Protein–RNA interactions for Protein: Q08493

PDE4C, cAMP-specific 3',5'-cyclic phosphodiesterase 4C, humanhuman

Predictions only

Length 712 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
PDE4CQ08493 PKD2-201ENST00000237596 5056 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.82■■□□□ 1.24
PDE4CQ08493 CLN6-201ENST00000249806 2243 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.82■■□□□ 1.24
PDE4CQ08493 EEFSEC-201ENST00000254730 2232 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.82■■□□□ 1.24
PDE4CQ08493 LIMS2-202ENST00000355119 2045 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.82■■□□□ 1.24
PDE4CQ08493 NEURL3-201ENST00000310865 1710 ntTSL 1 (best) BASIC22.82■■□□□ 1.24
PDE4CQ08493 GRK3-203ENST00000619906 2873 ntTSL 5 BASIC22.82■■□□□ 1.24
PDE4CQ08493 BOK-201ENST00000318407 2657 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.82■■□□□ 1.24
PDE4CQ08493 GPSM1-206ENST00000616132 2270 ntTSL 1 (best) BASIC22.82■■□□□ 1.24
PDE4CQ08493 MPST-204ENST00000404393 1329 ntTSL 5 BASIC22.82■■□□□ 1.24
PDE4CQ08493 DAG1-221ENST00000541308 5676 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.82■■□□□ 1.24
PDE4CQ08493 SHE-201ENST00000304760 6243 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.81■■□□□ 1.24
PDE4CQ08493 TMEM8A-204ENST00000431232 3691 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.81■■□□□ 1.24
PDE4CQ08493 LSR-203ENST00000360798 1963 ntTSL 2 BASIC22.81■■□□□ 1.24
PDE4CQ08493 ASL-203ENST00000380839 1765 ntTSL 5 BASIC22.81■■□□□ 1.24
PDE4CQ08493 CTGF-201ENST00000367976 2339 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.81■■□□□ 1.24
PDE4CQ08493 SMOX-212ENST00000621355 2322 ntTSL 1 (best) BASIC22.81■■□□□ 1.24
PDE4CQ08493 PPP5C-201ENST00000012443 2109 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.81■■□□□ 1.24
PDE4CQ08493 UBTF-203ENST00000393606 2683 ntTSL 1 (best) BASIC22.81■■□□□ 1.24
PDE4CQ08493 STK10-201ENST00000176763 6060 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.81■■□□□ 1.24
PDE4CQ08493 LMLN-210ENST00000482695 2010 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.81■■□□□ 1.24
PDE4CQ08493 ABCG4-204ENST00000615496 2459 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.81■■□□□ 1.24
PDE4CQ08493 CD6-203ENST00000352009 1809 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.81■■□□□ 1.24
PDE4CQ08493 TRADD-202ENST00000486556 1833 ntTSL 2 BASIC22.81■■□□□ 1.24
PDE4CQ08493 URAD-201ENST00000332715 931 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.81■■□□□ 1.24
PDE4CQ08493 AL138963.3-201ENST00000610057 588 ntTSL 4 BASIC22.81■■□□□ 1.24
PDE4CQ08493 SARDH-203ENST00000371868 2266 ntTSL 2 BASIC22.81■■□□□ 1.24
PDE4CQ08493 CCKBR-206ENST00000532715 1734 ntTSL 3 BASIC22.81■■□□□ 1.24
PDE4CQ08493 P4HB-201ENST00000331483 2603 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.81■■□□□ 1.24
PDE4CQ08493 YIPF2-201ENST00000253031 2087 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.81■■□□□ 1.24
PDE4CQ08493 SLC18A3-201ENST00000374115 2420 ntAPPRIS P1 BASIC22.81■■□□□ 1.24
PDE4CQ08493 PDLIM2-216ENST00000464275 1995 ntTSL 2 BASIC22.81■■□□□ 1.24
PDE4CQ08493 ZDHHC18-202ENST00000374142 5020 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.81■■□□□ 1.24
PDE4CQ08493 UBP1-202ENST00000283629 4148 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.81■■□□□ 1.24
PDE4CQ08493 AC025164.2-201ENST00000501008 1898 ntTSL 5 BASIC22.81■■□□□ 1.24
PDE4CQ08493 FRRS1L-201ENST00000561981 8197 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.81■■□□□ 1.24
PDE4CQ08493 MAPK8IP3-202ENST00000356010 4456 ntTSL 5 BASIC22.8■■□□□ 1.24
PDE4CQ08493 TMEM5-201ENST00000261234 1918 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.8■■□□□ 1.24
PDE4CQ08493 UCHL5-205ENST00000367454 1815 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.8■■□□□ 1.24
PDE4CQ08493 FBXL22-202ENST00000534939 2443 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC22.8■■□□□ 1.24
PDE4CQ08493 CCDC28B-201ENST00000373602 1089 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.8■■□□□ 1.24
PDE4CQ08493 FOXB2-201ENST00000376708 1299 ntAPPRIS P1 BASIC22.8■■□□□ 1.24
PDE4CQ08493 C16orf86-201ENST00000403458 1267 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.8■■□□□ 1.24
PDE4CQ08493 NMRAL1-202ENST00000404295 1233 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.8■■□□□ 1.24
PDE4CQ08493 AL590128.2-201ENST00000442889 415 ntTSL 3 BASIC22.8■■□□□ 1.24
PDE4CQ08493 PPM1N-207ENST00000451287 1293 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.8■■□□□ 1.24
PDE4CQ08493 RARRES2P6-201ENST00000567333 442 ntBASIC22.8■■□□□ 1.24
PDE4CQ08493 CCM2-206ENST00000474617 1532 ntTSL 5 BASIC22.8■■□□□ 1.24
PDE4CQ08493 NR0B1-202ENST00000378970 2021 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.8■■□□□ 1.24
PDE4CQ08493 RETREG2-203ENST00000430297 4618 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.8■■□□□ 1.24
PDE4CQ08493 NUTM2D-201ENST00000381697 3290 ntAPPRIS P5 TSL 1 (best) BASIC22.8■■□□□ 1.24
PDE4CQ08493 ZC3H12D-201ENST00000409806 5791 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.8■■□□□ 1.24
PDE4CQ08493 SH2D5-202ENST00000444387 1934 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.8■■□□□ 1.24
PDE4CQ08493 AL356309.3-201ENST00000624132 1934 ntBASIC22.8■■□□□ 1.24
PDE4CQ08493 POTED-202ENST00000620442 1988 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.8■■□□□ 1.24
PDE4CQ08493 PRR16-202ENST00000407149 1747 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.79■■□□□ 1.24
PDE4CQ08493 ZNF410-206ENST00000540593 1722 ntTSL 2 BASIC22.79■■□□□ 1.24
PDE4CQ08493 DUSP9-202ENST00000370167 2289 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.79■■□□□ 1.24
PDE4CQ08493 NOX4-209ENST00000527626 1774 ntTSL 2 BASIC22.79■■□□□ 1.24
PDE4CQ08493 PRKAA1-202ENST00000354209 1918 ntTSL 1 (best) BASIC22.79■■□□□ 1.24
PDE4CQ08493 Z83844.2-201ENST00000456099 1945 ntTSL 2 BASIC22.79■■□□□ 1.24
PDE4CQ08493 IKBKG-212ENST00000617207 1949 ntAPPRIS ALT1 TSL 3 BASIC22.79■■□□□ 1.24
PDE4CQ08493 AK1-201ENST00000223836 736 ntTSL 3 BASIC22.79■■□□□ 1.24
PDE4CQ08493 FAM219A-202ENST00000379078 770 ntTSL 3 BASIC22.79■■□□□ 1.24
PDE4CQ08493 AL355877.1-204ENST00000451482 1078 ntTSL 1 (best) BASIC22.79■■□□□ 1.24
PDE4CQ08493 AC116614.1-201ENST00000456949 539 ntTSL 2 BASIC22.79■■□□□ 1.24
PDE4CQ08493 AP2S1-203ENST00000593442 636 ntTSL 2 BASIC22.79■■□□□ 1.24
PDE4CQ08493 AC012313.1-203ENST00000597980 570 ntTSL 4 BASIC22.79■■□□□ 1.24
PDE4CQ08493 PAX1-205ENST00000613128 5352 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.79■■□□□ 1.24
PDE4CQ08493 KCTD2-201ENST00000322444 3635 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.79■■□□□ 1.24
PDE4CQ08493 AC133065.2-201ENST00000573379 2147 ntTSL 2 BASIC22.79■■□□□ 1.24
PDE4CQ08493 ECEL1P1-201ENST00000373592 1742 ntBASIC22.79■■□□□ 1.24
PDE4CQ08493 KHDRBS2-201ENST00000281156 2332 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.79■■□□□ 1.24
PDE4CQ08493 SNX21-212ENST00000491381 1607 ntTSL 1 (best) BASIC22.79■■□□□ 1.24
PDE4CQ08493 DMRT1-201ENST00000382276 2222 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.78■■□□□ 1.24
PDE4CQ08493 ZNF511-202ENST00000361518 1520 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.78■■□□□ 1.24
PDE4CQ08493 PDK3-201ENST00000379162 1809 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.78■■□□□ 1.24
PDE4CQ08493 MAPK9-206ENST00000425491 2266 ntTSL 5 BASIC22.78■■□□□ 1.24
PDE4CQ08493 PCSK1N-201ENST00000218230 1050 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.78■■□□□ 1.24
PDE4CQ08493 ZNF48-201ENST00000320159 3234 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.78■■□□□ 1.24
PDE4CQ08493 LGALS9B-201ENST00000324290 1243 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC22.78■■□□□ 1.24
PDE4CQ08493 WDR86-201ENST00000334493 2023 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.78■■□□□ 1.24
PDE4CQ08493 NT5C3AP1-201ENST00000394500 1012 ntBASIC22.78■■□□□ 1.24
PDE4CQ08493 SP2-202ENST00000613139 908 ntTSL 5 BASIC22.78■■□□□ 1.24
PDE4CQ08493 MTSS1L-201ENST00000338779 4992 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.78■■□□□ 1.24
PDE4CQ08493 P4HA3-202ENST00000427714 2248 ntTSL 2 BASIC22.78■■□□□ 1.24
PDE4CQ08493 CFAP99-206ENST00000616117 1941 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.78■■□□□ 1.24
PDE4CQ08493 ZNF843-201ENST00000315678 2137 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC22.78■■□□□ 1.24
PDE4CQ08493 FARP2-223ENST00000627550 2122 ntTSL 2 BASIC22.78■■□□□ 1.24
PDE4CQ08493 MARK2-208ENST00000508192 2924 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC22.78■■□□□ 1.24
PDE4CQ08493 DUSP26-201ENST00000256261 1835 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.78■■□□□ 1.24
PDE4CQ08493 PLCB2-204ENST00000557821 4517 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.78■■□□□ 1.24
PDE4CQ08493 RAB3A-201ENST00000222256 1528 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.77■■□□□ 1.24
PDE4CQ08493 BX005040.4-201ENST00000637145 1518 ntBASIC22.77■■□□□ 1.24
PDE4CQ08493 PTPRE-201ENST00000254667 5331 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.77■■□□□ 1.24
PDE4CQ08493 EED-201ENST00000263360 2223 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.77■■□□□ 1.24
PDE4CQ08493 CACNA1A-253ENST00000637927 6847 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.77■■□□□ 1.24
PDE4CQ08493 NXT1-201ENST00000254998 1123 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.77■■□□□ 1.24
PDE4CQ08493 AC027612.3-201ENST00000413684 1047 ntBASIC22.77■■□□□ 1.24
PDE4CQ08493 AC026271.2-201ENST00000428091 497 ntBASIC22.77■■□□□ 1.24
PDE4CQ08493 FAM222B-213ENST00000583522 556 ntTSL 2 BASIC22.77■■□□□ 1.24
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 19 ms