Protein–RNA interactions for Protein: Q08378

GOLGA3, Golgin subfamily A member 3, humanhuman

Predictions only

Length 1,498 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
GOLGA3Q08378 PIP5KL1-202ENST00000388747 2198 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC34.01■■■■□ 3.03
GOLGA3Q08378 PLEKHJ1-205ENST00000587394 937 ntTSL 2 BASIC34.01■■■■□ 3.03
GOLGA3Q08378 SPOP-206ENST00000504102 1865 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC34■■■■□ 3.03
GOLGA3Q08378 PLSCR3-201ENST00000324822 1689 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC34■■■■□ 3.03
GOLGA3Q08378 FUZ-212ENST00000528094 1479 ntTSL 2 BASIC34■■■■□ 3.03
GOLGA3Q08378 ESRRAP1-201ENST00000400596 1257 ntBASIC34■■■■□ 3.03
GOLGA3Q08378 CCNL1-203ENST00000461804 1998 ntTSL 2 BASIC34■■■■□ 3.03
GOLGA3Q08378 RENBP-201ENST00000369997 1322 ntTSL 5 BASIC34■■■■□ 3.03
GOLGA3Q08378 EIPR1-206ENST00000443925 1771 ntTSL 3 BASIC33.99■■■■□ 3.03
GOLGA3Q08378 SLC25A24P1-201ENST00000411846 1569 ntTSL 5 BASIC33.99■■■■□ 3.03
GOLGA3Q08378 GRINA-202ENST00000395068 1814 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC33.99■■■■□ 3.03
GOLGA3Q08378 FAM107B-211ENST00000468747 2633 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC33.99■■■■□ 3.03
GOLGA3Q08378 DUSP2-201ENST00000288943 1688 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC33.99■■■■□ 3.03
GOLGA3Q08378 HSD11B1L-218ENST00000581773 1687 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC33.99■■■■□ 3.03
GOLGA3Q08378 NUDT22-201ENST00000279206 1094 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC33.99■■■■□ 3.03
GOLGA3Q08378 LINC00471-201ENST00000313064 1282 ntTSL 1 (best) BASIC33.99■■■■□ 3.03
GOLGA3Q08378 NUDT22-204ENST00000441250 986 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC33.99■■■■□ 3.03
GOLGA3Q08378 AL591742.1-201ENST00000604433 565 ntBASIC33.99■■■■□ 3.03
GOLGA3Q08378 RAB28-201ENST00000288723 1810 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC33.98■■■■□ 3.03
GOLGA3Q08378 EYA2-203ENST00000357410 2465 ntTSL 1 (best) BASIC33.98■■■■□ 3.03
GOLGA3Q08378 C16orf74-201ENST00000284245 906 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC33.98■■■■□ 3.03
GOLGA3Q08378 GNAS-AS1-201ENST00000424094 1156 ntTSL 1 (best) BASIC33.98■■■■□ 3.03
GOLGA3Q08378 C14orf28-204ENST00000557112 1097 ntTSL 5 BASIC33.98■■■■□ 3.03
GOLGA3Q08378 MPST-202ENST00000397225 2116 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC33.98■■■■□ 3.03
GOLGA3Q08378 ZSCAN18-217ENST00000601144 2190 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC33.98■■■■□ 3.03
GOLGA3Q08378 TPD52L1-201ENST00000304877 1468 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC33.98■■■■□ 3.03
GOLGA3Q08378 CLN6-201ENST00000249806 2243 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC33.98■■■■□ 3.03
GOLGA3Q08378 MOK-226ENST00000522874 1890 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC33.97■■■■□ 3.03
GOLGA3Q08378 ITM2C-202ENST00000326427 2078 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC33.97■■■■□ 3.03
GOLGA3Q08378 AC108693.2-201ENST00000492981 303 ntTSL 3 BASIC33.97■■■■□ 3.03
GOLGA3Q08378 EPHX3-202ENST00000435261 1771 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC33.97■■■■□ 3.03
GOLGA3Q08378 SAC3D1-205ENST00000531072 1362 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC33.97■■■■□ 3.03
GOLGA3Q08378 AC133561.1-201ENST00000568600 2415 ntBASIC33.97■■■■□ 3.03
GOLGA3Q08378 PBX4-201ENST00000251203 1724 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC33.96■■■■□ 3.03
GOLGA3Q08378 NAA20-202ENST00000334982 1260 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC33.96■■■■□ 3.03
GOLGA3Q08378 LGALS7-201ENST00000378626 466 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC33.96■■■■□ 3.03
GOLGA3Q08378 DGCR6L-202ENST00000405465 962 ntTSL 3 BASIC33.96■■■■□ 3.03
GOLGA3Q08378 AC007040.1-201ENST00000416229 477 ntTSL 3 BASIC33.96■■■■□ 3.03
GOLGA3Q08378 PTPA-214ENST00000423100 988 ntTSL 2 BASIC33.96■■■■□ 3.03
GOLGA3Q08378 BET1L-207ENST00000529614 560 ntTSL 5 BASIC33.96■■■■□ 3.03
GOLGA3Q08378 RAP1B-220ENST00000539091 977 ntTSL 2 BASIC33.96■■■■□ 3.03
GOLGA3Q08378 AL049874.3-201ENST00000557618 868 ntTSL 3 BASIC33.96■■■■□ 3.03
GOLGA3Q08378 CCS-208ENST00000533244 1430 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC33.96■■■■□ 3.03
GOLGA3Q08378 HLA-C-201ENST00000376228 1536 ntAPPRIS P2 BASIC33.96■■■■□ 3.03
GOLGA3Q08378 SEPT1-201ENST00000321367 1592 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC33.96■■■■□ 3.03
GOLGA3Q08378 CKLF-201ENST00000264001 669 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC33.95■■■■□ 3.03
GOLGA3Q08378 PPCS-203ENST00000372561 1431 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC33.95■■■■□ 3.03
GOLGA3Q08378 DPF1-201ENST00000355526 1632 ntTSL 1 (best) BASIC33.95■■■■□ 3.03
GOLGA3Q08378 PSIP1-201ENST00000380715 1966 ntTSL 1 (best) BASIC33.95■■■■□ 3.03
GOLGA3Q08378 SOAT2-201ENST00000301466 2044 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC33.95■■■■□ 3.03
GOLGA3Q08378 RTCA-201ENST00000260563 1534 ntTSL 1 (best) BASIC33.95■■■■□ 3.02
GOLGA3Q08378 TRPT1-201ENST00000317459 962 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC33.95■■■■□ 3.02
GOLGA3Q08378 AC100835.1-201ENST00000565737 498 ntTSL 5 BASIC33.95■■■■□ 3.02
GOLGA3Q08378 YIF1B-213ENST00000591755 1077 ntTSL 2 BASIC33.95■■■■□ 3.02
GOLGA3Q08378 FAM21FP-204ENST00000608637 956 ntBASIC33.95■■■■□ 3.02
GOLGA3Q08378 INO80E-214ENST00000620599 515 ntTSL 2 BASIC33.95■■■■□ 3.02
GOLGA3Q08378 P2RY2-203ENST00000393597 2107 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC33.94■■■■□ 3.02
GOLGA3Q08378 EIF2B4-211ENST00000616081 1754 ntTSL 5 BASIC33.94■■■■□ 3.02
GOLGA3Q08378 PRSS33-202ENST00000570702 1676 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC33.94■■■■□ 3.02
GOLGA3Q08378 ADAM22-209ENST00000439864 2576 ntTSL 1 (best) BASIC33.94■■■■□ 3.02
GOLGA3Q08378 THAP7-201ENST00000215742 1213 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC33.94■■■■□ 3.02
GOLGA3Q08378 GRTP1-201ENST00000326039 1294 ntTSL 1 (best) BASIC33.94■■■■□ 3.02
GOLGA3Q08378 C2orf50-202ENST00000405022 980 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC33.94■■■■□ 3.02
GOLGA3Q08378 STAG3L3-201ENST00000423834 1262 ntTSL 2 BASIC33.94■■■■□ 3.02
GOLGA3Q08378 CAVIN3-203ENST00000530979 957 ntTSL 2 BASIC33.94■■■■□ 3.02
GOLGA3Q08378 C17orf50-201ENST00000603305 569 ntTSL 3 BASIC33.94■■■■□ 3.02
GOLGA3Q08378 C17orf50-203ENST00000605587 1018 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC33.94■■■■□ 3.02
GOLGA3Q08378 AC093762.2-201ENST00000641700 291 ntAPPRIS P1 BASIC33.94■■■■□ 3.02
GOLGA3Q08378 DMPK-220ENST00000618091 2503 ntTSL 1 (best) BASIC33.94■■■■□ 3.02
GOLGA3Q08378 KRT18P55-201ENST00000577198 1950 ntTSL 1 (best) BASIC33.93■■■■□ 3.02
GOLGA3Q08378 PPP1R3F-203ENST00000466508 1885 ntTSL 2 BASIC33.93■■■■□ 3.02
GOLGA3Q08378 SPATA2L-201ENST00000289805 2335 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC33.93■■■■□ 3.02
GOLGA3Q08378 AC006435.1-201ENST00000571775 1065 ntTSL 5 BASIC33.93■■■■□ 3.02
GOLGA3Q08378 ANAPC11-212ENST00000577425 603 ntTSL 3 BASIC33.93■■■■□ 3.02
GOLGA3Q08378 PAQR6-205ENST00000368270 1765 ntTSL 1 (best) BASIC33.93■■■■□ 3.02
GOLGA3Q08378 AC006455.5-202ENST00000615248 2284 ntTSL 1 (best) BASIC33.93■■■■□ 3.02
GOLGA3Q08378 G6PD-202ENST00000393562 2631 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC33.92■■■■□ 3.02
GOLGA3Q08378 TGIF1-207ENST00000407501 1585 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC33.92■■■■□ 3.02
GOLGA3Q08378 G6PD-211ENST00000621232 2631 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC33.92■■■■□ 3.02
GOLGA3Q08378 PDIA6-207ENST00000540494 2509 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC33.92■■■■□ 3.02
GOLGA3Q08378 MAZ-201ENST00000219782 2698 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC33.92■■■■□ 3.02
GOLGA3Q08378 NKX2-4-201ENST00000351817 2238 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC33.92■■■■□ 3.02
GOLGA3Q08378 AC096537.1-201ENST00000437416 684 ntTSL 5 BASIC33.92■■■■□ 3.02
GOLGA3Q08378 PACS2-201ENST00000325438 3708 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC33.92■■■■□ 3.02
GOLGA3Q08378 AFDN-AS1-201ENST00000359760 2238 ntTSL 1 (best) BASIC33.92■■■■□ 3.02
GOLGA3Q08378 SEPT8-207ENST00000378719 2889 ntTSL 1 (best) BASIC33.91■■■■□ 3.02
GOLGA3Q08378 CCDC107-206ENST00000426546 1242 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC33.91■■■■□ 3.02
GOLGA3Q08378 UNC93B5-201ENST00000530315 699 ntBASIC33.91■■■■□ 3.02
GOLGA3Q08378 TIMM50-213ENST00000599794 786 ntTSL 2 BASIC33.91■■■■□ 3.02
GOLGA3Q08378 AC006058.3-201ENST00000606217 1069 ntBASIC33.91■■■■□ 3.02
GOLGA3Q08378 NUF2-208ENST00000524800 1845 ntTSL 5 BASIC33.91■■■■□ 3.02
GOLGA3Q08378 RFXAP-201ENST00000255476 2304 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC33.91■■■■□ 3.02
GOLGA3Q08378 CCM2L-201ENST00000262659 2523 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC33.91■■■■□ 3.02
GOLGA3Q08378 PLK5-202ENST00000454744 1930 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC33.91■■■■□ 3.02
GOLGA3Q08378 CD247-201ENST00000362089 1609 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC33.9■■■■□ 3.02
GOLGA3Q08378 SHMT1-202ENST00000352886 2437 ntTSL 2 BASIC33.9■■■■□ 3.02
GOLGA3Q08378 MAP1LC3A-201ENST00000360668 1574 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC33.9■■■■□ 3.02
GOLGA3Q08378 RPS14-201ENST00000312037 711 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC33.9■■■■□ 3.02
GOLGA3Q08378 STPG4-207ENST00000445927 891 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC33.9■■■■□ 3.02
GOLGA3Q08378 MMAB-206ENST00000540016 945 ntTSL 3 BASIC33.9■■■■□ 3.02
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 73.3 ms