Protein–RNA interactions for Protein: Q08554

DSC1, Desmocollin-1, humanhuman

Predictions only

Length 894 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
DSC1Q08554 MRPL40-201ENST00000333130 1387 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.31■■□□□ 1.16
DSC1Q08554 GAR1-201ENST00000226796 1224 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.31■■□□□ 1.16
DSC1Q08554 CKLF-201ENST00000264001 669 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC22.31■■□□□ 1.16
DSC1Q08554 MCRIP2P1-201ENST00000394346 511 ntBASIC22.31■■□□□ 1.16
DSC1Q08554 AC007322.3-201ENST00000426526 701 ntBASIC22.31■■□□□ 1.16
DSC1Q08554 STPG4-207ENST00000445927 891 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.31■■□□□ 1.16
DSC1Q08554 AC006252.1-201ENST00000483834 1101 ntTSL 1 (best) BASIC22.31■■□□□ 1.16
DSC1Q08554 ADM-205ENST00000528544 586 ntTSL 2 BASIC22.31■■□□□ 1.16
DSC1Q08554 AP001972.3-201ENST00000530792 495 ntTSL 3 BASIC22.31■■□□□ 1.16
DSC1Q08554 PLEKHB1-216ENST00000543085 632 ntTSL 3 BASIC22.31■■□□□ 1.16
DSC1Q08554 INO80E-214ENST00000620599 515 ntTSL 2 BASIC22.31■■□□□ 1.16
DSC1Q08554 GOLGA2P6-201ENST00000340929 2049 ntBASIC22.31■■□□□ 1.16
DSC1Q08554 TMEM259-201ENST00000333175 2581 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.31■■□□□ 1.16
DSC1Q08554 NAPSA-201ENST00000253719 1548 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.31■■□□□ 1.16
DSC1Q08554 PPCS-203ENST00000372561 1431 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.31■■□□□ 1.16
DSC1Q08554 TMEM235-205ENST00000586400 2272 ntTSL 1 (best) BASIC22.31■■□□□ 1.16
DSC1Q08554 EIPR1-206ENST00000443925 1771 ntTSL 3 BASIC22.3■■□□□ 1.16
DSC1Q08554 BCAT2-207ENST00000597011 1579 ntTSL 5 BASIC22.3■■□□□ 1.16
DSC1Q08554 CDK6-202ENST00000424848 1465 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.3■■□□□ 1.16
DSC1Q08554 CLDN5-204ENST00000618236 1374 ntAPPRIS P1 BASIC22.3■■□□□ 1.16
DSC1Q08554 RPLP0-201ENST00000228306 1257 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.3■■□□□ 1.16
DSC1Q08554 PRORSD1P-201ENST00000295112 541 ntBASIC22.3■■□□□ 1.16
DSC1Q08554 GAS7-202ENST00000396115 929 ntTSL 5 BASIC22.3■■□□□ 1.16
DSC1Q08554 ASMTL-AS1-203ENST00000425740 840 ntTSL 2 BASIC22.3■■□□□ 1.16
DSC1Q08554 ZNF346-203ENST00000503425 1191 ntTSL 2 BASIC22.3■■□□□ 1.16
DSC1Q08554 C14orf28-204ENST00000557112 1097 ntTSL 5 BASIC22.3■■□□□ 1.16
DSC1Q08554 PRORSD1P-203ENST00000579162 626 ntTSL 5 BASIC22.3■■□□□ 1.16
DSC1Q08554 ANKRD54-201ENST00000215941 2184 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.3■■□□□ 1.16
DSC1Q08554 ZIM2-201ENST00000593711 2083 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.3■■□□□ 1.16
DSC1Q08554 ARRDC2-202ENST00000379656 2528 ntTSL 2 BASIC22.3■■□□□ 1.16
DSC1Q08554 ENTPD2-201ENST00000312665 1500 ntTSL 1 (best) BASIC22.3■■□□□ 1.16
DSC1Q08554 SOX17-201ENST00000297316 2342 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.3■■□□□ 1.16
DSC1Q08554 DUSP2-201ENST00000288943 1688 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.3■■□□□ 1.16
DSC1Q08554 PCSK6-218ENST00000619160 3093 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.29■■□□□ 1.16
DSC1Q08554 TANGO2-212ENST00000434570 2180 ntTSL 2 BASIC22.29■■□□□ 1.16
DSC1Q08554 SH3GL1-206ENST00000598564 2194 ntTSL 2 BASIC22.29■■□□□ 1.16
DSC1Q08554 C16orf58-209ENST00000567994 1845 ntTSL 5 BASIC22.29■■□□□ 1.16
DSC1Q08554 ACBD4-202ENST00000376955 1453 ntTSL 2 BASIC22.29■■□□□ 1.16
DSC1Q08554 PYURF-201ENST00000273968 1361 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.29■■□□□ 1.16
DSC1Q08554 DMRT1-201ENST00000382276 2222 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.29■■□□□ 1.16
DSC1Q08554 THAP7-201ENST00000215742 1213 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.29■■□□□ 1.16
DSC1Q08554 CAPN10-202ENST00000270364 1267 ntTSL 2 BASIC22.29■■□□□ 1.16
DSC1Q08554 SERF1A-201ENST00000317633 963 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.29■■□□□ 1.16
DSC1Q08554 C20orf196-202ENST00000378979 585 ntTSL 2 BASIC22.29■■□□□ 1.16
DSC1Q08554 ESRRAP1-201ENST00000400596 1257 ntBASIC22.29■■□□□ 1.16
DSC1Q08554 AC007285.1-201ENST00000422239 893 ntTSL 5 BASIC22.29■■□□□ 1.16
DSC1Q08554 ALG5-202ENST00000443765 1119 ntTSL 2 BASIC22.29■■□□□ 1.16
DSC1Q08554 LINC01659-202ENST00000449711 917 ntTSL 3 BASIC22.29■■□□□ 1.16
DSC1Q08554 IGFBP6-203ENST00000548547 1177 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.29■■□□□ 1.16
DSC1Q08554 FDXR-219ENST00000583917 1762 ntTSL 5 BASIC22.29■■□□□ 1.16
DSC1Q08554 ME2-206ENST00000638410 2289 ntTSL 5 BASIC22.29■■□□□ 1.16
DSC1Q08554 ME2-210ENST00000639255 2262 ntTSL 5 BASIC22.29■■□□□ 1.16
DSC1Q08554 THRA-201ENST00000264637 2538 ntTSL 1 (best) BASIC22.29■■□□□ 1.16
DSC1Q08554 HSD11B1L-218ENST00000581773 1687 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.29■■□□□ 1.16
DSC1Q08554 GRINA-202ENST00000395068 1814 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.29■■□□□ 1.16
DSC1Q08554 ARL2BP-201ENST00000219204 2130 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.28■■□□□ 1.16
DSC1Q08554 NENF-201ENST00000366988 949 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.28■■□□□ 1.16
DSC1Q08554 ANKRD39-201ENST00000393537 976 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.28■■□□□ 1.16
DSC1Q08554 GTF2A2-203ENST00000396061 758 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.28■■□□□ 1.16
DSC1Q08554 KRT18P29-201ENST00000397031 1267 ntBASIC22.28■■□□□ 1.16
DSC1Q08554 AC114730.1-201ENST00000400768 472 ntTSL 4 BASIC22.28■■□□□ 1.16
DSC1Q08554 NREP-209ENST00000455559 698 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC22.28■■□□□ 1.16
DSC1Q08554 AC008667.2-201ENST00000504413 469 ntTSL 3 BASIC22.28■■□□□ 1.16
DSC1Q08554 COX6C-208ENST00000522940 694 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC22.28■■□□□ 1.16
DSC1Q08554 C19orf25-213ENST00000592872 1287 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.28■■□□□ 1.16
DSC1Q08554 RNF39-201ENST00000244360 2206 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.28■■□□□ 1.16
DSC1Q08554 KCNQ2-201ENST00000344425 1426 ntTSL 1 (best) BASIC22.28■■□□□ 1.16
DSC1Q08554 AK4-208ENST00000546702 1335 ntTSL 1 (best) BASIC22.28■■□□□ 1.16
DSC1Q08554 PRAF2-202ENST00000553851 1334 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.28■■□□□ 1.16
DSC1Q08554 GFRA3-201ENST00000274721 2039 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.28■■□□□ 1.16
DSC1Q08554 CNN3-201ENST00000370206 2165 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.28■■□□□ 1.16
DSC1Q08554 PTGES2-202ENST00000338961 2331 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.28■■□□□ 1.16
DSC1Q08554 NPEPL1-201ENST00000356091 2378 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.27■■□□□ 1.16
DSC1Q08554 AL645608.1-202ENST00000417705 1389 ntTSL 3 BASIC22.27■■□□□ 1.16
DSC1Q08554 PSMD7-201ENST00000219313 1670 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.27■■□□□ 1.16
DSC1Q08554 RRNAD1-202ENST00000368218 1802 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC22.27■■□□□ 1.16
DSC1Q08554 PEX10-202ENST00000447513 1997 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.27■■□□□ 1.16
DSC1Q08554 MFF-203ENST00000349901 1716 ntTSL 2 BASIC22.27■■□□□ 1.16
DSC1Q08554 NELFE-202ENST00000375429 1584 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.27■■□□□ 1.16
DSC1Q08554 TRA2B-203ENST00000382191 976 ntTSL 2 BASIC22.27■■□□□ 1.16
DSC1Q08554 DGCR6L-202ENST00000405465 962 ntTSL 3 BASIC22.27■■□□□ 1.16
DSC1Q08554 NME6-213ENST00000451657 871 ntTSL 2 BASIC22.27■■□□□ 1.16
DSC1Q08554 GATS-209ENST00000454084 1030 ntTSL 3 BASIC22.27■■□□□ 1.16
DSC1Q08554 UNC93B5-201ENST00000530315 699 ntBASIC22.27■■□□□ 1.16
DSC1Q08554 ANAPC11-208ENST00000572851 686 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.27■■□□□ 1.16
DSC1Q08554 BAG4-202ENST00000432471 1943 ntTSL 1 (best) BASIC22.27■■□□□ 1.16
DSC1Q08554 PRR7-202ENST00000502922 1345 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.27■■□□□ 1.16
DSC1Q08554 ZNF622-201ENST00000308683 1699 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.26■■□□□ 1.15
DSC1Q08554 NBL1-202ENST00000375136 2172 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.26■■□□□ 1.15
DSC1Q08554 GPS2-201ENST00000380728 1379 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.26■■□□□ 1.15
DSC1Q08554 OLIG3-201ENST00000367734 2049 ntAPPRIS P1 BASIC22.26■■□□□ 1.15
DSC1Q08554 ADCK2-203ENST00000476491 2092 ntTSL 1 (best) BASIC22.26■■□□□ 1.15
DSC1Q08554 IRX4-207ENST00000613726 2403 ntTSL 1 (best) BASIC22.26■■□□□ 1.15
DSC1Q08554 SPHK1-201ENST00000323374 2138 ntTSL 1 (best) BASIC22.26■■□□□ 1.15
DSC1Q08554 RBP4-201ENST00000371464 1068 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.26■■□□□ 1.15
DSC1Q08554 CRIP2-202ENST00000483017 1176 ntTSL 2 BASIC22.26■■□□□ 1.15
DSC1Q08554 MMAB-206ENST00000540016 945 ntTSL 3 BASIC22.26■■□□□ 1.15
DSC1Q08554 AL589743.5-201ENST00000616611 1050 ntBASIC22.26■■□□□ 1.15
DSC1Q08554 PGRMC2-201ENST00000296425 2767 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.26■■□□□ 1.15
DSC1Q08554 NOXO1-202ENST00000356120 1539 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.26■■□□□ 1.15
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 46.8 ms