00000264834 1592 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.16■■□□□ 1.46
SSRP1Q08945 DUSP28-201ENST00000343217 1555 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.16■■□□□ 1.46
SSRP1Q08945 SCLY-201ENST00000254663 2562 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.16■■□□□ 1.46
SSRP1Q08945 NISCH-201ENST00000345716 5238 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.16■■□□□ 1.46
SSRP1Q08945 SH3RF3-201ENST00000309415 5803 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.16■■□□□ 1.46
SSRP1Q08945 TMEM121-201ENST00000392519 1532 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.16■■□□□ 1.46
SSRP1Q08945 SLC35A3-210ENST00000638371 2298 ntTSL 5 BASIC24.16■■□□□ 1.46
SSRP1Q08945 MRPL37-201ENST00000336230 1179 ntTSL 1 (best) BASIC24.16■■□□□ 1.46
SSRP1Q08945 TSPAN2-201ENST00000369515 793 ntTSL 3 BASIC24.16■■□□□ 1.46
SSRP1Q08945 MANBAL-202ENST00000373606 1208 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.16■■□□□ 1.46
SSRP1Q08945 AC108002.2-201ENST00000519782 340 ntTSL 4 BASIC24.16■■□□□ 1.46
SSRP1Q08945 AC011825.4-201ENST00000582233 473 ntTSL 2 BASIC24.16■■□□□ 1.46
SSRP1Q08945 SDK1-201ENST00000389531 7606 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.16■■□□□ 1.46
SSRP1Q08945 DAZAP2-201ENST00000412716 2598 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.16■■□□□ 1.46
SSRP1Q08945 PACRGL-208ENST00000503585 1582 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.16■■□□□ 1.46
SSRP1Q08945 TMEM206-205ENST00000535273 2119 ntTSL 2 BASIC24.16■■□□□ 1.46
SSRP1Q08945 PTDSS2-201ENST00000308020 2445 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.15■■□□□ 1.46
SSRP1Q08945 GJC2-201ENST00000366714 2243 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.15■■□□□ 1.46
SSRP1Q08945 OLIG2-202ENST00000382357 2578 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.15■■□□□ 1.46
SSRP1Q08945 CIZ1-206ENST00000372954 2731 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.15■■□□□ 1.46
SSRP1Q08945 SGTA-201ENST00000221566 2330 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.15■■□□□ 1.46
SSRP1Q08945 CCDC88B-203ENST00000359902 2326 ntTSL 1 (best) BASIC24.15■■□□□ 1.46
SSRP1Q08945 TMEM8B-203ENST00000377996 2473 ntTSL 2 BASIC24.15■■□□□ 1.46
SSRP1Q08945 LINC01678-201ENST00000411694 863 ntTSL 5 BASIC24.15■■□□□ 1.46
SSRP1Q08945 UMAD1-202ENST00000463725 559 ntTSL 4 BASIC24.15■■□□□ 1.46
SSRP1Q08945 CAPNS1-205ENST00000588780 1035 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.15■■□□□ 1.46
SSRP1Q08945 CIRBP-222ENST00000589235 1073 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC24.15■■□□□ 1.46
SSRP1Q08945 ANKRD20A6P-201ENST00000618763 204 ntBASIC24.15■■□□□ 1.46
SSRP1Q08945 RARRES2P11-201ENST00000635158 484 ntBASIC24.15■■□□□ 1.46
SSRP1Q08945 DTX4-201ENST00000227451 5642 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.15■■□□□ 1.46
SSRP1Q08945 HAUS4-203ENST00000347758 1428 ntTSL 2 BASIC24.15■■□□□ 1.46
SSRP1Q08945 HOXA11-AS-204ENST00000522674 1549 ntTSL 1 (best) BASIC24.15■■□□□ 1.46
SSRP1Q08945 SPI1-201ENST00000227163 1168 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC24.14■■□□□ 1.45
SSRP1Q08945 NFKBIB-201ENST00000313582 1159 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.14■■□□□ 1.45
SSRP1Q08945 CAMK2B-207ENST00000358707 1895 ntTSL 1 (best) BASIC24.14■■□□□ 1.45
SSRP1Q08945 PMPCA-201ENST00000371717 2174 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.14■■□□□ 1.45
SSRP1Q08945 MPRIP-203ENST00000395806 527 ntTSL 3 BASIC24.14■■□□□ 1.45
SSRP1Q08945 MIR935-201ENST00000401179 91 ntBASIC24.14■■□□□ 1.45
SSRP1Q08945 GXYLT1P2-201ENST00000433312 1230 ntBASIC24.14■■□□□ 1.45
SSRP1Q08945 WWTR1-AS1-202ENST00000479752 1700 ntTSL 1 (best) BASIC24.14■■□□□ 1.45
SSRP1Q08945 ABHD14A-204ENST00000491470 674 ntTSL 3 BASIC24.14■■□□□ 1.45
SSRP1Q08945 F2RL3-202ENST00000599210 613 ntTSL 2 BASIC24.14■■□□□ 1.45
SSRP1Q08945 MXRA8-201ENST00000309212 2273 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.14■■□□□ 1.45
SSRP1Q08945 THEM6-201ENST00000336138 2259 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.14■■□□□ 1.45
SSRP1Q08945 SPINT2-202ENST00000454580 1367 ntTSL 1 (best) BASIC24.14■■□□□ 1.45
SSRP1Q08945 UPF3A-202ENST00000375299 2387 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.14■■□□□ 1.45
SSRP1Q08945 ERMP1-202ENST00000339450 5376 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.14■■□□□ 1.45
SSRP1Q08945 EPHX3-202ENST00000435261 1771 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.14■■□□□ 1.45
SSRP1Q08945 E4F1-206ENST00000565090 2028 ntTSL 1 (best) BASIC24.13■■□□□ 1.45
SSRP1Q08945 AC110285.2-201ENST00000571724 1565 ntTSL 2 BASIC24.13■■□□□ 1.45
SSRP1Q08945 TEAD1-206ENST00000527636 2544 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.13■■□□□ 1.45
SSRP1Q08945 CNR1-203ENST00000369501 6031 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.13■■□□□ 1.45
SSRP1Q08945 RNH1-222ENST00000533410 1829 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.13■■□□□ 1.45
SSRP1Q08945 BSN-AS2-201ENST00000421598 2603 ntTSL 2 BASIC24.13■■□□□ 1.45
SSRP1Q08945 MAP1LC3A-202ENST00000374837 961 ntTSL 3 BASIC24.13■■□□□ 1.45
SSRP1Q08945 AC245052.3-201ENST00000450182 901 ntBASIC24.13■■□□□ 1.45
SSRP1Q08945 UBE2DNL-204ENST00000602536 740 ntBASIC24.13■■□□□ 1.45
SSRP1Q08945 CERS1-202ENST00000542296 1947 ntTSL 1 (best) BASIC24.13■■□□□ 1.45
SSRP1Q08945 AP000662.2-202ENST00000530595 2790 ntTSL 2 BASIC24.13■■□□□ 1.45
SSRP1Q08945 SPR-201ENST00000234454 1480 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.13■■□□□ 1.45
SSRP1Q08945 LTBP3-201ENST00000301873 4443 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC24.13■■□□□ 1.45
SSRP1Q08945 ORAI3-201ENST00000318663 2206 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.12■■□□□ 1.45
SSRP1Q08945 FAM193B-217ENST00000514747 2913 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.12■■□□□ 1.45
SSRP1Q08945 ZBTB42-202ENST00000555360 1411 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.12■■□□□ 1.45
SSRP1Q08945 HOXC9-203ENST00000508190 1505 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC24.12■■□□□ 1.45
SSRP1Q08945 LY6E-201ENST00000292494 1181 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.12■■□□□ 1.45
SSRP1Q08945 IL15RA-201ENST00000379971 588 ntTSL 3 BASIC24.12■■□□□ 1.45
SSRP1Q08945 AC012313.1-204ENST00000444227 462 ntTSL 1 (best) BASIC24.12■■□□□ 1.45
SSRP1Q08945 COL19A1-203ENST00000478620 589 ntTSL 1 (best) BASIC24.12■■□□□ 1.45
SSRP1Q08945 AL162430.1-201ENST00000480705 870 ntBASIC24.12■■□□□ 1.45
SSRP1Q08945 DBI-210ENST00000542275 757 ntTSL 5 BASIC24.12■■□□□ 1.45
SSRP1Q08945 SLC7A5P1-201ENST00000568957 537 ntBASIC24.12■■□□□ 1.45
SSRP1Q08945 E2F1-201ENST00000343380 2503 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.12■■□□□ 1.45
SSRP1Q08945 ALG1-201ENST00000262374 2132 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.11■■□□□ 1.45
SSRP1Q08945 DPF1-201ENST00000355526 1632 ntTSL 1 (best) BASIC24.11■■□□□ 1.45
SSRP1Q08945 AC121338.2-201ENST00000622535 1744 ntBASIC24.11■■□□□ 1.45
SSRP1Q08945 HCFC1R1-201ENST00000248089 965 ntTSL 1 (best) BASIC24.11■■□□□ 1.45
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 21.1 ms